Thread by @2Ludwig2

#COVID19COLIMA
Actualización 13 a 19 diciembre 2020, del Estado de Colima, en base a, las bases de datos abiertos @SSalud_mx , @saludcolima , @gobiernocolima y @GobiernoMX ; así como las proyecciones de @cimatoficial y @Conacyt_MX

Fuentes de información:
•Uso de datos abiertos (Ley): datos.gob.mx/libreusomx
•Uso de datos abiertos (Resumen): creativecommons.org/licenses/by/4.…
•Datos Federales: datos.gob.mx/busca/dataset/…
•Datos Estatales: datos.gob.mx/busca/dataset/…

•Proyecciones: coronavirus.conacyt.mx
•Ocupación Hospitalaria: gits.igg.unam.mx/red-irag-dashb…
•Todo sobre el COVID-19: coronavirus.gob.mx
•Datos Georreferenciados: datos.covid-19.conacyt.mx

Noticias más relevantes:

•La falta de vitamina D podría explicar un mayor trastorno del espectro autista en los niños: robotitus.com/la-falta-de-vi…

Exceso de Mortalidad en países seleccionados.
Fecha de corte: Finales de abril de 2020

Fuente: nytimes.com/interactive/20…

Exceso de Mortalidad en países y ciudades seleccionadas.
Fecha de corte: Inicios de diciembre de 2020

Fuente: ft.com/content/a2901c…

Curva Epidemia Estatal, por condición de los pacientes.

Desglose de la primera curva anterior.
•Activos Diarios.
•Recuperados Acumulados.
•Defunciones Acumuladas.

Y por porcentajes.
•Activos: 2.34%
•Defunciones: 10.78%
•Recuperados: 86.88%

Casos y Recuperados por Fecha de presentación.
Notas:
El 18 de julio 2020, tuvimos un recuperado menos.
El 20 de agosto 2020, se confirmaron 141 nuevos casos.

Defunciones por fecha de presentación.
Nota:
El 21 de septiembre, se confirmaron 15 defunciones.

Reporte Semanal de @SSalud_mx
•Por Clasificación Final.
•Por Resultado.

Pruebas Diarias que se han realizado en la Entidad al Corte a las 16:00 horas 17 de diciembre del 2020, según la SSA Estatal.

Pruebas por Semana Epidémica
•Por Positividad.
•Por Resultado.
•Reporte diario de @saludcolima aplicable.
Nota:
La positividad de la última semanas no cuenta, debido al alto número de sospechosos.

Aclaraciones.
•En realidad, hay 7,443 positivos y 6,794 negativos.
¿Por qué hay 7,443 positivos y 6,794 negativos, si registrados para ese día había: 7,244 positivos y 6,659 negativos?

Esto se debe a que @saludcolima en sus reportes diarios solo registra los casos ocurridos en pacientes, los cuales su residencia es el Estado de Colima.
Los 199 positivos y los 135 negativos "faltantes" son de:

Hay 80, pacientes residentes del Estado de Colima, que fueron atendidos en otros Estados, todos positivos.
De estos municipios:

Métricas por mes, según SSA Federal.
En total:
Personas Estudiadas: 16,536
Positivos: 7,610
Hospitalizados: 2,982
Defunciones: 1,063

Desglose de las personas estudiadas por mes.
En total:
Estudiados con muestra: 14,450
Estudiados sin muestra: 1,996

Métricas por semana epidemiológica:

Desglose de la métrica anterior.

Métricas de personas estudiadas por tipo de estudio y semana epidemiológica.

Por Jurisdicción las pruebas se realizan en:
Jurisdicción 1:
•Miguel Trejo Ochoa (ISSSTE)
•Hospital General de Zona 1 (IMSS)
•Usmer Colima (SSA Estatal)
•Usmer Zona Oriente (SSA Estatal)

Jurisdicción 2:
•Centro de Salud (Tecomán)
•Hospital General de Tecomán
Jurisdicción 3:
•Hospital General de Manzanillo
•Caps Manzanillo (SSA Estatal)

La Metodología de las pruebas en el Estado es:
•100% de pruebas a hospitalizados.
•100% de pruebas a defunciones.
•70% de pruebas a ambulatorios.

