Thread by @bslagter

Een draad over de positieve coronatest. Wat zegt een positieve test? Heb je dan corona? Ben je besmettelijk? Zijn de cijfers wel betrouwbaar? 👇

2/ Als je je laat testen op corona, dan wordt de wattenstaaf naar een laboratorium gebracht, waar ze met een techniek met de naam RT-PCR op zoek gaan naar stukjes erfelijk materiaal (RNA) van het coronavirus SARS-CoV-2.

3/ Zo'n RT-PCR-test levert niet alleen ja of nee op, maar ook een Ct-waarde. Sterk versimpeld geeft die aan hoeveel moeite men moest doen om stukjes RNA te vinden.

Hoge Ct-waarde = zwak signaal (bijv. infectie lang geleden)

Lage Ct-waarde = sterk signaal (bijv. super shedder)

4/ In het Erasmus MC hebben ze onderzoek gedaan naar besmettelijkheid, en vonden dat het virus vaker succesvol opgekweekt kon worden (positive virus culture), in de volgende omstandigheden:

- bij lage Ct-waardes
- korter na begin van symptomen

medrxiv.org/content/10.110…

5/ Dit artikel in CEBM legt dat vrij toegankelijk uit. Er is nog een tijdje RNA meetbaar, zonder dat er nog besmettelijk virus is.

cebm.net/covid-19/infec…

6/ Hoe lang is er dan nog RNA meetbaar? Nou meestal niet erg lang. In Nederlandse ziekenhuizen gebruikten ze de PCR-test om te bepalen wanneer mensen uit isolatie mochten. Bij een groot deel van de IC-patiënten was de test na twee weken weer negatief.

h/t @BertMulderCWZ

7/ Tests in NL zijn erg specifiek: ze detecteren geen andere virussen. Helemaal in het begin zijn er tests ontworpen die ook varianten detecteerden, omdat men verwachtte dat het virus snel zou muteren (gebeurde niet). In dit artikel mooi uitgelegd.

virologydownunder.com/yes-pcr-tests-…

8/ Een positieve test is daardoor een sterke aanwijzing dat je:

(a) op dit moment geïnfecteerd bent
(b) op dit moment besmettelijk kunt zijn

Het is echter geen absoluut bewijs.

De betekenis van een positieve test hangt daarom af van de situatie. Laten we er drie bekijken.

9/ (A) Individu met symptomen

De combinatie van een "klinisch beeld" - symptomen waarvan we weten dat die bij Covid horen - en een positieve test is erg sterk. Goed genoeg om bijvoorbeeld een behandeling op de baseren, of in quarantaine te gaan.

10/ (B) Individu zonder symptomen

Een positieve test zonder de typische symptomen is een minder sterk signaal. Het zou kunnen dat je oude stukjes RNA meet. Bij het preventief testen van bijvoorbeeld reizigers of contacten uit BCO is dit een interessant gegeven.

11/ (C) Trends onder de bevolking

Wat betekent een stijgend aantal positieve tests? Zou het kunnen dat we nu vooral oude RNA-restjes meten? Dat we meer positieve tests meten omdat we meer zijn gaan testen?

Ivor Cummins noemde dat een 'Casedemic'.

https://twitter.com/timspector/status/1294223268308815872

12/ Er zijn 3 aanwijzingen dat dit niet het geval is.

Ten eerste zien we ook een stijgend aantal positieve tests in (ook Europese) landen waar men al maanden dezelfde teststrategie hanteert.

In Nieuw-Zeeland nam men in enkele weken tienduizenden tests af zonder 1 positieve.

13/ Ten tweede zien we het percentage positieve tests op het totaal aantal tests ook oplopen. Landelijk van <1% naar 3,2%, maar in sommige regio's tot boven de 10%.

14/ Ten derde, als de 'casedemic' hypothese klopte, dan zou je het percentage positieve tests zien teruglopen, omdat naarmate de tijd voortschrijdt steeds minder mensen restjes RNA in hun lijf hebben.

15/ Om meer inzicht te krijgen in wat er achter de positieve tests zit, zou het interessant zijn om per dag en per regio het volgende te weten:

(a) de gemiddelde Ct-waarde
(b) het percentage positieve tests

RIVM publiceert dat helaas niet.

16/ Critici hebben gelijk dat een positieve PCR-test op zichzelf geen absoluut bewijs is dat je (a) ziek bent of (b) besmettelijk bent.

Het maakt de methode niet direct "onbruikbaar" en "volslagen onzinnig" en "ridicuul".

Het dwingt wel tot voorzichtigheid bij interpretatie.

17/ Veel mensen die zich laten testen hebben namelijk daadwerkelijk klachten. Verlies van reuk of smaak, koorts, hoesten.

Na een positieve test is er voldoende aanleiding om thuis te blijven en bij verergering de dokter te bellen.

18/ Mensen zonder symptomen met een positieve test kunnen uit voorzorg voorzichtig zijn.

Net zoals veel vrouwen met een positieve zwangerschapstest meteen stoppen met alcohol en rauw vlees, terwijl slechts gemeten is of je hCG in je urine hebt, en de echo pas veel later volgt.

19/ Bij het analyseren van de cijfers moet je breder kijken dan alleen de reeks landelijks positieve tests, zoals:

- concentratie virus-RNA in rioolwater
- percentage positieve tests (stijging/daling)
- ziekenhuisopnames
- heterogeniteit (regio's, leeftijden)

20/ Laten we eens kijken naar het totaalbeeld nu.

(a) concentratie virus-RNA in rioolwater loopt op.

Afbeelding van het coronadashboard, maar zie ook onderzoek van KWR:

kwrwater.nl/actueel/de-nie…

21/ (b) percentage positieve tests stijgt, lokaal zelfs naar boven 10%

trouw.nl/binnenland/per…

22/ (c) ziekenhuisopnames stijgen

In een maand tijd:
- verpleeghuizen met besmettingen: 20 → 69
- mensen in ziekenhuis: 156 → 360
- mensen op IC: 23 → 56

23/ (d) het zijn nu vooral jongeren die ziek worden

h/t @BDDataplan

24/ (e) er zijn steeds meer gemeenten met oplopend aantal positieve tests (verschillende plekken dus)

25/ Mijn conclusies:

- Het zou kunnen dat er een achtergrondruis is van een klein deel van de positieve tests die oude RNA-restjes meten (de 'casedemic')

- Er is een heel duidelijk signaal van sterk toenemende verspreiding op verschillende plekken, waar mensen echt ziek worden