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max
@Max_Deforet
Scientist, Inventor, Explorer. IG maxdeforet.lab. (PP 📷: @verabee)
May 31, 2021 • 17 tweets • 3 min read
À l'occasion de la publication de ce livre, je me dis qu'il est tant de raconter une anecdote qui date de mars 2020. Quinze mois plus tard, il y a prescription, Yanis ne m'en voudra pas. Le 17 mars, Raoult (et ses collègues) publie le fameux article sur son traitement à l'hydroxychloroquine. Je prends le temps de le lire et de relever toutes les erreurs statistiques, etc. Dans la foulée, l'IHU publie des papiers presque tous les jours.
Oct 13, 2020 • 5 tweets • 3 min read
I believe #EmilyInParis viewers should know a historical fact about where she lives: Place de l'Estrapade.

It's located in the Fifth Arrondissement, in the Quartier Latin, one of the oldest neighborhoods in Paris. Until 1687, this cute little place hosted an 'estrapade', or 'strappado', a torture instrument that is not exactly Instagram-friendly.
It consisted in suspending the victim by a rope tied to the wrists, behind their back, resulting in dislocated shoulders.
Sep 26, 2020 • 7 tweets • 1 min read
A friend asked me why the number of cases is increasing while the reproduction number (R) is stable.

The answer is obvious for someone who is used to concepts like functions, curves, derivatives, primitives.

For others, it's impenetrable. I'm not going to make a long thread out of it, but a simple comparison:
- In a car, when you press the gas pedal, you move forward. More precisely: you accelerate.
- The position of the car increases, the speed of the car increases, the acceleration is constant.
Sep 25, 2020 • 7 tweets • 1 min read
Un ami vient de me demander pourquoi le taux de positivité augmente alors que le R est stable.

La réponse est évidente pour quelqu'un qui a l'habitude manipuler des courbes, des fonctions, des dérivées, et des primitives.
Pour les autres, c'est incompréhensible. Je vais pas en faire un long thread, mais une simple comparaison.
- En voiture vous appuyez sur l'accélérateur, vous avancez, et plus précisément : vous accélérez.
- La position de la voiture augmente, la vitesse de la voiture augmente, l'accélération est constante.
Sep 19, 2020 • 4 tweets • 2 min read
Instant veille journalisme US:
Une éditrice du Guardian US fait un grand appel pour trouver de nouvelles plumes, via Twitter, et propose de skyper avec des freelances pour discuter. Des centaines de réponses. Depuis quelques temps les chroniqueurs du NYT discutent pendant une heure sur Periscope après la publication de leurs chroniques, avec questions/réponses. Ça permet de voir le travail de fond qui est fait (c'est souvent des chroniques très argumentées).
Sep 6, 2020 • 4 tweets • 2 min read
Published in Advances in Genetics, which does not provide the list of Editorial Board members. Who accepted this paper? Any opinion, Prof. @GenomeKumar?
Sep 1, 2020 • 4 tweets • 2 min read
"Le virus est moins dangereux"
"Le virus touche les jeunes mais ne touchera pas les vieux"

Pendant ce temps, à Marseille (les entrées quotidiennes en réanimation) : Image Et en cumulé (nombre de personnes en réa à l'instant T), et par classe d'âge, on ne peut plus dire que ça ne touche que les jeunes.
Pour PACA, dans l'ordre : 50-59, 60-69, 70-79, 80-89 ans. ImageImageImageImage
Aug 29, 2020 • 5 tweets • 2 min read
Si ça continue à ce rythme, dans deux semaines il y aura autant de nouvelles hospitalisations à Marseille que lors du pic de fin mars. #covid_19 #curvefitting #exponentielle #armchairepidemiology Image Je ne sais pas faire de modèle épidémiologique, mais je sais fitter et prolonger des exponentielles. L'avantage des Bouches-du-Rhônes est qu'il y a tellement d'hospitalisations qu'on peut commencer à voir le signal sortir du bruit (source Geodes).
Aug 27, 2020 • 4 tweets • 2 min read
Un long papier (30000 signes !) sur le fact-checking des essais. L'autrice s'interroge sur ce qui lui apparaît comme une absurdité : la plupart des magazines US fact-checkent leurs papiers, mais peu de maisons d'édition gèrent le fact-checking des essais.
esquire.com/entertainment/… Les auteurs consciencieux paient parfois de leurs poches des fact-checkers indépendants. L'article couvre mille détails (les budgets, les contrats, les protocoles, etc).
Aug 13, 2020 • 5 tweets • 2 min read
At the beginning of the pandemic, @MarkJHandley from UCL was plotting cases and deaths curves for various countries. He made a plot for "warm countries" as he noticed that in Malaysia, Qatar, Indonesia, Egypt, etc, cases were increasing slower than in Europe (in March/April). Image Right now in Europe cases are rising again, but at a much slower pace compared to March/April. Is that a weather effect? Is a much faster rise expected in the near future as the temperature will be dropping (fall/winter)? Image
Aug 10, 2020 • 4 tweets • 1 min read
Face masks must to be handled with great care. I understand this rule exists for surgeons, where the mask can be contaminated by droplets. Does anyone know whether the rule holds for #covid_19? Can I fold the mask and keep it in my pocket until I take it back? If I am covid+, a mask prevents spitting out too many aerosols, whether my fingers touch it or not.
If I am covid-, a mask cuts me from possible floating aerosols, which then could stick on the external side.

