Thread by @ramos262740691

【重大なお知らせ】
僕が3日前にTweetしたB.1.1.XはB.1.1.529となりました。大量の変異を持っていて、長い旅をしてきた感じのもの。
まだ登録されているシークエンスは10人分ですが、南アフリカの70kmも離れた位置、0歳児、そして香港(南ア滞在20日後帰国)の4例から始まり

僕はこのbloombergを誤報だと思いたい。
すでに100人のこの変異株によるものと推定される感染者(3日前に報告された株だぜ？？)。WHOは会合を開いた。
日本も中央は今集まってるでしょうか？集まってないなら終わりですが。bloomberg.co.jp/news/articles/…

100人の推定を述べているのはbloombergのみか。
まだ登録は10人だから焦る必要はないのかも知れません。冷静に冷静に。

僕は去年、企業名をあげてこんな粗悪抗原定性検査キットが承認されたのは明らかに利権だと(何だよあの「行政検体」)いい、その企業が同じく売っている

theguardian.com/world/2021/nov…

抗原定量検査に「わざわざこれまでやっていたPCR空港検疫を辞めて」国防を放棄したのは売国奴だ。変異株入れたいのか？自民党は反愛国者の集まりだと散々述べ、
2021/01/04の英国変異株日本に流入で「日本は終わった」とTweetしまくりました。

そして事実、二ヶ月後に大阪を中心に医療崩壊しました。

僕の今の焦り具合は、2021/01/04と同じです。

ファイザーワクチン免疫を無効化しむしろ悪化される+4覚えてますか？
K417N, (N440K), S477N, T478K, E484A, N501Y, D614G, P681H,
この大量変異株は少なくとも3つ持ってます(440が439相当になるか？)
幸運だったのはL452Rは持っていないこと。

つまり2nd impactは既に起こっていた可能性があります。

【日本政府、霞ヶ関で残業中の方へ】
絶対に入れないで下さい。
空港検疫をPCRに戻し、南ア、香港は例外なく着陸拒否。
お願いします。

こいつの感染力がどの程度か現実データはまだ出ていないし、まだこの大量の変異が弱毒化を産んでいる望みも残っていますが、
今まで知る限りの変異見地で言えば

完全にダメです。

@PeacockFlu
Thanks for Tom Peacock
彼が報告してくれたことに最大の感謝を。

南アのシークエンス数が少ないことはあるけど、おう……
3日前、まだ4例だけどと余裕こいててすいませんでした。マジで

NHK見てないけど日本もニュース流したの？
たぶん発見からニュースになる最速だよこれ(3日)。そして変異数が本当に多い

笑えるほど懸念しか出てこないし、世界中の研究者がTweetしだしたぞ。今日。
マジで待って。ちょっと待って。

今から官房長官の頑張りに期待。

+4と同じ変異が2つ以上の意味が分からない方へ
これ

なので僕の感想が現段階でこうなる

結局、言えることは
今世界に必要なのは「変異前株」の「発症予防」ワクチンではなく、「変異株対応」の「感染予防」ワクチンだよ
だけなのかも知れないな。サードショットではなく、変異株対応サードショットを。

もちろん、国防である水際対策強化は必要だけど、それだけで終わるものではない。

朝、普段は株や米国市場の話をしている友人から「オミクロン株（笑）」とLINE入ってて、はて？どこの会社かな…と思ry

WHOの動きも早い。
何度も言うけど、これシークエンス登録されたの11/23日、11/25にPango登録で529になり、11/26もうギリシャ文字当てられた。

つまり、シークエンスがまだ10例しか登録されてないくせに、
南アのハンデンなんとかって地域は90%コイツではないかと言われている(シークエンスが圧倒的に不足していて精度なしだが)
それがどうやら冗談ではないらしい雰囲気ってとこか。

日本シークエンス数増やして、空港検疫強化して。やること

たくさんです。

日常派、コロナ風邪派が「騒ぐな！」と騒いでますが懸念点は画像の通り。

今回の変異株、SgeneDropOutTestが効く。そこからあくまで懸念として拾うなら南ア、完全にδ駆逐された？可能性。
彼らの検査数が充分かがこの情報精度に関わります。

これまで検討されていない新変異が多いので、そこの影響が+か-か分からない。
でも検討済みの変異で言えば、K417N,N439K,E484K,N501Yこの4つをδに入れた場合、Pfizerワクチン接種者の20に1人しか生き残りません。抗体をむしろ悪利用するので。
実験と違いベースがδではないけど、K417N,N440K,E484A,

N501Y
E484AはE484K相当の懸念があるとされていたかと思います。
E484K:圧倒的に一部の免疫抗体C052辺りを回避。人は沢山の種類の抗体作るが新コロ排除の50%をC052辺りに頼っているのでE484Kは免疫回避強。
N440KはN439Kと同じ効果をもたらさないか？と懸念。
+4のうち、+3は持っていると見ていい。

僕が言っているのは、「ワクチン接種者はむしろ感染増大する変異」とあう悪夢はラボで実際作られたことがあり、それがδ+4で、
今回大量に変異した中にはこの+4に近いものがあるよ(幸いにもδが一部消えてるけど)です。

なので、残りの機能不明変異が弱毒化変異であることを祈るしかないね。が感想です

懸念ばっかり述べてもしゃーなし。空港検疫徹底！渡航制限各国で強化。SgeneDropOutテストで拾えるのだからやる。日本のシークエンスキャパあげる。
昨夜官房長官が言われたらしいことで全部です。後はデータ待つ。
一応変異載せておきます
L452Rはないが+4に近い
P681Hは

膜融合能です。
膜融合と言うとδ株のP681Rでしょ？と思う方が多いでしょう。実はP681Hはα株からずっとあったのですが、他の変異ばかりが注目されあまり相手にされず。
δの猛威を前にえ？なぜ？と研究者がなってP681Rの膜融合能が注目され半定量的な結果が出て確定しました。

