Thread by @arikouts

Il y a quelque chose qui m’interpelle depuis quelques semaines, quand on regarde les discussions sur « le vaccin ne permet pas d’arrêter les transmissions ». On réfléchit beaucoup trop en « distribution horizontal » et on oublie totalement les chaînes de contaminations
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Ca a commencé avec la grand-mère de @MartinBlachier, en gros « 64% c’est nul, inutile de se vacciner pour limiter les transmissions » (bon toujours pas compris pourquoi la grand-mère de l’histoire est pas vaccinée)

https://twitter.com/boutaour/status/1412789560451473410

Il n’a pas forcément tort sur le pass, enfin il ne l’invalide que si on fait tomber en même temps les gestes barrières…. Mais il oublie une bonne partie du sujet

https://twitter.com/arikouts/status/1417510471243075588

Un second point, c’est le fait qu’en Israël le virus se propage tout de même (on verra plus tard l’effet réel) et que le CDC explique qu’un infecté delta vacciné ou non, on propage autant (au moins au début)

https://twitter.com/vincentglad/status/1421161486831992840

C’est donc la fin du monde, le vaccin ne sert à rien, et même quelqu’un de parfois censé commence à perdre de vue certains des effets d’une vaccination complète de la population

https://twitter.com/AQuatennens/status/1421468328506413060

Reprenons la grand-mère de Blachier dans son exemple, un jeune va en boite de nuit, et puis va voir sa grand-mère. Il y a donc dans cette histoire 3 personnes qui peuvent être vaccinée, celui qui amène le virus en boite, le jeune et sa grand-mère.

Pour lui inutile, le vaccin des jeunes ne protègera plus la grand-mère. Ce n’est pas aussi simple….

Les probabilités ont un effet multiplicatif, on ne peut pas oublier les probabilités précédentes quand on veut chercher un effet
En gros quand on regarde la probabilité au maillon 3 d’une chaine (la grand-mère) on doit regarder les maillons 1 et 2 aussi.

Prenons quelques hypothèses (pour simplifier)
- 50% de risque d’infection quand on est vacciné (100% sans)
- 100% de transmission (le vaccin ne fait rien sur la transmission quand on est infecté)
....

- Chaque personne ne va rencontrer que 2 personnes (différentes de toutes les autres) et ne rencontre qu’une fois le virus (il va être infecté ou non donc)
- Personne encore immunisé hors vaccin

Dans 2 mondes parallèles de nos little dudes avec sars cov 2, l’un 0% vacciné, l’un 100%, on a donc 10 infectés dans l’un et 5 dans l’autre (proba 1/2 d'être infecté si vacciné)

On passe à la phase suivante, chacun rencontre 2 personnes, pas de gestes barrières :
- 30 infectés au total dans le monde sans vaccin
- 10 dans le monde 100% vaccin (1/2*1/2)

On constate 2 premières choses
- On a 3 fois moins d’infectés dans le monde 100% vacciné
- On a un R 2 fois plus petit
Même avec 50%, le vaccin joue énormément sur l'épidémie

Phase 3, phase de la grand-mère :
- 70 infectés dans le monde sans vaccins
- 15 au total seulement dans le monde avec vaccin - 5 par phase - (1/2*1/2*1/2)

Si la partie grand-mère (phase 3) c’est que des non vaccinés, on arrive à ça dans le dernier groupe :
- 10 infectés (non vaccinés) VS 40 infectés (non vaccinés) dans le monde 0% vaccin
Soit 4 fois moins déjà

Dans l’exemple de Blachier, on a donc (je simplifie à l’extrême, me tombez pas dessus !)
1) Personne n’est vacciné => La grand-mère va le choper à 100% X la prévalence dans la société

2) Tout le monde est vacciné => la probabilité est de 1/2*1/2*1/2 = 1/8 donc 12,5% X la prévalence dans la société actuelle. On a réduit de 8 la probabilité de le choper au 3ème cercle

Et si elle n’est pas vaccinée, ça reste 4 fois moins de probabilité

Bien entendu il faut prendre en compte qu’en vie réelle on rencontre plus de gens, mais aussi qu’on fait attention (ou pas), qu'on s'isole etc.

Reprenons en israel, le virus est arrivé par les enfants non vaccinés, le R a explosé, puis il est passé dans les personnes vaccinés, il redescend, et là il repasse dans les zones moins vaccinés et il y a une peur que ça rexplose (on le voit déjà dans les cas graves)

Le vaccin est donc un outil important pour réguler aussi le taux de transmissions, car le « mur » qu’il impose réduit de facto le R effectif (je rappelle que le delta à un R théorique de 6 ! Mais on ne constate que des R à 1-2 dans les pays vaccinés).

Je ne suis pas le seul à voir qu’on oublie ça et c'est très dommage

https://twitter.com/Jean__Fisch/status/1421382685243629570

Quant à la question du pass sanitaire, tant que la prévalence est élevé, et le taux de couverture bas, on ne peut pas baisser les gestes barrières. L’un ne remplace pas l’autre. C’est une mauvaise idée de faire tomber les masques donc.

Il n’est donc pas inutile de vacciner une large partie de la population, notamment pour protéger les plus faibles, et aider sur l’immunité de groupe, et limiter les transmissions

https://twitter.com/arikouts/status/1397532400536670217

On lit aussi que les vaccins vont « créer » des variants. En réalité c’est la large diffusion dans la population qui va les créer (les mutations sont des « erreurs » pas des choix)....

Le vaccin peut par contre faire une « pression » de sélection et seuls ceux qui peuvent infecter les vaccinés vont rester.

En réduisant la transmission, on réduit donc la fabrication de variant, mais on garde que celui qui passe le mieux (ici celui à 50% par exemple – le delta). De plus on baisse la charge virale rapidement, on évite donc les réplications avec erreur

En effet on réduit plus rapidement la charge virale et on réduit la circulation

https://twitter.com/vincentglad/status/1421487858527862785

Mais si on est dans un monde hybride (comme en ce moment notamment dans les pays où il y a peu de vaccination) on pourrait avoir les 2 effets kiss cool, pas top, comme expliqué dans ce model….
nature.com/articles/s4159…

Le vaccin n'est pas "une solution miracle" mais si réalisé conjointement et rapidement avec d'autres mesures, un des meilleurs outils que l'on a.

Tl;dr on n’est pas dans un monde horizontal et la vaccination a aussi un effet bénéfique sur la transmission et les chaînes de contaminations, même si pas parfaite, et même à 50% seulement. Mais ce n’est pas suffisant en l’état actuel des choses avec un variant avec R0 à 6