Para combatir el #coronavirus es clave conocerlo más. Por eso la ciencia lo estudia desde varias disciplinas. Una es la biosimulación: el uso de modelos informáticos para describir y explorar estructuras y procesos biológicos. En este #hilo, aportes de @IPMontevideo y @ClusterUy
En particular, las simulaciones moleculares traducen datos biológicos en ecuaciones matemáticas que permiten crear imágenes por computadora de moléculas de virus, bacterias y células. Mirá el #ZikaVirus y las proteínas de su cobertura que lo ayudan a entrar en la célula humana
En la práctica, estas simulaciones permiten estudiar procesos biológicos ahorrando tiempo, ensayos en animales o humanos, y dinero. En el desarrollo de fármacos es útil para simular cambios en una molécula con potencial terapéutico y predecir sus efectos antes de producirla.
Ante el #coronavirus, la biosimulación analiza las proteínas que usa el virus para infectar y replicarse. En eso trabajan el Lab. de Simulaciones Biomoleculares de @IPMontevideo y @ClusterUy, y comparten la info con la comunidad científica internacional en una web abierta
Entre varios desarrollos, @IPMontevideo y @ClusterUy simularon la estructura y dinámica de “Mpro”, la principal proteína vinculada a la multiplicación del #coronavirus. Conocerla mejor ayuda a los expertos a hallar formas de bloquearla y evitar la propagación del virus, por ej.
También simularon el primer contacto entre el virus y la célula. Esto ocurre cuando la proteína "Spike" (naranja), ubicada en la superficie del virus, se acopla a una parte de la célula (receptor ACE2, violeta) para ingresar en ella, introducir su material genético y reproducirse
Las simulaciones creadas por @IPMontevideo y @ClusterUy están disponibles en esta web para ayudar a científicos a entender procesos o diseñar de fármacos. Pero en general, el resultado es visualmente atractivo y vale la pena curiosear. La pueden visitar en cluster.uy/blog/covid/
@ClusterUy es una plataforma de computación con un poder superior a 10.000 computadores, capaz de procesar datos en segundos. Es usada principalmente por investigadores del país y surgió con apoyo de @ANIIuy @Udelaruy @FundRicaldoni @AntelDeTodos @UTE_ComCorp #CSIC y otros
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