Thread by @Javisburgos

Visto el éxito de los hilos de los últimos días, he decidido proponeros un juego que no es, ni más ni menos, que una nueva #TurraPCR camuflada ¿os apetece jugar? Vamos pues

Esta es parte de mi biblioteca (podéis hacer zoom para saber lo que leo). Pongamos, por decir algo, que el número de letras que conforman todas las palabras de todos los libros que veis aquí es de 3.000 millones

Si os pregunto cuántas “e” o cuántas “d” hay en todos esos libros, convendréis conmigo en que deben ser muchísimas ¿verdad? Con seguridad tendremos muchos millones de “e” y de “d” en todos esos libros

Pero si combinamos ambas letras y buscamos la palabra “de” todos estaremos de acuerdo en que habrá muchas menos, seguramente cientos de miles o unos pocos millones

Si buscamos ahora una palabra corta, pongamos “casa”, el número de coincidencias bajará tremendamente. Así que parece que la idea está clara; cuanto más larga sea la palabra que busquemos, menos repeticiones habrá

Si probamos a buscar una frase más larga, por ejemplo: “Confía en el tiempo, que suele dar dulces salidas a muchas amargas dificultades”, pues lo más probable es que sólo encontremos una coincidencia entre los millones de frases de todos mis libros

Pues bien, la PCR es la técnica capaz de encontrar esa frase rápidamente entre todas las que hay en mis libros (sería algo así como el buscador de Word). Una vez la encuentra la copiará millones de veces (su fotocopiadora es la enzima que llamamos polimerasa)

Pero ¿cómo encuentra exactamente la frase entre todas las que hay en todos mis libros? Pues utilizando unas moléculas que se llaman cebadores (primers, en inglés). Los cebadores son las copias “en negativo” de ciertas partes de la frase que buscamos

Recordad que la secuencia de letras de una cadena de ADN (con las letras ATGC) se puede deducir de su copia en negativo (la A de una cadena se empareja siempre con la T de la otra, y la G con la C)

Para encontrar la frase exacta usaríamos dos cebadores diferentes. El primero buscaría todas las frases de mi biblioteca que empezaran exactamente con las palabras “Confía en el tiempo”. El segundo cebador buscaría frases que acabaran exactamente en “muchas amargas dificultades”

Con esta técnica encontraríamos todas las frases en mi biblioteca que empezaran por “Confía en el tiempo” y que acabaran en “muchas amargas dificultades”, y casi seguro encontraríamos solamente una

Si vosotros tenéis el mismo libro, que yo creo que sí, la PCR encontraría exactamente la misma frase en vuestra biblioteca, en el mismo libro y en el mismo capítulo

Pero pongamos que en vuestra edición hubiera habido un error tipográfico y vuestra frase fuera: “Confía en el Xiempo, que suele dar dulces salidas a muchas amargas dificultades”. Habríais encontrado entonces una mutación

En nuestro ejemplo, la biblioteca sería el genoma humano, pero… ¿y qué pasa con los virus? Un virus sería una secuencia de letras ajena a nuestra biblioteca y que introduciríamos en ella: sería como poner un post-it con un texto dentro de un libro al azar

Si sabemos el texto del post-it podríamos diseñar cebadores específicos de 20 o 25 letras para buscarlo. Y si hubiera muchos post-its con el mismo texto, entonces lo encontraríamos más rápidamente y en mayores cantidades

Pero… ¿y si el post-it estuviera escrito en otro idioma, pero sólo pudiéramos usar cebadores en castellano? Entonces el primer paso sería traducir los post-its al castellano antes de lanzar los cebadores a buscar

Este segundo ejemplo sería si el virus fuera de ARN, como los coronavirus, mientras que el primer ejemplo estaría escrito en idioma “ADN”, que es el mismo en el que están escritos mis libros y mis cebadores

Así que usando el ejemplo de mi biblioteca os he dado argumentos para que expliquéis a vuestros cuñados porqué la PCR tiene una especificidad tan alta

Jugando con el ejemplo podríamos explicar muchísimos conceptos de Biología Molecular, pero convendrán conmigo que ya he dado bastante la #TurraPCR para ser viernes. Buen fin de semana