הפוטנציאל של מודלים גנרטיביים כמו #ChatGPT לשנות את עולם הרפואה מסעיר את הדמיון

קצב ההטמעה של הכלי הזה הוא המהיר בהיסטוריה - מיליון משתמשים תוך 5 ימים (מה שלקח לנטפליקס 3.5 שנים), ועם ההתפשטות יגיעו יישומים חדשים ומרגשים

אבל כבר כעת אפשר לראות כמה דברים מרתקים בתחום שלנו:

/1 החדשות האחרונות: ציון של 67 במבחן הגמר ברפואה USMLE, לכלי FlanPalM של @GoogleAI
כלומר - מודל שפה ׳טיפש׳ למדי עם גישה לדאטה מוגבל עובר את המבחן

התוצאה פורסמה זמן קצר לאחר פרסום תוצאה מדהימה קודמת, מודל #PubmedGPT שהשיג תוצאה הטובה לשעתה (׳שעתה׳ נמשכה כמה ימים) של ציון 50

2/

https://twitter.com/ranbalicer/status/1609904654980374531

ערד - ראיתי שתייגת אותי
קראתי את הציוץ

הוא טוען, בצדק:
1. מול הזנים *עד אומיקרון*, החיסון (בח׳ שאחרי החיסון לפני דעיכת הנוגדנים, ושוב אחרי בוסטר) מנע הידבקות (infection) והדבקה (transmission)
זה ההגיון בבסיס ההנחה שהתו הירוק הפחית הדבקה ותחלואה קשה באירועים המוניים בגל 3-4

1/ זה סביר וצפוי
בחיסונים שונים (למשל: פנאומוקוקוס) האפקט הבלתי-ישיר של הגנה מהחיסון (לא ההגנה על המתחסן אלא על מגעיו) מונע יותר תחלואה מהגנה על המחוסנים

זה הודגם בקורונה בעבודה שלנו ב-@ScienceMagazine👇וכן בעבודות נוספות כמו זו למשל של הבריטים, ב-NEJM
nejm.org/doi/full/10.10…

2/

🧵קצר - מבט מאזן:

מדוע *לא* להגביל התקהלויות:
1. כי זו מדיניות לא-דיפרנציאלית, וזה לא הוגן להגביל מחוסנים כשרוב החולים קשה לא-מחוסנים
2. כי זה ימנע חלק לא גדול מההדבקות (רוב ההדבקות לא קורות שם)
3. כי בימים מאז ההמלצה, מגמת ירידה (צפויה) אולי החלה
4. כי התו הירוק עומד להתעדכן

> 5. כי הגבלה של מס׳ שב׳ בהתכנסויות יכולה לפגוע בתעשיה זו לתקופה נוספת
6. כי בריאות היא לא שיקול יחיד, ולנזק כלכלי מחיר בבריאות

מדוע *כן* להגביל התקהלויות:
1. כי יש 55 מטופלים על אקמו - הספיקה מוצתה
2. כי במצב כזה מי שעלול לשלם מחיר הוא *המחוסן* שמגיע עם התקף לב / לאחר ניתוח

>

Noteworthy trends in Covid-19 in Israel - short thread:

1.
Among highest infection rates globally
- >1,000 cases/M/d, ~8% positives
(note very high testing rates)

2.
1:200 unvaccinated older adults in Israel have became severely ill with COVID-19 in the last 3 weeks!

1/n
🧵> 3.
Vast majority of adults were vaccinated w/ 2 doses by Feb 2021

Now - largest ongoing 3rd booster vaccination campaign globally in place to tackle high rates of breakthrough cases and severe cases-
by now, 3rd shot uptake by age group:
60+: 75%
50-59: 55%
Graph👇

🧵>

1/
סיכום סטטוס נוכחי והמלצות קדימה:

- זן דלתא מדבק ב-50% יותר מאלפא ולכן יהיה הזן השולט בישראל תוך זמן קצר, כמו במדינות רבות

- במדינות בהן כבר התפשט יש זינוק בתחלואה (גרף). לאף אחת מהן אין 85% חיסון בבוגרים- אז אין לדעת אם גם אצלנו נראה החרפה מהתפרצויות מקומיות לתחלואה מפושטת
> 2/

- החיסון של פייזר ב-2 מנות יעיל נגד זן דלתא, אבל קצת פחות. כמה פחות- לא ברור, דווחה יעילות 80-90% לתסמינים. פחות מאלפא- 88-96% לפי עבודות שונות

- במדינה כמו ישראל בה >85% מהבוגרים מחוסנים, ולאור יעילות החיסון לעיל יש לצפות, בחישוב פשוט, שרוב הבוגרים הנדבקים יהיו מחוסנים

>

https://twitter.com/ranbalicer/status/1406695565056950277

הזן ההודי (דלתא) - שרשור🧵קצר:

מדבקות -
פי 1.5 מהזן ׳הבריטי׳ (אלפא- שהיה בעצמו מדבק יותר מקודמו).
זו בעיה. ככל שזן יותר מדבק, הוא יודע להתפשט למרות שיעור מחוסנים גבוה יותר.
לכן - הוא כבר הפך לזן הדומיננטי ב-UK
והוא גורם ל-73% מההדבקות שם.

