【素朴な疑問】
新コロにとって有利な抗体って(たぶん俺のリサーチ不足で)この報告の7個だけしか知らんのだけど。
この7個の抗体がδ+4株では最大限利用されて、逆に免疫ある人間の方が最悪な結果になることを示唆するのが阪大データ。
え、なら次作るmRNAワクチンNTD領域
sciencedirect.com/science/articl…
抜けばいいだけじゃね？
そしたらウイルスにとって都合悪い抗体だけが誘導されると想定してvitro試験してみれば良し。
δのNTD変異は、
T19R、G142D、E156G、Δ157-158
οのNTD変異は
A67V、Δ69-70、 T95I、 G142D、Δ143-145、 Δ211、L212I、 ins214EPE
このNTD変異が免疫逆利用側なのかどうかが重要
逆利用促進のRBD変異+4(おそらく単にACE2結合有利な免疫回避か結合力up)は
K417N,N439K,E484K,N501Y(δベースの時)
οが持つのは、
K417N,(N440K,T478K,)E484A, N501Y
S371L,S375Fは他のサルベコにあり、位置的に抗体回避か
K417N, N440K, G446S, E484A, Q493K, G496S, Q498R, N501YがACE2関係
P681H, N679K, N764Kと3つも膜融合関係？
実験的回避株2(膜融合が入ってない)
L18F, V47M, ∆69-70, D80A, ∆145, D215G, ∆242-244, W258R, R346S, K417N, N440K, V445E, L455R, A475V, E484K, N501Y, D614G, A701V, P792H, N801D
ο株の似たとこ(約半分)
Δ69-70, Δ143-145, ins214EPE, K417N, N440K, G446S, S477N, E484A, N501Y, D614G
懸念は上げだすとキリないけど、抗NTD抗体の一部が悪さするなら変異株対応mRNAワクチン、NTD単純に抜いて作ってみてVivoチャレンジ試験とか見たい。
上の実験的に作られた回避最強20箇所変異株はこちら
そのうち10個は同じか似たものをοが持っている。と
nature.com/articles/s4158…
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