1/69
Je ne suis ni épidémiologiste, ni modélisateur.
Les modèles sérieux se limitent à un horizon à 7 jours.
L'objet de ce thread n'est donc absolument pas de modéliser, mais simplement d'évoquer des tendances épidémiques qu'on peut déduire des données actuelles sur Omicron
Je ne suis ni épidémiologiste, ni modélisateur.
Les modèles sérieux se limitent à un horizon à 7 jours.
L'objet de ce thread n'est donc absolument pas de modéliser, mais simplement d'évoquer des tendances épidémiques qu'on peut déduire des données actuelles sur Omicron
2/69
Actuellement, nous sommes dans ce qui est appelé la "5ème vague".
Elle est due au variant Delta, couvert par l'efficacité vaccinale (efficacité maximale >90% un mois après D2, avec >90% des adultes déjà vaccinés)...
Actuellement, nous sommes dans ce qui est appelé la "5ème vague".
Elle est due au variant Delta, couvert par l'efficacité vaccinale (efficacité maximale >90% un mois après D2, avec >90% des adultes déjà vaccinés)...
https://twitter.com/nicolasberrod/status/1469406929378320386?s=20
3/69
Compte-tenu de sa transmissibilité+++, sa réplication++ (charges virales élevées), la ↘️ progressive des capacités de neutralisation au cours du temps, et surtout du % de pop pas encore vaccinée, les hôpitaux sont déjà à la peine actuellement.
ouest-france.fr/sante/virus/co…
Compte-tenu de sa transmissibilité+++, sa réplication++ (charges virales élevées), la ↘️ progressive des capacités de neutralisation au cours du temps, et surtout du % de pop pas encore vaccinée, les hôpitaux sont déjà à la peine actuellement.
ouest-france.fr/sante/virus/co…
4/69
La stratégie gouvernementale face à cette 5ème vague est limitée à une réponse 100% vaccinale, se résumant à accélérer l'administration des 3èmes doses.
C'est indispensable, mais ça ne sera pas suffisant.
L'OMS le dit depuis 1 an.
Pourquoi ?
La stratégie gouvernementale face à cette 5ème vague est limitée à une réponse 100% vaccinale, se résumant à accélérer l'administration des 3èmes doses.
C'est indispensable, mais ça ne sera pas suffisant.
L'OMS le dit depuis 1 an.
Pourquoi ?
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1462219470953406464?s=20
5/69
Quel est l'objectif ?
↘️↘️ l'impact hospitalier des nouvelles contaminations.
C'est la fameuse expression : "décorréler infections et hospitalisations".
En fait, ce n'est pas "décorréler" mais ↘️ le facteur de corrélation (↘️ la fréq d'hospitalisation)
Quel est l'objectif ?
↘️↘️ l'impact hospitalier des nouvelles contaminations.
C'est la fameuse expression : "décorréler infections et hospitalisations".
En fait, ce n'est pas "décorréler" mais ↘️ le facteur de corrélation (↘️ la fréq d'hospitalisation)
6/69
Sur ce plan, si l'épidémie était limitée à Delta, le résultat serait probablement en partie atteint d'ici quelques semaines.
Israël a illustré cette réussite transitoire qu'on obtient en déployant les 3èmes doses à vitesse fulgurante
Sur ce plan, si l'épidémie était limitée à Delta, le résultat serait probablement en partie atteint d'ici quelques semaines.
Israël a illustré cette réussite transitoire qu'on obtient en déployant les 3èmes doses à vitesse fulgurante
7/69
Cependant, Israël ne s'est pas limité à la vaccination.
Pour contrôler la 4ème vague, de nombreuses mesures de distanciation et de limitation de la transmission virale avaient été déployées parallèlement aux 3èmes doses :
Cependant, Israël ne s'est pas limité à la vaccination.
Pour contrôler la 4ème vague, de nombreuses mesures de distanciation et de limitation de la transmission virale avaient été déployées parallèlement aux 3èmes doses :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1429487306336047115?s=20
8/69
Mais alors pourquoi l'OMS dit qu'une stratégie 100% vaccinale est vouée à l'échec ?
Tout simplement parce que :
1) Ne pas confondre "↘️ des indicateurs d'incidence" et "↘️ de la circulation virale"
2) L'épidémie n'est pas figée sur le variant actuel.
Mais alors pourquoi l'OMS dit qu'une stratégie 100% vaccinale est vouée à l'échec ?
Tout simplement parce que :
1) Ne pas confondre "↘️ des indicateurs d'incidence" et "↘️ de la circulation virale"
2) L'épidémie n'est pas figée sur le variant actuel.
9/69
On commence par le point 1) : ne pas confondre "↘️ des indicateurs d'incidence" et "↘️ de la circulation virale".
Pour comprendre cela, il faut tout d'abord revenir aux méthodes de construction de ces indicateurs d'incidence.
