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Most recents (10)
Sur les cas de #variole #simesque (#MPXV) détectés de par le monde, quelques réflexions d'épidémiologie, de modélisation et d'évolution de l'équipe.
Car, pour le moment, ce sont surtout les #génomes viraux qui apportent des indications !
ecdc.europa.eu/en/news-events…
1/N
Car, pour le moment, ce sont surtout les #génomes viraux qui apportent des indications !
ecdc.europa.eu/en/news-events…
1/N
Sans entrer dans les détails, ces infections sont causées par un (gros) #virus à #ADN.
Pour des détails cliniques et thérapeutiques, @MarcGozlan a un post très détaillé en #acceslibre 👇
lemonde.fr/blog/realitesb…
2/N
Pour des détails cliniques et thérapeutiques, @MarcGozlan a un post très détaillé en #acceslibre 👇
lemonde.fr/blog/realitesb…
2/N
Les épidémies de #MPXV sont beaucoup étudiées par les modélisateurs car elles ont, habituellement, un #R0<1. Autrement dit, on s'attend à ce qu'elles régressent vite.
Notre collègue @jlloydsmith les a beaucoup analysées :
journals.plos.org/ploscompbiol/a…
3/N
Notre collègue @jlloydsmith les a beaucoup analysées :
journals.plos.org/ploscompbiol/a…
3/N
#groepsimmuniteit betekent dat er genoeg mensen immuun zijn waardoor er geen grootschalige verspreiding meer kan plaatsvinden
je gebruikt de R0 om de immuniteitsgraad te berekenen die nodig is om groepsimmuniteit te bereiken
#R0 van #DeltaVariant = geschat tussen 5-7
1/n
je gebruikt de R0 om de immuniteitsgraad te berekenen die nodig is om groepsimmuniteit te bereiken
#R0 van #DeltaVariant = geschat tussen 5-7
1/n
de immuniteitsgraad die je dan nodig hebt = 1 - (1/R0)
Met een R0 van 5-7 moeten dus 80-86% van de mensen immuun zijn wil je grootschalige verspreiding tegengaan
Die 80-86% moet ook nog eens homogeen (netjes/eerlijk) verdeeld zijn over de bevolking
2/n
Met een R0 van 5-7 moeten dus 80-86% van de mensen immuun zijn wil je grootschalige verspreiding tegengaan
Die 80-86% moet ook nog eens homogeen (netjes/eerlijk) verdeeld zijn over de bevolking
2/n
Echter, de vaccins hebben tegen milde infectie met de #COVID19 #DeltaVariant een effectiviteit van ~65%
vaccinatiegraad is niet hetzelfde als immuniteitsgraad
en al zou 100% van de 🇳🇱 bevolking zich laten inenten: daar bereik je geen #groepsimmuniteit mee
3/n
vaccinatiegraad is niet hetzelfde als immuniteitsgraad
en al zou 100% van de 🇳🇱 bevolking zich laten inenten: daar bereik je geen #groepsimmuniteit mee
3/n
Le #variant #B117 de #SARSCoV2 détecté outre-Manche fait la une.
Des modèles de fin Déc suggèrent que son R0 est plus de 50 % supérieur aux autres variants.
Cause ou conséquence ? Le variant s’est-il fixé « par hasard » ou de par son avantage ?
On en sait un peu plus.
1/N
Des modèles de fin Déc suggèrent que son R0 est plus de 50 % supérieur aux autres variants.
Cause ou conséquence ? Le variant s’est-il fixé « par hasard » ou de par son avantage ?
On en sait un peu plus.
1/N
Le #variant #B117 a été détecté car 25 % des tests #PCR britanniques ont 3 cibles dans le génome viral et, pour le #B117, 2 sur 3 sont positives. Mais seul le séquençage permet d’être sûr.
Selon @PHE_uk, en Oct, 3 % des tests douteux étaient liés à #B117, en Déc > 95 %
2/N
Selon @PHE_uk, en Oct, 3 % des tests douteux étaient liés à #B117, en Déc > 95 %
2/N
Les analyses préliminaires de @cmmid_lshtm montrent que ce #variant s’est propagé rapidement dans des régions mais pas dans d’autres.
Les données de mobilité ne semblent pas expliquer ces différences. L'avantage de #B117 serait alors de 50 à 74 %.
cmmid.github.io/topics/covid19…
3/N
Les données de mobilité ne semblent pas expliquer ces différences. L'avantage de #B117 serait alors de 50 à 74 %.
cmmid.github.io/topics/covid19…
3/N
Comment pourrait évoluer la #virulence du #SARSCoV2 pour l'homme ?
Quelques éléments de réponse dans ce #thread.
Pour des détails, il y a notre Rapport 12 du mois d'août :
covid-ete.ouvaton.org/Rapport12.html
1/N
Quelques éléments de réponse dans ce #thread.
Pour des détails, il y a notre Rapport 12 du mois d'août :
covid-ete.ouvaton.org/Rapport12.html
1/N
La #virulence est le mal qu’un parasite (virus, bactérie,...) fait à son hôte.
Dans le cas du #SARS-CoV-2, on peut la mesurer via le risque d’être hospitalisé ou de décéder. Sachant que cela dépend fortement de l’âge.
thelancet.com/journals/lanin…
2/N
Dans le cas du #SARS-CoV-2, on peut la mesurer via le risque d’être hospitalisé ou de décéder. Sachant que cela dépend fortement de l’âge.
thelancet.com/journals/lanin…
2/N
Contrairement à une idée répandue, les parasites n’évoluent pas tous pour rapidement devenir avirulents.
