Urartu Şeker Profile picture
Sep 15, 2020 6 tweets 2 min read Read on X
Sars-CoV-2 labda üretildi geyikleri yeniden başlamış, bu sefer virüs üretim şeması bile var. Bu komplo teoricileri neden böyle biraz şey oluyorlar. Bari bilen birine hazırlatsaydınız, "structure guided design" yapıp reseptöre bağlanacak süper bölge bulacak kadar zekiyiz+
ama klonlamayı antika kes/yapıştır ile yapıyoruz. Çifte kesim yapınca geni tek yönde sokarsınız diye okumuşlar wikipediadan, iki restriksyon enzimi koyalım o zaman. Bu arada araya Furin enzimi kesim alanı koymamız lazım, salak olduğumuz için onu Desgined RBM'e baştan koymuyoruz
sonra aklımıza geliyor koyuyoruz, hem bu sayede QuickChange PCR'ıda bir şenlik olsun diye ekliyoruz, bir nevi küsuratlı vereyimde salladığım anlaşılmasın. Sonra kocaman genom birleştireceğiz, nasıl yapsak, literatür search hooop Gibson Assembly (Golden Gate daha şık dururdu).
Şimdi burada kafaları karışmış biraz : Yav acaba, Gibson işimizi görürü mü görmemez mi emin olamamışlar, o zaman lineer rekombinasyonu mayada yapalım (tabii ki wikipedia), oysa Gibson zaten 100 K ya kadar birleştirir, tüm genom 30K zaten, hep boş yere masraf nasıl olsa
Çin Komünist partisi veriyor parayı savur gitsin. Şaka bir yana, böyle şeyleri ciddiye almayınız, virüs evrimsel bir süreç sonrasında oluşmuş, bunun insanlar neden tasarlayamaz söyleyeyim orada yazdığı RBM (receptor bindin motif) tasarımı bu kadar güzel ve süper yapabiliyor +
olsaydık, pek çok süper bilgisayar yardımı ile orayı bloklayacak yapıyı da bulurduk. Siz en iyisi mi, bunları vesile görüp rekombinant DNA teknikleri okuyun bir değişiklik olur. Ayrıca ulaşabilenler için kitap önerisi