それが5月なので、色々な変異が合わさった上でのP681Hはまだ危険性分かりません。
P681Rよりはマシだけど未変異よりは確実に悪い変異です。

他にも色々と変異ありますが、結局それは警戒検出体制を維持しつつVitro実験データを待つしかないです。

インフルエンザーさんのスレ

ο株メモ

今回のN440K, +4の1つのN439Kと免疫回避ほぼ変わらないと見て良さそうだし、S375Fが更に440の免疫回避助ける可能性ありそうな位置ね。
いや、+4の免疫回避増強がなぜ抗NTD抗体使った悪化に繋がるのか次第だな。
ο株で阪大のと同じ試験結果見たい

行け
自分たちの身を守るために国防を、防疫を見捨てさせるな
#空港検疫をPCRに戻して下さい
#オミクロンを日本にいれるな
#富士レビオ辞めろ

#空港検疫をPCRに戻して下さい
#オミクロンを日本にいれるな
#富士レビオ辞めろ

貴方が貴方と、何よりも貴方の大事な人の命を守りたいなら、このタグをTweetして下さると幸いです。

杞憂？それでもリスク管理のために動くのが本物の保守です。

さっきドイツも2例追加。更に疑い1名。
南アの疑い例が多く、疑い例は合計1000件へ。

倍加時間は4.8日とか4.7日とか言われている。δが11-14だった。
もちろんこれは社会的防御などの因子が影響するんだけど。
さすがに4日って…潜伏期間とかどうなったの？と。ハウテン州のデータは今感染見つけ始めたところでその速度がくっついちゃってると思う、さすがにね。

【良いニュースと悪いニュースがある】
まだ信頼性の低い情報とおもってます。
テレグラフから、
🇿🇦の医師の話として、みんな症状は軽く元気だ(低毒性株？)との話。
これが良い方のニュース。
悪い方のニュースは
ワクチン接種者と非ワクチン接種者が50:50と。

🇿🇦のこの医師が働いている地域のワクチン接種率が飛び抜けて高ければ、ワクチン有効性ありそうですが

🇿🇦自体のワクチン接種率は28%なので、現状そのまま計算するとワクチン有効性はマイナス、つまり「ワクチン接種者を好んで感染してる」ように見えます。

懸念していた有効性がマイナスになるδ+4

に一歩近付いた形です。
ただ、まだ精度の全然薄い話だと思ってます。
まずは低毒性化してる希望が見えてきたことを喜びますか。

【感染力は本当に強い推定があたっているかも知れない】
SGTF陽性をまた疑い登録してたりする慎重なとこもあるBNOに、オランダだけ61件のただのコロナ陽性でしかない乗客すべてが疑いで計上されている。謎

んで原因がこれ
オランダ国立保険衛生局が、61人のサンプル来て
rivm.nl/nieuws/omicron…

数人分テストしたら(おそらくSGTFだろう)全部南ア疑いだったので、61人全てを疑っているという話で、解析結果は日曜日に発表
(僕らは月曜日に朝起きたら分かる感じか)

離陸前ワクチン接種者であってもPCR陰性証明求めてた？
飛行機内でこれだけの感染起きた可能性もあり、そんなことになると

倍加時間4.8日だって確かにおかしくはない数字なのかもしれない。
1人が感染させる数が多過ぎるということで。

そして、どうもみんな軽症らしいという話、「いや重症化には時間かかるのに対して、いままだこの変異見つかってから数日じゃん」という指摘があり、感染はもっと前に起きてたと思うけど

少しデータまった方がいいな。と思った。

dutchnews.nl/news/2021/11/a…

【製薬企業へ】
3rdショットは変異株対応がいいし、何なら分かっているADE的な抗体(anti-NTD enhancing antibody)避けるようにNTD丸々抜いたワクチンも作ってテストしてみてよ。その自由度がmRNAワクチンの強さじゃん！って話。

変異について復習。
有名な変異はGuptaさんのコレにまとまってる
doi.org/10.1007/s00018…

変異のとこの文章構成を見よう。
有名変異毎に1つ項立てで13+NTDで1+S2で1の流れ。

ο株は？
13の内9個+下位互換1個:E484Aの計10個持つ。

さて、そこに実験的に作られた変異ウイルス論文(これまでもざっくりと引用した3件)も加味して、ο株の変異にコメントしていきます。

ο株は？

NTD 14-20変異なし。140–158変異有り。245–264変異なし。←NTDの大事なエリアの変異はざっくり1/3

A67V:機能不明

Δ69-70:実験的回避株PRMS20と同じ

T95I:免疫回避、全体構造調整

G142D:免疫回避兼ACE2親和性アップ

Δ143-145:免疫回避想定(PRMS20にも有)

Δ211、L212I:不明

ins214EPE:免疫回避想定(PRMS20のD215G変異代替可能性)

G339D, S371L, S373P, S375F, 不明

K417N:有名。+4の1つ。PRMS20にも

N440K:まずN439Kは有名(ACE2親和性アップ+免疫回避)、+4の1つ。
GuptaはN440Kにも項立てしてて、免疫回避。PRMS20ではこちらを選択している。440が+4の代替になりそうで気になる。

G446S:PRMS20がV445E選択してて免疫回避の可能性。実験も有

さて、473-490はACE2結合する最大に大事なとこです。

S477N, T478K:どちらも有名。477はACE2との親和性アップ、478は明らかに親和性下げる方向だけど501,681変異とかと共存で免疫回避兼感染力アップになる。今回変異入りまくってるけどどちらに動くか？