On commence par le point 1) : ne pas confondre "↘️ des indicateurs d'incidence" et "↘️ de la circulation virale".
Pour comprendre cela, il faut tout d'abord revenir aux méthodes de construction de ces indicateurs d'incidence.
10/69
En France, comme dans la plupart des pays, seuls 2 sources de données sont utilisées pour mesurer/calculer les taux d'incidence des nouvelles contaminations par SARS-CoV-2 (reflet de la circulation virale).
A) Les tests de diagnostic
B) Les tests de dépistage
En France, comme dans la plupart des pays, seuls 2 sources de données sont utilisées pour mesurer/calculer les taux d'incidence des nouvelles contaminations par SARS-CoV-2 (reflet de la circulation virale).
A) Les tests de diagnostic
B) Les tests de dépistage
11/69
Les tests de diagnostic sont réalisés chez les MALADES, pour identifier l'étiologie de leurs symptômes.
Ces tests sont minoritaires, mais associés à un très fort taux de positivité (TP+) car ils sont guidés par les symptômes = proba+++ d'être infecté
Les tests de diagnostic sont réalisés chez les MALADES, pour identifier l'étiologie de leurs symptômes.
Ces tests sont minoritaires, mais associés à un très fort taux de positivité (TP+) car ils sont guidés par les symptômes = proba+++ d'être infecté
12/69
On réalise actuellement 6990 tests / 100000 hab / 7 jours.
Mais seuls 16% sont des tests de diagnostic (chez des personnes symptomatiques).
Soit seulement 1118,4 tests / 100000 hab / 7 jours.
Mais leur TP+ est très élevé : 20,2% !
santepubliquefrance.fr/maladies-et-tr…
On réalise actuellement 6990 tests / 100000 hab / 7 jours.
Mais seuls 16% sont des tests de diagnostic (chez des personnes symptomatiques).
Soit seulement 1118,4 tests / 100000 hab / 7 jours.
Mais leur TP+ est très élevé : 20,2% !
santepubliquefrance.fr/maladies-et-tr…
13/69
84% des tests faits sont donc du dépistage (chez des personnes asymptomatiques).
N'étant pas guidés par le contact tracing (mais par la validation d'un pass, un voyage...) ces tests ont une proba très faible d'être positif.
D'où un TP+ bcp plus faible : 3,8%
84% des tests faits sont donc du dépistage (chez des personnes asymptomatiques).
N'étant pas guidés par le contact tracing (mais par la validation d'un pass, un voyage...) ces tests ont une proba très faible d'être positif.
D'où un TP+ bcp plus faible : 3,8%
14/69
On voit d'ailleurs l'impact de ces tests de dépistage (incluant les tests dits "de confort"), sur le suivi épidémique.
Avec le raccourcissement du délai de validité à 24h, la demande ↗️↗️ et la part des symptomatiques parmi les infectés ↘️
On voit d'ailleurs l'impact de ces tests de dépistage (incluant les tests dits "de confort"), sur le suivi épidémique.
Avec le raccourcissement du délai de validité à 24h, la demande ↗️↗️ et la part des symptomatiques parmi les infectés ↘️
15/69
Avec de tels indicateurs, il est impossible de suivre la circulation virale RÉELLE.
Tout d'abord pour la simple raison qu'on ne teste qu'une fraction extrêmement faible de la population (très inférieure à la prévalence des infections dans la population)
Avec de tels indicateurs, il est impossible de suivre la circulation virale RÉELLE.
Tout d'abord pour la simple raison qu'on ne teste qu'une fraction extrêmement faible de la population (très inférieure à la prévalence des infections dans la population)
16/69
Actuellement, avec 6990 tests / 100k hab / 7j, on teste en fait 1% de la pop chaque jour. C'est insignifiant.
Ça fait >18 mois que je parle de ce problème, donc je ne redéveloppe pas ce point, déjà une dizaine de threads dessus, exemple :
Actuellement, avec 6990 tests / 100k hab / 7j, on teste en fait 1% de la pop chaque jour. C'est insignifiant.
Ça fait >18 mois que je parle de ce problème, donc je ne redéveloppe pas ce point, déjà une dizaine de threads dessus, exemple :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1443633963084419079?s=20
17/69
Autre raison qui empêche de suivre la circulation virale réelle avec ces indicateurs = les tests utilisés.
Plus on déploie les TAG et autotests, plus on dépend de tests à faible sensibilité. On rate donc de +en+ d'infectés, et on sous-estime encore plus l'incidence réelle
Autre raison qui empêche de suivre la circulation virale réelle avec ces indicateurs = les tests utilisés.