La #tuberculose est restée virulente.
Quand au #VIH, sa virulence semble même avoir #augmenté depuis les années 1980.
thelancet.com/journals/lanhi…
3/N
La #tuberculose est restée virulente.
Quand au #VIH, sa virulence semble même avoir #augmenté depuis les années 1980.
thelancet.com/journals/lanhi…
3/N
Will Slovakia avoid „Czech scenario“?
Health minister #marekkrajčí 16.10. first time publicly compared the second wave COVID-19 trends in Slovakia and Czech republic in a chart showing that Slovakia is following the scenario in Czech republic with a delay of 2~3weeks.:
Health minister #marekkrajčí 16.10. first time publicly compared the second wave COVID-19 trends in Slovakia and Czech republic in a chart showing that Slovakia is following the scenario in Czech republic with a delay of 2~3weeks.:
Trend chart from few days ago (22.10.) was even worse and clearly showing that Slovakia is repeating the Czech scenario:
Somewhere here we should be looking for motivation of the government in Slovakia and prime minister #igormatovič to solve the problem of rising second wave of epidemics and dark vision of collapsing health care by unusual way - #masstesting in combination with limited lockdown.
La valeur du #R0 (nombre de reproduction de base) n'est pas spécifique à un agent infectieux. Elle a deux composantes, l'une biologique et l'autre sociale. Pour plus de détails sur son calcul, voir notre note covid-ete.ouvaton.org/Note_R0.html 1/6 thread
Toutes choses étant égales par ailleurs, plus un virus cause des infections longues, plus il survit longtemps dans l’environnement extérieur, plus les personnes infectées on des virémies élevées, plus le #R0 est élevé. C'est la dimension biologique (ou virologique). 2/6
On parle beaucoup du développement des #vaccins contre le #SARSCoV2 pour prévenir le #COVID19 mais peu de leur mise en place. Cela relève beaucoup du champ scientifique qu’est la dynamique des populations. 1/8 thread
Certains vaccins peuvent être thérapeutiques mais, le plus souvent, comme pour le #COVID19, ils sont à but prophylactique (pour empêcher l’infection). Vous pouvez alors avoir deux cibles : protéger les personnes les plus à risque ou éteindre l’épidémie. 2/8
5 paramètres entrent en jeu : le nombre de reproduction de l’épidémie #R0, l’efficacité de protection du vaccin (P), la fraction de la population vaccinée ou "couverture vaccinale" (C), le risque individuel à la #vaccination (V) et le risque individuel lié à l’infection (I) 3/8
107 Infizierte in Folge eines Gottesdienstes in Frankfurt!! spiegel.de/panorama/coron…
Eine eindrückliche Meldung, die gut zum Thema meines verlinkten Threads passt– die sehr heterogene #Ansteckungsrate von #Coronavirus #SARSCoV2 #COVID19! Ein paar Worte dazu jetzt auf deutsch!
1/15
Eine eindrückliche Meldung, die gut zum Thema meines verlinkten Threads passt– die sehr heterogene #Ansteckungsrate von #Coronavirus #SARSCoV2 #COVID19! Ein paar Worte dazu jetzt auf deutsch!
1/15
In dem langen, sehr guten (aber englischen) Thread von @kakape und auch in dem dort genannten ausgesprochen interessanten Manuskript (covid.idmod.org/data/Stochasti…) geht es in erster Linie darum, wie ungleichmäßig sich das aktuelle #Coronavirus ausbreitet und was das bedeutet.
2/15
2/15
In knappen Worten: der #R0-Wert einer Infektion gibt an, wieviele Personen jeder Infizierte IM MITTEL ansteckt. Die Zahl verändert sich im Lauf einer Epidemie (durch #Maßnahmen aber auch durch zunehmende #Immunität) und heisst dann Rt. Für #SARSCoV2 ist R0 grob 2,5.
3/15
3/15
As said in the article, I am keen to engage in a meaningful and constructive dialogue on #COVID19SWEDEN, based on science... so lets explore some of the science in the points raised. svd.se/brittisk-exper… via
@SvD
@SvD
1. The role of #asymptomatic and #presymptomatic transmission. As previously Tweeted, there are clear examples of #asymptomatic transmission... including through non-household contact: #communitytransmission nejm.org/doi/10.1056/NE…
2. Here is a pre-print of a review which reports multiple examples: medrxiv.org/content/10.110… (as always, caution with pre-prints, but the take home here is there are several published examples)
1/n
What I've learned about #COVID19:
1. We don't want it. It has a death rate 10 to 20X that of flu. It is on average as bad as the 1918 #H1N1 strain in death rate
2. It is highly infectious. The #R0 is 2 or greater without countermeasures
What I've learned about #COVID19:
1. We don't want it. It has a death rate 10 to 20X that of flu. It is on average as bad as the 1918 #H1N1 strain in death rate
2. It is highly infectious. The #R0 is 2 or greater without countermeasures
2/n
3. Humans shed the virus even before they have subjective symptoms and this period can last several days.
4. Most people who have symptoms have fever and dry cough.
3. Humans shed the virus even before they have subjective symptoms and this period can last several days.
4. Most people who have symptoms have fever and dry cough.
3/n
5. Even with a good test, some people have tested falsely negative on first test
6. My fellow Americans are culturally and politically focused less on medical science than on psychological projection in an attempt to avoid fear
5. Even with a good test, some people have tested falsely negative on first test
6. My fellow Americans are culturally and politically focused less on medical science than on psychological projection in an attempt to avoid fear