ומגמת העליה שם מטרידה:

>
(1/5) ההתפרצות הזו קורית למרות שרוב הבוגרים הבריטים מחוסנים במנה 1 - בשיעור דומה לישראל.
ב-2 מנות - עדיין פער לטובתנו, שאולי מסביר את ההתפרצות שם אך לא כאן.

להזכיר שבסיבוב הקודם לאחר שזן אלפא (הבריטי) הפך לדומיננטי בבריטניה, כך קרה גם כאן.

>
(2/5)

B.1.351 variant partially evades Pfizer vaccine protection in real world:

A @ClalitResearch & @SternLab study shows 8-fold (!) B.1.351 prevalence in sequenced virus from breakthrough cases fully vaccinated (Pfizer) vs matched unvaccinated w/ infection

>

medrxiv.org/content/10.110… Implications:
1. Pfizer vaccine likely still largely protective, as B.1.351 spread in Israel very limited (~1% of infections).

2. Even in mass-vaccinated areas, surges driven by B.1.351 may happen. Some NPIs should still be maintained.

Key study limitation- limited #’s (800).

מחקר חדש פרי שת״פ בין כללית @ClalitResearch לאונ׳ ת״א בחן את השאלה האם הוריאנט הדר׳ אפר׳ יעיל יותר מהבריטי בפריצת ההגנה שמקנה החיסון של פייזר.

התשובה - כן.

400 מקרי ׳פריצת חיסון׳ (הדבקה לאחר 2 מנות) הותאמו ל-400 נדבקים דומים שלא חוסנו, ורוצפו גנטית.

>

medrxiv.org/content/10.110… הריצוף הגנטי של הנגיפים הראה שכיחות לא צפויה של הזן הדר׳ אפר׳ דווקא בצד המחוסן מלא של הצמדים (פי 8 מה-1% הצפוי לאור שכיחותו בצד הלא מחוסן)

ההבדל מובהק

זוהי עדות ברורה לכך שזן זה רכש ייתרון, יחסית לזן הבריטי, בהתחמקות מההגנה של החיסון

ועדיין- הוא לא התפשט כאן עד כה מעבר ל-1%

>

תובנה מאד רלוונטית מדנמרק-

צעדי הבלימה המירביים שם (׳lockdown׳- אך הוא לא מחמיר כמו פה) הביאו לירידה דרמטית בהדבקות - עם R של 0.78.

אלא מה- באותו זמן הוריאנט הבריטי (זה שהפך פה לדומיננטי) ׳לא נשמע לסגר’ ונותר R>1.

מסקנה- זן בריטי ׳מנצח׳ סגר.
מציאות חדשה ומטרידה.

צאו להתחסן.

https://twitter.com/maxcroser/status/1357311537489326082

מה המשמעות של אי היכולת להשיג הפחתה בתחלואה בעזרת סגר?

אי אפשר לבנות על כך שאם הפתיחה לא תהיה אחראית ושקולה, נוכל תמיד לעשות ׳השבת מצב לקדמותו׳ על ידי מגבלות כואבות, בטרם יתמלאו בתי החולים.

ומאידך, אי אפשר להמשיך בסגר ולקוות לראות ירידה בתחלואה שתספק לנו ׳תקופת ביטחון׳ להתנסות.

שרשור שו״ת כתחליף לכותרות הדרמטיות וחצאי הפרשנויות:

*האם סגרים בעבר עבדו כמוצא אחרון? כן. הם לא רק בלמו עליה מעריכית בתחלואה, גם הקטינו אותה דרמטית.
בזכותם נמנעה תמותה רבה בחודשים שקדמו למבצע החיסון. והחיסון מייצר תקווה, ומתווים חדשים של חזרה לחיי שגרה במינימום נפגעים.