Plus on déploie les TAG et autotests, plus on dépend de tests à faible sensibilité. On rate donc de +en+ d'infectés, et on sous-estime encore plus l'incidence réelle
18/69
Pour rappel, la sensibilité des meilleurs TAG (et bien prélevés) ne dépasse pas 60% (je n'évoque même pas les autotests 😅).
On le sait depuis 2020.
Exemple avec le CNR des virus respiratoires (cf. à partir de 6m40) :
Pour rappel, la sensibilité des meilleurs TAG (et bien prélevés) ne dépasse pas 60% (je n'évoque même pas les autotests 😅).
On le sait depuis 2020.
Exemple avec le CNR des virus respiratoires (cf. à partir de 6m40) :
19/69
Et certains pays tiennent compte de ce défaut majeur de sensibilité pour leurs recommandations sanitaires officielles.
Exemple avec la Tchéquie :
Et certains pays tiennent compte de ce défaut majeur de sensibilité pour leurs recommandations sanitaires officielles.
Exemple avec la Tchéquie :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1467149559499481090?s=20
20/69
Ainsi, par le simple remplacement de toutes les RT-PCR par des TAG (ou pire, des autotests), on pourrait faire ↘️ la courbe du taux d'incidence alors que la circulation virale progresse 🤷♂️
Vous commencez à percevoir la limite de ces indicateurs épidémio...
Ainsi, par le simple remplacement de toutes les RT-PCR par des TAG (ou pire, des autotests), on pourrait faire ↘️ la courbe du taux d'incidence alors que la circulation virale progresse 🤷♂️
Vous commencez à percevoir la limite de ces indicateurs épidémio...
21/69
Si on déploie suffisamment vite les 3èmes doses face à Delta, on peut également faire diminuer les taux d'incidence apparents.
Pour le comprendre, il faut avoir en tête :
A) l'efficacité+++ de ces 3èmes doses contre la maladie
B) l'absence d'immunité stérilisante
Si on déploie suffisamment vite les 3èmes doses face à Delta, on peut également faire diminuer les taux d'incidence apparents.
Pour le comprendre, il faut avoir en tête :
A) l'efficacité+++ de ces 3èmes doses contre la maladie
B) l'absence d'immunité stérilisante
22/69
Les données israéliennes ont montré une efficacité majeure de ces 3èmes 💉 contre les formes symptomatiques de COVID (moteur des tests de diagnostic).
Leur incidence est ↘️ x7 à x15 par rapport aux vaccinés 2 💉 ou non-vaccinés
Déjà évoqué ici : atlantico.fr/article/decryp…
Les données israéliennes ont montré une efficacité majeure de ces 3èmes 💉 contre les formes symptomatiques de COVID (moteur des tests de diagnostic).
Leur incidence est ↘️ x7 à x15 par rapport aux vaccinés 2 💉 ou non-vaccinés
Déjà évoqué ici : atlantico.fr/article/decryp…
23/69
Pour illustrer le propos de manière simpliste, imaginons que nous ayons déjà déployé toutes les 3èmes 💉, nous aurions alors 7 à 15x moins de tests de diagnostic !
Or ce sont les tests qui drainent le plus de cas positifs !!!
Vous ne me croyez pas ?
Reprenons les datas...
Pour illustrer le propos de manière simpliste, imaginons que nous ayons déjà déployé toutes les 3èmes 💉, nous aurions alors 7 à 15x moins de tests de diagnostic !
Or ce sont les tests qui drainent le plus de cas positifs !!!
Vous ne me croyez pas ?
Reprenons les datas...
24/69
Chez les asympto (dépistage) = 4 279 984 * 84% * 3,8% = 136 617 cas+ en 1 semaine.
Chez les malades (diagnostic) = 4 279 984 * 16% * 20,2% = 138 329 cas+ en 1 semaine. 🤷♂️
Le simple déploiement des 3èmes 💉 pourrait ↘️ ce chiffre x7 à x15, à circulation virale inchangée !
Chez les asympto (dépistage) = 4 279 984 * 84% * 3,8% = 136 617 cas+ en 1 semaine.
Chez les malades (diagnostic) = 4 279 984 * 16% * 20,2% = 138 329 cas+ en 1 semaine. 🤷♂️
Le simple déploiement des 3èmes 💉 pourrait ↘️ ce chiffre x7 à x15, à circulation virale inchangée !
25/69
Ce qui nous amène à l'absence d'immunité stérilisante, et ce qui me permet de dire "à circulation virale inchangée".
Pour cela on doit utiliser les données britanniques du PHE 🇬🇧, qui s'appuie non pas sur 2, mais sur 4 "piliers" pour construire ces indicateurs épidémio
Ce qui nous amène à l'absence d'immunité stérilisante, et ce qui me permet de dire "à circulation virale inchangée".
