1/ Résumé podcast #Drosten du 5/1/21
nouveau variant anglais: difficile de savoir ce qu'il en est vraiment, les experts anglais examinent ts les mêmes datas... donc prudence avec leurs conclusions.
Le DK séquence bcp aussi, ont nv variant qui se développe localement: à suivre!
3/ Comment ce variant a-t-il pu apparaître? virus resté longtemps chez patient immunodéprimé? sérum donné à un malade? virus qui a transité par un animal? mais pas de lien avec le virus du vison.
Ce virus a pu apparaître ailleurs avant sa découverte en GB medrxiv.org/content/10.110…
4/ Variant + contagieux? la Sras2 a déjà présenté cette mutation qui ne s'est pas imposée, ce n'est pas forcément un avantage pour lui (s'accrocher trop fort au récepteur rend difficile le décrochage)
5/ Afrique du Sud. Hypothèse: comme il y a déjà une forte proportion de population immunisée, le virus contourne le pb de nos anticorps en s'accrochant mieux à nos récepteurs (escape-mutation) medrxiv.org/content/10.110…
6/ On a une situation différente en GB: il y a une escape-mutation contre les anticorps monoclonaux, mais pas contre le sérum (polyclonal). L'examen du variant en laboratoire est encore en cours, il faut attendre
7/ Réinfection possible? ce n'est pas blanc ou noir, c'est possible mais avec symptômes légers. Il se *pourrait* que le vaccin marche un peu moins bien (= on aurait alors la gorge qui gratte un peu si contaminé)
-> donc pas d'inquiétude
8/ Si le variant se révélait effectivement + contagieux ce serait + inquiétant. Cela voudrait dire qu'il faudra + de mesures pour garder le R<1, surtout en période hivernale
9/ Dans l'ensemble, Drosten reste sceptique par rapport à + gde contagiosité. Ce sont des modèles qui ont conclu cela. Quant à la + grande charge virale chez les patients avec ce variant, elle peut s'expliquer par le "disease awareness" (on se fait tester + tôt à cause des news)
10/ Les enfants: pas de rôle particulier avec ce nouveau variant. L'incidence était déjà élevée chez les scolaires, et en décembre, beaucoup d'écoles se trouvaient en 40aine
11/ Par contre le virus Afrique du Sud est à prendre au sérieux. Certes on a moins de données. Preprint d'Italie montre qu'il arrive à se répliquer en présence de sérum d'anticorps.
Nécessité de surveiller les frontières tant qu'on n'en sait pas + biorxiv.org/content/10.110…
12/ Si ces nvx variants sont vraiment + contagieux, alors on aura un pb jusqu'en mai. Il faut s'y préparer. Trouver des concepts pour écoles, télétravail, transports en commun... Utiliser les tests antigéniques, changer les priorités vaccinales (métiers en contact avec le public)
13/ Trouver des solutions pour les gens qui ne peuvent pas manquer des jours de travail (précaires...), qui ne peuvent pas s'isoler chez eux (les mettre à l'hôtel). Il faut y penser tant qu'on a encore une marge de manœuvre. Fermer les écoles ne peut pas être la seule réponse
14/ Variant et efficacité du vaccin: n'est pas du tout inquiet. Il n'y a pas que les anticorps. L'immunité par les cellules T ne pourra pas être déjouée par mutations du virus avant plusieurs 10aines d'années.
15/ Le Sars2 va devenir endémique, il va "drifter" quand on sera immunisés. Nous sommes actuellement en période pré-endémique: on va encore s'inquiéter à propos de nouveaux mutants...
cf travail de Derek Smith à propos du virus de la grippe
16/ Stratégie vaccin: 2e dose vaccin mRNA = 3 à 6 semaines après. Le délai le + long est meilleur pour une immunité + durable.

Risque de résistance? possible, oui. Mais priorité à la protection des pop. Et puis on ne vaccine que certains groupes, et des variants circulent déjà
17/17 Maisons de retraite: ce ne sont pas les visiteurs qui contaminent les résidents, mais le personnel. Drosten ne croit pas qu'on puisse les protéger sans un lockdown

