שרשור על מה זה Molnupiravir, התרופה החדשה של Merck כנגד Covid19.
יאללה מתחילים.
הדבר הראשון שרואים היא שהתרופה (משמאל) נראית כמו נוקלאוטיד RNA שנקרא Cytidine ומצוי בכל תא של אורגניזם בטבע (מימין).

אגב, איך אני יודע שזה נוקלאוטידים של RNA ולא DNA? רואים למטה כמו שני רגלים עם OH בכל צד? אז אם הרגל הימנית היא OH, זה RNA, ואם היא פשוט H, אז זה DNA. קל!
הדימיון כמעט מושלם חוץ משני מקומות:
השינוי בכחול הוא לא כזה חשוב לענייננו. מדובר בתוספת שיורדת מהר מאד בגוף על ידי אנזים מיוחד ומחזיר אותנו למצב כמו ב Cytidine רגיל.

השינוי ה OH בחלק שסימנתי באדום הוא הקסם של המולקולה הזאת שהופכת אותה מסתם Cytidine לסוכן כאוס.
איך?
אז בוא נזכיר שבגוף יש ארבע סוגי נוקלאוטידים שמהוות את אבני הבניין של דנ״א ורנ״א: Cytidine מיודענו, יחד עם Adenosine' Thymidine*, ו Guanosine או בקיצור: C,A,G,T.
החלק הצבעוני נקרא הבסיס של הנוקלאוטיד ונותן לו את היחודיות שלו.
*ברנ״א יש שינוי קטן ולא מהותי ב Thymidine שנתעלם ממנו.
ארבעת הנוקלואטידים האלה מושכים אחד את השני כמו קטבים של מגנט. האזורים עם קבוצות החנקן-מימן (NH) הם חיובים והאזורים עם קבוצות החמצן (O) הם שלילים.
ככה יש שתי זוגות:
א C מתחבר עם G
ב A מתחבר עם T
וככה חברים אפשר ליצור סליל כפול ולשכפל מולקולות דנ״א ורנ״א!
בוא רגע נעצור ונפנים את הפרט המרגש הזה שהוא הבסיס לחיים על כדור הארץ.
חזרה ל Molnupiravir!
התוספת באדום יוצרת יכולות חדשות. כמו הנוכלים של חיים אתגר התרופה נראית כמו נוקלאוטיד נורמלי מבחינת מכונות השכפול של הוירוס והוא מכניס אותו לגנום שלו כאילו הוא C רגיל.
אבל שהוירוס ישכפל את עצמו, התוספת הקטנה גורמת שבמקום ש G יתחבר מולה, A יתחבר!
רגע. למה זה כזה חשוב?
כי גרמנו לוירוס לעשות טעות בקוד הגנטי שלו. במקום לשים G מול C הוא שם A בכל פעם שהתרופה הקטנה נכנסה לו לגנום. ושיש לוירוס המון טעויות בגנום, אין לו שום יכולת יותר לקודד את מכונות השכפול שלו ולכן הוא סתם מולקולת RNA שזרוקה בתא שתוך כמה שעות תתפרק.
🧬⬅️🗑️
אגב, הרבה תרופות אנטי-ויראליות עובדות על עיקרון דומה:
לתת נוקלאוטיד משונה לוירוס שמשתכפל באמוק כדי שיהרוס את עצמו בתהליך. רמדסיביר הוא נוקלאוטיד דומה מאד ל A רק במקרה שלו הוא ״אמור״ לתקוע את מכונת השכפול ולא להכניס מוטציות.
מסיבות לא מובנות, זה פשוט לא עובד💁‍♂️
סיכום ביניים: Molnupiravir גם מבוססת RNA. אבל בניגוד לחיסון, פה זה לא מולקולה ענקית של אלפי נוקלאוטידים שמקודדים חלבון. כאן יש רק נוקלאוטיד בודד שהוא סוס טרויאני. תרופה כזאת קל יותר לייצר. אבל ההבדל במנות הוא ענקי:
בחיסון של פייזר כמות הRNA היא 0.00003גרם/מנה וכאן היא 0.8גרם!
למה צריך כאלה מנות ענק?
כי אנו רוצים שבכל תא מטרה (ריאות, מערכת נשימה, וכו׳) יהיה מספיק מהנוקלואוטיד הזה כדי שהוירוס משתכפל הוא בסבירות גבוהה יכניס אותו לתוך הגנום שלו ויקרוס לתוך עצמו.
זה מביא אותנו לדבר על הבטיחות של Molnupiravir ויש לנו שתי בעיות:
1. גם התא האנושי עשוי להתבלבל ולהכניס את הנוקלאוטיד הזה לתוך הדנ״א שלו. נכון שזה RNA, אבל יש אנזימים בתא שיודעים להפוך אותו ל DNA. ניסוי תרבית הראו שהוא אכן עשוי להכנס לדנ״א ולגרום למוטציות.
academic.oup.com/jid/article/22…
זה דורש התייחסות. חלק לא קטן מהחולים הלא מחוסנים הקשים הם צעירים יחסית. הטיפול הזה דורש מהם לקחת גרמים של נוקלאוטיד שעשוי ליצור מוטציות בדנ״א שלהם. זה לא פוסל את הטיפול אבל יהיה מעניין לראות את ההתייחסות של ה FDA לפרופיל הבטיחות של התרופה.
בעיה 2 היא יצירת זנים עמידים. הטיפול למעשה מעלה בצורה מלאכותית את קצב המוטציות של הוירוס. באופן אירוני אם אנחנו מפחדים מזנים חדשים, פה אנחנו יוצרים הזדמנות ליצירת זן כזה. אני פחות מוטרד מאפשרות כזאת. למה?
וירוסים עברו אופטימיזציה של קצב המוטציות שלהם. ברגע שיש יותר מדי מוטציות קשה להשביח את הזן והם יותר עסוקים בלהרוס את מה שעובד.