Pour cela on doit utiliser les données britanniques du PHE 🇬🇧, qui s'appuie non pas sur 2, mais sur 4 "piliers" pour construire ces indicateurs épidémio
26/69
En plus des tests de dépistage et de diagnostic, le UK 🇬🇧 utilise aussi :
A) les enquêtes de séroprévalence (% de pop ayant des anticorps détectables contre SARS-CoV-2)
B) les enquêtes virologiques hebdo sur grands échantillons de pop
gov.uk/government/pub…
En plus des tests de dépistage et de diagnostic, le UK 🇬🇧 utilise aussi :
A) les enquêtes de séroprévalence (% de pop ayant des anticorps détectables contre SARS-CoV-2)
B) les enquêtes virologiques hebdo sur grands échantillons de pop
gov.uk/government/pub…
27/69
Cela permet au PHE de documenter une circulation virale que les autres pays ne peuvent pas voir.
Ils montrent ainsi que le virus circule au moins autant chez les vaccinés que chez les non-vaccinés.
Déjà évoqué++, exemple :
Cela permet au PHE de documenter une circulation virale que les autres pays ne peuvent pas voir.
Ils montrent ainsi que le virus circule au moins autant chez les vaccinés que chez les non-vaccinés.
Déjà évoqué++, exemple :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1464354403004162048?s=20
28/69
Ainsi, en déployant les TAG, autotests, et 3èmes doses, on peut faire s'effondrer les indicateurs d'incidence alors que la circulation virale se poursuit à haut niveau.
ATTENTION : en déployant les 3èmes 💉, on ↘️↘️↘️ par contre fortement l'impact hospitalier !
Ainsi, en déployant les TAG, autotests, et 3èmes doses, on peut faire s'effondrer les indicateurs d'incidence alors que la circulation virale se poursuit à haut niveau.
ATTENTION : en déployant les 3èmes 💉, on ↘️↘️↘️ par contre fortement l'impact hospitalier !
29/69
On n'empêche cependant pas le virus de circuler.
Il continue donc à trouver de nouveaux hôtes à infecter. Ainsi il se réplique tjs plus, mute et évolue de +en+ vite.
Ce qui nous amène au point 2 : "l'épidémie n'est pas figée sur le variant actuel"
On n'empêche cependant pas le virus de circuler.
Il continue donc à trouver de nouveaux hôtes à infecter. Ainsi il se réplique tjs plus, mute et évolue de +en+ vite.
Ce qui nous amène au point 2 : "l'épidémie n'est pas figée sur le variant actuel"
30/69
Et c'est là que les autorités commettent une lourde erreur en pensant que, comme pour la vague 3 et 4, il suffira de déployer les vaccins pour éteindre la crise.
Les données associées à Omicron montrent clairement que ce ne sera pas le cas.
Et c'est là que les autorités commettent une lourde erreur en pensant que, comme pour la vague 3 et 4, il suffira de déployer les vaccins pour éteindre la crise.
Les données associées à Omicron montrent clairement que ce ne sera pas le cas.
31/69
Au moins 2 de ses caractéristiques permettent d'anticiper une dégradation sanitaire à court terme :
A) sa transmissibilité fortement ↗️↗️↗️
B) son échappement immunitaire+++
Au moins 2 de ses caractéristiques permettent d'anticiper une dégradation sanitaire à court terme :
A) sa transmissibilité fortement ↗️↗️↗️
B) son échappement immunitaire+++
32/69
Un variant qui gagne en transmissibilité est bien plus dangereux qu'un variant qui gagne en virulence.
Virulence ↗️ = impact linéaire sur la morbi-mortalité, sur un nb d'infections inchangé
Transmissibilité ↗️ = même morbi-mortalité MAIS sur ↗️ exponentielle de cas 🤷♂️
Un variant qui gagne en transmissibilité est bien plus dangereux qu'un variant qui gagne en virulence.
Virulence ↗️ = impact linéaire sur la morbi-mortalité, sur un nb d'infections inchangé
Transmissibilité ↗️ = même morbi-mortalité MAIS sur ↗️ exponentielle de cas 🤷♂️
33/69
Plusieurs épidémiologistes ont déjà expliqué/vulgarisé ce piège à de nombreuses reprises :
Exemple avec le Dr. Kucharski :
Plusieurs épidémiologistes ont déjà expliqué/vulgarisé ce piège à de nombreuses reprises :
Exemple avec le Dr. Kucharski :
https://twitter.com/AdamJKucharski/status/1348742487846875138?s=20
34/69
Ou avec le Dr. Gasperowicz qui montre également qu'un variant plus transmissible et MOINS virulent, reste bien plus dangereux qu'un variant PLUS virulent sans gain de transmissibilité :
Ou avec le Dr. Gasperowicz qui montre également qu'un variant plus transmissible et MOINS virulent, reste bien plus dangereux qu'un variant PLUS virulent sans gain de transmissibilité :
https://twitter.com/GosiaGasperoPhD/status/1469456805491138560?s=20
35/69
Malheureusement, Omicron = transmissibilité ↗️↗️↗️, nettement supérieure à celle de Delta.
