Ch. Julian Villabona-Arenas Profile picture
🇨🇴 Assistant Prof. at @CMMID_LSHTM 🇬🇧. Viruses, phylogenies & typos. Now is a good time to follow me, Im going to the bar 🇧🇷🇫🇷🏳️‍🌈 Opinions are my own
A. Salcedo Profile picture 1 subscribed
Jan 16, 2021 17 tweets 4 min read
Este hilo está destinado a proporcionar perspectiva adicional sobre la aparición de variantes y sobre mutaciones. Hay mucha discusión sobre esto y algunos se preguntan ¿Por qué ahora? ¿Y qué viene luego? 🧵 1/n 1ro, lo habitual: los virus cambian TODO el tiempo. Mutación: cada cambio en el material genético. Variante: cada combinación de mutaciones. Cada 🦠 circulando tiene la capacidad de acumular 1-2 mutaciones veces por mes. Por tanto, variantes nuevas aparecen TODOS los días… 2/n
Jan 14, 2021 19 tweets 5 min read
Una vez que Variantes De Importancia epidemiológica (VdI) 🦠 parecen estar apareciendo a nivel mundial, una de las grandes preguntas en este momento es: ¿Qué tan elevado es el riesgo en términos de eficacia de la vacuna? Aquí un hilo 🧵 1/n virological.org/t/tracking-the… Por VdI me refiero a los linajes reportados recientemente en Inglaterra (B.1.1.7), Sudáfrica (B.1.351) y Brasil/Japón (P.1). Pueden ver aquí su distribución actual basada en los datos disponibles en el dominio público: cov-lineages.org/global_report.… 2/n
Dec 22, 2020 13 tweets 5 min read
Este es un hilo para dar un poco más de perspectiva sobre la situación actual y la vigilancia genómica que la OMS aconseja 🧵 1/n Por vigilancia genómica me refiero al (1) proceso de descifrar las letras (el genoma del virus) con las cuales se escribe el funcionamiento de virus y al (2) estudio de los cambios (mutaciones) en las letras para entender ¿por ejemplo, si es más transmisible o de donde viene? 2/n
Nov 5, 2020 35 tweets 8 min read
Creo que es hora de un (pequeño) hilo de actualización sobre las mutación virales y las variantes SARS-CoV-2 dada la forma en que este tema está siendo cubierto en algunos medios. 1/n Mutación es un proceso natural. Cuando virus y células se multiplican, hacen copias de las “letras” de su material genético. El genoma del SARS-CoV-2 tiene unas 30000 letras. Errores ocurren durante su copiado, así como yo cometo errores tipográficos cuando twitteo 2/n
Jun 29, 2020 18 tweets 8 min read
Junto a @INSColombia @KLaitonDonato @JoseUsmeCiro @Dialealvarez @cefrancom @LizVillabonaA @ZulmaCucunuba @nadim_ajami @mmercado_EPICO y los que no están en twitter hemos utilizado datos epidemiológicos, genéticos y de movilidad humana para el estudio de COVID-19 en Colombia 1/n El trabajo se encuentra disponible en medrxiv.org/cgi/content/sh… sin embargo, la versión disponible actual no es la versión definitiva. El trabajo se encuentra actualmente bajo revisión por pares académicos quienes verificaran la calidad de la investigación 2/n
Jun 29, 2020 18 tweets 8 min read
Junto a @INSColombia @KLaitonDonato @JoseUsmeCiro @Dialealvarez @cefrancom @LizVillabonaA @ZulmaCucunuba @nadim_ajami @mmercado_EPICO y los que no están en twitter hemos utilizado datos epidemiológicos, genéticos y de movilidad humana para el estudio de COVID-19 en Colombia 1/n El trabajo se encuentra disponible en . Sin embargo, la versión disponible actual no es la versión definitiva. El trabajo se encuentra actualmente bajo revisión por pares académicos quienes verificaran la calidad de la investigación 2/n
Feb 4, 2020 18 tweets 9 min read
Existe un # cada vez mayor de secuencias genómicas completas del #2019nCoV: 52 en el último recuento en @nextstrain. Aquí, en el #ElDesparche, discuto sobre virus y cómo extraemos información del genoma de los #coronavirus para obtener pistas sobre su origen y propagación 1/ Los virus son parásitos microscópicos mucho más pequeños que las bacterias (y muy diferentes a nivel biológico, por eso Los antibióticos no tienen efecto en los virus). Algunos virus son patógenos, es decir, causan enfermedades como el virus del Ébola o el H1N1 #ElDesparche 2/
Jan 29, 2020 13 tweets 5 min read
Cuando aparece un brote por un nuevo virus como #2019nCoV, muchos se preguntan ¿de dónde viene? En este hilo, junto con @AndersonBrito_ y la edición de @MondragonShem y @CienciaAbiertaL , explicamos los orígenes de los *virus nuevos*. 1/
(fig. adaptada de nature.com/articles/nri35…) Los virus no aparecen de la nada, ¡son los microorganismos más abundantes en la Tierra! Infectan no sólo personas sino también animales, plantas, hongos y bacterias. 2/
Jan 26, 2020 15 tweets 9 min read
Con @AndersonBrito_ vamos a resumir lo que sabemos actualmente sobre #nCoV2019 mediante datos genéticos públicos de China, Tailandia y Estados Unidos.

Nos apoyaron con edicion @MondragonShem y @noalsilencio de @CienciaAbiertaL
#2019nCoV
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La mayor parte de estos resultados se encuentran disponibles en la plataforma (en inglés) nextstrain.org gracias a @trvrb @richardneher @hamesjadfield @firefoxx66 @nicfelm & Misja Ilcisin y los proyectos de vigilancia que generan los datos #CienciaAbierta!
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