Thread by @_jorgegd_

COVID 8/8/2020 Creo que la preocupación por el repunte veraniego ha llevado a muchos a estar más pendiente y, probablemente esté todo dicho, así que creo que poco tengo que aportar. No obstante, vamos al lío.

La práctica del análisis de datos ha crecido en twitter. Es buena noticia porque destaca la inquietud analítica de nuestra sociedad que en última instancia empuja a gobiernos, organismos e instituciones a poner en marcha servicios que despejen dudas y hagan un país más informado

Qué optimista me he levantado hoy, qué cojones

La realidad es que la ausencia de un repositorio de información central y actualizado, así como un data governance reconocido por todas las autonomías ha llevado a complicar la faena y hay que dedicar mucho trabajo al primer paso: la limpieza y depuración de datos.

Lo primero, contexto. Desde el fin del estado de alarma hemos recuperado gran parte de nuestra vida normal y podríamos decir que la vida que tenemos se parece en un (ponga usted aquí el porcentaje que quiera) a la vida que teníamos en febrero.

Así que, a fin de racionalizarme a mí mismo la situación y basándome en el estudio de seroprevalencia, he pintado dos curvas. Cuál ha sido la evolución de la incidencia real (azul) y cuál ha sido el aumento de los casos diagnosticados (naranja) (next tuit)

Es una aproximación, pero puede valer
He asumido que a día de hoy detectamos un 50% de los casos (deberían ser más, porque 50% era la tasa de detección que tenía la Rioja en marzo-abril)
En verde marco la etapa en la que llevábamos vida normal y en morado la nueva normalidad

Las conclusiones que saco son dos:
- La principal explicación del repunte de Julio es simple. Este virus se contagia mucho cuando hacemos vida normal (fijaos en la parte marcada en verde) y no estamos dando abasto a todo

- La segunda es que aún estamos exageradamente lejos de nuestras peores pesadillas
Y una alarma. Esto se dispara cagando hostias así que hay que ponerse las pilas para que la zona morada se parezca algo menos a la zona verde, sobre todo desde septiembre

No obstante, vemos cómo el crecimiento de la incidencia es bastante más suave y, por tanto, más digerible para el sistema sanitario, que recordamos fue de las primeras lecciones que aprendimos en este jaleo.

Y la prevalencia hospitalaria, por tanto, es algo siempre un indicador casi más importante que el número de contagios detectados por dos razones a la vez.
- es una aproximación al aumento de la incidencia
- es una aproximación a la gravedad de la incidencia
(con pinzas todo esto)

He visto que @mianrey hace un fantástico trabajo de patearse las webs de las CCAAs para ver esta información y nos da que a día de hoy, hay 2367 personas hospitalizadas por COVID19 en nuestro país

https://twitter.com/mianrey/status/1291799601041874944

Recordemos que hemos detectado 35000 casos en la última semana pero la relación de situación hospitalaria con respecto a otros países, parece ser bastante favorable.
No obstante, hablo a nivel agregado, si entramos en detalle, veremos focos calientes.

La curva de la IA a 7 días hasta el 2 de agosto tiene esta pinta. Hace giros raros porque el reparto de la incidencia no es nada homogéneo y, encima, sabemos que la CCAA con más problemas (Aragón) tuvo la semana pasada problemas con las PCRs que retrasaron los diagnósticos

Vemos que la IA nacional a 7d ha seguido creciendo aunque la curva, en general, es más lineal que exponencial y parece que suavizándose. Si vamos al detalle, veremos buenas y malas noticias, como la vida misma.

Por CCAAs tenemos los trending topic habituales de las últimas semanas: Aragón, Cataluña y Navarra.
Con Madrid y País Vasco en una tendencia bastante peor.

Aragón se ve muy bien el retraso en diagnósticos que comentábamos. Mantiene una incidencia muy alta aunque la sospecha que teníamos de que se estaba estabilizando parece confirmarse
En el pdf del ministerio de esta semana, adelanta que la IA a 7 días se ha movido entre 300 y 310

Por provincias vemos que Huesca que junto a Lleida es la provincia que ha alcanzado una incidencia más alta, la ha reducido en dos semanas a menos de la mitad (desde 350 a 142). Podrá variar la cosa al meterse más casos en la serie, pero difícilmente cambiará esta clara tendencia

De Zaragoza y Teruel no me mojo porque los retrasos en los diagnósticos aún están por ver, pero si la IA que da el pdf del ministerio parece casi estabilizada, supongo que los incrementos de estas provincias serán mucho menos severos que semanas anteriores.

Cataluña va teniendo mejor pinta. Lleida sigue la misma inercia que Huesca y el resto de provincias parecen haberse quedado en plano.
El pdf del ministerio parece acompañar esta tendencia. Cataluña cerró la semana pasada con una IA a 7 días de 65,25 y ésta lo hace con 65,20

Y la tercera CCAA que ha registrado incrementos más elevados en las últimas semanas es Navarra. Diríamos que tocó techo en base a la serie, pero la IA adelantada por el ministerio esta semana no parece confirmarlo así que tocará esperar un poco más.