E484A:免疫回避、E484Kほどではない、論文有り
E484Kは超有名、超免疫回避、+4の1つ

PRMS20にも当然入る。AはE484K下位互換変異でいいでしょ。

Q493K:可能性:L452Rが490,492からの自由度獲得だったことを考えるとL452R下位互換になるか？ちょっとそれは厳しいか？

G496S, Q498R:不明 。位置的にはここらへんの変異は全部怖い

N501Y:はい、ヤバい。+4の1つ。PRMS20もそりゃ選ぶ。

Y505H, T547K:不明
D614G:いつもの。
H655Y:s1/s2 cleavage site。侵入能アップ。
N679K:s1/s2 cleavage site.侵入能アップ。
P681H:有名:s1/s2 cleavage site。侵入能アップ。膜融合力により感染力・毒性上げる。論文上はδのP681Rよりマシ(単体比較)。
N764K:s1/s2 cleavage site関与想定
D796Y:不明

N856K:可能性:D614Gが854,859からの自由度上がる方だったこと考えればD614G効果の補強あり得る？
Q954H, N969K, L981F:不明

結局、変異単体の懸念の大小なんて(科学的には面白いのだけど)意味なくて、合わさることで相互作用でどの程度になってるかが大事です。

例えばT478Kは単体では明らかに

マイナス。hACE2との結合阻害側への変異。でもD614G, P681H,  T732Aと共存するとむしろ感染力アップ兼免疫回避側へ。

δのP681Rだって単体では膜融合、侵入能驚異ですが、実はL452R, E484Q変異合わせると下がります。

なので、実験結果を待ちましょう。という身も蓋もないオチ。

ま、でも
レビュー論文で項立てされて1つ1つ取り上げられている有名変異って13個あって、その8個をο株は持ってるよ。
そのレビュー論文についてるFigの有名変異23個のうち、11個が該当ないし下位互換かなって感じだよ。

ってことで、なんとなく研究者たちの懸念の理由が1つ分かって貰えれば。

例えば膜融合系で既に分かっている変異が3つ同時に入ってるのはたぶん初で、δのP681Rより弱いのか？3つ合わさるとどうなる？
をまず最初に懸念する人もいるでしょう。

機能不明変異が一番気になる！って人もいるでしょうし。

とりあえずο株、現段階変異まとめは以上です。

あ、当たり前ですが、抗原検査ではどんな変異株であれ原則対応できません。臨床試験やり直さないと精度に疑問残るまま。

PCR？Primer変えるだけです。
変異が前提の世界で空港検疫捨てないで下さい。
いま皆さんが声を上げるべき理由はこれです。

訂正
レビュー論文で項立てされて1つ1つ取り上げられている有名変異って13個あって、その8個をο株は持ってるよ→✖
その10個をο株は持ってるよ→⭕

Ericがはっきりと切り捨て。
弱毒化してるかも？そんなの今の段階で言えるわけないし、一次ソースの1医師の発言(印象)というのも体系的でもエビデンスでもない、と。

はい、すいません。
他の方も指摘してましたがHopiumなだけに迅速に広がってる状況は危険ですね。

あ、一次ソースが本来相手にされない様なあれなのに「弱毒化してるかも」がこれだけTweetに広がってる状況が危険という意味です。
Hopiumだとの指摘はここから。

僕もこんなTweetしちゃってますが、反省。
きちんとしたデータ＆公式機関の発表を待ちましょう。

今必要なのは確実な防疫措置。
イスラエルが正解。また隔離期間もしっかり持とう。

オランダの61例疑いは件数こそまだ明かされてないものの、複数いるとのこと。それがSGTFなのかシークエンス確定なのか分からんけど。
とすると、空港機内クラスター

隔離でしか防げない

ο株、オランダ13人は確定。48人はまだ疑い。
オランダ保健省の公表みても現在進んでいるシークエンスで13の陽性とだけ書いてあり、まだ増える可能性ありとのいつもの文が続く。
なので13/61で確定なのか、まだシークエンス終わってないのか今はまだ分からず。
rivm.nl/nieuws/coronav…

ドイツ1件はシークエンスで確定。
ま、SGTFポジならそうでしょと。
しばらくは、どの国もシークエンスで確定とする流れかな。メインVariantでもないから

デンマーク2例のシークエンスも終了。SGTFポジはやっぱりο株。
SGTFつえぇ
ssi.dk/aktuelt/nyhede…

今の状況。
しかし、probableの定義が曖昧。
ドイツはSGTFポジでもProbableにしていて、オランダも空港PCRでο株が疑われた61人としてるのでてっきりSGTFと思った。フランスはpressからProbable8人は他の変異株PCRで陰性だった場合にしてるのでSGTFと同じくらい可能性高い。

つまりこれらの国のprobableはシークエンス待ちなだけでもうほぼ確定の人が含まれる。
それに対して日本のProbable1人はただ精度の悪い抗原定量検査でザンビアから来た陽性者ってだけ。

Probableの中では可能性が低い方。これProbableにするの？BNOと思ったり。

各国のPressをしっかり見た訳じゃないけど(というかオランダとか情報公開度低いし)、Probableの中にフランスみたいな「コロナ陽性、他の変異株PCR陰性、シークエンス待ち」みたいなほぼο株だろって情報から日本まで含まれてるのはちょっと。
probableより下のsuspectedって項も作って欲しい。

先週火曜深夜→「こんなの見つけたぜ」報告。4例。お、すっげ。おもしろ。くらい
先週金曜昼→急に100例Probable。え？ヤバいヤバいヤバい
現在→Probable1000例。

