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En #bioinformática se utilizan ficheros 💾 en formato estándar para unificar los resultados. Muchos de estos ficheros derivan de la aplicación de las técnicas de secuenciación nucleotídica 🧬.Abrimos 🧶👇 para describir algunos ejemplos, que no son todos (1/9) @scbi_uma @InfoUMA
El resultado de los procesos de secuenciación se muestran en ficheros tipo 'file.fastq'. Éstos tienen una estructura muy establecida, incorporando tanto la secuencia como la calidad de los nucleótidos secuenciados (fuente: en.wikipedia.org/wiki/FASTQ_for…) (2/9).
Los ficheros file.fastq son la entrada para otros muchos algoritmos, como los algoritmos de ensamblaje, de genomas o transcriptomas. El resultado de aplicar estos algoritmos devuelve un fichero 'file.contig.fa' que contiene, en formato fasta, los contigs reconstruidos (3/9)
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