Share this page!

Enter URL or ID to Unroll

You can paste full URL like: https://x.com/threadreaderapp/status/1644127596119195649
or just the ID like: 1644127596119195649

How to get URL link on X (Twitter) App

  1. On the Twitter thread, click on or icon on the bottom
  2. Click again on or Share Via icon
  3. Click on Copy Link to Tweet
  4. Paste it above and click "Unroll Thread"!
  5. More info at Twitter Help
The Sato Lab (Kei Sato) Profile picture
The Sato Lab (Kei Sato)
@SystemsVirology
東京大学医科学研究所システムウイルス学分野教授 The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium主宰 一般社団法人G2P-Japan代表理事 週プレNEWSでコラム連載中→https://t.co/zLvSNcurTq
8 subscribers
Oct 17 • 7 tweets • 3 min read
BREAKING🔔 A new study from G2P-Japan🇯🇵, led by Yu in my lab, is out at bioRxiv @biorxivpreprint. We elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 #XEC. Please repost🔥 1/
biorxiv.org/content/10.110… Compared with KP.3, #XEC harbors two spike substitutions, S:T22N and S:F59S. Recombination analysis by Shusuke @KawakuboShusuke showed that XEC is a recombinant lineage of KS.1.1 (JN.13.1.1.1) and KP.3.3 (JN.1.11.1.3.3) with a breakpoint at genomic position 21,738–22,599. 2/ Image
Image
Jul 17 • 10 tweets • 2 min read
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の新しい研究成果「新型コロナウイルス変異株KP.3.1.1のウイルス学的特性の解明」について、プレプリント公開に先立って速報します。本研究では、最近いくつかの国で増加傾向にある、JN.1の子孫株である新しい変異株KP.3.1.1の特性を検証しました。1/ 春になり、JN.1の子孫株が出現し、それらが優勢になり始めています。現在本邦は第11波に入っていますが、それはこれらのJN.1の子孫株によって引き起こされています。現在の流行状況などについては、本日公開の最新コラムで解説しています↓ 2/
Jul 17 • 8 tweets • 2 min read
BREAKING🔔 Here I want to quickly report our new results from G2P-Japan🇯🇵 before the preprint publication. We have elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 KP.3.1.1 - a progeny of JN.1. Please RT🔥 1/ Cf.1 A new one, KP.2 (JN.1.11.1.2), has been already elucidated. 2/
Jun 6 • 8 tweets • 2 min read
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の新しい研究成果「新型コロナウイルス変異株KP.3, LB.1, KP.2.3のウイルス学的特性の解明」について、プレプリント公開に先立って速報します。本研究では、最近いくつかの国で増加傾向にある、JN.1の子孫株である新しい3つの変異株の特性を検証しました。1/ 春になり、JN.1の子孫株が出現し、それらが優勢になり始めています。そのひとつ、KP.2 (JN.1.11.1.2)の特性については、すでにG2P-Japan🇯🇵が論文として報告しています。2/
Jun 6 • 7 tweets • 2 min read
BREAKING🔔 Here I want to quickly report our new results from G2P-Japan🇯🇵 before the preprint publication. We have elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 KP.3, LB.1 and KP.2.3 - progeny of JN.1. Please RT🔥 1/ Cf. A new one, KP.2 (JN.1.11.1.2), has been already elucidated. 2/
May 20 • 5 tweets • 2 min read
#拡散希望 第2回新型コロナウイルス研究集会を、8月2日〜4日に東京・品川で開催します！　今年のテーマは「COVID-19の疫学、臨床医学、免疫学、ウイルス学」。新型コロナに関する科学のすべてを網羅した集会になるよう準備を進めています！ 1/
confit.atlas.jp/guide/event/co… 参加・演題登録はこちらから↓
今年は「オンデマンド配信」も予定しています。先約があったり、遠方で現地参加が難しい方や、医療従事者のみなさまにも広くご参加いただき、新型コロナの科学の最先端を知る機会を提供できればと思っています。2/
confit.atlas.jp/guide/event/co…
Apr 27 • 6 tweets • 2 min read
BREAKING🔔 A new study from G2P-Japan🇯🇵 is out at bioRxiv @biorxivpreprint. We elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 KP.2 - a progeny of JN.1. Please RT🔥 1/
biorxiv.org/cgi/content/sh… Cf. This is KP.2 (aka JN.1.11.1.2). In spike, KP.2 = JN.1 + S:R346T, S:F456L & S:V1104L).