つまり3日で10倍の流れ。そういう中に精度低そうな情報はちょっと…
とは思う。

そしてこれはボケ？

首相「原則全員入国禁止！一旦鎖国だ！厳し過ぎると批判されても、私が責任を持つ！」

官房長官「えー、では私から。先月の1日入国者平均は2434人でしてー。それが今回の措置で上限3500人/日になりまぁす。」

ん？

ん？？

www3.nhk.or.jp/news/html/2021…

ボケてる余裕あるんや…

NHKの原稿の書き方というか、時系列が逆なんか？これ？……

もう情報が錯綜してる状態？

とりあえず俺にはこのNHK記事が難し過ぎて理解できなかったわ。

ちょっと上の話解説すると、空港検疫がもともとPCRで、更に変異株を見分ける変異株用PCRまで構築している先進国各国から出てくるProbableはほぼο株と思っていい人数です。
(全部の国のやり方調べきれてないけど)
それに対して、日本はコロナ陽性→シークエンスなので、シークエンス検査資源の無駄使い

+他国と同レベルの危険性のあるProbableではない。
せめてSGTFやろうよ。
ほんとお前ら頑なにPCR恐怖症だなこんな段階でも。
って感想。

正直、日本が今やるべきことはそんな一世一代の大ボケ1人火事場の傘回しではなく、

・空港検疫SGTF(早期検出力)
・隔離期間延長(単純に防御力)
・過去1ヶ月アフリカ圏から日本に入国帰国した人のシークエンス
(入り込んでないか早期に確認)

の3つ。

精度悪い空港検疫に、日本の少ないシークエンス資源浪費してる場合か？

ちょっと理解できないです。

オランダの空港もかなり酷かった模様。

今回世界はパンデミック当初の経験を活かして迅速に厳格にリスクに対応している様に見えたけど……

僕達はまだまだパンデミックに弱い

francetvinfo.fr/sante/maladie/…

WHOの声明。

まぁ、まだ分からないことが多いよと当たり前ながら冷静な対応と、ワクチン格差が問題だ(それは本当にそう)という部分は従来・想定通り。

気になったところだけ個人的に抜き出す。

・🇿🇦の劇的感染者増加はちょうどο株が捉えられたのと呼応する気がするが、
who.int/news/item/28-1…

WHOはο株と決まった訳ではないと慎重な姿勢。
・「予備的なデータでは入院者数が増えている」が、ο株と決まった訳ではない。数日〜数週間待て
・「予備的なデータでは再感染率が上がっている可能性がある」が、データは限られている。数日〜数週間待て。
・PCR検査はok.迅速抗原検出法を含む他の

検査法に影響があるかどうかについては、現在調査中です。

Hell!!
一体なんでその「予備的なデータ」を出さないんだい？

とは初見思うが、色んなインフォデミックになり得るから、信頼性上がるまで待ってるんだろう。

「再感染率があがる」に関しては免疫回避がまず疑われるから、慎重ね。

首相「外国人原則入国禁止！」
官房長官「現在一日平均2434人入国。これが3500人/日に上限引き下げる。」
の理由これかー
なるほど。

さすが、最遅。
今からSGTF備えますだそうです。先進国の中で最遅じゃねえの？
先進国のProbableはSGTFだったりするわけだが、日本の場合ただのコロナ感染者だもんな。

で？
変異株PCRするならもう空港に抗原検査要らない訳だけど、やっぱり抗原検査→SGTFっていう

news.yahoo.co.jp/articles/9374b…

完全無駄使いするのかな？

ま、問題が起こってからやっと対処する。リスクが高くてもまだ発生してなければ、何の経営措置もしない。
日本人の悪い癖よね。リスク管理の考え方が弱いところは。

例えば初めからこの2年近くPCR検査拡充に動いてきた他の先進国たちは、
1.空港検疫の変異株PCR(SGTF)で初めからο株の可能性が極めて高いサンプルだけをゲノム解析に回せるし、
2.すぐ結果でる変異株PCRでここ一ヶ月の入国者に検査呼びかけもして早期発見対応できるし、
3.ゲノム解析拡充も抜かりない

あの人たちマジでマスクせんけど。
でも合理的で科学的に正しいから、市中感染だってすぐ見つける。
m.bild.de/regional/leipz…

一方日本は今からSGTFの「準備」やるらしい。マジでマスクする国民性だけで持ってる(マジでアベノマスクがお似合い)。

ドイツの様にすぐ市中感染が見つかるだろうか？

なぜ？どうやって？

なにもしてないのにどうやって見つけるの？

ほんと科学的にデタラメなPCRデマをばら撒いた
@minesoh
@mph_for_doctors
@georgebest1969
らの罪は重い。

無知が許されるのはちゃんと間違えに気付いて方向修正できる人だけ。

彼らはどれだけ指摘されても

「特異度100%とかあるわけないだろwww」と無知を晒し日本を間違った方向へ進めるのを辞めなかった。

そしてこれまでと同様、その割を食うのは彼らではなく、
この「変異株PCR体制を築こうにも、そもそも空港検疫がPCRでさえなかった」国に住む貴方たちです。

お疲れさまでした。

未来の話をしよう。
今話せる範囲の不確定な話だけど

2週間でワクチンの有効性データを手に入れることができるが、楽観的ではないとModernaが牽制。
france24.com/en/live-news/2…

これが当たる場合、僕達はそれでも結局、今のワクチンで3rd, 4thを打つ。

先進国が我先にと金をだして変異株対応ショットを待つ。ワクチン格差は消えることがなく、まだ変異リスクは残り続ける。

そんな感じかなって気がしてる。

もちろん、β株みたいに免疫回避最強だけど流行らなかったというオチもあり得るけど。

今できることは結局この3つだけ

11/24未明→発見。4例
11/26昼→100例疑い
11/29昼→1000例疑い
12/3昼→28000例疑い
12/6未明→48000例疑い。確定はついに750例に。

