C'est normalement les mêmes données que Géodes (SPF fournit les données)
C'est pratique car en un clic on récupère tout l'historique des données
Dans ces fichiers il y a deux variables "T" et "P". Dans le fichier de description des données il est indiqué P = "Nombre de test positifs" et T = "Nombre de test réalisés"
Mais quand on compare les valeurs de cette variable T, cela correspond en fait à l'indicateur "Nombre de personnes testées" de Geodes.
Dans mes graphiques j'indique "Nombre de test réalisés" mais cela devrait être "Nombre de personnes testées" (d'après la définition de SPF)
Là où ça se complique c'est que pour calculer le taux de positivité, le site de Geodes indique dans l'info de l'indicateur que la formule est "Nombre de tests positifs rapportés au nombre de tests réalisés"
Alors que si on regarde les indicateurs : "Nombre de tests réalisés"
"Nombre de personnes testées"
"Nombre de personnes positives"
"Taux de positivité"
On constate que la formule est en fait "Nombre de personnes positives" / "Nombre de personnes testées"
Alors d'où vient cette différence entre "Nombre de personnes testées" et "Nombre de tests réalisés" ?
A priori des re-tests, car si une personne fait plusieurs tests qui sont tous négatifs, SPF ne garde que le premier dans "Nombre de personnes testées"
Par exemple, si je fais un test qui est négatif le 1/9 et un deuxième test qui est négatif le 15/9, seul mon test négatif du 1/9 compte pour le taux de positivé du 1/9. Mon test du 15/9 est ignoré dans "Nombre de personnes testées" mais apparaît dans "Nombre de tests réalisés"
Si on compare "Nombre de personnes testées" et "Nombre de tests réalisés", on se rend compte que la différence s'accentue : de ~97% mi-mai à ~80% actuellement.
Ce qui veut dire que "Nombre de personnes testées" correspond à 80% de "Nombre de tests réalisés", ce qui semble indiquer que ~20% des tests pratiqués actuellement sont des re-tests.
Merci à @PGuerendel qui a soulevé la question ce qui m'a poussé à regarder de plus près.
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Petit retour d'expérience d'un échec personnel d'aide à l’installation de capteurs CO2 dans l'école maternelle de mon fils 1/N 🧵
Fin août 2021, voyant que rien ne bougeait j'ai proposé à la directrice de l'école de lui prêter un capteur ARANET4 personnel. Il fallait l'accord de la mairie 2/N
L'accord est arrivé la veille des vacances de la Toussaint (après 2 mois). Le capteur a été utilisé jusqu'à Noël avec beaucoup d'intérêt par l'équipe pédagogique 3/N
Santé Publique France publie ce soir un point épidémio. sur le COVID-19 chez les 0-17 ans.
Il contient notamment une information attendue depuis longtemps, les hospi. POUR cause de COVID ou AVEC le COVID (hospi. d'enfants COVID+ mais hospitalisés pour une autre raison)
Distribution hebdomadaire des cas pédiatriques nouvellement hospitalisés POUR COVID-19 en France du 01/01/2021 au 09/01/2022
Distribution hebdomadaire et par classe d’âge des cas pédiatriques nouvellement hospitalisés POUR COVID-19 en France du 01/01/2021 au 09/01/2022
À partir des taux d'incidence par niveau scolaire de la semaine 34 (semaine dernière) j'ai calculé l'estimation de la probabilité d'avoir au moins 1 cas positif dans un groupe de 30 élèves (de la même classe d'âges et du même département)
1/n
J'ai appliqué un facteur 3 sur les contaminations car les tests ne permettent pas d'identifier toutes les personnes positives (le choix de ce facteur peut être discuté).
2/n
J'avais déjà fait ce calcul en population générale il y a quelques mois
Les taux d’incidence, de positivité et de dépistage par niveau scolaire en France sont disponibles en open-data sur data.gouv.fr merci @SantePubliqueFr !
La transmission du SARS-CoV-2 entre groupes d'âge en France qui semblait être visible dans les cartes de chaleur (heatmap) en Août / Septembre a été étudié par @SCauchemez et al. @institutpasteur dans ce pre-print ⤵️
"Nous avons développé un modèle qui reconstruit la propagation du virus entre les groupes d’âge en nous appuyant sur les données des cas positifs et des hospitalisations stratifiées par âge dans les 13 régions métropolitaines, entre le 15 juin et le 28 septembre 2020."
"Dans toutes les régions, l’épidémie reprend chez les jeunes adultes et se propage dans les différents groupes d’âge pour atteindre les individus âgés de plus de 80 ans après 4 semaines en moyenne."