Le PHE 🇬🇧 estime son R-eff actuellement à 3,7 au UK, alors que celui de Delta est ~1 !!!
Selon eux, Omicron représentera 50% des cas à la mi-décembre.
assets.publishing.service.gov.uk/government/upl…
Malheureusement, Omicron = transmissibilité ↗️↗️↗️, nettement supérieure à celle de Delta.
Le PHE 🇬🇧 estime son R-eff actuellement à 3,7 au UK, alors que celui de Delta est ~1 !!!
Selon eux, Omicron représentera 50% des cas à la mi-décembre.
assets.publishing.service.gov.uk/government/upl…
36/69
Ce simple phénomène, va suffire à décupler la tension hospitalière car au fur et à mesure que le % de cas associés à Omicron va ↗️, le R va se rapprocher du R-eff d'Omicron (actuellement 3,7), et ainsi générer de très nombreuses contaminations supplémentaires...
Ce simple phénomène, va suffire à décupler la tension hospitalière car au fur et à mesure que le % de cas associés à Omicron va ↗️, le R va se rapprocher du R-eff d'Omicron (actuellement 3,7), et ainsi générer de très nombreuses contaminations supplémentaires...
37/69
Dans ce même rapport, le PHE 🇬🇧 montre que la transmission secondaire d'Omicron sera nettement plus rapide et intense qu'avec Delta :
Dans ce même rapport, le PHE 🇬🇧 montre que la transmission secondaire d'Omicron sera nettement plus rapide et intense qu'avec Delta :
38/69
Ce qui nous amène à l'autre caractéristique délétère d'Omicron = son échappement immunitaire+++.
Cette semaine, plusieurs études ont démontré cet échappement, avec en moyenne, une ↘️ x40 de nos capacités de neutralisation virale face à Omicron.
Ce qui nous amène à l'autre caractéristique délétère d'Omicron = son échappement immunitaire+++.
Cette semaine, plusieurs études ont démontré cet échappement, avec en moyenne, une ↘️ x40 de nos capacités de neutralisation virale face à Omicron.
39/69
Etant un variant doté d'une forte ↗️↗️ d'affinité pour ACE2, seules les études sur cultures cellulaires avec virus entier sont capables de refléter fidèlement ses caractéristiques (les études sur pseudo particules ne peuvent renseigner que sur l'adhésion des anticorps)
Etant un variant doté d'une forte ↗️↗️ d'affinité pour ACE2, seules les études sur cultures cellulaires avec virus entier sont capables de refléter fidèlement ses caractéristiques (les études sur pseudo particules ne peuvent renseigner que sur l'adhésion des anticorps)
40/69
On peut citer la 1ère en date, publiée par le @sigallab :
secureservercdn.net/50.62.198.70/1…
Et déjà évoquée il y a quelques jours :
On peut citer la 1ère en date, publiée par le @sigallab :
secureservercdn.net/50.62.198.70/1…
Et déjà évoquée il y a quelques jours :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1468353366866767873?s=20
41/69
Également l'étude allemande publiée le 8 décembre et évoquée également
Cette étude apportait des infos supplémentaires, notamment sur la perte d'activité du Ronaprève (anticorps monoclonaux) et avantage de 3 💉 versus 2 💉
Également l'étude allemande publiée le 8 décembre et évoquée également
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1468572109244968960?s=20
Cette étude apportait des infos supplémentaires, notamment sur la perte d'activité du Ronaprève (anticorps monoclonaux) et avantage de 3 💉 versus 2 💉
42/69
Sur ce point, l'étude montrait qu'avec 2x Pfizer ou 2x ModeRNA ou 1xAZ+1xPfizer, plus aucune neutralisation n'est détectée contre Omicron.
Mais 3 mois après la 3ème 💉, on détecte encore 25% de neutralisation face à Omicron (versus 95% contre Delta)...
Sur ce point, l'étude montrait qu'avec 2x Pfizer ou 2x ModeRNA ou 1xAZ+1xPfizer, plus aucune neutralisation n'est détectée contre Omicron.
Mais 3 mois après la 3ème 💉, on détecte encore 25% de neutralisation face à Omicron (versus 95% contre Delta)...