疑いの中でもSGTF陽性はもうシークエンス確認するまでもなく、確定して行っていいでしょう。特にもうシークエンスキャパ超えた🇿🇦は。

そしてBNO追いついてない？

BNO上デンマークの確定18、疑い42ですが、実際はこうです。

デンマークはもうSGTF陽性ならシークエンス確認するまでもないと判断。まあ合理的。
これにより確定例が183件になります。

【ごめんなさい】
想定以上に悪いです。
まだ公表されていないという論文。

2回Pfizerワクチン接種者血漿のオミクロン株中和能
希釈しなくても０。
ブースター接種後0.5ヶ月血漿
希釈しなくても40%の人が中和能０。

答え→マジでまったく効かない。

どれくらい悪いか解説します。

僕、ホントは今日こんなTweetしようと考えてました。

そろそろワクチン会社がVitro中和能試験結果を出してくる頃です。
例えば『NT50が、3倍減ったから既存論文のこのモデルから20%しかワクチン効果落ちない！』という内容でしょう。

騙されないで

NT50が1/3に落ちたという結果に定量性はありません。
以前、δ株のとき紹介した様にラボによって値は2-10倍まで変わります。
そのラボが100%を何にするか、感度のいいラボかどうかに寄るんです。

なので、「同時に試験したβ株が何倍落ちると算出されたか」で見るべきです

なぜβ株かと言うと、β株は唯一臨床試験の揃っていて、およそVE98%の最強ノババックスがβでは50%になるからです。

ここで換算して考える必要があります。」

ま、僕が今日Tweetしようと思ってた内容はそんな感じです。

無駄でした。ムダでした

何故ならNT50が計測不能。
まさかの血漿100%でも中和能力０だからです。

オミクロン株にワクチンは効きません。全くです。
これは意外すぎる結果です。

この研究者の採取したワクチン接種者血漿がワクチン接種から日が立ちすぎていた？
いやいや、ブースター接種後半月でも40%の人が中和能０じゃん

え、これどうするの？

入院率

thelancet.com/journals/lanin…
より、
δ株の14日以内入院率は5.5%
ο株の入院率は？

とりあえず今日の新規入院÷新規感染で出すと🇿🇦は2.9%
今日の新規入院÷7日前新規感染で出すと🇿🇦は8.75%
うん、ばらつき多すぎて分からん。

でも若者に感染する様になったのに想定より劇的に減らない

ことだけは分かる。
若い人はもっと強くないか？と考えると毒性は変わらない程度から少しは上がってる可能性さえまだある。
データ待たんと分からんけど。

そして免疫はほぼ完全に回避？
再感染率そりゃ上がるわ。

いや、マジでキツイ。本当にキツイ。
正直、ごめんやっぱ鎖国継続でお願い。

ん。データがヤバ過ぎてTweetしたが、2回接種後のデータそもそもδ株に対して47%しか中和活性示してないから接種から期間経ちすぎの可能性はあるな。
ちなみに「ファイザーは2回接種後の元株に対する活性と3回接種後のオミクロン株に対する活性は同じ」と主張してるけどそれは右図とほぼ同じこと。

要するに「ワクチンでο株に効く抗体を出せる人はサードショットで劇的に盛り上がった中和能がある。なのでそれが０の人との平均値が、
結局2回接種の人の元株中和能平均値とほぼ同じ」

というだけのことであって、こういう結果も同日に出てて2回接種効かないことは両者同じなので、平均値じゃなくて

分布出せやボケェェェエ！

って話やね。
まだN=1なので、冷静に次のラボを待ちたいが、
「2回接種者でもVE40%に落ちるだけで済んだね！でもサードショット用意するよ！」みたいな甘い話ではないことはまず2者とも確定と。

こうなると、サードショットはまだο株侵入がなくて、比較的接種率の低い国に売ってδ株駆逐へ回して貰い世界経済の打撃軽減に努めるとか、
ο株対応ワクチンまでの繋ぎに原理上細胞性免疫誘導がより見込めるだろうValnevaの様な従来型ワクチンをサードに試してみるとか。

とりあえず考えること増えた

もう一報追加。
緑ワクチン済み+感染も経験6人
赤ワクチン済み
オミクロンでは41倍中和活性落ちます。
sigallab.net/?s=09
より

こちら追加した文献ではワクチン接種からの日数は平均24日です。つまり古い血漿ではない。
平均年齢は高めかな。

こちらの文献は、感染者血漿、疑似ウイルス系。
WHOスタンダードではο株に40倍程度の減弱(免疫回避)が確認されたが、既感染者血漿では7倍程度。
いやしかしここに来てδ株ももともとそれなりに回避強いじゃんってデータがちらほら見えるけど今更？

ο株同じ様なデータが続々出てくるだろう。

これも僕の想定より悪いですね。ごめんなさい。

数日前に、今回早く対策した世界各国、UKやデンマークが、今後日本がどうすべきかの参考になると述べました。背景に早く対応できたので🇿🇦より伝播速度は落ちるだろうという期待がありました。

🇿🇦とUKの伝播速度が今の所同じ
gov.uk/government/pub…

こうなると、もう入れないことの一択です。また今日ニュースを見ていてPfizerは今回の自分たちの予想(2回接種でも重症化予防は残るかも。支持データはない。)は6-8週間後に現実データを使って確認できるだろうと述べているのを見ました。

僕は思いました。

「対応ワクチン販売までの時間稼ぎ」と

昨日最初にTweetした左図。
δ株への効果も弱すぎて2回接種血漿は期間経ち過ぎでは？との想定は正解。2回接種後半年。
だから11倍しか落ちていない。感度悪い。

一方右図は41倍ダウン(2回接種後24日後)。ο株強い。
さて従来のやり方でワクチン効果算出する。
横軸下限だから30%？
キツイ

俺が中の人なら今ならワクチンは第三世界への外交として売りつつ、試しでサードショットは不活化ワクチンのValnevaと変異株へ強めのデータ持つcloverへ切り替える博打を打つ。

