Dvir Aran Profile picture
Apr 5, 2022 15 tweets 6 min read Read on X
Getting ready to #DMCI after dark from the top of Tel-Aviv. I’ll try to live tweet the talks. Image
View from the venue. Image
Udi Goori, Anthem Israel general manager, opening #DMCI. Why are we here? To connect academia and industry to solve the pressing healthcare problems.
The #DMCI community Image
Dr. Yona Vaisbuch @RambamHCC moderating the meeting. Image
Dr. Noa Dagan @ClalitResearch @BenGurionUni talking about prediction models in healthcare (no COVID19 allowed). Integrating models in the clinic is an ongoing struggle. Clalit developed novel platform to solve this. Image
Calibrating is a critical performance measure. Calibration may be noisy on subpopulation. Developed a multicalibration method to solve this. ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P… Image
How do we choose candidates for intervention? Should we add features to increase diversity? No good answers yet, but we have to be accountable and fair. Image
Now up Dr. David Golan #VizAI on identifying stroke as soon as possible. If we capture it early we can save from its devastating outcomes. Every minute of delay 1.9 neurons die, 4.2 days of disability, $1060 additional costs. Image
How do you evaluate the impact of an AI solution? For causality you need an RCT, but hard expensive and logistical nightmare. Here isn’t really possible to randomize. Stepped wedged cluster RCT can solve this - randomly install the technology in hospitals. Image
Testing the prediction model across all hospitals, not just top academic centers. Important to understand that quality of data might be very different. Image
Dr. Irit Gat-Viks @TelAvivUni on creating baseline clinical states of health to develop risk predictors of complex diseases. Image
Its getting dark outside. Tel-Aviv lights from above. Image
The 2d map of clinical states can differentiate between patients in different conditions. Focused on atherosclerosis and found that after correcting to its clinical states the biomarkers are not indicative. Image
Ending with a panel with the speakers. How to go from basic research to clinical impact? Image

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with Dvir Aran

Dvir Aran Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @dvir_a

Jan 27
🚨New preprint alert. GPT-4 has been shown to work well for diagnostics, but rarely as a clinical decision-support tool. In joint work with @ShellyShahar from @RambamHCC we used it to decide how to treat patients with stroke. How did it do? Amazingly well! medrxiv.org/content/10.110…
Image
We collected 100 cases of patients arriving at the ER with stroke symptoms. The data was routine ER charts, notes, and brain CT evaluations. Outcomes were whether the patient was treated, and if so with EVT, tPA or both. An expert also reviewed the cases and made his evaluations. Image
For each patient we asked GPT-4 whether to treat or monitor and with which treatment. We designed the prompt to return a scaled response (1-7) instead of yes/no. This had many advantages: identify uncertainty, use ROC-AUC, and reduce hallucinations by replicating the question. Image
Read 13 tweets
Sep 19, 2022
ראיתי פה ממש מעט על החדשות המדהימות שפורסמו בשבוע שעבר על הניסוי של GRAIL, וחשבתי שכדאי לכתוב על זה.
לפני שבוע פורסמו התוצאות הסופיות של ניסוי קליני ענק שכלל 6,662 איש מעל גיל 50 לגילוי מוקדם של סרטן. בניסוי, ביצעו בדיקת דם שבודקת סמנים אפיגנטיים על דנ״א חופשי, >>
והתוצאות מדהימות! 92 איש קיבלו תוצאה חיובית, ול-35 מהם הסתבר שבאמת יש סרטן. זה PPV של 38% שזה בלתי נתפס, בטח ביחס למה שהיה עד היום. הבדיקה הזו, שנקראת Galleri, יכולה לזהות 50 סוגי סרטן שונים, וזה ממש גיים צ׳יינגר.
הבדיקה מגלה את המחלה בשלבים מאוד מוקדמים, שבהם הטיפולים מאוד אפקטיביים. היא גם מגלה את המחלה בסוגי סרטן שאין בהם בכלל בדיקה רוטינית (כמו ממוגרפיה ודם בצואה) ולכן מזוהות בדרך כלל בשלבים מאוחרים מדי (למשל סרטן לבלב). news-medical.net/news/20220913/…
Read 7 tweets
Sep 19, 2022
Real word cancer data meetup by #DMCI on the roof of VIM in TLV.First speaker is @IdoWolf1 talking about their use of RWD in @tasmc1. Image
Not your regular academic meeting 😉 Image
Next up Dr. Shlomit Farkash-Amar @FarkashShlomit from Carelon Israel. Shlomit talks about how RWD can complement RCT to improve clinical decision making in oncology. Image
Read 4 tweets
Jun 18, 2022
קראתי את דיוני הועדה ואת הנתונים שהציגו מודרנה ופייזר, וצריך להודות שמתנגדי החיסונים צודקים הפעם בביקורת שלהם. הם כמובן איבדו אותנו בזעקות הזאב זאב שלהם לאורך כל הדרך, וברור שכלל לא מעניין אותם הנתונים האמיתיים, אבל הפעם יש אמת בכך שהניסויים הקליניים לא מרשימים בלשון המעטה. >>
הניסוי הקליני של פייזר כשל. ראשית ניתן לראות את הנוגדנים המנטרלים: לא היתה תגובה אחרי שתי מנות מול אומיקרון. כדי להציל את הניסוי הם הוסיפו מנה שלישית (שלא היתה בתוכנית המקורית) ושם כן ראו תגובה מול אומיקרון.
אבל מספר הילדים שקיבלנו מנה שלישית, וזמן המעקב אחריהם היה קצר ולכן המספר של 80% הגנה מבוסס על בסך הכל 10 ילדים שנדבקו משתי הקבוצות ובעל סטיית תקן של 14%-97%. זו תוצאה שלילית.
Read 9 tweets
Jun 16, 2022
Another exciting milestone 🔥. Our #SingleR paper just crossed the 1K citation threshold!
@MallarBhattach1 @atulbutte @NatImmunol
nature.com/articles/s4159…

