Primer análisis semanal del estado de la pandemia del #Covid19Chile, haciendo al mismo tiempo una auditoría de los datos del @ministeriosalud. Tengo una buena noticia y varias malas noticias :-( Abro hilo. 1/
@jmanalich @pdazan @arturozunigaj @min_ciencia @acouvecorrea
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La buena noticia es que el aumento porcentual diario de muertes totales va disminuyendo y estamos llegando cerca del 20% diario si tomamos un promedio geométrico (es decir, si el numero de muertes es M elevado al número de días desde el primer deceso, entonces M=1.2) 2/ 
La primera mala noticia es que usando esta trágica medida, Chile queda en la posición 21 junto a Italia, Perú y Suiza. El ranking es liderado por Turquía y Brasil con un aumento diario cercano al 30%, como muestra el esquema que incluye los 51 países con 50 o más muertes. 3/
Es decir, vamos mejorando pero no estamos bien, pues quedamos en el 11% peor de los 197 Estados que existen en el mundo. Varios países asiáticos han conseguido reducir la tasa de aumento, utilizando confinamiento, rastreo de contactos físicos y tests, muchos tests. 4/
¿Hacemos suficientes tests en Chile? Si calculamos la tasa de letalidad de casos (muertes/casos reportados), vemos que ha ido aumentando desde el 0,5% a sobre el 1%. Por supuesto se sobrestima la tasa, pero si fuera un % fijo de los enfermos, debiera ser constante, y no lo es. 5/
La respuesta es no, no hacemos suficientes tests. Otra validación de este hecho es calcular que % de los casos reportados se hacen en tests y pueden ver que la curva varía de 133% (¡!) a 37%. Peor aún, va bajando en los últimos días y nos gustaría que fuera al menos constante. 6/
Si fuera constante, al menos estaríamos haciendo una muestra de tamaño representativo con respecto a la población enferma, suponiendo que realmente los casos reportados son una muestra representativa, algo que es difícil de creer cuando hay crecimiento exponencial. 7/
Por otro lado el % de tests positivos varía de 5% al 14%. Si esta fuera una muestra representativa de la población, uno esperaría una incidencia mucho más constante y no que varíe casi 3 veces de tamaño. Y la mayoría de los tests deben ser reactivos y no proactivos. 8/
¿Y cuántos tests se hacen al día? Esto comenzó a infomarse el 1 de abril, pero varían mucho, desde 2.250 el 7 de abril a casi 8 mil el 9 de abril, es decir una variación de 3,5 veces. Y parece que los tests positivos no dependen del total, cada día es un país distinto. 9/
Esto es como si quisiéramos medir cuanta lluvia cae y un día usamos una taza y otro día un jarro de un litro. Si llueve mucho y usamos la taza, podemos medir sólo una taza. Pero da lo mismo lo que usemos, nunca se llena más del 15%. Es como si la lluvia supiera que voy a usar 10/
Veamos ahora los pacientes que entran y salen de la UCI. Uno esperaría que estos números estuvieran inversamente correlacionados con las muertes diarias. Y lo están, pero no demasiado (-0,33). 11/
Podemos ver que los días del 9 al 11 de abril fueron los más trágicos, por eso incluso el día 9 fue negativo. Contando los recuperados, el 11 de abril fue el peor día, ya que el 44% de los que dejaron la UCI murieron. 12/
Si la tasa de mortalidad fuera constante, quiere decir que el número de muertes dividido por los casos reportados D días atrás debiera ser constante. Esto ocurre para D=10. Con esto podemos estimar el número real de casos: medium.com/@rbaeza_yates/… 13/
Si no te gustan las matemáticas, te puedes saltar este tweet. Resumiendo lo de Medium, directamente de los datos. el número real de casos el día x es C(x)*M(x)/C(x-D)/T donde M(x) son las muertes del día x, T es la tasa de mortalidad (desconocida) y D es 10 días. 14/
Usando tasas de mortalidad de 1% (pesimista), 0,6% (en base a pub. científicas y ajustada a la pirámide de edad chilena) y 0,2% (como la gripe, optimista) hacemos un gráfico con eje y logarítmico. Es decir, hay más de 27 mil casos y sólo conocemos 27% de ellos. 15/
Y más de 10 mil pueden ser asintomáticos. En conclusión, para saber la realidad, tal como explico en Medium, tenemos que hacer muchos más tests focalizados en grupos aleatorios y grupos de riesgo. No se puede ser complaciente con una pandemia! 16/
Hasta ahora es como si fuéramos un grupo de jóvenes haciendo chistes sobre virus en un auto con barro en el parabrisas y posiblemente el chófer no tiene ni licencia de conducir. Podemos hacerlo mejor. @perez (gracias) @elaval @abarros @cadaunante 17/
Errata: misterios de la computación, dos países desaparecen cuando convierto el gráfico a una imagen, así que los tuve que agregar a mano. Por supuesto, por la ley de Murphy, uno de ellos era Chile y el otro el más alto, Turquía. 18/
Y elimine Australia por error!
