Thread by @hk_nien

1/ Draadje reproductiegetal juli (dagelijkse updates).
Toelichting rekenmethode:

https://twitter.com/hk_nien/status/1364582102902145029

Draadje juni:

https://twitter.com/hk_nien/status/1399719106065096714

Rapportagevertraging:

https://twitter.com/hk_nien/status/1391384017929478144

2/ Update reproductiegetal Nederland t/m 23 jun: R=1.04. Boven de één! De schaduwpunten in de grafiek voor 24-26 juni liggen ruim boven de 1. Die zijn (nog) minder nauwkeurig, maar doet vermoeden dat vandaag niet een uitschieter naar boven was.

3/ Update reproductiegetal Nederland t/m 24 jun: R=1.22 (datapunt), R=1.14 (voorlopige trendlijn).
Veranderingen in R zijn altijd uitgesmeerd over een week in de berekening, dus het effect van 26 juni uitgesmeerd over 23-29 juni.

4/ In Enschede (superspread in de disco) en Amsterdam (feesten) gaat het nog harder.

5/ En hier de R per variant o.b.v. de laatste RIVM-update. Die data loopt wat achter op de positieve testcijfers en wordt met terugwerkende kracht gewijzigd. De R van de Delta is iets lager dan het eerder leek.

6/ Update reproductiegetal Nederland t/m 25 jun: R=1.46 (datapunt), R=1.35 (voorlopige trendlijn). Amsterdam 1.9/1.7, Enschede 5.3/3.3.

7/ Hier per-capita cijfers (7-d gemiddelde) voor provincies en grote steden (+Enschede). De R is de helling van de lijnen (logaritmische schaal). De "x2" bijschriften zijn o.b.v. week-op-week trends (zwarte stippellijnen).

8/ Update reproductiegetal Nederland t/m 26 jun: R=1.64 (datapunt), R=1.54 (voorlopige trendlijn). 26 juni was de datum van de versoepelingen. De R-schatting hier smeert het effect uit over een week, dus reken op nog 3 dagen verdere stijging.

9/ Hier nog de R voor Enschede en Amsterdam (en de positieve testcijfers per provincie en voor de grotere steden. ("2x" tijden zijn o.b.v. de zwarte stippellijn).

10/ Update reproductiegetal Nederland t/m 27 jun: R=1.76. Ook weer grafieken met provincies en steden.

11/ Update reproductiegetal Nederland t/m 28 jun: R=2.11 (datapunt), R=2.06 (voorlopige trendlijn).

12/ Update reproductiegetal Nederland t/m 29 jun: R=2.84 (datapunt), R=2.53 (voorlopige trendlijn). N.B. Hoger dan maart 2020 (R=2). Er staat nu '% gevaccineerd' in de bijschriften; dat staat voor mensen die volledig gevaccineerd zijn (volgens RIVM-definitie).

13/ Hier is de R voor regio's (steden en provincies).

14/ Update reproductiegetal Nederland t/m 30 jun: R=3.61 (datapunt), R=2.98 (voorlopige trendlijn).
Ik had verwacht dat hij nu wel zou stabiliseren rond 2.7, maar ja, duidelijk niet dus.

15/ Update reproductiegetal Nederland t/m 01 jul: R=3.69 (datapunt), R=3.21 (voorlopige trendlijn).
In elk geval stijgt hij niet (hard) verder mee; ongeveer dezelfde waarde als gisteren.

16/ R en positief (per capita) per provincie en per stad.

17/ Update reproductiegetal Nederland t/m 02 jul: R=3.77 (datapunt). Derde dag op rij met ongeveer 3.7. Effect sluiting nachthoreca gaan we pas een beetje zien in de dagcijfers op donderdag.

18/ Nu dus een verdubbelingstijd 2.1 dagen; extrapoleren naar a.s. donderdag is 50.000 positieve tests, als de testcapaciteit van de GGD's toereikend is. Enfin, hier nog grafieken per stad/provincie.

19/ Update reproductiegetal Nederland t/m 03 jul: R=3.18 (datapunt). Gelukkig weer een daling na drie dagen 3.7. "Daling van R" betekent overigens nog steeds verdubbelingstijd 2.4 dagen.

20/ Grafieken per provincie en stad. De positieve tests zijn 7-daags gemiddelden, op logaritmische schaal. Exponentiële groei = rechte lijn. (Geen dagcijfers omdat het dan een bende wordt met zoveel lijnen in een grafiek).

21/ Mogelijk toch geen daling van R. De komende dagen gaan we waarschijnlijk meer problemen met de datalevering zien. Wachttijd testen loopt vooralsnog niet op; ik zou in diverse steden morgen om 10:00 getest kunnen worden.

https://twitter.com/Thomas06901916/status/1414215073124470784

22/ Update reproductiegetal Nederland t/m 04 Jul: R=2.20 (datapunt).
Ik weet niet wat ik hiervan moet denken. Positieve tests uit Testen voor Toegang zijn sinds gisteren weggevallen; dat drukt de R-schatting. Ik kan zo gauw niet vinden hoeveel positieve tests uit TvT komen.

23/ De melding van gisteren over testachterstanden is weg. Maandagen hebben typisch 16% minder positieve tests dan de trend, maar deze R-schatting is daar al voor gecorrigeerd.
Mijn eerdere stelling 50k positief op donderdag o.b.v. verdubbeling per 2.1 d komt niet uit.

24/ Helaas moet ik een pauze inlassen in de dagelijkse R updates. De testlaboratoria en/of GGD lijken te kampen met achterstanden. Ik kan nu geen cijfer neerzetten waar ik zelf in geloof.

https://twitter.com/hk_nien/status/1414915662783336458

25/ Update reproductiegetal Nederland t/m 05 jul: R=1.52 (datapunt). Het lijkt erop dat de vertragingen niet zo hard oplopen als gevreesd. Ik heb nu aangenomen dat de tijd tussen infectie en testuitslag met 1 dag is toegenomen. Hierdoor zijn de R-waarden rond 1 juli naar boven…

26/ …bijgesteld. (Die extra dag is een aanname!) Deze R-schatting is in essentie een maat voor de week-op-week groei in de dagcijfers; interpreteer voorzichtig. Zie ook hier over de vertragingen.

https://twitter.com/hk_nien/status/1415306382459510787

27/ Update reproductiegetal Nederland t/m 06 jul: R=1.37 (datapunt). Voorbehoud over de onzekere doorlooptijd van infectie tot testuitslag en natuurlijk of we evenveel % van de infecties zien. Zie ook:

https://twitter.com/hk_nien/status/1415662806897209344

28/ Update reproductiegetal Nederland t/m 07 jul: R=1.23 (datapunt).
De RIVM-waarde (1 juli) is deze keer substantieel lager dan wat ik vind. Ik ben benieuwd hoe de RIVM-R zich verder ontwikkelt. >

29/ Aangezien beide berekeningen zijn gebaseerd op het aantal positieve tests en de R-schatting een maat is voor groei/krimp daarvan, zal RIVM-R alsnog moeten stijgen òf veel langzamer dalen.
Zie ook opmerkingen hierboven over de onzekerheden nu.