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Jul 20, 2021 19 tweets 9 min read Read on X
Ich hab nicht nur viele Bilder aufgenommen, sondern beschäftige ich mich auch mit deren Qualität in Publikationen. #DataEthics

~4% der wissenschaftlichen Artikel haben manipulierte Bilder. Bei ~1 mio publizierter Artikel pro Jahr könnt ihr ausrechen wieviele das pro Tag sind!
Für #ImageForensics ist Elisabeth Bik @MicrobiomDigest eure erste Adresse, sie spürt besser als jedes Gerät ungewöhnliche Pixelabweichungen in wissenschaflichen Bildern auf!

Hier hat sie dazu einen Artikel verfasst: journals.asm.org/doi/10.1128/mB…
Ein erster Artikel ist auch hier schon erschienen, der das Problem mal benannt hat:
rupress.org/jcb/article-lo…

Worum gehts bei #ImageForensics? Versucht es mal, ist das Bild unten eine mikroskopische Aufnahme, oder Fake? Image
Und noch ein Versuch, weil's so schön ist: Image
Bei dem Gesamtbild sieht man ganz klar, dass es aus mehreren Bildern zusammengeschnitten wurde. Image
Hier noch ein Beispiel, oben das publizierte Bild, unten die Analyse der Pixel-Intensitäten, zeigt: das erste ist KEIN Bild, sondern ein schwarzer Kasten, beim mittleren Foto ist der Rand manipiliert/insgesamt Intensity erhöht worden. Bild, und unten Analyse der...
Hier ist in dem Fachmagazin @Nature ein Protrait über Elisabeth Bik und ihre Arbeit, guckt unbedingt die Bilder durch, da kann man sich selber trainieren in image forensics!

nature.com/articles/d4158…
Es aber auch Bilder die einfach unwissenscahftlich/unverständlich sind, das haben @TraceyWeissgerber, ich & ein int. Team an 600 Manuskripte untersucht. Wir haben systematisch geguckt: passt da alles? Spoiler: nö!
Wir haben in Top-Publikationen der Physiologie, der Pflanzenwissenschaften und Zellbiologie systematisch geguckt:

45-70% der Bilder hatten KEINE oder LÜCKENHAFTE Massangaben (scale bar) - und das lernt man doch schon sehr früh als Wissenschaftler: Image
Richtig wäre es so, mit Skalierung im Bild (noch ok: Vergrößerungsfaktor)

Jedes wissenschaftliche Bild brauch unbedingt eine Größenangabe, damit vergleichbar bleibt! Kann ja sein, dass durch einen Defekt plötzlich Zellen kleiner bleiben

Mehr (EN):
helenajambor.wordpress.com/2017/08/06/sca… Image
Oft sind Farben in Bildern auch nicht oder nicht gut sichtbar. Hier Zellen auf verschiedenen Hintergrund Farben... Image
in Schwarz-Weiss sieht man welche Farbkombinationen besten Kontrast haben.

Blau auf Schwarz = ganz blöd für kleine Details visualisieren

(🚨Beim Invertieren von Farben, was der Sichtbarkeit hilftt!, muss dringend darauf geachtet werden ob die Software das linear macht) Image
Wichtig es gibt Farbkombinationen die Farbblinde nicht sehen können. Wenn es separate Farbkanäle gibt --> alternative Farben wählen (Software 'Lookup Table', LUTs genannt)

🛠️alert colororacle.org = freie Desktop-App zur Simulation wie Farbblinde sehen -> auch für Charts! ImageImage
Und klar, bitte auch bei Beschriftungen an Farbblinde denken und Rot/Grün Kombinationen vermeiden!

In unserer Untersuchung NICHT lesbar für Farbblinde waren:
30-50% aller von uns gescreenten Bilder
15-40% der Bildbeschriftungen waren Image
Apropos Beschriftung, es gibt eine Obergrenze was wir verarbeiten können, da kommen auch Normalsehende an ihre Grenzen:

Und ein Teil des Bilds sollte immer noch sichbar bleiben. Image
Unser Artikel mit noch mehr Tipss ist hier:

journals.plos.org/plosbiology/ar…

Bei Interesse auch mal bei @T_Weissgerber gucken (EN)
Wer noch mehr wissen will zu Bilder in den Wissenschaften, hier ist ein Spickzettel (Cheat Sheet) mit Tipps.

Übersetzungen ins DE, Plattdeutsche und Österreichische sind aus Zeitmangel bisher nur angedacht.
@ChriSchmied + @helenajambor haben CC0 darauf -> jeder darf loslegen Image
🛠️Alert: wer noch Photoshop nutzt, @FijiSc ist eine open source + freie Alternative;
Und das Cheat Sheet wie man die Visualisierung in FIJI umsetzen kann haben wir auch schon gemacht.

Und weil ihr alle gerade am Strand seid: damit kann man auch Urlaubsfotos bearbeiten! 🏖️🌴 Image
update-update-update, hier das aktuelle Cheatsheet zum Visualisieren von Billdaten:

Alle Dateien:
osf.io/cjp8w/#! Image

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Dec 4, 2023
⚡️Transkutane Vagusnerv-Stimulation (taVNS)⚡️
#vagusnerv #stimulation Image
1.1 ⚡️Habt ihr schon mal bemerkt, wie us Ohren in ihrer Form und Größe sind? Die Ohrmuschel hat Nervenverbindungen zum Vagusnerv (rot im Bild).Für nicht invasive Vagusnerv-Stimulation platzieren wir Elektroden in der Ohrmuschel (transkutan = "durch die Haut").
1.2 Vor allem ein Bereich, der sich „cymba conchae“ nennt (dunkelrot im Bild) wird dabei oft benutzt, da er ausschließlich durch den Aurikularast des Vagusnervs (ABVN) innerviert wird. Aber es gibt auch andere Stellen in der Ohrmuschel, die man für eine taVNS nutzen könnte.
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Nov 17, 2023
Noch ganz kurz zum Thema Energieprojekte. Was ist wichtig, um hier die Akzeptanz zu erhöhen? Das erste ist, Vertrauen zu schaffen, indem Menschen vor Ort mit in das Projekt mit eingebunden sind (Segreto et al., 2020). D.h. eine transparente und klare Kommunikation… (1/7)
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Aug 27, 2023
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Aug 23, 2023
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