Does anyone how long a virus survive on a mask?
Jul 14, 2020 • 12 tweets • 4 min read
Aujourd'hui, #14juillet, c'est le feu d'artifice dans le journal International Journal of Antimicrobial Agents. C'est ce journal qui avait publié en mars la première étude foireuse de Raoult. sciencedirect.com/science/articl… Ce papier avait été édité par Dr. Po-Ren Hsueh, reviewé et accepté en 1 jour. L'ISAC (International Society of Antimicrobial Chemotherapy), la société savante qui chapeaute le journal, avait publié un communiqué le 2 avril pour confirmer que le papier était un torchon.
Jun 25, 2020 • 6 tweets • 2 min read
Didier Raoult released his "big paper". A study of 3737 patients. He claims hydroxychloroquine/azithromycin has great effects on Covid-19 patient.

I claim his study demonstrates that Covid-19 kills mostly older people.

sciencedirect.com/science/articl… The paper provides this table with (incomplete) mortality data by age.
In his center (IHU), Covid-19 kills only old people (>70). Image
Jun 25, 2020 • 4 tweets • 1 min read
Le format des commissions parlementaires ne permet pas d'aller au fond des sujets complexes. Chaque député pose une question, la personne interrogée répond (ou non), et on passe au député suivant.

Je rêve d'un format à l'américaine, 5 minutes de questions-réponses par député. "- M. Raoult, avez-vous dit, je cite "Des infections respiratoires dans lesquelles il y a des secondes vagues, il n’y en a pas, donc je ne vois pas pourquoi il y en aurait pour celle-là" ?
- Euh, oui.
Jun 23, 2020 • 12 tweets • 3 min read
Raoult dans sa dernière video cite une étude de l'APHP sur l'hydroxychloroquine.
Les résultats qu'il en extrait me rendent triste. J'imagine qu'il parle de cette étude medrxiv.org/content/10.110…
Jun 19, 2020 • 6 tweets • 2 min read
Depuis quelques temps, le NYT sort des super projets éditoriaux sur de simples thèmes, avec en général une dizaine de textes et une mise en page adaptée au thème. En français on appellerait ça un cahier spécial.

La joie :
nytimes.com/interactive/20… J'arrête :
nytimes.com/interactive/20…
Jun 9, 2020 • 8 tweets • 2 min read
Each published article, good or bad, is worth "SIGAPS" points in the French public medical research system. Each point brings funding to the host research institute.
Afaik, this point has not been raised yet on twitter among the informal reviewers that criticize Raoult's works. An article published in a high IF journal brings more points that an article published in a lower IF journal. But the lowest value is 1, not 0. Therefore, a good strategy is too publish as much crap as possible. SIGAPS fundings can be a large part of a research center budget.
Jun 9, 2020 • 8 tweets • 2 min read
Il se passe quelque chose dans la presse US Démission aussi à Longreads
Jun 7, 2020 • 5 tweets • 1 min read
Vous vous demandez encore comment Raoult et l'IHU ont pu tester autant en mars/avril ? Tout est expliqué ici :


"Comme tout le monde, on a été face à un pénurie de réactifs et consommables" Ils ont cherché partout en Europe, sans succès.
Le 20 mars, coup de bol, une société vétérinaire leur propose des réactifs. Ils sautent dessus, avant que d'autres clients ne prennent ces réactifs.
Avec ces réactifs, ils ont dû acheter/emprunter de nouvelles machines adaptées.
May 28, 2020 • 5 tweets • 2 min read
On parle partout du test salivaire Easycov. Pas un seul article n'explique la technologie derrière le test. C'est secret défense ?
A priori c'est isothermal amplification, mais le test Abbott aux US qui utilise cette techno a bcp de faux négatif.
cc @BioHospitalix Pas un seul article n'explique le trade-off sur les technologies de détection (On ne peut pas avoir à la fois précision/rapidité/coût), et se contente de reprendre les communiqué de presse. Misère.
May 27, 2020 • 32 tweets • 6 min read
Pas besoin de super-spreaders pour avoir du super-spreading. Si tous les infectés sécrètent exactement la même quantité de virus, il peut y avoir du super-spreading. Il suffit pour ça d’avoir des rassemblements importants. Thread (avec des bateaux). L’idée ici est de développer une intuition sur les clusters, pourquoi ils sont si importants, et pourquoi il faut absolument éviter les rassemblements en lieux clos, indépendamment des probabilités de transmission.