> * האם סגרים היו ברירת המחדל של פורום המומחים?
לא. הפורום התנגד לסגרים והציע מגוון גדול של פתרונות שלו היו מיושמים, היו עשויים למנוע את הצורך בסגר בכל אחת מהפעמים שהוטל
אולם ב-2 הפעמים, מרגע שהמחלה התפשטה בהיקפים שאיימו להכריע את מערכת הבריאות, הם הפכו לאופציה היחידה והפחות גרועה.

סיכום דיון קבינט המומחים מהלילה, מופץ לציבור בשקיפות ומיידית כמו כל דיונינו.

בצומת הדרכים בו אנו נמצאים עומדות בפנינו רק חלופות גרועות ו/או עתירות סיכון.
אין ׳תשובות נכונות׳ אך ניסינו לאזן ככל האפשר את הסיכונים והסיכויים ולייצר מתווה שנושא בחובו תקווה להמשך אך לא תקוות שווא.

> עמוד אחרון של הסיכום-

אז מה בעצם נשתנה?
1. עשינו הכל לעבור בשלום את השנה- עד לחיסון המוני והגנה על אוכלוסיות הסיכון.

בתוך שבועיים זה יקרה, חיים רבים ניצלו בשל כך. וכעת צריך להחליט על החיים מכאן לצד הנגיף.

יש מספר חלופות, ההכרעה קשה אך מרגע שתקרה, תייצר תקווה ותאפשר לציבור להתלכד סביב מטרה משותפת.

>

https://twitter.com/ranbalicer/status/1354883722311561217

2. לממשלה היתה אופציית מילוט מהכרעות קשות והתמודדות עם הפרות. קראו לה ׳סגר לסירוגין׳.
זו לא היתה המלצת המומחים באף סיבוב, אבל כאשר התעלמות מההמלצות הביאה להתפשטות בלתי נשלטת, נאלצנו פעמיים לבחור בה כמוצא אחרון הפחות גרוע.

החדשות הן- לא עוד. זה כבר לא עובד.

תוצאות מטרידות מ-UK:
סדרת ניתוחי דאטה מצביעים על כך שבניגוד להשערות (ולתוצאות) הראשוניות, יש עדות נסיבתית לכך שהזן הבריטי (B.1.1.7) כן כרוך בשיעור עודף של תחלואה קשה.

אם (וזה אם גדול) כך הדבר, עשוי להאט את ירידת שיעור המקרים הקשים בישראל, למרות החיסון.
gov.uk/government/pub… למרבה השמחה, רוב העדויות עד כה מלמדות שהחיסון של פייזר יעיל באופן מלא כנגד הזן הבריטי.

These data, together with the combined immunity involving humoral and cellular effectors ... make it unlikely that the B.1.1.7 lineage will escape BNT162b2-mediated

biorxiv.org/content/10.110…

Clalit’s preliminary analysis demystified:

I want to elucidate the preliminary data we made public 10 days ago.

By now we have much better data and inferences, but until the publication is out, the previous interim analysis continues to draw much attention.

Thus - a thread:

> Inclusion in the analysis:

200,000 vaccinees age 60+ with at least 11-days of follow-up post vaccine 1st dose. Few had >18 days follow-up.

were compared with a matched group (age and other covariates) of 200,000 unvaccinated individuals.

Clalit members= >50% of Israelis.

>

Israel update:

1. Vaccines:
- 2.4 million vaccinated (27%)
- Incl. 700k w/ 2nd dose (8%)
- 78% of age 60+ covered
- 205,000 vaccinated yesterday (!)
- 70k 1st dose, 130k 2nd dose

2. Covid:
- Massive community spread
- record high 10,000 new PCR+ daily cases earlier this week

> - 9% PCR test positivity. Saturation may mask smaller changes.
- 1,200 severely ill inpatients - stable but very high burden on wards
- R~1 under prolonged lockdown
- yet very miserable status-quo to be ‘stuck’ in with R=1.
- lockdown prolonged for 10 more days by the gvmt

בישראל מתחסנים היום 100 איש כל דקה. זה מדהים.
אבל >70% מבני 60+ עדיין צריכים להתחסן, וצריכים לעבור 10 ימים עד שמתחילה הגנה משמעותית מסיבוכי המחלה

בשביל שנוכל ׳לספוג׳ עליה של פי 2 במספר המאומתים היומי בלי לראות עליה בחולים קשה, נצטרך להיות 2-3 שבועות לאחר חיסון של 2/3 מבני 60+

https://twitter.com/nadav_eyal/status/1344180792478605313

בשביל לספוג עליה פי 4 במאומתים ולשמור על אותו מספר של חולים קשים ליום, נצטרך להיות 2-3 שב׳ אחרי שכל (100%) בני 60+ התחסנו וחלק מה 50+ עם מחלות כרוניות

תוספת החולים הקשים הנוכחית, 70-80 ליום, מייצר הצטברות של חולים קשים בבתי״ח (בניכוי המשתפרים/מתים) בקצב של 20 ליום.
וההאצה נמשכת

Israel: Vaccination continues at >100k per day. Tomorrow aiming for 150k (~1.7%) per day, vaccinating 24/7.