43/69
Mais il faudra être prudent+++ avec ce résultat, car si vous regardez bien, les données sont très hétérogènes, avec bcp de sérums (individus) déjà revenu à 0% de neutralisation 3 mois après la 3ème 💉 ou après nouvelle 🦠
Cf. cercles bleus
Mais il faudra être prudent+++ avec ce résultat, car si vous regardez bien, les données sont très hétérogènes, avec bcp de sérums (individus) déjà revenu à 0% de neutralisation 3 mois après la 3ème 💉 ou après nouvelle 🦠
Cf. cercles bleus
44/69
Et ce retour à 0% de neutralisation 3 mois après la 3ème 💉 n'est pas lié à un âge élevé de ces cohortes. Un autre thread a détaillé les données démographiques de cette publi :
Et ce retour à 0% de neutralisation 3 mois après la 3ème 💉 n'est pas lié à un âge élevé de ces cohortes. Un autre thread a détaillé les données démographiques de cette publi :
https://twitter.com/janko_js/status/1468756054473388032?s=20
45/69
Alors j'entends déjà : "mais nos lymphocytes T vont nous sauver" !
Ce story telling ne s'arrêtera jamais en France, mais désolé :
A) Omicron est le variant le plus muté sur ces épitopes ciblés par les lymphocytes T
Alors j'entends déjà : "mais nos lymphocytes T vont nous sauver" !
Ce story telling ne s'arrêtera jamais en France, mais désolé :
A) Omicron est le variant le plus muté sur ces épitopes ciblés par les lymphocytes T
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1466117665186058248?s=20
46/69
B) La vaccination n'induit pas ou peu de lymphocytes T dans l'arbre bronchique.
De plus, la protection induite par la vaccination ne dépend pas des Ly T (leur déplétion totale ne change pas l'efficacité vaccinale)
B) La vaccination n'induit pas ou peu de lymphocytes T dans l'arbre bronchique.
De plus, la protection induite par la vaccination ne dépend pas des Ly T (leur déplétion totale ne change pas l'efficacité vaccinale)
https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1433570082647642112?s=20
47/69
C) Les Ly T sont un des moteurs de la sévérité de la COVID !
La moindre fréquence des formes graves chez les enfants, tient notamment à leur moindre activation de leurs lymphocytes T (ils contrôlent l'infection via la réponse interféron)
C) Les Ly T sont un des moteurs de la sévérité de la COVID !
La moindre fréquence des formes graves chez les enfants, tient notamment à leur moindre activation de leurs lymphocytes T (ils contrôlent l'infection via la réponse interféron)
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1459853051557203970?s=20
48/69
"Oui mais nos cellules mémoires nous protègeront" !
Autre story telling qui confond souvent "réponse immunitaire" et "protection immunitaire" (et qui doit donc se demander pourquoi les essais cliniques ont besoin d'une phase 3 après la phase 2 🤷♂️😅)...
"Oui mais nos cellules mémoires nous protègeront" !
Autre story telling qui confond souvent "réponse immunitaire" et "protection immunitaire" (et qui doit donc se demander pourquoi les essais cliniques ont besoin d'une phase 3 après la phase 2 🤷♂️😅)...
49/69
Et qui oublient aussi que les cellules mémoires sont surtout une cicatrice immunologique qu'on met à profit pour les rappels vaccinaux, afin de décupler la réponse protectrice AVANT d'être infecté...
Et qui oublient aussi que les cellules mémoires sont surtout une cicatrice immunologique qu'on met à profit pour les rappels vaccinaux, afin de décupler la réponse protectrice AVANT d'être infecté...
50/69
Mais lors de l'infection, les cellules mémoires mettent plusieurs jours à réagir et à induire une nouvelle réponse immunitaire.
Il est alors bien trop tard pour compenser une immunité insuffisante au moment de l'infection (l'invasion virale a déjà progressé+++)
Mais lors de l'infection, les cellules mémoires mettent plusieurs jours à réagir et à induire une nouvelle réponse immunitaire.
Il est alors bien trop tard pour compenser une immunité insuffisante au moment de l'infection (l'invasion virale a déjà progressé+++)
51/69
Pour comprendre cette limite, rappelez-vous que les anticorps monoclonaux ne sont actifs que s'ils sont administrés dans les tous premiers jours de l'infection.
Si on les administre au-delà de 3-5 jours après l'infection, ils ne protègent plus 🤷♂️
Pour comprendre cette limite, rappelez-vous que les anticorps monoclonaux ne sont actifs que s'ils sont administrés dans les tous premiers jours de l'infection.
Si on les administre au-delà de 3-5 jours après l'infection, ils ne protègent plus 🤷♂️
52/69
Que serait la réponse de nos cellules mémoires ?
Rien de plus qu'une production d'anticorps neutralisants environ 7 à 10 jours après l'infection = administration tardive d'anticorps monoclonaux = inefficace 🤷♂️
Que serait la réponse de nos cellules mémoires ?
Rien de plus qu'une production d'anticorps neutralisants environ 7 à 10 jours après l'infection = administration tardive d'anticorps monoclonaux = inefficace 🤷♂️
53/69
Alors comment les études de séroneutralisation d'Omicron vont se traduire en termes d'efficacité vaccinale contre Omicron ?
