“La vaccination est inutile, vous avez vu ce qui se passe en Israël ?"
Un fil explicatif.
🧵
1/21
Ici 🔽 on a calculé le nombre de nouveaux cas à chaque pas de temps dans des situations simplifiées (couverture et efficacité vaccinale comme paramètres).
En fait vous avez posé la formule pour calculer Rt le taux de reproduction effectif. Et oui!

2/
Vous êtes prêt.e.s ?
3/
Souvenez-vous (1/2):
Scénario 1 sans vaccin, Rt était égal au taux de reproduction de base R0= 6
Scénario 2 avec 70% de vaccinés avec un vaccin efficace à 100%, Rt=1,8
Scénario 3, avec 70% de vaccinés avec un vaccin efficace à 80%, Rt=2,6
4/
(2/2)
Pour obtenir le nombre de nouveaux cas en T1, vous avez multiplié le nombre de cas en T0 par Rt. Idem pour passer de T1 à T2, etc.
On avait postulé que la contagiosité d’1 personne contaminée était identique qu’elle soit vaccinée ou pas.
On continue sur ces paramètres.
5/
Donc, cette formule pour calculer Rt, vous l’avez??
6/
En fait, la voici:
Rt= R0 x (proportion de personnes susceptibles)
c’est-à-dire
Rt= R0 x (taux échec vaccin x proportion vaccinés + proportion non vaccinés)
7/
Imaginons à présent quelques variations du scénario 3 (efficacité vaccin 80%), mais avec des couvertures vaccinales de 50% (a) et 90% (b) au lieu des 70% initiales. Les Rt correspondants sont donc:
8/
3a) Rt= 3,6= R0x(0,20x0,50+0,50)
3b) Rt= 1,7= R0x(0,20x0,90+0,10)
Rt est >1, même avec une couverture vaccinale élevée (ce qui signifie que le virus circule).
9/
Dans la vraie vie, nous ne faisons pas que vacciner. Les personnes immunisées, après avoir risqué les complications de la maladie & participé à la diffusion du virus, réduisent la proportion de personnes susceptibles, mais sans être assez nombreuses pour faire passer Rt< 1.
10/
Supposons que 30% de la population a été immunisée naturellement. Alors on multiplie Rt par (1-0,3= 0,7). On obtient
3a) Rt= 2,5= 0,7x3,6
3b) Rt= 1,2= 0,7x1,7
11/
Il y a aussi les NPIs (Non pharmaceutical Interventions visant à réduire nos contacts et/ou leur risque associé (Ref 1). On pense bien sûr masques mais pas seulement: gestes barrière, télétravail, isolement des personnes testées +, entre autres.
en.wikipedia.org/wiki/Non-pharm…
12/
Par exemple, si on décide de strictement diviser par 2 nos interactions sociales, cela revient à multiplier Rt par un facteur 0,5 :

3a) Rt=1,3 =2,5x0,5
3b) Rt=0,6 =1,2x0,5
13/
Ca va, vous suivez ?
14/
Mais si dans le scénario (3a) on réduit nos contacts non plus de 50% mais de 75% :
3a) Rt=0,6 =2,5x0,25
3b) Rt=0,6 =1,2x0,5

Oui, Rt= 0,6 comme dans le précédent scénario.
15/
Conclusion: 1er scénario - couverture vaccinale 50%, 75% d’interventions non pharmaceutiques (masques, réduction de contacts), on aboutit à 1 vitesse de circulation identique au 2nd scénario avec 1 taux de vaccination bien plus élevé- 90% mais 1 réduction de contacts moindre.
16/
On voit donc par ces calculs assez simples que gestes barrière, télétravail, masques et vaccination sont complémentaires. C’est le concept de l'Emmental.