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with Urartu Şeker

Urartu Şeker Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @uosseker

Oct 23, 2022
Kimerik (birleşik?) virüs yapmak : bir virüse diğer bir virüsten parça alıp koymak şeklinde. Buna benzer bir deneme, Sars-CoV-1 virüsüne, doğadaki yarasalardan toplanan coronovirüslerden birisinin spike protein bölgesi eklenerek yapılmıştı.
nature.com/articles/nm.39…
Buradaki amaç, acaba coronovirüsler doğda evrimleşip başedemeyeceğizi hale gelebilirler mi, Sars'dan ve Mers'den sonra sorun çıkarırlar mı sorusuna cevap aramaktı. Ve bugünkü Sars-CoV-2 ile benzerliği olmayan bir virüsle, muhtemel bir gelecekte pandemi oluşabileceği+
hazırlanılması gerektiği bilim insanlarınca rapor edildi. Bu çalışmadan, kocaman kocaman yalanlarla komplolar üretildi. Oysa, Sars-CoV-2 , bambaşka bir virüstü. Sah,p olduğu furin kesim bölgesi, hücre girişide önemliydi. Özellikle bu bölgede genetik değişiklik yapıldığı iddia+
Read 7 tweets
Oct 23, 2022
" Virüs laboratuvarda üretildi", dayanaksız iddiası aşağıdaki ön basımda yeniden ortaya çıkmış. Detaylı bir analiz yazacaktım ki @virusfantom hocam yazmış. Şunu ekleyeyim; makalede iddia edildiği gibi genom assembly için endonükleaz kullanılır demek+
biorxiv.org/content/10.110…
ben bu işten hiç anlamıyorum demektir. Zira, genome assembly için çok daha ucuz, verimli ve hızlı yöntemler var : Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, linear rekombinasyonu. Bulduklarınıniddia ettikleri ortak enzim kesim bölgeleri anlamsız. Alçak gönüllü olmayacağım- oldukça +
deneyimili bir laboratuvarımız var. O nedenle bu konuda deneyimliyim. Böyle bir genom sentezi için cut/ligate yapıldığını düşünmek dahi komik. Böyle bir işe kalkışacaksanız ve cut/ligate ile assembly yapacaksınız. Şurada benzer bir iddiayı cevaplamıştım
Read 4 tweets
Mar 3, 2022
mRNA genome entegre oluyorcular yeni bir dandik makale yazmışlar. Bakalım bu süper iddialı makale ne diyor. Diyor ki, biz karaciğer kanser hücrelerine bastık mRNA aşısını sonra RT-PCR baktık, genomik DNA izole edip+
mdpi.com/1467-3045/44/3…
RT-PCR ile baktığımızda mRNA aşısından "parçalar" gördük diyor. Öncelikle makalede çok ciddi metodik hatalar var. Teknik olarak, insan hücrelerinde mRNA- DNA'ya geri dönmez, bunun için ters transkriptaz adı verilen bir enzim varlığı gerekir ki, bu enzime bezer aktiviteyi insanda+
çok düşük seviyelerde gösterme potansiyeli olan LINE elemanları adı verilen hareketli elemanlar sağlayabilir diye düşünülebilir. Ancak genomda belli bölgeleri copy/paste etme potansiyeline sahip olsalar da bu transpozonları kodlayan kısımların evrimsel süreçte çk fazla mutasyon
Read 12 tweets
Sep 12, 2021
mRNA aşılarının içinde grafen var diyen YALAN söylüyor, ve okuduğunu anlamakta ciddi sıkıntısı var. mRNA aşılarını oluşturan mRNA kodunu stabilize edip dayanımının artıran 5 ucunda yer alan bir kimyasal (patentli1) . Bu kodun en yüksek verimle viral proteini-antijeni üretmesini +
sağlayan ise hem 5 ucunda hem de 3 ucunda yer alan UTR adı verilen bölgeler(patentli-2) ile kodun sonunda yer alan polyA kuyruğu adı verilen (uzunluğu patentli-3) ve bu kısımda yer alan kısımlar (patentli) var. Bu yapıda iki çok kritik nokta var birisi, daha önce MERS aşısı için+
geliştirlen 2 proline mutasyonu (patentli), bir de normal RNA yapısında olan urasil (üridine şeklinde) yerine, pseusoduri diye bir analog molekül var (patentli) bunlardan ilki antikor cevabının ikincisi antijen üretini artırmak amaçlı. Tüm bu yapı lipit nanoparçacıkların içinde+
Read 6 tweets
Jul 24, 2021
Şu linktekini okuyup #PCRBalonuPatladı yazan ya katıksız cahildir, ya kötü niyetlidir. Anlamak isteyenler için açıklayalım. CDC diyor ki daha önce FDA aracılığı ile genel olarak önerdiğim spesifik PCR panelini önerimi geri çektim.
cdc.gov/csels/dls/locs…
artık FDA tarafından onaylanmış başka bir RT-PCR testini kullanabilirsiniz. Eski panel şuraydaydı.
fda.gov/media/134922/d…
Bunun bir kaç nedeni var, birincisi, artık sürekli yeni varyant çıktığı için varyant testleri de kullanımda olsun,
ayrıca ola ki bizim setimizden daha iyi prime proje testleri varsa onlar daha hassas olabilir, onlarında kullanımı için yeterince deneyim oluştu. Bir de demişler ki ayı anda hem gribe hem coronaya bakabilen testlere geçmek daha mantıklı olabilir.
Read 4 tweets
Jul 24, 2021
Sars-CoV-2'nin bloke edilmesi sağladığını gösterdiğimiz, proflaktik rekombinant protein ilaç adayımıza dair preklinik çalışmamız. Çalışmada da görüldüğü üzere, düşük viral yüklerde tamamen, yüksek viral yüklerde ise anlamlı ölçüde farelerde enfeksiyon engellenebiliyor.
GRFT adlı protein, virüsün spike proteini üzerinde bulunan şeker gruplarına bağlanıyor. Ancak spesifik bir AA dizin bağlanmadığından, tüm varyantlara ve oluşacak varyantlarda karşı da etkin olması beklenen doğal bir durum (test de edilecek). Burun spreyi formunda tasarladığımız+
bu ilacın preklinik çalışmaları aslında Kasım 2020'de, Ankara Üniversitesi'nden Prof. Aykut Ozkul @weirdvirus ve Hacettepe Ü.'den #ProfKorayErgunay ve benim yer aldığım bir ekip tarafından tamamlandı.
Read 7 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Don't want to be a Premium member but still want to support us?

Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal

Or Donate anonymously using crypto!

Ethereum

0xfe58350B80634f60Fa6Dc149a72b4DFbc17D341E copy

Bitcoin

3ATGMxNzCUFzxpMCHL5sWSt4DVtS8UqXpi copy

Thank you for your support!

Follow Us!

:(