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Sep 17, 2020 41 tweets 11 min read Read on X
Carte du taux d'incidence par département (nombre de cas détectés pour 100 000 habitants sur les 7 derniers jours disponibles, ici du 8 au 14 septembre).

La France était à 72,3 jeudi dernier (79 après consolidation), aujourd'hui elle est à 83,6. Image
Deux mois séparent ces deux cartes. ImageImage
Image
Pour les intervalles utilisés dans la légende : les 4 du milieu sont basés sur les valeurs de SPF, j'ai rajouté les deux extrêmes ("moins de 1" et "plus de 100") pour distinguer le degré de catastrophe dans le rouge et parce que "moins de 1" reflète un objectif de suppression.
Au début de la deuxième vague, on dépistait 3x moins qu'aujourd'hui, donc quelques départements seraient sûrement passés à la couleur du dessus avec les standards actuels.

3 départements dépassaient le seuil de vigilance, 2 celui d'alerte. Aujourd'hui, c'est 48 et 54.
Sur le point hebdo SPF.

Le R sur test a encore baissé, à 1,1. Passage de relais au R hospitalier en forte croissance, à 1,4.

santepubliquefrance.fr/maladies-et-tr… Image
Avec, toujours, ce bémol que les instruments se brouillent à cause des délais de remontée, notamment en IDF, PACA et ARA : Image
C'est rageant, si ces imbéciles avaient alerté la population dès la mi-juillet, on aurait pu au moins ralentir l'épidémie et éviter si facilement de se retrouver dans cette situation où ils avaient laissé du virus se répandre partout avant la rentrée et l'automne…
Il semble en tout cas y avoir eu un ralentissement global de la mi-août à la première semaine de septembre. L'IDF est la seule région dont le R tests est passé sous 1 cette semaine (0,9), la PACA est en plateau à 1. Toutes les autres étaient encore en croissance exponentielle.
Comme d'habitude, délais de remontée obligent, il y a un faux plat ou une fausse descente sur les derniers jours (il peut manquer plus de 10% de la valeur). Image
Le dépistage est reparti à la hausse, mais sature toujours. Impossible de suivre le rythme de l'exponentielle. Image
La diffusion dans toutes les classes d'âge supérieures se poursuit.

germain-forestier.info/covid/heatmaps… Image
L'aboutissement de ce processus dans les Bouches-du-Rhône. Image
La part des plus de 60 ans dans les tests positifs continue d'augmenter. Plus de 1000 seniors sont testés positifs chaque jour. Et ça augmente plus vite chez les plus de 80 ans que chez les 60-79 ans, sans doute parce que les Ehpad exposent. Image
Le taux de positivité est en baisse sous 20 ans. Sans doute dû à l'augmentation récente du nombre de tests (rentrée) : plus on teste d'asymptomatiques sans ciblage, plus le taux de positivité est censé baisser puisque la prévalence en population générale est inférieure. Image
Cette baisse chez les moins de 20 ans explique peut-être la récente stagnation du taux de positivité, à 5,4% :

L'exponentielle hospitalière poursuit son ascension. La moyenne des nouvelles hospitalisations et entrées en réanimation a doublé en 14 jours. Image
À noter qu'il y a eu une bizarrerie hier dans les chiffres du Val d'Oise au niveau des hospitalisations (+77) et décès (+19) : soit un bug, soit un arriéré de données. Les chiffres réels sont donc sûrement un poil plus bas, mais ça ne change rien au panorama d'ensemble.
Le tableau depuis fin février. Image
Ces dernières semaines, il y a de plus en plus de cas symptomatiques en proportion (58% cette semaine). L'information était disponible pour plus des trois quarts des cas cette semaine. Image
Les Ehpad prennent l'eau.

« En S37, une forte augmentation du nombre de clusters [en Ehpad] a été observée avec 68 clusters signalés (vs 37 en S36). Au total, 302 clusters ont été signalés (94% en métropole) incluant 3 735 cas. » Image
Une focalisation intéressante sur le sport. Image
Cette semaine, on a le droit en bonus à une estimation de la séroprévalence sur la base d'échantillons aléatoires. Et cette fois-ci, contrairement à ce qui avait été publié le 9 juillet, les résultats font sens.

Ils disent préparer une "publication détaillée globale".
Sans surprise et en phase avec toutes les autres séros européennes, seule une petite fraction de la population (4,9% — intervalle de 4,0 à 5,9%) avait développé des anticorps en semaine 20, à la mi-mai (ce qui renvoie à l'état de l'épidémie fin avril).
Ici, la répartition par âge : Image
Par région : Image
On ne sait toujours pas d'où viennent la plupart des cas, donc le dispositif de traçage ne fonctionne pas. Image
Conclusion : c'est toujours mauvais. Image
Sur la "stratégie" (on comprendra le droit aux guillemets), il est maintenant clair qu'on est dans le laissez-circuler tant que l'hôpital ne déborde pas trop.