Il est encore tôt, notamment pour évaluer l'efficacité contre les formes sévères (les vagues Omicron sont encore trop récentes)
Alors comment les études de séroneutralisation d'Omicron vont se traduire en termes d'efficacité vaccinale contre Omicron ?
Il est encore tôt, notamment pour évaluer l'efficacité contre les formes sévères (les vagues Omicron sont encore trop récentes)
54/69
Mais on dispose tout de même de données préliminaires.
Notamment contre les formes symptomatiques.
Le PHE l'estime à :
0% après 2 💉 d'AZ
~30-35% après 2 💉 Pfizer
~70% 1 mois après 3ème 💉
(attention : pas encore de recul sur la durée de cette protection).
Mais on dispose tout de même de données préliminaires.
Notamment contre les formes symptomatiques.
Le PHE l'estime à :
0% après 2 💉 d'AZ
~30-35% après 2 💉 Pfizer
~70% 1 mois après 3ème 💉
(attention : pas encore de recul sur la durée de cette protection).
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Pour les formes sévères, on ne dispose que de données préliminaires non-consolidées (fournies par le ministère de la santé sud-africain 🇿🇦)
Merci @RomainMartinIO pour le lien 🙏
Pour les formes sévères, on ne dispose que de données préliminaires non-consolidées (fournies par le ministère de la santé sud-africain 🇿🇦)
Merci @RomainMartinIO pour le lien 🙏
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On peut y voir que l'efficacité vaccinale contre les formes sévères liées à Omicron ne SERAIT plus que de 65-69% (contre >90% actuellement contre Delta).
ATTENTION : plusieurs facteurs confondants à garder à l'esprit et qui empêchent d'extrapoler pour l'Europe
On peut y voir que l'efficacité vaccinale contre les formes sévères liées à Omicron ne SERAIT plus que de 65-69% (contre >90% actuellement contre Delta).
ATTENTION : plusieurs facteurs confondants à garder à l'esprit et qui empêchent d'extrapoler pour l'Europe
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Outre le caractère préliminaire de ces données, elles sont obtenues sur une population bcp plus jeune qu'en Europe (médiane 🇿🇦 = 20 ans, médiane 🇫🇷 = 41 ans).
La pop sud-africaine compte également 20 à 30% de séropositifs pour le VIH.
Outre le caractère préliminaire de ces données, elles sont obtenues sur une population bcp plus jeune qu'en Europe (médiane 🇿🇦 = 20 ans, médiane 🇫🇷 = 41 ans).
La pop sud-africaine compte également 20 à 30% de séropositifs pour le VIH.
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De plus, la population 🇿🇦 a déjà été infectée par Beta/Delta à >70%.
Les >60 ans y sont vaccinés à >60%.
L'association 🦠+💉💉 fournit une immunité comparable à celle de 💉💉💉.
Les plus âgés sont donc potentiellement très bien protégés.
De plus, la population 🇿🇦 a déjà été infectée par Beta/Delta à >70%.
Les >60 ans y sont vaccinés à >60%.
L'association 🦠+💉💉 fournit une immunité comparable à celle de 💉💉💉.
Les plus âgés sont donc potentiellement très bien protégés.
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Et on voit que la vague Omicron provoque un impact hospitalier associé à une sur-représentation+++ des jeunes (immunisés à >70% par l'infection), et notamment des enfants <5 ans.
Et on voit que la vague Omicron provoque un impact hospitalier associé à une sur-représentation+++ des jeunes (immunisés à >70% par l'infection), et notamment des enfants <5 ans.
https://twitter.com/DrEricDing/status/1468358431430086661?s=20
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Pour illustrer l'impact d'Omicron chez les jeunes non-vaccinés comparez les courbes 🟠 (Omicron) chez les 30-39 ans, 20-29 ans, <5 ans, et les courbes 🔵 (Delta) chez les >50 ans...
Omicron envoie plus de jeunes à l'hôpital, que Delta n'y envoyait de >50 ans 🤷♂️
Pour illustrer l'impact d'Omicron chez les jeunes non-vaccinés comparez les courbes 🟠 (Omicron) chez les 30-39 ans, 20-29 ans, <5 ans, et les courbes 🔵 (Delta) chez les >50 ans...
Omicron envoie plus de jeunes à l'hôpital, que Delta n'y envoyait de >50 ans 🤷♂️
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Au final, qu'est-ce que cela nous dit pour l'avenir à court terme ?
Transmissibilité ↗️↗️↗️ = ↗️ exponentielle des contaminations.
Echappement immunitaire+++ et ↘️ de l'efficacité vaccinale = ↗️ de la fréquence des formes sympto/sévères.
= ↗️↗️ de la morbi-mortalité.
Au final, qu'est-ce que cela nous dit pour l'avenir à court terme ?
Transmissibilité ↗️↗️↗️ = ↗️ exponentielle des contaminations.