Casos Estimados:
Se uso el total de casos positivos por municipio y su relación para el calculo.
En total, existen 7,244 casos confirmados, 189,044 casos invisibles y 196,288 casos totales estimados.

De los cuales 58,886 casos fueron sintomáticos y 137,402 asintomáticos.

Explicación de lo anterior:
•De cada 100 personas con el virus SarsCov2 se han registrado al 3.69%.
•De cada 100 personas con síntomas asociados al virus, se han registrado al 12.30%

Lo que nos lleva a concluir:
•Los casos sintomáticos tendrían que multiplicarse por 8.13 y el total de casos por 27.10 veces, para conocer el total.
Como recordaran en su momento (marzo), la SSA Federal calculo estos mismos valores, solo que hizo hincapié en el primero.

Casos por Fecha de Registro.
Identifica la fecha de ingreso del paciente a la unidad médica de atención.

Esta semana 51, se agregaron 105 casos positivos, 13 defunciones y 274 casos negativos.
Nuestro pico de casos confirmados es, 25 de agosto con 84 casos confirmados.

Diferencia.
•Son 105 positivos: 105 de diciembre.
•Son 274 negativos: 274 de diciembre.
•Son 13 defunciones: 1 de julio y 12 de diciembre.

Fecha de Inicio de Síntomas.
Identifica la fecha en que inició la sintomatología del paciente.

Mismos casos confirmados y defunciones, pero re-acomodados a fecha de inicio de síntomas.
•Nuestro pico real es, el 10 agosto con 97 casos.
•Nuestros picos de letalidad son, el 11 de julio, el 9 agosto y 1 septiembre con 11 defunciones.

Mismos casos confirmados positivos, pero re-acomodados por Jurisdicción.
Jurisdicción 1:
•Comala
•Colima
•Coquimatlán
•Cuauhtémoc
•Villa de Álvarez
Jurisdicción 2:
•Armería
•Ixtlahuacán
•Tecomán
Jurisdicción 3:
•Minatitlán
•Manzanillo

"Lo que se confirma a diario, no es, lo que ocurre a diario"
¿Cómo se distribuyen a lo largo del tiempo, estos 105 nuevos confirmados y estas 13 defunciones confirmadas?

Acumulados:

Acumulado de casos.
•Mil en 119 días.
•Dos Mil en 19 días.
•Tres Mil en 18 días.
•Cuatro Mil en 17 días.
•Cinco Mil en 24 días.
•Seis Mil en 20 días.
•Siete Mil en 31 días.

Acumulado de defunciones.
•Cien en 90 días.
•Doscientas en 19 días.
•Trescientas en 15 días.
•Cuatrocientas en 16 días.
•Quinientas en 20 días.
•Seiscientas en 22 días.
•Setecientas en 23 días.

Número de días por casos activos y número de días por defunciones.

De estos 105 nuevos casos positivos, 14 corresponden a hospitalizados (total 1,815) y 91 de ambulatorios (total 5,795)

Los 105 casos positivos, se distribuyen:
•Armería, total 129 (+4)
•Colima, total 2,032 (+29)
•Comala, total 84 (+0)
•Coquimatlán, total 143 (+1)
•Cuauhtémoc, total 187 (+5)

•Ixtlahuacán, total 108 (+1)
•Manzanillo, total 2,069 (+32)
•Minatitlán, total 44 (+0)
•Tecomán, total 1,142 (+9)
•Villa de Álvarez, total 1,671 (+24)

Mismos casos positivos, pero acomodados por municipio y su porcentaje.

De las 13 defunciones nuevas, 13 corresponden a personas hospitalizadas (total 737) y 0 corresponden a ambulatorias (total 47)

Las 13 defunciones nuevas, se distribuyen:
•Armería, total 23 (+0)
•Colima, total 181 (+6)
•Comala, total 15 (+1)
•Coquimatlán, total 17 (+0)
•Cuauhtémoc, total 26 (+1)

•Ixtlahuacán, total 13 (+0)
•Manzanillo, total 262 (+3)
•Minatitlán, total 6 (+0)
•Tecomán, total 119 (+0)
•Villa de Álvarez, total 121 (+2)

Mismas defunciones positivas, pero acomodadas por municipio y su porcentaje.