We remember that R346T was observed in BQ.1.1 and XBB lineages, while F456L is a hallmark of EG.5 lineage. 2/ Image
Jan 9 • 12 tweets • 3 min read
BREAKING🔔 The 32nd paper from G2P-Japan🇯🇵 is out at Lancet Infectious Diseases @TheLancetInfDis. We show the breadth of antisera induced by XBB.1.5 monovalent vaccine - comparison between infection-naïve and XBB-infected individuals. Please repost🔥 1/
thelancet.com/journals/lanin… To control SARS-CoV-2 infection, the XBB.1.5 monovalent vaccine is now available. However, we found that natural infection with XBB subvariants, including XBB.1.5, does not efficiently induce humoral immunity against the infecting XBB subvariants, e.g. 2/
Jan 4 • 7 tweets • 3 min read
BREAKING🔔 The 33rd paper from G2P-Japan🇯🇵 is out at Lancet Infectious Diseases @TheLancetInfDis. We elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 JN.1 - a progeny of BA.2.86 (#Pirola). Please retweet/repost 1/
thelancet.com/journals/lanin… This is JN.1 (aka BA.2.86.1.1; in spike, JN.1 = BA.2.86 + S:L455S. We remember that the L455 substitution, S:L455F, was observed in the XBB lineage (e.g., HK.3 and these are known as "FLip" subvariants). 2/ Image
Dec 10, 2023 • 8 tweets • 3 min read
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の新しいプレプリント「JN.1のウイルス学的特性の解明」を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。本研究では、最近増加傾向にある、BA.2.86（俗称 #ピロラ）の子孫株である新しい変異株JN.1の特性を検証しました。1/
biorxiv.org/content/10.110… JN.1とは、S:L455Sという変異を獲得したBA.2.86の子孫株です。こんな変異を持っています。
JN.1 S = BA.2.86 S + S:L455Sです。2/ Image
Dec 10, 2023 • 7 tweets • 3 min read
BREAKING🔔 A new study from G2P-Japan🇯🇵 is out at bioRxiv @biorxivpreprint. We elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 JN.1 - a progeny of BA.2.86 (#Pirola). Please RT🔥 1/
biorxiv.org/content/10.110… Cf. This is JN.1 (aka BA.2.86.1.1; in spike, JN.1 = BA.2.86 + S:L455S. Importantly, we remember that the L455 substitution, S:L455F, was observed in the XBB lineage (e.g., HK.3 and these are known as "FLip" subvariants). 2/ Image
Nov 30, 2023 • 11 tweets • 3 min read
BREAKING🔔 A new study from G2P-Japan🇯🇵 is out! The preprint will be out so soon, but we first show our results on the efficacy of XBB.1.5 monovalent vaccine - comparison between infection-naïve and XBB-infected individuals. Please retweet/repost🔥 1/ XBB.1.5 monovalent mRNA vaccine has been available since September 2023. However, we found that breakthrough infection with XBB subvariants, including XBB.1.5, does not efficiently induce humoral immunity against the infecting XBB subvariants. e.g., 2/
Nov 30, 2023 • 7 tweets • 1 min read
#拡散希望 速報🔔 ちょっと遅れましたが、G2P-Japan🇯🇵の新しい研究成果「XBB.1.5単価ワクチンで誘導される中和抗体の機能の評価」を報告します。プレプリントは投稿中なので、近日中に公開されるかと思いますが、それに先立って速報します🔥 1/ 本年9月から、XBB.1.5対応単価ワクチンの接種が始まりました。期待を持たれるこのワクチンですが、我々の先行研究の結果を見ると、XBB亜株にブレイクスルー感染しても、XBBに対する中和抗体が充分に誘導されないことがわかっています。2/
Nov 4, 2023 • 7 tweets • 3 min read
BREAKING🔔 A new study from G2P-Japan🇯🇵 is out at bioRxiv @biorxivpreprint. We elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 BA.2.86 (aka #Pirola).
*BA.2.86 is has >30 mutations in the genome.
Please RT🔥 1/
biorxiv.org/content/10.110…

