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@EllingUlrich
Feb 24, 2023 • 4 tweets • 3 min read • Read on X
🇦🇹 Representative genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Austria week 8, 2023 across all regions. Current analysis includes samples until February 15th allowing faithful nowcasting. A collaboration of #AGES @agesnews and @IMBA_Vienna/@oeaw.
1/4 Image
XBB.1.5 continues to grow and makes up ~60% of cases now in nowcasting. Shown here are the relative fractions within the total reported (!) cases.
2/4 Image
In quantitative sewage monitoring the situation looks very different. The level of detected SARS-CoV-2 appears to be near the values of last year at this time. Infection risk is thus very high currently and hospitalizations are also increasing.
3/4
 abwassermonitoring.at/dashboard/ Image
New and currently fast sublineages of XBB specifically detected in Austria are EG.1 (XBB.1.9.2 + S:Q613H; N:L219F) and EK.1 (XBB.1.5.13 + S:K417S).
Absolute numbers shown below per calendar week are still small and growth relative to XBB.1.5 is currently limited.
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Jan 6
Der Lebensmittelhandel fordert die Verhinderung der neuen EU Richtlinie zur Gentechnik. 🙈

Warum? Protektionismus! Produzenten werden so noch mehr an den Handel gekettet.

Und für VerbraucherInnen ist das eindeutig die schlechtere Lösung.
1/
 ots.at/presseaussendu…
Das Wichtigste zuerst: Die neue Gentechnik (CRISPR) erlaubt sehr kleine, punktuelle Mutationen und kann Züchtung durch radioaktive Bestrahlung (z.B. pink Grapefruit) ersetzen. Dabei verhindert sie ungewollte Mutationen und ist damit viel sicherer als konventionelle Verfahren.
2/
Ausserdem erlaubt Gentechnik Herstellung von Pflanzen die weniger empfindlich gegenüber Klimawandel (z.B. Trockenheit) sind, weniger Spritzmittel brauchen, oder sogar gesünder sind als konventionelle Produkte. Am Ende besser für Mensch und Umwelt!
3/
Read 13 tweets
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Nov 29, 2023
Danke, @abergthaler für das Abwasser Update! JN.1 Anteil verdoppelt sich international jede Woche, Proben vor 2 Wochen zeigen hier ~10%, wir könnten also schon in der nächsten Woche JN.1 Dominanz in 🇦🇹 erreichen. Dann ist noch Luft nach oben in der Welle🥴
So frühe Dominanz von JN.1 hat weitreichende Konsequenzen.
- Es kommt nicht zu zwei Wellen vor und nach Weihnachten, sondern XBB und JN.1 kommt überlappend.
-auch RSV und Info beginnt
- Der Schutz der Impfung vor Ansteckung (nur!) ist schon ab Dezember deutlich herabgesetzt.
2/n
Nach 2 Jahren Original-Serotyp (bis und mit Delta) und 2 Jahren Omicron (2023 die XBB Rekombinante) beginnt nun also the Ära von Pirola. Pirola hat nochmal >30 Mutationen auf Omicron obendrauf und die Pirola Evolution geht gerade erst los. JN.1 ist nur der erste Sprössling. 3/n
Read 4 tweets
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Nov 28, 2023
Nun zeigt auch das wirklich gute Abwassermonitoring in Tirol ein deutliches Signal: Die Schätzung ergibt bis zu 4% der Bevölkerung Covid positiv. 1/n
tirol.gv.at/gesundheit-vor…
Image
Derweil haben wir national den Rekordwert an SARS-CoV-2 Konzentration im Abwasser erreicht. 2/n
abwassermonitoring.at/dashboard/
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Auch in Vorarlberg noch kein überzeugender Trend nach unten.


ABER: Viruslast im Abwasser ist NICHT GLEICH Krankheitslast im Land. Die Hoffnung wäre, dass diese Zweit- oder Mehrfachinfektionen sich nun nicht mehr so sehr auswirken.
3/n dashboard.vorarlberg.at/public-dashboa…
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Read 5 tweets
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Nov 18, 2023
Wir steuern auf eine der höchsten Covid-Wellen jemals zu.

Mit Ende der Rhino-Interferenz und Beginn der Kälte lange erwartet. Noch nicht von Pirola/JN.1 verursacht, wird aber auch kommen. Wir erwarten keine überfüllten Intensivstationen, aber sonst das Übliche... 1/2 Image
Selber Trend in mehreren Europäischen Ländern soweit Daten vorhanden. Wäre jetzt halt klug i) frisch geimpft zu sein ii) Maske zu tragen iii) Rücksicht zu nehmen.

Zur Erinnerung: Für Geimpfte gab es de facto keine Erstinfektion. Nein, Corona ist kein Schnupfen. 2/2
PS: z.B. Schweiz:
Read 5 tweets
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Mar 31, 2023
🇦🇹 After 114 next generation sequencing runs without a single failed one and a total of 217 302 successfully sequenced SARS-CoV-2 samples this is the final SARSeq report for Austria. The pipeline was a very successful partnership of academia and the state of Austria.
1/
Set up within 2 weeks with @Lcochella, @yelagandula_ram and others in response to Alpha , @IMBA_Vienna/@oeaw, @IMPvienna, and the Austrian Agency for Health and Food Safety @agesnews provided a great example of how science can contribute to society and emergency response.
2/
The pipeline circumvents NGS library generation steps and runs at a fraction of costs of standard sequencing. It was empowerd by the great service facilities on campus, foremost MolBio and VBCF ProTech and NGS. Thank you!!
cores.imp.ac.at/molecular-biol…
viennabiocenter.org/vbcf/
3/
Read 22 tweets
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Mar 17, 2023
🇦🇹 Representative genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Austria week 11, 2023 across most regions. Current analysis includes samples until March 9th allowing faithful nowcasting. A collaboration of #AGES @agesnews and @IMBA_Vienna/@oeaw.
1/6
With 2688 successfully sequenced samples this week Austria still has a remarkably good overview over the pandemic and become an international role model in surveillance.
2/6
Austria is past the XBB.1.5 peak and also EG.1 (a.k.a. XBB.1.9.2.1) will not mount another peak here. But we detected another two cases of XBB.1.16, which deserves close monitoring as only the latter, but not XBB.1.5, appears to result in growing incidences in India.
3/6
Read 6 tweets

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