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Sep 24, 2020 20 tweets 7 min read Read on X
Carte du taux d'incidence par département (nombre de cas détectés pour 100 000 habitants sur les 7 derniers jours disponibles, ici du 15 au 21 septembre).

La France était à 83,6 jeudi dernier (96,4 après consolidation), aujourd'hui elle est à 102,7. Image
Image
Sur le point hebdo SPF.

Le R sur tests s'est stabilisé vers 1,1, le R Urgences (passage pour suspicion de Covid) a baissé à 1,25. SPF introduit un troisième calcul à partir des hospitalisations, à 1,28 cette semaine.

santepubliquefrance.fr/maladies-et-tr… Image
Commentaire de SPF sur les trois indicateurs. Image
Le taux d'incidence par région : Image
La courbe des tests positifs. Image
Après une semaine de plateau, le taux de positivité est reparti à la hausse depuis la mi-septembre. Image
Taux de positivité par classe d'âge.

germain-forestier.info/covid/heatmaps… Image
SPF : « Le taux de dépistage (nombre de personnes testées pour SARS-CoV-2 rapporté à la population) hebdomadaire était de 1 600/100 000 habitants et a légèrement diminué par rapport à la semaine 37 (1 678/100 000 hab., –5%). » Image
Étrange, la part des <20 ans dans les tests positifs est en augmentation, +40% entre la période 24/08—07/09 et celle 07/09—21/09.

Qu'a-t-il bien pu se passer ? Aurait-on entassé cette classe d'âge dans des salles mal ventilées avec des protocoles sanitaires en peau de lapin ? Image
Les 10-19 ans sont désormais sur-représentés dans les tests effectués. Les enfants sous 10 ans, eux, restent sous-testés et semblent décrocher bizarrement vite, même en tenant compte des délais de remontée. Image
De là à dire que les récentes directives relèvent d'un "sabotage" pour soulager un dépistage sous tension et éviter de devoir fermer des classes tous les 4 matins, il n'y a qu'un pas que nous nous garderons évidemment de franchir…
Évidemment, avec une incidence aussi élevée, le système scolaire (65 000 établissements) est chaque jour bombardé d'introductions, avec de gros trous dans la défense.

Capture d'écran du jour de la carte des Stylos Rouges, légende sur le lien.

google.com/maps/d/viewer?… Image
Les indicateurs hospitaliers.

L'exponentielle des décès a décollé à la mi-septembre, 2 semaines après celle des hospitalisations et réa. Les trois ont doublé en ~15 jours. Image
61% de symptomatiques pour les cas confirmés dont on connaissait le statut cette semaine, toujours en hausse. Image
Le délai moyen par région entre apparition des symptômes et date de prélèvement, autour de 3 jours en moyenne ; plus en Outre-Mer. Image
Et ce qui devait arriver arriva… Tout l'été, les entreprises avaient trôné en tête des foyers de contamination recensés (qui sont la pointe émergée de l'iceberg).

Après la rentrée, devinez qui est passé médaille d'or en une semaine ? Image
Un peu plus de détails (bienvenus) sur les lieux de travail où ont été recensés le plus de foyers de contamination. Image
La conclusion.

Plus haut, ils écrivent : « Si la dynamique de l’épidémie se maintient, il est estimé que le nombre hebdomadaire de nouvelles hospitalisations pour COVID-19 aura doublé dans 24 jours. » Image

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May 13
Rapport d'Axa sur la santé au travail : le taux d'absence en 2023 était 31% plus élevé qu'en 2019, avec une forte hétérogénéité selon les secteurs. Les troubles psychologiques et musculosquelettiques étaient les 2 premières causes d'arrêts longue durée.

axa-assurancescollectives.fr/wp-content/upl…
Chiffres 2023  Taux d'absence 4,2% +162% de recours au temps partiel thérapeutique en 4 ans < 30 ans : +30 d'absence depuis 2019 1/4 des arrêts de longue durée causés par des troubles psychologiques + de 3 salariés sur 10 absents au moins un jour -23% d'absences pour les salariés en télétravail
"Ce baromètre s’appuie sur le traitement anonymisé des Déclarations Sociales Nominatives (DSN) du portefeuille AXA observées en 2023, pour plus de 3 millions de salariés."
Les arrêt maladie de >2 mois sont en hausse constante depuis 2019 (taux d'absence de 1,9% en 2019 à 2,7% en 2023), tendance moins nette pour les arrêts de < 2 mois. Image
Read 13 tweets
May 2
[S17-2024] Point hebdomadaire C*vid et autres virus à transmission respiratoire du 22 au 28 avril 2024.