Over 600,000 (~7%) of Israelis vaccinated in the last 10 days. Over 20% of the 60+ age group, aiming for 70% by next weekend.

Close ‘race’ as cases are rising fast. Next in line for vaccination- older individuals with certain chronic conditions.

Other groups incl. school teachers and younger individuals with chronic diseases could be next- still under deliberation.

The overall number of doses to be available in January is yet unknown.

הוריאנט הבריטי B.1.1.7 - תקציר ופירוט מדעי:
1. בודד לראשונה ב-20 בספטמבר בבריטניה. התפשט בקצב גובר והולך. לפני שבוע זיהו שהגיע לכדי ל-60% מהזנים המבודדים בלונדון.

2. בעוד בקורונה הצפי הוא לצבירה של 1-2 מוטציות בחודש, הזן הזה צבר 17(!) מוטציות. לא ברור איך קרתה הקפיצה הזו.

> 3. רושם מתחזק (עדיין לא ודאי/מאומת) להתפשטות מהירה יותר של הזן הזה. עשוי להיות קשור לאחת המוטציות (N501Y) שמשנה את החיבור של הנגיף לרצפטור על התא הנתקף.
המקור לנתון הבריטי של 70%- לא ברור

המוטציה הזו גם נצפתה בזנים אחרים שמתפשטים (מהר) במדינות כמו ד. אפריקה.

>

נשאלתי הערב שאלה טובה בערוץ 13- אם החיסונים בדרך, למה לא ׳לתת למחלה לרוץ׳?

מספר סיבות:
1. חיסון האוכ׳ בסיכון (18% מהתושבים) ייצור שינוי דרמטי בקבלת ההחלטות- הסכנה להצפת מערכת הבריאות פרקטית תעלם.

אבל: א. צריך לעבור בשלום את החודשים עד אז. ו-ב. יש מספר רכיבי סיכון וחוסר ודאות. א. לעבור בשלום את החודשים הקרובים-
כי הקפיצה יכולה להיות מהירה מאד. R=1.25 משמעותו הכפלה פעם בשבועיים.

מס׳ הקשים החדשים ליום כבר זינק ל-60+ בימים האחרונים.
בספטמבר הגענו מ-60 ל-160 ליום תוך כ-3 שב׳, ללא שפעת.
אין זמן. חייבים לפעול לבלום את העליה, לפחות עד סיום מתן המנה ה-1.

1
אני לא רואה בסגר והירידה הדרמטית בתחלואה בעקבותיו הצלחה

לטעמי סגר הוא הנחת ׳חסם עורקים׳.
הדימום עצר, אבל הבעיה לא נפתרה:
אם לא תוריד אותו-> נמק. חברתי, כלכלי, רפואי.
אם תוריד אותו ולא טיפלת בבעיה השורשית-> תחזור לדמם ודבר לא הושג.

ממחר הדימום חוזר. ולא נעשה די כדי למנוע אותו. 2
יציאה מהסגר-
1. לטעמי בתכנית היציאה המדורגת יש ליחס חשיבות מוגבלת לתקנות ולסייגים הספציפיים המנויים בהם, אשר בפועל מוגבלים ומתועלים על ידי מגבלות חוקיות, פוליטיקה, ואתגרים פרקטיים ותכנוניים של משרדי הממשלה.

החלק הקובע באמת הוא ההסבר הבהיר לציבור- איך מומלץ לנהוג ומה הרציונל.

מהן ההמלצות להתנהלות היומיומית, אם ברצונכם מחד לשמר אורח חיים בריא, חברתי ושפוי, ומאידך להמנע ככל האפשר מהדבקה ומסיכון של בני משפחתכם?

שש המלצות לתקופה של מחלה מפושטת (וזה עדיין המצב ברוב הארץ): א. בחרו מספר מצומצם של אנשים עמם תקיימו מפגשים ממושכים בחלל סגור, ודבקו בהם. רק הם, מעבר לבני הבית.
הם ה-׳בועה׳ שלכם ביומיום.
בחרו לבועה שלכם מי שבעצמו מתנהל יומיום בזהירות.

ב. ישיבה של >5 אנשים בחדר סגור, לא מאד גדול ומאוורר? - סרבו/ותרו על המפגש, או העבירו החוצה לאוויר הפתוח.