Echappement immunitaire+++ et ↘️ de l'efficacité vaccinale = ↗️ de la fréquence des formes sympto/sévères.
= ↗️↗️ de la morbi-mortalité.
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La forte ↘️↘️ d'efficacité vaccinale contre les formes symptomatiques, et la transmissibilité ↗️↗️, devraient "neutraliser" la ↘️ apparente des taux d'incidence obtenue via les 3èmes 💉 (on n'aura pas une ↘️ x7 à x15 du recours aux tests de diagnostic)...
La forte ↘️↘️ d'efficacité vaccinale contre les formes symptomatiques, et la transmissibilité ↗️↗️, devraient "neutraliser" la ↘️ apparente des taux d'incidence obtenue via les 3èmes 💉 (on n'aura pas une ↘️ x7 à x15 du recours aux tests de diagnostic)...
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La tension hospitalière risque de fortement ↗️.
Les 3ème doses permettront de l'atténuer, mais bien moins nettement que face à Delta.
De plus, pas encore de recul sur la durée de protection conférée par la 3ème 💉.
La tension hospitalière risque de fortement ↗️.
Les 3ème doses permettront de l'atténuer, mais bien moins nettement que face à Delta.
De plus, pas encore de recul sur la durée de protection conférée par la 3ème 💉.
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Tout ce qu'on peut dire c'est :
1) ne pas hésiter pour réaliser sa 3ème dose (= seule chance de maximiser sa protection face à Omicron ; qui devrait rapidement devenir majoritaire parmi les variants en circulation)
Tout ce qu'on peut dire c'est :
1) ne pas hésiter pour réaliser sa 3ème dose (= seule chance de maximiser sa protection face à Omicron ; qui devrait rapidement devenir majoritaire parmi les variants en circulation)
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Inutile d'attendre un vaccin mis à jour pour Omicron.
Dan Staner (vice-président de ModeRNA) a annoncé que celui-ci ne serait pas disponible avant 6 à 7 mois :
lemonde.fr/planete/articl…
Et la 3ème dose est nécessaire face à Delta qui est la menace actuelle.
Inutile d'attendre un vaccin mis à jour pour Omicron.
Dan Staner (vice-président de ModeRNA) a annoncé que celui-ci ne serait pas disponible avant 6 à 7 mois :
lemonde.fr/planete/articl…
Et la 3ème dose est nécessaire face à Delta qui est la menace actuelle.
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Avec l'échappement immunitaire+++ d'Omicron, il ne faudra pas espérer une ↘️ de transmissibilité grâce à la vaccination.
Les mesures barrières sont donc plus nécessaires que jamais :
ventilation (<700ppm de CO2), masques FFP2, télétravail, tests itératifs à l'école…
Avec l'échappement immunitaire+++ d'Omicron, il ne faudra pas espérer une ↘️ de transmissibilité grâce à la vaccination.
Les mesures barrières sont donc plus nécessaires que jamais :
ventilation (<700ppm de CO2), masques FFP2, télétravail, tests itératifs à l'école…
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Et ne pas oublier de tester/tracer/isoler.
Les tests = RT-PCR (les TAG ne sont utiles que pour les tests itératifs ; et les autotests sont interdits si symptôme ou cas-contact).
L'isolement = dès la notion de contact à risque ou dès symptôme (on n'attend pas son résultat) !
Et ne pas oublier de tester/tracer/isoler.
Les tests = RT-PCR (les TAG ne sont utiles que pour les tests itératifs ; et les autotests sont interdits si symptôme ou cas-contact).
L'isolement = dès la notion de contact à risque ou dès symptôme (on n'attend pas son résultat) !
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Encore une fois, nous manquons+++ d'anticipation.
Début novembre, Israël a anticipé la dégradation sanitaire.
"L'exercice Omega" visait à planifier la réponse militaire, sanitaire, économique à déployer face à un variant semblable à Omicron
jpost.com/health-and-wel…
Encore une fois, nous manquons+++ d'anticipation.
Début novembre, Israël a anticipé la dégradation sanitaire.
"L'exercice Omega" visait à planifier la réponse militaire, sanitaire, économique à déployer face à un variant semblable à Omicron
jpost.com/health-and-wel…
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Comme dit le gouvernement : "nous avons notre avenir entre les mains"...
Oui puisqu'ils ne font strictement rien pour lutter contre la transmission virale.
Mais nous avons 2 ans de recul sur la réponse à cette pandémie : vaccination+++ ET mesures barrières+++ 🤷♂️
Comme dit le gouvernement : "nous avons notre avenir entre les mains"...
Oui puisqu'ils ne font strictement rien pour lutter contre la transmission virale.
Mais nous avons 2 ans de recul sur la réponse à cette pandémie : vaccination+++ ET mesures barrières+++ 🤷♂️
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