Mais en fait, c'est pire que la Suède, car la Suède avait quand même réussi à mettre le R sous 1. Ils avaient laissé plein de gens s'infecter pour rien en mettant des plombes à descendre, mais au moins ils étaient descendus. Là, on grimpe et ce n'est pas contrôlé.
Macron est revenu à son état d'esprit du 7 mars — la vie continue, allez au théâtre. Il refuse les restrictions nécessaires. Lorsqu'il dit "il faut laisser les gens vivre", on entend : "il faut laisser les gens s'infecter, et tant pis pour la casse".
Fermer les bars et restaurants quand ça flambe, c'est la base, non seulement parce que ce sont des lieux de contacts à haut risque (pas de distance autour de la table, pas de masques) mais parce qu'on ne peut rien tracer là-dedans. Si on ne fait même pas ça…
Même l'australopithèque trumpiste qui gouverne la Floride avait refermé les bars pour maîtriser leur deuxième pic cet été. Macron est plus laissez-fairiste qu'un gouverneur trumpiste… c'est dire le niveau de refus d'intervention où il est rendu.
La seule rationalité que je comprends, de sa part, c'est qu'il espère prendre la vague de front en stabilisant l'épidémie sur un plateau élevé, avec le minimum de mesures nécessaires pour cela ; et puis démerdez-vous avec le virus ("il faut vivre avec").
Israël a tenté de procéder ainsi. Le plateau a tenu un mois, et puis c'est reparti à la hausse et maintenant ils sont reconfinés.

« Le Conseil scientifique, mais aussi la cellule de crise du ministère de la Santé, et Olivier Véran, ont perdu cette fois-ci, et définitivement probablement, tous les arbitrages. »

liberation.fr/france/2020/09…
Le taux d'incidence (toujours sur 7j et pour 100 000 habitants) en Israël était à 220 lorsqu'ils ont décidé de reconfiner. La Guadeloupe est à 260, les Bouches-du-Rhône sont à 210.

La valeur pour les métropoles en tête (capture d'écran du point presse de Véran aujourd'hui) : Image
Marseille, qui devrait être sous un régime de restrictions dur depuis un mois, est à 279 (189 pour les 65+ ans !). Leur seuil d'alerte est bientôt crevé par un facteur 6, les vieux font du surf viral et ils ne ferment même pas le minimum du minimum syndical. Image
Le taux de positivité en Guadeloupe est à plus de 20%. Le préfet a fermé un certain nombre de lieux, mais il ne ferme les bars, restaurants et cafés qu'à partir de 22h en semaine, sauf minuit de jeudi au samedi inclus. Image
Véran a dit : « Dans les territoires pour lesquelles des mesures fortes ont déjà été prises, particulièrement Marseille et la Guadeloupe, si la situation sanitaire ne s'améliore pas, (…) il faudra sans doute prendre des mesures encore plus fortes. »

Et là, avec leur pari du plateau comme avec les mesures prises lundi par les préfets, il va ENCORE falloir attendre pour voir ce que ça donne.

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inspq.qc.ca/sites/default/…Image
L'étude s'appuie sur 2 questionnaires :

a) le questionnaire électronique, avec 21 518 répondants et un taux de réponse bas (6%)
b) le questionnaire téléphonique, avec 4995 répondants et un taux de réponse beaucoup plus élevé (69%)
Les échantillons :

Questionnaire électronique :
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42,5% présentaient au moins une comorbidité

Questionnaire téléphonique :
79% de femmes
Âge moyen : 42,4 ans
41,5% présentaient au moins une comorbidité
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Oct 3
[S39-2024] Point hebdomadaire sur les infections respiratoires du 23 au 29 septembre 2024.

Activité C*vid stable ou en légère hausse sur les indicateurs ville/hôpital, pic possiblement atteint. Image
Niveau national de SARS-CoV-2 dans les eaux usées en S39

2022 : 7115
2023 : 7570
2024 : 6200 Image
[Note : la moyenne nationale des ~20 dernières semaines a été pas mal changée (sur le niveau absolu, pas la tendance) par l'inclusion de 42 stations supplémentaires. Je laisse momentanément les anciens chiffres sur 12 stations tels que donnés dans le bulletin SPF.]
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Sep 4
Ça fait 2 ans que je demande chaque semaine aux gens ici s'ils ont eu le début des symptômes d'une infection respiratoire. Fil sur les résultats. Graphique des réponses au sondage "Avez-vous eu le début des symptômes d'une infection respiratoire (ex. angine, Covid, grippe, rhume, etc.) cette semaine ?" évoluant en parallèle au taux d'incidence des consultations pour infection respiratoire aiguë (réseau Sentinelles)
Entre septembre 2023 et la semaine dernière, j'ai obtenu en moyenne ~580 votes.

Les réponses ont continué à tracer une courbe épidémique proche de celle des consultations pour infection respiratoire aiguë chez les médecins généralistes (réseau Sentinelles).
Par saison (l'automne démarrant au 1er septembre, l'hiver au 1er décembre, 1e printemps au 1er mars, l'été au 1er juin) :

Entre les 2 années, pas de différence particulière sur l'automne et l'hiver, où les 3 vagues d'infections respiratoires suivent les rentrées scolaires. Avez-vous eu le début des symptômes d'une infection respiratoire  (ex. angine, Covid, grippe, rhume, etc.) cette semaine ?  % oui (moyenne par saison)  Automne 2022	28,4 Hiver 2022-2023	26,6 Printemps 2023	19,5 Été 2023	14 Automne 2023	25,8 Hiver 2023-2024	23,9 Printemps 2024	18,6 Été 2024	16,6
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