Nota:
Comala no ha confirmado casos en las últimas dos semanas, sin embargo tuvo una defunción de un paciente de 84 años, que empezó con síntomas el 11/11, fue hospitalizado desde el 15/11 y finalmente falleció el 14/12.
Paso 29 días hospitalizado.

Tasa de ataque total y positividad actual por municipio.
A nivel Estatal:
•La positividad, total se sitúa en: 51.52%
•La tasa de ataque total, se sitúa en: 0.969%

Tasa de Letalidad por Municipio.
A nivel Estatal, la letalidad total se sitúa en: 10.29%

Evolución de los pacientes críticos positivos por porcentaje, desde el 1 septiembre a la actualidad.

Este es el estado, particular de los Pacientes Críticos Positivos al Corte a las 16:00 horas 17 de diciembre del 2020

44 ambulatorios en Terapia Intensiva.
Yo solo pongo lo que viene en la base de datos, no me invento nada.
Si pasa como con la enfermera de 0 años (ósea un error de dedo), se verá reflejado en la siguiente actualización.

Comorbilidades de los pacientes positivos y su tipo de manejo al Corte a las 16:00 horas 17 de diciembre del 2020

•Diabetes
•Enfermedad Pulmonar Obstructiva Crónica (EPOC)

•Asma
•Inmunosupreción

•Hipertensión
•VIH / SIDA

•Cardiovascular
•Obesidad

•Insuficiencia Renal Crónica
•Tabaquismo

•Otra Condición
•Embarazada (Corte del 19/12/2020)

Estado de los pacientes sin comorbilidades.

Estado de los pacientes con una sola comorbilidad.

Detalle de los pacientes con una sola comorbilidad.

Estado de los pacientes con múltiples comorbilidades.

Porcentajes y dobles comorbilidades de pacientes positivos.

Distribuciones de grupos de edades de los pacientes positivos.
•Positivos y Defunciones.
•Casos Ambulatorios y Hospitalizados.
•Defunciones Ambulatorios y Hospitalizadas.

Síntomas atribuibles a pacientes positivos.
•Por Casos Ambulatorios
•Por Casos Hospitalizados
•Por Defunciones Ambulatorias
•Por Defunciones Hospitalizadas

Casos Asintomáticos Positivos.

De los 274 negativos nuevos, 25 corresponden a personas hospitalizadas (total 1,082) y 249 corresponden a ambulatorios (total 5,798)

Los 274 negativos, se distribuyen:
•Armería, total 156 (+7)
•Colima, total 2,025 (+76)
•Comala, total 107 (+1)
•Coquimatlán, total 123 (+3)
•Cuauhtémoc, total 191 (+3)

•Ixtlahuacán, total 65 (+1)
•Manzanillo, total 1,505 (+78)
•Minatitlán, total 29 (+0)
•Tecomán, total 996 (+32)
•Villa de Álvarez, total 1,683 (+73)

Mismos casos negativos, pero acomodados por municipio y su porcentaje.

Se han registrado 9 nuevas defunciones en pacientes negativos, 9 de Hospitalizados (total 258) y 0 de Ambulatorios (total 6)

Las 9 defunciones negativas, se distribuyen:
•Armería, total 7 (+0)
•Colima, total 75 (+1)
•Cómala, total 7 (+0)
•Coquimatlán, total 1 (+0)
•Cuauhtémoc, total 10 (+0)

•Ixtlahuacán, total 3 (+0)
•Manzanillo, total 53 (+1)
•Minatitlán, total 4 (+0)
•Tecomán, total 37 (+0)
•Villa de Álvarez, total 67 (+7)

Mismos defunciones negativas, pero acomodadas por municipio y su porcentaje.

Evolución de los pacientes críticos negativos por porcentaje, desde el 1 septiembre a la actualidad.