Sí es cierto que la subida de la IA semanal reportada por el ministerio ha sido de un 25%, que queda muy lejos de ser un crecimiento exponencial descontrolado pero... esperemos que empiece a bajar.

Un inciso aquí para una observación muy friki. Según datos del Ministerio de Fomento basados en antenas móviles, un mes de julio clásico, los principales flujos de comunicación desde/hasta Zaragoza son, en este orden:
-Huesca
-Tarragona
-Teruel
-Madrid
-Navarra
-Barcelona
-Lleida

Sigamos de paseo por el país. Sacando estas CCAAs de la ecuación vemos que Madrid (verde) y País Vasco (naranja) cogen otra semana más una pinta regular y el pdf del ministerio no parece adelantar que esta semana haya sido mejor.

El primer repunte empezó con Guipuzcoa y en seguida siguieron las otras dos provincias, comportándose como una sola provincia. La primera puede que se haya frenado (está por ver) pero me temo que aún le quedan algunos días hasta estabilizarse, sobre todo el área de Bilbao.

Y Madrid... pues a ver. Ya no sólo que sea la provincia más difícil de gestionar (muy poblada, hub de comunicaciones, con metro, densidad de población alta...) pero tiene pinta de que va a ser el foco de preocupación las próximas semanas siempre a la espera del efecto agosto.

Además, se está dando la particularidad que no se da en otros territorios. Que la prevalencia hospitalaria ha crecido esta semana al mismo ritmo que los contagios según pdf del ministerio (se ha duplicado).
- IA 7 días.- 31 -> 62
- Prev hospit.- 169 -> 331
- Prev UCI.- 32 -> 51

Insisto en que esto es algo que creo que no ha estado sucediendo de la misma manera ni en Aragón ni Cataluña, así que hay que levantar la ceja con esto. No porque la incidencia esté demasiado alta sino porque las condiciones de partida para controlar el brote, no parecen buenas

En Madrid, obviamente estamos muy lejos de lo que fue marzo-abril, que comparativamente, vemos lejos. Estamos a tiempo de controlarlo antes de meses peores. Pero recordamos lo de siempre. Esto se dispara muy rápido.

Sigamos revisando el resto. El resto de CCAAs aún no están en incidencias especialmente altas pero se observa un crecimiento general de los casos (cosa lógica) que estresan más los equipos de rastreo y de atención primaria.

Decíamos la semana pasada pero lo recordamos que en el mediterráneo han subido los casos mucho las últimas semanas. Pongo aquí Baleares, Murcia y las provincias de la Comunidad Valenciana.

Los datos adelantados en el PDF del ministerio apuntan a que en Baleares la incidencia ha seguido una evolución muy superior (lo veremos en la serie de la semana que viene) mientras que Murcia y Valencia tampoco parecen estabilizarse.

Es obvio decirlo. Pero es que son destinos habituales en verano, así que confiemos en que las próximas semanas no sean especialmente fuertes.

Otra CCAA que ha ocupado alguna portada es Castilla y León. Parece que en este caso, los aumentos en la incidencia se han concentrado en Soria, Burgos y, en menor medida, Valladolid.

Soria, con pocos habitantes, ha disparado su IA a 7 días hasta cerca de 90.
Volvemos a lo de antes, por encontrarle algunos ingredientes. Los principales flujos de movilidad con Soria un julio normal son en este orden:
-Madrid
-Zaragoza
-Valladolid, centro neurálgico de CyL

Voy a parar también en Andalucía. Parece una CCAA que se está comportando razonablemente bien en esta etapa pero ha concentrado un aumento grande de la incidencia en Almería. Aún sin tener el mismo efecto en el resto de provincias. Parece algo controlable.

Y bueno, paro en casa. Extremadura en estas últimas dos semanas parecen haber repunte de casos.
La IA el 27 de Julio estaba en 5 y el último adelanto del PDF del ministerio apunta a 15. Es una incidencia aún muy controlable y es una región que está reaccionando bien a los brotes

Hoy no voy a repasar la situación hospitalaria porque creo que hay gente como @guilleortiz_77 @mianrey o @ngbpadel2 que la ha revisado mucho más que yo, así que me limito a decir las conclusiones que yo saco.

Se está produciendo en los hospitales lo que era previsto. Más casos, más ingresos.
Por suerte, en general, la traducción no es directa y salvo en Zaragoza (y aún en una situación controlable), parece que la prevalencia no se ha disparado.

Comparativamente con otros países, vemos que la situación en hospitales no parece preocupar (Francia sin ir más lejos, ha detectado la tercera parte de casos que nosotros en la última semana y tiene el triple de hospitalizados).

Pero esto no es un consuelo. Cada contagio debe ser rastreado, atendido al menos en atención primaria, aislado, gestionarle una ficha individualizada, darle seguimiento...

El aumento de los contagios es explicable por la movilidad del país y por la simple vida que hacemos en el día a día, como hemos visto.
Pero hay que y evitar riesgos innecesarios limitar el estrés del sistema sanitario, que afecta a muchas capas. Por empatía

Eso sí. Es probable que veamos aumentos en la mortalidad con el virus las próximas semanas. Pero parece que dentro de los márgenes esperables del MoMo.

En fin. Cierro. Que como dijo aquel...