אבל הייתי רוצה לראות ריצוף של הוירוס אצל בן אדם שלקח טיפול חלקי (בלע רק כדור אחד ולא 5ימים כפול שתי טיפולים ביום) ואם זה מדגרת זנים.
סיכום:
הכדור שב Molnupiravir הוא בהחלט התקדמות משמעותית אבל לא קסם. יש תוצאות יפות אבל צריך לראות את סך הדברים כולל היבטי הבטיחות. בכל אופן, בבחירה בין חיסון לכדור כזה, אני הייתי לוקח את החיסון.
תוספת: שאלו אותי האם Ivermectin דומה איכשהו לתרופה. אז התשובה היא לא. ככה נראה החומר הפעיל אצלה. זה לא נוקלאוטיד ולא נכנס לגנום. היא נקשרת לתעלות יוניות של חרקים ותולעים ובכלל לא אנטי ויראלית.

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with 𝄃𝄃𝄂𝄂𝄀𝄁𝄃𝄂𝄂𝄃-⚪ Yaniv Erlich יניב ארליך

𝄃𝄃𝄂𝄂𝄀𝄁𝄃𝄂𝄂𝄃-⚪ Yaniv Erlich יניב ארליך Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @the_yaniv

Apr 26
כמה חומר נפץ התפוצץ היום בבנדר עבאס?
#פידמדע פוגש את #פידאוסינט.
בוא לשרשור מרתק.
👇
בגדול הרעיון הוא שגל ההלם של הפיצוץ מתפשט כתלות באנרגיה הראשונית. מה שאתם רואים כאן זאת משוואה (מגעילה) שיש לה שלושה פרמטרים: זמן (ta), מרחק מתוקנן (Z), וכמות האנרגיה בק״ג של TNT (W) ונמצאה בניסויים של חיל האויר האמריקאי.
בואו נפתור!

מקור: link.springer.com/article/10.100…Image
שלב 1: זמן.
לקחתי את הסרטון של הבחור האיראני ומצאתי את הפריים של ההבזק לעומת הפריים שעף לו הטלפון כתוצאה מגל ההלם

1.63 שנ׳ זה הפיצוץ
3.30 שנ׳ עף לו הטלפון מהיד (תראו את הפריים לפני).
כלומר עברו 1.66 שניות. Image
Read 10 tweets
Apr 22
על היהירות והדורסנות של יובל כאהן שמענו מספיק. האיש קורא למדריך שלו ״הפוץ הזה״ רק כי הוא מתריע על מזג האויר.

אבל הכרעת הדין ב״אסון נחל צפית״ היא לא מסמך למשפטנים אלא להיסטוריונים וסוציולוגים.

כנסו לשירשור👇 Image
מה שהעפיף לי את המוח במסמך הכרעת הדין הוא הרעיון המסדר של יובל. הבן אדם למעשה פיתח תיאוריה הלכה למעשה על איך ניתן לטייל בביטחה בנחלים כאשר יש סכנת שיטפון. עשרות עמודים מוקדשים לבירור הרעיון שלו שעומד במרכז האסון וכולל עדויות מומחים להידרולוגיה ומטרולוגיה. Image
התיאוריה היא סופר טכנולוגית ומתבססת למעשה על שלוש הנחות: (א) שיטפון זורם בקצב 5ק״מ (ב) ניתן לחזות את שעת השיטפון באמצעות הערכת מרחק אגן הניקוז למעוק (ג) הערכה הזאת יכולה להיות מעודכנת בזמן אמת ע״י טלפון לוויני שמחובר לשירותי חיזויי פרטיים.
בקיצור - שיטפון זה מדע מדויק. Image
Read 8 tweets
Feb 25
התחקיר הכי מעניין על ״מוצב״ נחל עוז הוא של 3 חוקרות (שופטת בדימוס ושתי אקדמאיות) שראיינו עשרות קצינים, חיילים, ובני משפחה ויצרו פסיפס מטורף שפורסם כבר באוקטובר 24.

