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Jul 8, 2021 17 tweets 5 min read Read on X
Estoy leyendo el artículo (#preprint) que acaba de publicarse sobre el origen del #SARSCoV2. Es una excelente recopilación de la evidencia disponible sobre el caso 👉🏻zenodo.org/record/5075888…
Voy a comentar los aspectos más relevantes en un 🧵
1/n Tenemos en primer lugar un análisis espacio-temporal de los primeros casos y un análisis filogenético de las primeras secuencias disponibles 👇🏻 Image
2/ En el análisis filogenético vemos dos linajes claramente diferenciados ya en las primeras semanas. Eso es dificil de explicar por escape de laboratorio, y más bien apunta a más de un evento de "spillover" de animal a humano (zoonosis 1:escape 0).
3/ El análisis espacio-temporal destaca que el surgimiento de casos se agrupa en torno a los mercados "humedos" y no al laboratorio del WIV. (zoonosis 2:escape 0)
6 (cont)/ El riesgo de escape asociado a la secuenciación de muestras víricas (la mayor parte del trabajo del WIV en este tipo de virus era de esa naturaleza) es negligible ya que las muestras se inactivan previamente a analizarlas (zoonosis 4: escape 0).
7/ Los datos de seguimiento clínico, analítico y epidemiológico del personal del WIV (incluyendo el del equipo de la Dra Zheng-Li) descartan que hubiera ninguna infección por virus relacionados con el SARS-Cov2 antes de diciembre de 2019 👇🏻 Image
8/ No hay rastro en el WIV de actividad alguna de experimentos de "ganancia de función" con virus similares al SARS-CoV2, que en aislamiento convencional pierden un sitio clave, lo que obliga a desarrollar genetica reversa, de lo cual tampoco hay rastro... 👇🏻 Image
9/ No solo no hay rastro, sino que tampoco hay lógica alguna: de hacer ese tipo de experimentos, no se emplearía un virus desconocido hasta el momento, precisamente por carecerse de conocimientos básicos sobre él (zoonosis 5: escape 0).
10/ Suponiendo un escape de cualquier tipo, antes de diciembre de 2019 no tendría sentido haber ocultado estas investigaciones. 👇🏻 Image
11/ Es imposible que el virus surgiera de experimentos in vivo con roedores: el virus ha de adaptarse para ello mutando la posición N501Y. Esta mutación se ha producido en numerosas variantes durante la pandemia, pero no estaba presente al principio 👇🏻 Image
12/ Durante la pandemia el virus ha ido "afinando" su dominio de unión al receptor ACE-2 mediante mutaciones, asi que lo de que está "manipulado" para "humanizarlo" va a ser que no (zoonosis 6: escape 0) 👇🏻 Image
13/ Además, SARS-CoV2 es bastante "generalista", ya que es capaz de infectar no solo a humanos, sino a un buen número de especies de mamíferos, con lo cual eso de que esta "pre" adaptado a humanos no tiene ningún sentido (zoonosis 7: escape 0) 👇🏻 Image
14/ Lo del sitio de procesamiento por furina tampoco es nada del otro mundo ya que multitud de coronavirus lo portan. Por lo tanto es perfectamente natural y evolutivamente comprensible que SARS-CoV2 lo lleve también 👇🏻 Image
15/ Además, el sitio de procesamiento por furina del SARS-CoV2 es de un diseño más bien pobre comparado con otros sitios análogos en otros coronavirus. Es poco realista pensar que ese pobre diseño obedezca a una manipulación artificial con una finalidad concreta 👇🏻 Image
16/ Por todo lo anterior, la explicación más plausible es el origen zoonótico del virus, que gana por goleada a la alternativa del escape, que de hecho, cuenta con 0 ("cero") evidencias en su favor 👇🏻
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Y fin del hilo.

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Apr 13
First identification of Crimean-Congo Hemorrhagic fever virus genome in ticks colleted from cattle in Corsica, France. This finding helps to better understand previous findings on #CCHF in Western Europe. Thread 🧵 Source: https://www.google.com/url?sa=i&url=https%3A%2F%2Fwww.flickr.com%2Fphotos%2Fhj_cuper%2F10534000145&psig=AOvVaw3-ft8Z4e36Ly7JyZIKdbcU&ust=1713071655993000&source=images&cd=vfe&opi=89978449&ved=0CBQQjhxqFwoTCIjBrL63voUDFQAAAAAdAAAAABAE
2/16 - After the detection of CCHF human cases in Spain (12 cases since 2013) the interest on this disease had grown in this country and neighboring ones. Different lines of evidence support a continuous circulation of CCHFV in certain local spots in Western Spain
3/16 - On one hand, evidences from ticks support 1) the presence of suitable vectors in affected areas; 2) CCHFV genome repeatedly found in tick vectors. Moreover, genome analysis point out to several independent introductions in Spain, likely from Africa.
Read 18 tweets
Feb 8, 2023
Esta mañana he respondido con un 🧵a una pregunta de @Fre_CP () sobre la singularidad de los brotes de gripe aviar en mamíferos que estamos viendo recientemente. Como el hilo no quedo muy bien lo reproduzco más ordenado aqui 👇
El virus H5N1, desde que apareció en Hong Kong en 1997 siempre ha sido capaz de infectar mamíferos, entre ellos humanos. Lo que es nuevo es la enorme diseminación que ha alcanzado este virus en el mundo, afectando a cientos de millones de aves (2/n)
Esta "novedad" multiplica las posibilidades de spillover a mamíferos, y por tanto las oportunidades de adaptación a éstos. Brotes como el de los visones de Galicia muestran que algunos de estos intentos resultan en virus que eficazmente se transmiten entre mamiferos (3/n)
Read 9 tweets
Nov 6, 2022
Empezamos el domingo traduciendo el mini-hilo que tuiteé ayer, porque me parece que puede tener interés para la audiencia hispanohablante de esta cuenta. Vamos allá (1/10) 🧵
Se trata de unos comentarios al siguiente hilo de @dfocosi () sobre la evolución de SARSCOV2, con información importante sobre lo que depara el futuro (2/10)
Primero mostraré algunas de las imágenes del propio autor, -Daniele Focosi- extraidas del hilo mencionado. La primera representa todas las variantes recientes -Omicron- identificadas hasta ahora, relacionadas entre sí por las mutaciones que las originan (3/10) 👇 Image
Read 10 tweets
Aug 5, 2022
Segundo caso de fiebre hemorrágica de Crimea-Congo en el Bierzo (León) este año. Este segundo caso (varón, 51 años) fue diagnosticado retrospectivamente en julio tras fallecer un mes antes por causa desconocida
#FHCC #CCHF
👇
redaccionmedica.com/secciones/mini…
Información completa de los casos más recientes en España. via @sanidadgob 👇sanidad.gob.es/profesionales/…
"Entre 2013 y 2022 se han confirmado un total de 12 casos (4 mortales) en España: 1 en 2013 en Ávila, 2 en 2016 (1 Ávila y otro 2º a éste en un sanitario), 2 en 2018 (Badajoz y Salamanca), 3 en 2020 (Salamanca), 2 en 2021 (Salamanca y Bierzo -León-) y 2 en 2022 en Bierzo -León-"
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