というか彼らが早くο株チャレンジすればいい。
ただ既感染者の再感染率も高いので

変異前前提ワクチンでは何やっても細胞性免疫さえ期待できない可能性も充分あると思うが。。。

度々紹介してきた3報目(ワクチン接種24日後で41倍ダウン)が今日昼にpreprintとして公開されたので、紹介します。
この報告で、一番ヤバイのは右図の記述。

「β株は免疫回避最強として知られており、我々のアッセイでも3倍の中和能減弱を示した」(←ぶっちやけ感度悪い)

medrxiv.org/content/10.110…

そんなラボがο株には41倍の減弱を示した。

β株は臨床試験で元株に対し最強のノババックスの効果(98%だっけ？)を48%にすることが臨床試験で実証されています。

つまりスゲー乱暴にもう中和能-ワクチン効果の図を直線の線形反応とみて、β=50%落ちるとこの14倍は？
ο株=3.8%

ワクチン効果は3.8%

もちろん論文書いた彼らは「ワクチン効果否定ダメ絶対！」縛りでもあるのか、ファイザーワクチン免疫回避は不完全だよ(=０%ではないよ)を論文タイトルにし、細胞性免疫というHopiumを述べるのですが。

個人的にはワクチン効果は12.5%以下だろうなと思った次第ですご査収ください

ファイザーの結果もまだちゃんと読んでおらず図だけですが、ワクチン効果8%と示していますね。
ちゃんとβ株を同時に試験しているので、計算できる。
解説はこれ

現実を反映しにくい疑似ウイルス使ってるから、免疫回避の陽性対照であるβ株(臨床試験・現実世界データでワクチン効果50%下げることわかってる)を試験している。

わざと感度悪い実験系使ってこれを隠すと最低なんだけど、営利企業としてはやりうるかなと思ってた。

ファイザー良心的じゃん。

(俺が研究者やってた時の企業が悪どかっただっただけかも…笑)

ただ、きちんと世界とコミュニケーションすべきデータは出しつつ、言い訳としてサードを用意した。そんな感じか。
以下の感じを予想

研究者「ヤッベ！ワクチン効かねぇwwwこんなの上司に出せないからサードならなんとか？付けとこ。」

CEO「は？これ俺に発表しろって？世界中の2回接種の皆さんごめんなさい無意味でしたって？ムリムリムリ。サード売り込む前に従業員焼き討ちされるわ。文章考え直し！1時間で出せ！」

薬事部「ハハハハ！ハハハハ！(←データのない細胞性免疫を推すバカらしい文章作成に御乱心中。いつものこと)」

メディア＆愚衆「せっかく打った2回接種無意味とか信じたくないし(誤報だったら嫌だし)、サードと細胞性免疫超プッシュでポジティブニュースにしよ！」

研究者「は？俺様のデータちゃんと見ろよ…」

ま、製薬業界では良くあることです。少なくともβ株ちゃんと出した研究部門はまだ良心持ってる

世界がバカなのが悪い。元研究者として言うと。

ちなみに、ファイザーの言う3回接種で、2回接種後と同じなのでサードは期待できる！はイスラエルの現実と合わない気もしますが実験データ上は正しいです。左図

GMTでみると同じ文章が成り立つ、右図では半数近い人が効果ない。
なので、ファイザーには生ウイルス使った同じ実験系の結果でどうなるか

それを示して欲しいところですね。

サンプルの個体差なら右図が運悪いだけもあり得るし、実験系の差なら、ファイザーが疑似ウイルスだから感度悪くて見えなかっただけもあり得るところ。

そこは2つのほぼ同じだが相反する結果があるだけ、というのが今の現状かと思います。

すっごい簡単に言おう。

強い免疫得られるはずの感染経験にワクチン接種まで足しても効果41倍落ちるよ。
つまりぶっちやけο株は変異っていうよりもう別のウイルスだね。

だから、その新しいウイルスに対応した新しいワクチン出してね。

今起きてることはそれだけです。

11/24未明→発見。4例
11/26昼→100例疑い
11/29昼→1000例疑い
12/3昼→28000例疑い
12/6未明→48000例疑い
12/11未明→78000例疑い
🇿🇦は完全に検査キャパ超え。変異株PCRさえ追いついていない模様。これに2週間かからず。

こっから先は英国、デンマークなどの確定例推移を見たほうがいいか。

【ごめんなさい】

ここ最近の『ο株やべー、ワクチンマジで効かねぇ！』『細胞性免疫？笑　お前らデータないのに何言い出してるの？』Tweetについてマジで謝罪します。

恐怖煽ってごめんよ。

ワクチン効果は50%残っている可能性があります。
解説はここ

現実世界でワクチン効果を50%も下げたβ株

そのβ株の中和能が3倍程度しか下がらない測定系でο株は41倍下がる。左図

そのβ株の中和能が4倍程度しか下がらない測定系でο株は25倍下がる。右図

世界の科学者はこれまで中和能とワクチン効果は相関する！として下図で、変異株へのワクチン効果を論じて来ました。左図

しかし、英国の初期解析ではο株へも50%ワクチン効果残っている。？？？

こうなると前提が間違えていて、ワクチン効果の実は半分程度は細胞性免疫だった。という仮定が出てきます

つまり、β株(ラボ内で3倍〜20倍程度の免疫回避)時点で、既に中和抗体は何も活躍しておらず、細胞性免疫に頼っていたとか。

まぁ、完全に科学者には謎が増えた感じです。
ま、完全に言い訳ですね。
ごめんなさいm(_ _)m

(英国、実は全員2回接種+最近の既感染者だったというオチは辞めてね…)