Activité C*vid en légère hausse depuis un niveau très bas. Image
Concentration de SARS-CoV-2 dans les eaux usées de 12 collectivités (des grandes villes de chaque région métropolitaine) : à un niveau très bas, la baisse est terminée depuis fin mars.

data.gouv.fr/fr/datasets/su…
Image
[S17-2024] Évolution des indicateurs la semaine dernière :

• incidence (PCR) : non publié
• passages aux urgences : +12%
• hospitalisations après passage aux urgences : +9%
• actes SOS Médecins : +4% Image
Read 6 tweets
Apr 29
Pas mal de choses intéressantes dans l'étude de l'ONS sur le Covid cet hiver.

Le résultat principal est que 3,3% de la population (95% IC : 3,1 à 3,5%) déclarait souffrir de Covid long, en légère hausse par rapport aux 2,9% (2,8 à 3,0%) de mars 2023.

ons.gov.uk/peoplepopulati…
The characteristics of those most likely to have self-reported long COVID followed a similar trend to that previously reported at the end of CIS in March 2023. As a proportion of the England and Scotland population during wave 4 in the Winter CIS, the prevalence of self-reported long COVID was greatest in people aged 45 to 64 years, in females (3.6% compared with 3.0% in males), in those who were not working and not looking for work (9.1%) and highest in the North West (3.8%) and the North East (3.6%) regions of England.
L'étude comporte 4 vagues :

Vague 1 : du 14 novembre au 14 décembre 2023
Vague 2 : du 12 décembre 2023 au 11 janvier 2024
Vague 3 : du 9 janvier au 8 février 2024
Vague 4 : du 6 février au 7 mars 2024
"Ceux qui avaient été vaccinés depuis septembre 2023 avaient une probabilité réduite d'être testés positifs lors des vagues 1 et 2 ; il n'y avait pas de différence statistique pour les vagues 3 et 4."

L'effet durait donc 4 mois au mieux, en phase avec… Those who have had a vaccination since September 2023 were less likely to test positive in the early waves of the study period (1 and 2); in later waves of the study period (3 and 4) there was no statistical difference.
Read 37 tweets
Apr 20
Étude en Australie sur quelques dizaines de Covid long suivis à 2 ans comparés à des contrôles : la "dysfonction" immunitaire que trouvait l'étude précédente à 8 mois est résolue à 2 ans, et 62% des Covid long avaient vu leur santé s'améliorer.

nature.com/articles/s4146…
Il s'agit de la suite de l'étude suivante (cohorte ADAPT), qui trouvait une réponse inflammatoire soutenue chez les Covid long par rapport aux contrôles (ce que les auteurs appellent "dysfonction immunitaire").

nature.com/articles/s4159…
Les auteurs concluaient : "Les causes de cette activation [immunitaire] requièrent d'autres études, mais les possibilités incluent la persistance d'antigènes, une auto-immunité déclenchée par une réactivité antigénique croisée, ou le reflet de la réparation des dommages."
Read 11 tweets
Apr 18
[S15-2024] Point hebdomadaire C*vid et autres virus à transmission respiratoire du 8 au 14 avril 2024.

Activité C*vid globalement stable, au plus bas depuis fin 2021. Image
Note : changement dans la présentation du niveau d'activité. De mémoire, j'avais calibré le niveau "très élevé" sur les pics BA.2 et BA.5, mais ils étaient un peu trop hauts pour ce qui semble être la norme depuis la rentrée 2022. Avec les nouvelles valeurs, les pics hivernaux…
… apparaîtront plus facilement au niveau "très élevé," ce qui me paraît plus conforme à la réalité de la circulation virale.

J'utilise également les hospitalisations plutôt que les passages aux urgences (sans doute moins de variation saisonnière dans le recours).
Read 11 tweets
Apr 4
[S13-2024] Point hebdomadaire C*vid et autres virus à transmission respiratoire du 25 au 31 mars 2024.

Activité C*vid globalement stable, au plus bas depuis fin 2021. Image
Concentration de SARS-CoV-2 dans les eaux usées de 12 collectivités (des grandes villes de chaque région métropolitaine) : au plus bas depuis le début des mesures.

data.gouv.fr/fr/datasets/su…
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[S13-2024] Évolution des indicateurs la semaine dernière :

• incidence (PCR) : -14%
• passages aux urgences : -9%
• hospitalisations après passage aux urgences : -2%
• actes SOS Médecins : +5% Image
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