Este es el estado, particular de los Pacientes Críticos Negativos al Corte a las 16:00 horas 07 de diciembre del 2020

Embarazadas negativas (Corte del 12/12/2020)

Porcentajes y dobles comorbilidades de pacientes negativos.

Distribuciones de grupos de edades de los pacientes negativos:
•Negativos y Defunciones.
•Casos Ambulatorios y Hospitalizados.
•Defunciones Ambulatorios y Hospitalizadas.

Síntomas atribuibles a los pacientes negativos:
•Por Casos Ambulatorios
•Por Casos Hospitalizados
•Por Defunciones Ambulatorias
•Por Defunciones Hospitalizadas

Casos Asintomáticos Negativos.

Hoy se termina la semana epidemia 51, y empieza la 52.
A nivel Estatal, las semanas epidémicas, se quedan:
•Casos confirmados: +0.74%
•Defunciones: -60%

Curva epidémica del Estado.
•Curva de casos confirmados.
•Curva de defunciones confirmadas.

Tasa de Mortalidad.
•A nivel estatal la Mortalidad es: 0.1353%
•Con 1,062 defunciones.
•La Mortalidad asociada a COVID-19 es: 0.0997%
•Con 784 defunciones.

Aclaraciones:
•En realidad hay 1,063 defunciones totales y 784 defunciones por COVID-19.
•Hay 0 defunciones sospechosas y, 1 defunción sin municipio causada por el COVID-19.

Casos positivos y negativos por profesión.

Positivos y Negativos del personal médico.
•El personal positivo representa el: 17.62% del total.
•El personal negativo representa el: 20.82% del total.

Detalle del personal positivo.

Detalle del personal negativo.

Para el Corte a las 16:00 horas 17 de diciembre del 2020
Habían estudiados 2,744 personas del personal médico, de los cuales:
•Positivos: 1,311
•Negativos: 1,414
•Sospechosos: 19
Aquí están, divididos por el mes en el cual, empezaron su sintomatología.

Han habido 220 profesionales de la Salud contagiados por el COVID-19 en Hospitales.
Aclarar que son mutuamente incluyentes y que no hay datos de noviembre, ni de diciembre.

Censo del personal de la Salud 2019.

Tasa de ataque por COVID-19 en el personal de la Salud, por municipio.

Personal Médico Estudiado por Municipio y su Resultado al Corte a las 16:00 horas 17 de diciembre del 2020, (aclarar que se uso el Censo del 2019, para el calculó).

Sospechosos y positividad del personal médico estudiado por municipio.

Al 2020, están registradas a nivel Estatal:
•938 camas de hospitalización.
•554 camas en otras areás.
Este es el desglose por municipio:

Reportes de @saludcolima de camas de hospitalización, asignadas a pacientes con Coronavirus.
24 marzo 2020: 694 camas totales y 29 con ventilador.
21 mayo 2020: 205 camas y 38 ventilador.
02 junio 2020: 239 camas y 46 ventilador.
31 julio 2020: 259 camas y 122 ventilador.

Nota: Para realizar los cálculos, tuve que ajustar los reportes.
Ajustes:
•01 octubre 2020: 275 camas totales y 134 con ventilador.

•01 septiembre 2020: 269 camas y 130 con ventilador.
•15 julio 2020: 254 camas y 103 con ventilador.
•01 julio 2020: 249 camas y 84 con ventilador.
•12 mayo 2020: 245 camas y 29 con ventilador.
•03 mayo 2020: 123 camas y 29 con ventilador.

Nota: No hay datos de hospitalizados, previos al 14 de abril.
•Unidades Médicas Covid en el Estado.
Colores:
Colima - Rojo
Manzanillo - Azul oscuro
Tecomán - Blanco
Villa de Álvarez - Amarillo
Armería - Morado
Cuauhtémoc - Azul claro
Minatitlán - Oro
Ixtlahuacán - Verde claro

Ocupación Hospitalaria Histórica por porcentaje, desde 01 de abril 2020

Ocupación Hospitalaria de las ultimas 2 semanas por porcentaje.