ファウチさんが、変異対応ショット不要かもとさえ言い出した(いや、必要だろ…とは思う)理由もおそらくこの英国初期解析データかな？

となると、結局問題はその劇的な感染力だけかもしれません。
このデータなら確かにサードショットは売れるし買うわ。

しばらく英国データ注視ですね。

あ、50%残ってる可能性と言いましたがそれは言いすぎかも。

そう言えば、いまο株はそもそも若い人ターゲットに変えてたね。

下駄を履いているのは細胞性免疫？と見せかけて単に母集団年齢層の違いによる過大評価だったら嫌だなと思ったので一応。

ただ、中和能測定系だけで語るのが無意味化したのは

確定かと思います。

やっぱ英国データがおかしいだけなんじゃねえか？って気もしてきた。ο株発生から日が浅いからこれから発症入院していくだろう→このデータのο株有効性はこの後は下がる一方の可能性
+
ο株発生から日が浅いからそもそもο株に晒されるリスクが低い集団

これをδと比べちゃダメでしょとか。

そもそも最近ワクチン打ったのは若い人でしょ？とか

少なくともこの英国データが確定させたのは、おそらく2回接種後3ヶ月でワクチン効果50%以下であり、
まぁ元株ワクチンでサード打つなら3ヶ月頻度ということ。

それは良い選択肢には思えないな。
やっぱりο対応ワクチン欲しい。

人から紹介頂いた論文ですが、この図がお医者さん向けかと。

抗体治療薬でο株に効くのはソトロビマブ(VIR7831)とDXP-604のみとアブストですが、個人的にはこのグラフ見るとソトロビマブ一択と思います。
他の抗体治療薬が地平線なのは辛い。
この実験系は即時性のため疑似ウイルスです。

現実ではもっと弱まる可能性があることは注意。
とりあえずソトロビマブ争奪戦が始まるかな…

biorxiv.org/content/10.110…

あとは回復者血漿等から単離された240の抗体試して、ο株の変異を再現した疑似ウイルス(変異の能力を個々に測定なのでシナジー効果は見てません)が、合計85%の抗体を回避した、との報告。

これにより機能不明変異だったものの殆どが免疫回避能に関わることは証明されたことになります。

この図…

さて、こんな文献も。見逃してた。

彼らは「既存の中和抗体価からワクチン効果推定するモデル(いつものあれ)は40倍も落ちるオミクロンには使えない」として、文献集めてモデル作り直し。

そして、やり直した結論は
「オミクロンはmRNAワクチン接種の発症を7-10倍

medrxiv.org/content/10.110…

入院リスクを4-5倍増加させる。
なお、サードショット打っても、δに対して期間が経って減弱した程度の効果しかオミクロンに対しては得れないだろう。」

しっかし、作り直したモデル、急に甘くなったじゃん？大丈夫か？と思う。

なんでこんなことになった？
というと、彼らの集めた文献の中には、β株(ワクチン効果を現実世界で50%減らした)に対して「Pfizerワクチン効果は全然衰えない」というこれも現実世界論文があるらしい。

知らんかった。

これが推定モデルに組み込まれているため、僕が算出している「βに50%減弱！」

を前提に固定した計算と比べてそりゃ高くなる、というわけ。

そのファイザーの結果、オミクロン出てくるまではβがLabo内免疫回避最強だったこととかと色々と合わん気がするが、文献になってるなら、まぁそれも事実なんだろう。

このThomasの有効発症症例6例の結果
Narssenの有効発症症例1-4例の結果

これが結果的にこのモデルが僕の計算より甘いことに繋がっている。

ほら、前はβ株にみんな5-11倍落ちるデータ出してたんだよ。
なんで皆今回ο株のヤバさ伝えるときにβ3-5倍しか落ちてないの？？

あと今日紹介した中和能結果はこれ。
今日はこんなとこでしょ。

このスレぐちゃぐちゃに長いな。
今日のオミクロンツイは。

ワク2回接種がムリはもう確定。
オミクロンの毒性むしろ強くね？(入院率高いかも？)と懸念しだしたのがNew

あと、研究者としては、「ほらね、PMS20と同じだったでしょ？」が面白い。

確定例推移
11/24→4
11/29→163
12/6→793
12/13→7905

今日のオミクロンTweet。

新しいことは特にないが、δを制御できてない国は、(多少ワクチンで死のうが)δ+οという最悪の発生を防ぐためにブースターを打つべきだ。に立場を変えたのが個人的には転換点。

今日のオミクロン

Newは
ο株はδの2倍細胞への感染性高い(元株比で4倍)、ラボ1つめ
デンマークの現実世界データからδへの防御力が既に0(期限切れ)で、οには大きくマイナスになっている。ワクパスとかの社会的要因がワクチン効果をマイナスにしている要素か？
など

あとは、
・中和能低下を細胞性免疫は補わないだろうという論文
→ファイザーの希望的観測は消えた。
・ベーリンガーインゲルハイムの中和抗体薬も使えるというデータ
も新しかった。

デンマークのデータに、ワクチン未接種母集団は8%では？と言ってきた人いて「やっべ間違えてたら恥ずかしいぞ」と思ったけど、そっちの元ツイが間違えてるだけだった。

2回接種「以上」と3回接種を足し算して非ワク接種者割合を出してしまった模様。
公式発表見れば一発
sst.dk/en/english/cor…

「Fully vaxx」に3回接種者も含まれてる統計あるから分かりにくいよね

結局、デンマークの母集団ワクチン接種率は僕が引っ張ってきた数が正しかった(owidだけど)ので、先日のcdc使った計算と同じく、今のところワク接種者の方がオミクロンに感染。

ワクパスの弊害

で、「ワクチン接種者ほど会食する・マスク外す」などの、高リスク行動の結果と思う。

ADE株の可能性も頭に入れつつ、まだ何もラボデータ出てこないから保留してます。

デンマークのデータがADE株であることを示しているのではなく、更にこれから非ワクチン接種者の感染が増えて、大きくマイナスになったワクチン効果が、最終的に±0になるとしても。

