Thread by @carol_perelman

A 🔟días de q #omicron se convirtiera en la 5a variante de preocupación según la OMS hay mucho q sabemos y bastante por comprender…

🧵Abro hilo para explorar las evidencias sobre:

1) transmisibilidad
2) evasión de inmunidad y
3) severidad

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instagram.com/tv/CW1GiRiPzzt…

Primero recordar por qué ómicron está causando alerta mundial; y la respuesta está en q al tener tantas (30) mutaciones en la zona de la espícula (proteína S) mejor hay q tratarla “como culpable hasta demostrarse lo contrario”… mejor prevenir… 2/

Solo para ponerlo en contexto, la espícula de las demás variantes de preocupación (Alfa, Beta, Gama y Delta) tenían 11-13 mutaciones… pero además, esta variante Ómicron es bien distinta a las demás conocidas… viéndola en el árbol genealógico del virus tiene “salto evolutivo”3/

Se proponen 3️⃣ hipótesis para explicar esta divergencia tan amplia,
1) q la variante se produjo en alguna población sin monitoreo genético y ahora finalmente la encontramos
2) q pasó por algún animal intermedio
3) q se desarrolló en persona con inmunosupresion (SIDA?) 4/

Lo que sí es q al tener tantos cambios en zonas tan sensibles y al observarse el incremento de casos tan estrepitosos en Sudáfrica responsablemente los científicos avisaron al mundo para q tomen sus precauciones 5/

Aquí un tema relevante es aclarar q si cerrar fronteras atrasa la llegada de la variante para ganar tiempo… y q éstas se debieran abrir cuando el contagio comunitario por esta variante es mayor al riesgo de importarlo…lo q si hay q hacer son pruebas a viajeros para detectar 6/

Otro dato importante es q esta variante, al igual que Alfa, tiene una deleción (le falta un aminoácido) por lo q pruebas de PCR de cierta marca cuyo blanco es justo ese lugar alcanzan a detectarla fácilmente sin necesidad de hacer la secuenciación genética completa… 7/

Diariamente sale info relevante de Sudáfrica q está ayudando a esclarecer los detalles sobre las tres grandes preguntas, sin embargo es importante establecer q lo q suceda allá no necesariamente pasará en otros países; hay muchos factores q influyen… 8/

Entre ellos las políticas públicas, la inmunidad natural de la población, la inmunidad por vacunas de la población, las características de la población (comorbilidades, distribución de edad, etnias), la variante dominante actual así como los sistemas de salud… 9/

Y esto lo vimos con Beta, una variante q más allá de Sudáfrica no causó grandes consecuencias… sin embargo… es IMPORTANTE ahora q omicron está en más de 36 países y q Sudáfrica aviso al mundo con tanta premura poder seguir con cuidado la evolución para comprenderla mejor 10/

Y es que 1) la transmisibilidad depende de dos factores: de la capacidad infecciosa del virus 🦠 y de su capacidad para evadir la inmunidad…es decir, que tanto se contagia puede depender en sí de que realmente las mutaciones cambiaron la afinidad de la espícula al receptor…11/

Y entonces este cambio hace que sea más contagiosa… para lo cual está este artículo que habla de cómo las mutaciones sí pareciera al menos en modelo hacer a la espícula “mejor” llave para “abrir” nuestras células 12/
👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻👇🏻
biorxiv.org/content/10.110…

Pero lo importante es ver si realmente esto que vemos en teoría se traduce a una mayor contagiosidad… q por lo pronto vemos q el aumento de casos en la Provincia de Gauteng, donde está Pretoria y Johannesburgo está creciendo, duplicando los casos cada 3er día!
@jburnmurdoch 13/

Además la positividad ha aumentado de 6% a inicio de la semana a 25% siete días después (o sea 1 de cada 4 pruebas de COVID están saliendo positivas)… y de ellas, 75% son por ómicron, cuando hace dos semanas la variante dominante era delta!!!
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Hoy Delta es la variante dominante en el🌎y sabemos q es muy contagiosa, por lo q para desplazarla, ómicron tendrá q tener una VENTAJA, si no no podrá ganarle terreno; y será su capacidad para evadir inmunidad y/o su capacidad de contagio intrínseco (R0) o una combinación … 15/

Modelos de @trvrb muestran q hoy en Sudáfrica una persona con ómicron contagia a ~3 personas (Rt) por lo q si la población en ese país tuviera 85% se inmunidad (natural+vacunas) entonces así se vería la relación entre evasión y contagiosidad de ómicron 16/

Claro q estos modelos son eso,… y lo más importante es observar cómo se comporta en la realidad para poder tomar las mejores decisiones; por lo q veamos los datos q existen hoy:

Empezando por la evasión de inmunidad un reporte preliminar encontró q causa x2.4 reinfecciones 17/

Este estudio reportó q más de 35,000 casos son presuntamente por reinfección (personas q por 2da vez tienen COVID) y 322 casos por tercera vez!
Calculando así q ómicron sí parece evadir inmunidad en recuperados…
💉Por eso la insistencia de vacunarse!
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medrxiv.org/content/10.110…

Aún no sabemos en q % las 💉 seguirán siendo eficaces contra ómicron pero al parecer sí evitarán complicaciones y muertes por COVID

Farmacéuticas y en laboratorios se están haciendo estudios de neutralización pero lo relevante será ver su efectividad a nivel poblacional…
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Por lo pronto la mayoría (65%) de las personas hospitalizadas en Sudáfrica son no-vacunados y llama la atención que 80% 🏥 son menores a 50 años, y 19% menores a 9 años… @miamalan aunq la buena noticia es q hay menos proporción q en otras olas en UTI,… aunq oxígeno igual… 20/

Lo alentador es q 76% de las personas hospitalizadas en una de las regiones de Gauteng están ahí por OTRA razón y supieron q tienen COVID por q al ingreso se les hizo una prueba…👍🏻

Sin embargo, apenas están comenzando a subir los casos en mayores de edad…🧐🙌🏻🙌🏻🙌🏻 21/

Finalmente quizás estemos frente a un🦠endémico,q causará más casos pero menos letalidad, como lo comentó @BallouxFrancois ,y posiblemente uno de los factores es q ómicron integró en su genoma una parte de otro coronavirus q se ha adaptado a nosotros y causa gripa estacional 22/

Sobre tratamientos contra COVID funcionan molnopuravir, plaxovid, pero en menor medida los monoclonales (parece q solo Sotrovimab) y habrá q entender detalles de su fisiopatología…como síntomas y tiempo de incubación

Por ahora hay q💉vacunarnos todos👉🏻y poner los refuerzos
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Y seguir cuidándonos ya q la forma de evitar contagios por ómicron es igual q con las demás; es un virus de propagación aérea: ventila,😷, haz pruebas

…Y baja tu exposición; finalmente con nuestro comportamiento podemos evitar la propagación de virus; casos, 🏥 y secuelas

24/

Recordar q con más casos, aunq sí resulten más leves, habrá un % q requerirá atención médica y podríamos ver saturados los centros de salud! 🙏🏻

…Seguiremos aprendiendo… tengamos paciencia… pero mientras a cuidarnos todos!!!

25/fin

@biomolecules101 @WeTweetScienceM