Curva estimada de Hospitalizados Totales.
Día con mas hospitalizados a la vez: 09 agosto 2020 con 176.

Curva estimada de Hospitalizados Intubados.
Día con mas Intubados a la vez: 09 agosto 2020 con 83.

Evolución del total de los pacientes críticos por porcentaje, desde el 1 septiembre a la actualidad.

Activos Diarios y Estimación de Pacientes Hospitalizados, últimas dos semanas.

Hay 14 pacientes mas, sin prueba, ni diagnostico, 10 de Ambulatorios (Total 1,756) y 4 de Hospitalizados (Total 71)

Los 14 pacientes mas sin prueba, ni diagnostico, se distribuyen:
•Armería, total 27 (+0)
•Colima, total 618 (+8)
•Cómala, total 37 (+1)
•Coquimatlán, total 29 (+0)
•Cuauhtémoc, total 51 (+0)

•Ixtlahuacán, total 4 (+0)
•Manzanillo, total 316 (+4)
•Minatitlán, total 10 (+0)
•Tecomán, total 202 (+0)
•Villa de Álvarez, total 533 (+1)

Sin cambios en las defunciones sin prueba, ni diagnostico; de Ambulatorios (Total 7) y de Hospitalizados (Total 8)

Las defunciones se distribuyen:
•Armería, total 0 (+0)
•Colima, total 5 (+0)
•Cómala, total 6 (+0)
•Coquimatlán, total 0 (+0)
•Cuauhtémoc, total 1 (+0)

•Ixtlahuacán, total 0 (+0)
•Manzanillo, total 6 (+0)
•Minatitlán, total 0 (+0)
•Tecomán, total 3 (+0)
•Villa de Álvarez, total 0 (+0)

Total de pacientes sin posibilidad de resultado, agrupados por semana epidémica.
Total de casos (por fecha de registro): 1,827
Total de defunciones (por fecha de ocurrencia): 15

Sospechosos con posibilidad de resultado.
•Hay 219 sospechosos.
•Hay 0 defunciones sospechosas.

Histórico de Sospechosos Locales, con posibilidad de resultado, de acuerdo a los informes diarios de @saludcolima

Indice de Movilidad.
Nuestra movilidad es de -13.4% de los niveles, previos a la Jornada Nacional de Sana Distancia.
La diferencia entre la semana previa es de, -0.5%

Modelo Gompertz.
Para el 16 diciembre, se esperaban 9,745 casos con un nivel de confianza del 99%, tuvimos 7,562 casos.
2,183 casos menos.

Las proyecciones estatales de @cimatoficial y @Conacyt_MX aplicables al Estado de Colima, se quedan:
Cambios a nivel Estatal:
•Pico de casos: Mismo día y mismos casos.
•Defunciones: Cuantil 9%

Casos diarios:
•Mediana: 62 (Sin cambios)
•Rangos: Sin cambios
Ocupación Hospitalaria:
•Mediana: 353 (Sin cambios)
•Rangos: Sin cambios
Unidades Cuidados Intensivos:
•Mediana: 90 (Sin cambios)
•Rangos: Sin cambios

Zonas metropolitanas:
Colima-Villa de Álvarez:
•Mediana de casos diarios: 40 (Sin cambios)
•Cuantil defunciones: 6.6%
Tecomán:
•Mediana de casos diarios: 16 (Sin cambios)
•Cuantil defunciones: 9.0%

Semáforo Epidémico Federal.
¿Cómo funciona?

Evolución de la ponderación del semáforo, desde los 10 indicadores.

Estatal

Jurisdicciones

Semáforo Epidémico Actual.
Colima se sitúa en, semáforo amarillo.

Los semáforos Federales, del día 07/12 al 20/12 están:

Entidades en Riesgo de volver al riesgo máximo.
Colima no esta en este grupo.

Entidades que subieron su riesgo.
Colima está en este grupo.

Y por último y como soy un #CerdoCapitalista , si quieren donarme algo, les dejo mi PayPal:
Solo si quieren y pueden.
paypal.com/paypalme/Ludwi…

Nos vemos, el siguiente año (ahora si).

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