N=4000集まった時点で、2回接種者が一番感染「率」が高いのはワクパスパーティーマンが感染広げてることを意味するから

マジでオミクロンの前では自重しようね。日本人は。

今日のο株new

・ACE2への結合力ちょっと弱いくらい報告。これは先日の感染力4倍と合わせてACE2以外の感染力増加(おそらく膜融合能)
・大学生モデルから、なかなかキツイ未来が見えるシミュレーション報告

あとは抗体療法ソトロビマブのみ効く報告と発症予防効果が37%未満かな報告(同じpaper)で、今日まで確認されてきたことが追認された感じ。

(というか「中和力価０だから解析から外す」ってやっていいのか？論文として…ま、早くADE株かどうか調べる試験やって公開して、誰か)

今日はこんくらいで

昨日はオミクロンアップデートサボりました(金曜夜は酒飲むよね)。
ちなみにStrong500ml缶2本飲んだ後の初喋りは超ムズかったです。

Newはこれでしょう
・無症状割合も入院率もο株、δ株と同じですが？だれ？オミクロンは軽い言うたの？
・VEはPfizer2回接種者はマイナス

あ、ちなみに「誰やねん」は嫌味で、🇿🇦の1医師の経験談が世界中に広まったHopiumに過ぎないことは知っております
よくこれがここまで広がったよねとさえ思う。

ο株なう
・若い人大好き
・入院率がδと変わらない=若い人がメインなので生物学的にはδより強毒性か
・感染速度4倍以上(倍加1.6日は言い過ぎだろ…？8倍になるぞ？)
・Cell entry4倍Up vs 下がるの謎
・パーティーすんな

シンプルに、

夏の4倍以上酷いのが来ます。

が現状の予測・警告

ワクチンについて

その防御効果は、固定的なものではなくて環境で変動するもの

薄いシールドだと思って

降ってくる銃弾が強くなったら(変異したら)重ねて分厚くしたりしないと

δ下でパーティーに行く(vs二宮隊)とか死にに行ってるので、デンマークδへの効果０になってる

なお、ο株は千佳ちゃん

確定例推移
11/24→4
11/29→163
12/6→793
12/13→7905
12/18→34788

今日のοニュース

・WHOはバカ、これに騙されるやつもバカ。断言します。
・In Vitroデータはカオス化。
　ACE2結合力Up vs Down
　細胞感染性Up vs Down
・οはマウスから来た。これは最悪として想定してたけどかなりショックです。これ終わらないと思います

Now, Omicron become Zoonosis??

オミクロンがズーノーシス化したのだとしたら、感染環が確認されたら(もうその可能性がクソ高いのだが)、どうすればいい？

できることが何もない。

世界中のネズミを殺すか？
発展途上国の衛生レベルを今日明日いきなり日本レベルに上げるか？できるか？

デンマークのデータを最新版に合わせて更新

デンマークが12歳以下のオミクロン感染者を計上しなくなったので、それに合わせて計算。
ワクチン未接種の母集団数がガッツリ減りました。その結果VEは向上し、大きなマイナスが解消。

ο株への3回接種の有効性は現在40%です。

やっべ。恥ず。

デンマークのデータ、「最近12歳以下が集計されなくなった」が俺の間違えで、もともと集計されてない注意書きに俺が気付いてなかっただけだわ……

だから以下のツイがそもそも間違え

昨日のこっちが正しいです。

昨日のオミクロン

「ワクチン効果2年かけて消えるくらいの長期有効性じゃないとこれ終わらないよ」とタイトルでは楽観論と思わせといて冷たい結論言う論文

今日のオミクロン。

ま、ACE2に結合力落ちてる？落ちてない？
はおいといて、膜融合系変異3つもあったのにむしろマイナス方向で、膜融合能は最弱でFAでは？

ACE2もあまり使ってない雰囲気

何か細胞間感染を強めた模様

今日のオミクロン、はとりあえずこれで。

余力があれば付け足す。
英国国家統計局ONSのCISを、言わいる反ワクの人が「ワクチン売ったら4倍感染！-345%」と読み間違えてた(booster 37%ある)けど、きちんと計算すると(どうやっても)

2回接種vs ο株が「−71%」

が要点

今日はけっこう最悪だったかも。

なるべくワクチン効果上がる様に結局12歳未満除いて計算して、接種期間たったδへの有効性が60%ある少し高めの計算になっても、
同条件でブースターのο株への有効性37%だし、2回接種が「マイナス71%」だし、英国統計局データだし。

となるとADEの懸念増える。

Pfizer CEOはもうコロナが変異続けて2025まで続いてワクチン売れ続ける想定を勘定に入れてるし。

そして世界的にはδ+οが発生する懸念も増えるし。

それだけは辞めて欲しいんだが

今日のオミクロン。

ここ2日ハードで心折れるわ。
最初からWHOのデータ小出し感や、エリートパニックなのか
・根拠データない細胞性免疫押し
・根拠データない🇿🇦１医師のHopium

とおかしいと思ってはいたけど。
ADEの懸念を口にしにくい(反ワク認定されたくないという科学者特有の恐怖)状態あったし

でも、今日のオミクロンはこれ。

ちょっと目につくHopiumへの噛みつきから始まり、今日は論文読む気はなかったけど、Update眺めてたらこれ。

【ごめんなさい】

想定以上に悪いです。
昨日の英国データ解析でワクチン2回接種はオミクロンにマイナス71%を報告しましたが、

今日は僕の計算ではなく、デンマークの国家機関の論文からファイザー3月後には「マイナス76.5%」です。

ADE。
恐れずにこれを口にしなければ

なりません。

その懸念を僕らは本当に考えることができていますか？