17/
Vacciner permet de lever les interventions non thérapeutiques, mais avec précaution. C’est le problème d'Israël : les avoir levées suite à un bon démarrage de la vaccination, et se faire rattraper par le variant Delta.
18/
Donc non ce n’est pas incroyable ce qu’il se passe en Israël, c’est en fait facilement explicable avec une calculette et un peu de réflexion.
Et ce fil ne fait qu’expliquer de manière différente ce que dit @Emmanuel_microb ici :

19/
Ce fil vous a-t-il été utile ?
20/

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14 Sep
Souvenez-vous, il y a quelques mois on s’est intéressé à la (trop) méconnue rubéole.
Tournons-nous à présent vers un virus que vous connaissez toutes et tous, vous l’avez déjà croisé. Lui aussi est plein d’enseignements sur la situation actuelle.
Allez c’est parti pour un 🧵
1/
Je suis un virus respiratoire, à fort taux de contagiosité avant même les premiers symptômes. Je me développe dans le sang et les viscères (phase asymptomatique), puis j’engendre fièvre, macules, papules et vésicules.
Je suis, je suis le virus de la
2/
Mais oui, bravo, vous avez deviné : il s’agit de VZV (varicella-zoster virus), également appelé HHV-3 (human herpesvirus 3) !
3/
Read 27 tweets
31 Aug
"Porter le masque et respecter les gestes barrière, tout ça nuit à la stimulation de notre système immunitaire."

Vraiment ?

C’est parti pour une petite remise en perspective !
🧶un peu cinéphile.
1/15
Le temps passe depuis le début de cette pandémie et certaines personnes s'inquiètent du fait que notre système immunitaire ne serait plus assez stimulé à cause des gestes protecteurs comme le masque, l'hygiène des mains, la distance physique…
2/
Faites-vous partie de ces personnes inquiètes pour leur système immunitaire ?
3/
Read 15 tweets
18 Aug
“Les vaccinés restent contagieux, ça prouve bien que la vaccination ne sert à rien !”

Vous l’avez vu cet argument et vous avez du mal à l’analyser, est-il totalement, partiellement vrai ou complètement faux ?
Allez, c’est parti pour un 🧶, même pour les nul.les en maths!
1/28
On va regarder l’évolution de l’épidémie du temps T0, à T1, T2 et T3 dans 3 scénarios.
Vous allez voir que ce n’est pas si compliqué.
2/
En mode twitter interactif avec quiz, déroulez !

En mode blog, c’est ici 🔽
citizen4science.org/les-vaccines-r…
3/
Read 28 tweets
11 Aug
Il y a actuellement des débats sur la fameuse immunité collective.
Alors on va faire un rappel de base ici 🧶
1/7
Comme dit dans ce fil, le but de la vaccination n'est pas d'arriver à X% d’immunité et on stoppe tout.
Le but est d’aller le plus haut et le plus vite possible pour amortir au mieux et aborder l'endémicité (vivre avec le virus) sereinement. 2/
Les débats actuels restent des discussions de spécialistes qui ergotent sur des points techniques, il n'en reste pas moins que tous s’accordent sur le fond de ce qu'il faut faire : vacciner le plus vite et le plus large possible.
Alors pourquoi tous ces débats? 3/
Read 7 tweets
10 Aug
Je reviens d'une journée famille & ouvre twitter. Le but de mon post à @lionel_case était de lancer une discussion ouverte & constructive sur un sujet qui m'est cher: la pharma & sa perception. La suite ne s'est pas passée comme prévu et je le déplore. 1/4
Je remercie @lionel_case lui-même et d'autres comme @AlizeeRenault , @aimeezun ou @rmontard de leurs messages. Ma raison d'être sur ce réseau a toujours été d'échanger sur mes domaines d'expertise. 2/
Je suis fière d'être employée de l'industrie pharmaceutique et j'ai toujours souhaité débattre des avantages et des inconvénients de cette industrie, mon but restant d'être pédagogique et vulgarisatrice: allez voir sur mon fil et vous verrez. 3/
Read 4 tweets
27 Jul
Parce que j’en ai marre des généralisations sur “BigPharma” (utilisez plutôt “industrie pharma” cf plus loin) et que je ne vois pas le lien fait souvent avec les "bénéfices des traitements précoces” (contre lesquels BigPharma se bat... forcément).
1/11
Parce qu’à un moment il va falloir comprendre qu’on peut tous bosser ensemble, académiques et privés, consultants et experts, en respectant les normes précises édictées par les agences régulatoires (qui doivent rendre des comptes et spoiler alert!! Elles le font)
2/
Pour le bien du patient.
Ouiiii je sais, BigPharma tout ça. Mais en même temps les industries pharma développent des médicaments, des traitements, des vaccins non?
3/
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