(ce podcast a duré 1 heure 55)
ndr.de/nachrichten/in…

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4 Jan
Le thread de @MartinFierro769 (du 2/1) a suscité pas mal de réactions. Il y avait à boire et à manger dans la vidéo, certes.
Le thread suivant -qui a eu moins de succès- identifie les pop à risque et appelle à des mesures ciblées moins délétères 1/
Je pense que c’est quelque chose à faire, et vite,
car avec le nouveau variant on va rapidement se retrouver devant un confinement très long et très strict, comme au printemps, avec toutes les conséquences qu’on sait 2/
L'effet des fêtes de fin d'année combiné à l'arrivée d'un nouveau variant plus contagieux va peser sur le système de soins
Si davantage de personnes sont contaminées, le nb de décès augmentera, ainsi que celui des hospitalisations 3/
ecdc.europa.eu/en/publication…
Read 10 tweets
26 Dec 20
1/ds cette itw Drosten dit qu'il n'y a pas d'élément qui permette de dire qu'il y a 70% de transmissibilité en +, c'est un chiffre qui a été "extorqué" et qui vit maintenant sa propre vie ds le discours politico-médiatique. Au RU il y a eu un lockdown géographiquement
2/ différencié et qu'il n'est pas possible de savoir si la vague du Kent+London est due au variant ou si ce variant est apparu à cause de la vague. Il faudrait analyser les paires de transmission. Il n'est pas inquiet car ce variant est sur le continent depuis au moins
3/ novembre (par ex NL) sans qu'il y ait eu emballement. Il pense qu'on est un peu trop alarmiste. Une meilleure liaison au récepteur n'est pas forcément une bonne chose pour le virus, ce st des choses qu'on a déjà vues auparavant ms ça ne s'est pas imposé
Read 4 tweets
9 Dec 20
🇩🇪 Prise de position académie nationale des sciences pour un confinement plus strict en 2 temps:
14/12: fermer les écoles et appeler à télétravailler
24/12 (au moins jusqu'au 10/1): fermer les commerces non essentiels et limiter les contacts à une même bulle 1/
avant de passer les fêtes avec des personnes à risque: quarantaine de 10j. Un résultat négatif avec un test antigénique ne vaut que pour la journée. 2/
modélisation: si mesures prônées prises le 14/12, on peut espérer une incidence basse en janvier (courbe verte). Si peu ou pas de mesures=courbes bleues (graph de gauche)
à droite, effet Noël: + de contacts (bleu foncé), même nb de contacts (bleu), lockdown strict (vert) 3/
Read 6 tweets
7 Dec 20
🇸🇪 Quelques graphiques concernant l'épidémie de covid en Suède (publiés le 4/12)
heatmap 1/ Image
🇸🇪 Focus écoles: incidence par âge quinquennal pour les 0-19 ans 2/ Image
🇸🇪 clusters dans les lieux ouverts au public autres que secteur santé: (de bas en haut) travail, préscolaire, primaire/collège, lycée, université, autres (loisirs, privé, restau...)
Comme je ne parle pas le suédois, je ne sais pas si le contact-tracing marche bien en Suède 3/ Image
Read 5 tweets
6 Dec 20
Vidéo vulgarisation vaccins covid de @florian_krammer Focus sur Pfizer dont les datas seront discutées à l'EMA le 29/12
162 malades ds groupe placebo/8 gr vacciné=probabilité de tomber malade réduite de 95%. Idem pour les 65-85 ans. 1/ Image
Moderna. 185 malades ds groupe placebo/11 gr vacciné=probabilité de tomber malade réduite de 94%.
Discussion EMA le 12/1
Pour les deux vaccins, ce qui a été mesuré, c'est la probabilité de tomber malade (≠ infecté). Pas de pb de sécurité jusqu'à maintenant. 2/ Image
Vaccins: conséquences graves peuvent survenir (ex narcolepsie H1N1 chez les jeunes; vaccin grippe et Guillain-Barré etc) après plusieurs jours ou mois. Importance des études phase 4 (standard avec nouveaux vaccins)
Balance bénéfices/risques: quel risque avec infection/vaccin? 3/ Image
Read 9 tweets
25 Nov 20
Résumé #Drosten podcast du 24/11. Les essais du vaccin AstraZeneca menés de manière différente selon le pays (Angl, Brésil): erreur? Il faut attendre les données, on n'a que des communiqués de presse.

Précision sur les vaccins mRNA: ils ne vont pas changer l'ADN des gens! 1/
🇩🇪 nb de cas ↘️depuis 1semaine, ms pas très rapidement. On pourrait agir sur télétravail, transports en commun, cours des élèves les + âgés.
Le protocole ds les écoles permet de garder les infections à un niveau raisonnable. Pb action hétérogène qd cas: la pol doit régler ça 2/
L'étude faite à partir des données mobiles USA nature.com/articles/s4158… transposable? 1e ≠ 2e vague (pas de masque...); USA ≠ Europe (utilisation de la clim ds bcp de bâtiments...)
10% des "points of interest"= 85% des contaminations (restau, cafés, gym, hôtels, églises...) 3/
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