הנה מה שהעיף לי את המח
שרשור קצר 🧵🧵🧵
תצפיתניות היו במוצבים של כיסופים, כרם שלום, יפתח, ורעים. ברוב המקומות האלה התרחשו פריצות לבסיס וקרבות משמעותיים.

אבל כידוע רק בנחל עוז, התצפיתניות חטפו כל כך הרבה. איך זה יכול להיות? Image
גיאוגרפית, נחל עוז שוכן בשטח נחות. המאו״גים לדורותיהם מתעבים את המיקום שלו. הם רוצים לדלג אותו לנקודה עורפית יותר.

אבל המוצב (ריבוע) יושב סמוך לקיבוץ נחל עוז. זה לא נראה טוב לדלג אותו מבחינה ערכית. אז כל כמה שנים יש התלבטות אם להזיז, וכל פעם מחליטים שלא להחליט. *אז מייבשים אותו* Image
Read 11 tweets
Feb 21
עם החדשות הנוראיות על שירי ביבס, בואו רגע נסביר איך עובדת בדיקת דנ"א של המז"פ.

השיטה הבסיסית פותחה כבר בשנות ה80 והיא מתמקדת ב 13 אתרים ידועים בגנום. הרצפי דנ"א באתרים האלה הם מאד מיוחדים ומכילים מוטיבים שחוזרים על עצמם שוב ושוב. Image
גנטיקאים מכנים רצף כזה בשם Short Tandem Repeat או בקיצור STR (תמונה).

הרצפים האלה הם לא מאד יציבים. בסיכוי של אחת ל 1000 לידות לערך, מתווספות או נגרעות יחידות של המוטיב החוזר.

לצורך השוואה, סתם מוטציה בנקודה רנדומלית בגנום קורת בסיכוי 3 ל 10 מיליון לידות Image
קצב המוטציות הגבוה יחסית באתרים האלה, והעובדה שיש אפשרות למגוון אורכים, יוצר מגוון גנטי גדול באתרים האלה. וזה יתרון אדיר.

באתר מסוים יכולות להיות לי 11 חזרות מהכרומוזום שקבלתי מאבא ו 13 חזרות מהכרמוזום שקבלתי מאמא. ולמישהו אחר יהיו נניח 12 ו 14 חזרות.
Read 7 tweets
Jan 3
בוא נדבר על האזעקה אתמול.
שרשור קצר עם מחשבות על פקע״ר.

קודם כל מחלקת הדאטה סיינס של תשלובת ארליך ובניו מודה לחות׳ים שירו טיל לא קרוב מדי לים, מה שנותן אליפסה מהממת (כחול) ושימו לב שבעקבות דרישת הקהל, הוספתי את ה convex hull בירוק. Image
וכהרגלנו בקודש באליפסות כאלה, האיכון יוצא במערב תימן.
אבל לא על זה רציתי לדבר. Image
מרכז האליפסה ומרכז ה convex hull (ציור של בית) של האזעקה אתמול מאד קרובים אחד לשני ושניהם יושבים על העיירה הציורית מודיעין.
באופן מאד לא מפתיע, יש דיווחים של שברי ירוט במודיעין.

Image
Read 6 tweets
Dec 31, 2024
מאיפה התימנים יורים?

אחרי מלא אזעקות, כולם יודעים שאם מסתכלים על אפלקציית צופר, אפשר לדעת אם יורים עליכם מלבנון, תימן, או עזה כי האזעקות כמו ״מצביעות״ על כיוון שממנו בא הטיל. למשל כאן רואים אזעקה מאתמול של טיל מתימן.

בוא ננסה לדייק את זה כדי להבין מאיפה התימנים יורים.
שרשור🧵 Image
הנה דוגמא יפה מהירי מעזה בשבת.

לקחתי את הדאטה של @yuvharpaz שמתעד את אזעקות פקע״ר, מפיתי את הנ.צ. של מרכזי האזעקות, ואז התאמתי גאוסיאן (אליפסה) שמתארת את התפלגות המרחבית של האזעקות. הציר של המרכזי של האליפסה נותן את האזימוט שממנו הגיע הטיל. במקרה הזה באמת יוצא צפון הרצועה. Image
והנה האזעקות ב 21 בדצמבר של 3:43 בבוקר. יש כיוון דרום מערבי מהאליפסה ואם עושים zoom out... Image
Read 8 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Don't want to be a Premium member but still want to support us?

Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal

Or Donate anonymously using crypto!

Ethereum

0xfe58350B80634f60Fa6Dc149a72b4DFbc17D341E copy

Bitcoin

3ATGMxNzCUFzxpMCHL5sWSt4DVtS8UqXpi copy

Thank you for your support!

Follow Us!

:(