Thread by @Locuste_

Alors qu'on se demande fébrilement si la #VarioleDuSinge ne va pas provoquer une nouvelle pandémie, un rappel des conditions nécessaires à ce scénario du pire s'impose.

C'est parti !

⬇️⬇️⬇️⬇️⬇️

La variole du singe, ou variole simienne, est une maladie causée par un orthopoxvirus : l'orthopoxvirus simien.

Depuis l'éradication de la variole humaine (elle aussi provoquée par un orthopoxvirus), elle est reconnue comme l'infection à orthopoxvirus la plus importante.

Comment transmet-on ce virus ?

Théoriquement par projection de gouttelettes respiratoires (de courte portée), mais aussi par contact direct avec une personne infectée (fluides corporels), ou bien encore en contaminant des surfaces, vêtements, etc.

cdc.gov/poxvirus/monke…

Toutefois, et malgré l'apparition de cas sporadiques au fil des décennies, la transmission interhumaine de l'orthopoxvirus simien n'est jamais apparue comme étant efficace.

Aujourd'hui, cependant, la donne semble avoir changé puisqu'on observe une éclosion ubiquitaire des cas de variole du singe dans des écosystèmes où ce virus n'avait pas l'habitude de performer.

Comment expliquer cette différence ?

Comme vous le savez, les virus détournent la machinerie de la cellule hôte pour se répliquer.
Ce faisant, il arrive que des erreurs de copie s'intègrent dans leur matériel génétique.

Parfois, ces erreurs accouchent de mutations qui peuvent attribuer un avantage au virus, lui permettant de mieux se transmettre...

Dès lors, se pose la question de savoir si une mutation d'envergure n'a pas rendu l'orthopoxvirus plus adapté aux cellules humaines.

Le séquençage devrait nous donner bientôt la réponse.

Maintenant, est-ce que ce virus peut devenir pandémique ?

Pour cela, il faut réunir plusieurs conditions : la première, c'est d'avoir un R0 > 1, autrement dit, qu'une personne infectée en contamine plus d'une autre

et ce dans une population qui n'a pas d'immunité antérieure (tenir compte du déclin de l'immunité mondiale contre les virus du genre orthopoxvirus suite à l'arrêt de la vaccination antivariolique dans les années 80).

Avec un R0 > 1, donc, le nombre de cas augmente à chaque nouvelle génération.

Évidemment, plus le R0 est élevé, plus le virus devient inarrêtable.

A l'inverse, si le R0 est égal à 1, le nombre de cas restera constant (il n'y aura pas de flambée épidémique), et si le R0 est carrément inférieur à 1, pas de souci à se faire : l'épidémie s'éteint d'elle-même à petit feu, puisqu'il y a toujours moins de cas à chaque génération.

Ensuite, le mode de transmission est très important. Si le virus a acquis une bonne capacité à se transmettre par aérosols (à vérifier d'urgence), c'est évidemment un avantage puisqu'il peut contaminer des personnes à longue distance, sans contact direct ou indirect.

Un virus qui transmettrait efficacement de plusieurs façons différentes, nous menant à disperser nos efforts pour le contenir, un tel virus serait bien entendu très problématique (encore une fois, si son R0 excède la valeur seuil de 1).

Ensuite, il y a la période de contagiosité.

Pendant combien de temps une personne qui a attrapé le virus est-elle susceptible de le transmettre ? Plus longue est cette période, plus l'isolement du cas positif devra être long, avec toutes les difficultés que ça implique.

Il faudra également déterminer si on devient contagieux avant ou après l'apparition des symptômes.

Si le virus se transmet pendant la période d'incubation, par des gens qui n'ont même pas conscience d'en être vecteurs (comme avec le COVID-19), c'est très mauvais.

D'autre part, il faut aussi tenir compte du temps de génération du virus. Est-ce qu'on le retransmet vite après l'avoir attrapé, ou bien ce laps de temps est-il plus long ?

De la réponse à cette question dépend l'efficacité du traçage des cas contacts.

Dernier point à surveiller : l'intensité, ou du moins la visibilité des symptômes générés par l'infection.

Peut-elle ou non passer sous les radars ?

A priori, dans le cas de la variole simienne, les éruptions cutanées devraient être de nature à ne pas passer inaperçues.

On peut supposer que les parmi cas rapportées ces derniers jours, très peu, voire aucun ne pensaient être atteints de la variole - synonyme de maladie préhistorique dans l'imaginaire collectif - et qu'ils ont donc tardé à se signaler, promenant le virus dans la nature et

contaminant sans le savoir.
Alors d'un côté, c'est plutôt bon signe dans la mesure où ça souligne le caractère relativement bénin de la plupart des formes symptomatiques.

Mais il ne faudrait pas que ça ait conduit à une diffusion silencieuse trop importante.

Ceci dit, à présent qu'une alerte mondiale commence à poindre, il y a fort à parier que les comportements changent (garder la variole dans un coin de sa tête si intenses céphalées, ganglions tuméfiés et éruptions cutanées suspectes), et que ça nuise à la propagation d'un virus

qui jusqu'ici avançait masqué.

Quoi qu'il en soit, il demeure impossible à ce stade de prédire la trajectoire de ce peut-être virus muté.

Bien sûr que la multiplication des foyers dans différents pays a de quoi faire passer un frisson d'angoisse,

surtout dans une population encore fragilisée (quelle qu'en soit la raison) par la pandémie de COVID-19.

Toutefois, il est bon de rappeler que pour un COVID-19 pandémique, nous avons eu plusieurs "fausses alertes" au XXIème siècle,

au rang desquelles on pourrait citer le SRAS en 2003, la grippe aviaire H5N1 en 2006, le MERS en 2012 ou encore Ebola en 2014.

En d'autres termes, si nous savons maintenant que le pire est toujours possible (en espérant que les autorités sanitaires en profitent pour se montrer proactives), il n'est pas pour autant certain !

Aussi, j'appelle à faire preuve d'une certaine prudence vis-à-vis de tout ce qui sera dit ou relayé dans les prochains jours.

N'oubliez pas que le temps de la science n'est pas toujours le nôtre (hélas, mille fois hélas), et qu'une course effrénée à l'information dans un moment comme celui-ci peut vite s'avérer contre-productif, menant à de la désinformation.

La plus grande prudence est de mise, devant ce virus bien sûr, mais aussi contre toutes les informations encore non vérifiées, non relues par les pairs et non ratifiées par les sociétés savantes.

Prenez donc soin de vous, soyez prudents mais sans céder à l'affolement, si c'est possible !

En attendant, les gestes barrières et le retour du lavage des mains si vous l'aviez abandonné ne sont pas inutiles.

Bonne journée à tous !