>> Image
In this paper, we introduced #SingleR, an R package for annotating cells in scRNA-seq data, and used it to identify a novel transitional profibrotic macrophage state. bioconductor.org/packages/relea… Image
This couldn't have happened without the help of Aaron Lun who took it upon himself to rewrite the package for @Bioconductor, continues to maintain it, and wrote this awesome SingleR book. bioconductor.org/books/release/… Image
Read 4 tweets
Apr 29, 2022
עברתי בקצרה על המאמר. בסך הכל מאמר מעניין, ואני חושב ששימוש בקריאות למד״א זו בהחלט תוספת ראויה.
כבר דיברנו בעבר על כל החולשות של מאמר מהסוג הזה - נתונים אגרטיביים ואין מידע אישי על חיסונים, סיווג קריאות של מד״א, ועוד ועוד. אבל עכשיו כשיש נתונים אפשר גם להתייחס לנתונים >>
בעיני המודלים הסטטיסטיים על 5 החודשים של 2019 ל-2021 או על שנה שלמה הם חלשים מאוד ולא מעניינים. קל לראות מ-figure 1 שמספר הקריאות לא תלוי בזמן של השנה (ב-2019 היו מעט בינואר-מאי והרבה ביולי-דצמבר). זאת לא השוואה מעניינת. הסתכלות רציפה כן מעניינת ורואים את השיא בפברואר 2021.
השיא של מספר הקריאות לדום לב (אדום) בתקופה הזו קורה בדיוק בזמן מבצע החיסונים. בזום על תקופת החיסונים (סגול מנה 1, כחול מנה 2) רואים שהפיק האדום מגיע בדיוק עם הפיק של מנה 2 וזה מתאים למחקרים של משה״ב שרוב מקרי המיוקרדיטיס הגיעו כשבועיים אחרי מנה 2. אבל גם רואים פיק במאי, מה קרה?
Read 8 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Don't want to be a Premium member but still want to support us?

Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal

Or Donate anonymously using crypto!

Ethereum

0xfe58350B80634f60Fa6Dc149a72b4DFbc17D341E copy

Bitcoin

3ATGMxNzCUFzxpMCHL5sWSt4DVtS8UqXpi copy

Thank you for your support!

Follow Us!

:(