Una de las principales tareas en el tratamiento de datos en #bioinformática 🧬💾 es la encadenación de procesos para construir lo que se denomina #WorkFlow ⚙️ . A menudo estos procesos suelen dar error, lo que en muchas ocasiones nos obliga a reiniciar todo el trabajo. (1/9) Con el fin de automatizar estas tareas y desarrollarlas de la forma más eficiente existen los gestores de trabajo, que nos permiten agilizar y personalizar los análisis. Aquí os dejo los más representativos (2/9) 🧶👇:

En #bioinformática se utilizan ficheros 💾 en formato estándar para unificar los resultados. Muchos de estos ficheros derivan de la aplicación de las técnicas de secuenciación nucleotídica 🧬.Abrimos 🧶👇 para describir algunos ejemplos, que no son todos (1/9) @scbi_uma @InfoUMA El resultado de los procesos de secuenciación se muestran en ficheros tipo 'file.fastq'. Éstos tienen una estructura muy establecida, incorporando tanto la secuencia como la calidad de los nucleótidos secuenciados (fuente: en.wikipedia.org/wiki/FASTQ_for…) (2/9).

En muchas ocasiones me preguntan en clase dónde encontrar #cursos y/o #tutoriales ✍️ de introducción a la #bioinformática 🧬💾 de acceso libre. Os dejo una entrada abierta que iré completando con aquellos más representativos. Se admiten sugerencias. ¡Abrimos hilo 🧶 👇!@scbi_uma Curso introductorio a la bioinformática aplicada, enfocado a Python y Biopython. Utilizado como aproximación a la #bioinformática por la UC San Diego. Desarrollado, originariamente, por Sabeel Mansuri y Mark Chernyshev. Actualizado en enero 2022 (/1).
bioinformaticscrashcourse.com