Thread by @carol_perelman

No podemos andar la pandemia a ciegas:

➡️Además de diagnosticar y rastrear contactos, también hay que monitorear la evolución del virus🦠💉

Veamos q sabemos gracias a las 7,734 secuencias genómicas publicadas hasta 5/5/21 por México🇲🇽

Abro hilo 🧵1/10
mexcov2.ibt.unam.mx:8080/COVID-TRACKER/

El Consorcio Mexicano de Vigilancia Genómica🧬q reúne a @Tu_IMSS @RespiraINER @LANGEBIO @ibt_unam ha encontrado en México a las 4 variantes de preocupación (VOC:🇬🇧,🇿🇦,🇧🇷,🇮🇳) siendo la más prevalente de ellas la B.1.1.7🇬🇧: en <1% de las muestras en marzo y hoy presente en >5%
2/

Sin embargo la variante más abundante en el país es la B.1.1.519 hallada en el 78% de las muestras analizadas en 🇲🇽entre febrero y abril de 2021 de varios estados del país.

Esta variante fue detectada por 1a vez por el @INMEGEN el 17 de Nov de 2020
3/
medrxiv.org/content/10.110…

Esta variante (B.1.1.519) se ha encontrado principalmente en EUA y México, y contiene mutaciones en varias regiones del genoma:

4️⃣en la espícula (proteína S):
-T478K
-D614G
-P681H
-T732A

Además de mutaciones en región ORF1a/1b y proteína N
filogeneti.ca/covizu/
4/ @GISAID

El significado clínico y de salud pública de la variante B.1.1.519 habrá q analizarse siguiendo la evolución de los pacientes con esta variante y haciendo uso de herramientas de epidemiología...

Pero mirando de forma individual las mutaciones en el Spike encontramos que:...
5/

1.🌎ha aumentado la incidencia de la mutación T478K, resultado de la evolución convergente. El cambio en el sitio 478 de una Treonina (polar neutra) por Lisina (carga positiva) altera la interacción de la espícula con el receptor celular humano ACE2. 6/

doi.org/10.1101/2021.0…

2. Por su parte, la mutación P681H, el cambio de Prolina a Histidina está presente también en la variante B.1.1.7 británica y posiblemente ayuda al virus al momento de fusionarse con la membrana, aumentando la inefectividad 🤔7/

news-medical.net/whitepaper/202…

3. La mutación D619G surgió en China en etapas tempranas de la pandemia, y por su contagiosidad rápidamente se expandió en todo el mundo 🌎 llegando a estar en >98% de las secuencias. Todas las vacunas funcionan contra ella ✅👏🏻
8/
cell.com/cell/fulltext/…

4. La cuarta mutación de la espícula es la T732A donde en el sitio 732 se hace un cambio de aminoácido Treonina (polar neutra) a Alanina (hidrofóbico) sin q aún tenga un significado clínico conocido.
En enero COG-UK la había encontrado en solo 12 secuencias... 9/

Es importante la vigilancia genómica... así verificamos q las vacunas funcionan para protegernos de las variantes en circulación👏🏻💉...a seguir vacunándonos‼️
#VacunateYa ✅

➡️¿Habrá sido esta variante B.1.1.519 la principal en la enorme ola q vivimos en🇲🇽 en ene-feb🧐?

10/fin