Image
Image Epidemic dynamics modeling by @jampei2 and @JarelElgin showed that the relative effective reproduction number (Re) of BA.2.86 is 1.07-fold higher than that of the currently predominant EG.5.1, suggesting that BA.2.86 has the potential to become the next predominant one. 2/ Image
Sep 19, 2023 • 8 tweets • 3 min read
BREAKING🔔 The 28th paper from G2P-Japan🇯🇵 is out at Lancet Infectious Diseases @TheLancetInfDis. We elucidated the virological characteristics of new SARS-CoV-2 variant under monitoring, BA.2.86 (aka #Pirola). Please retweet/repost🔥 1/
thelancet.com/journals/lanin… Here I summarized the mutations detected in BA.2.86. 2/ Image
Sep 12, 2023 • 11 tweets • 4 min read
BREAKING🔔 The 27th paper from G2P-Japan🇯🇵 is out at Lancet Infectious Diseases @TheLancetInfDis. We elucidated the virological characteristics of new SARS-CoV-2 variant of interest, EG.5 (aka #Eris) Please RT🔥 1/
thelancet.com/journals/lanin… Currently, a subvariant of XBB.1.9, EG.5 (aka XBB.1.9.2.5) is well documented in Twitter (maybe aka #X) and elsewhere. 2/
* EG.5.1 S = XBB.1.9.2 S + #Q52H + #F456L
* XBB.1.9.2 S = XBB.1.5 S.

Image
Sep 7, 2023 • 9 tweets • 3 min read
BREAKING🔔 A new study from G2P-Japan🇯🇵 is out! The preprint will be out so soon, but first we show our results on BA.2.86 - transmissibility, infectivity and immune resistance. This would be the 4th non-peer-reviewed🗒, but includes some new stuff. Please retweet/repost🔥 1/ Cf. Non-peer-reviewed works on BA.2.86:
The 1st🗒 from @yunlong_cao :


The 2nd🗒 from @BenjMurrell :


The 3rd🗒 from @BarouchLab :


Here I summarized the mutations detected in BA.2.86. 2/


Image
Aug 9, 2023 • 11 tweets • 4 min read
BREAKING🔔 A new preprint from G2P-Japan🇯🇵 is out at bioRxiv @biorxivpreprint. We evaluated the antiviral humoral immunity induced by breakthrough infection (BTI) of XBB subvariants and its effect against a new one, EG.5. Please RT. 1/
biorxiv.org/content/10.110… Currently, a subvariant of XBB.1.9, EG.5 (aka XBB.1.9.2.5) is well documented in Twitter (maybe aka #X) and elsewhere.
EG.5.1 S = XBB.1.9.2 S + Q52H + F456L, and XBB.1.9.2 S = XBB.1.5 S. 2/
https://t.co/Tm6soayTIV
Image
Aug 9, 2023 • 11 tweets • 3 min read
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の新しいプレプリント「XBB亜系統のブレイクスルー感染で惹起される液性免疫とEG.5」を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。本研究は、最近増加傾向にある新しい変異株EG.5と、XBBブレイクスルー感染の関係を検討しました。1/
biorxiv.org/content/10.110… 最近、XBB.1.9の亜系統「EG.5（XBB.1.9.2.5）」の感染拡大が、国内外（やツイッター）で話題になっています。特にEG.5.1は、XBB.1.9.2（スパイクはXBB.1.5と同じ）のスパイクに、Q52HとF456Lというふたつの変異が追加されたものです。2/
https://t.co/0muHApwNVb
Image
Aug 5, 2023 • 10 tweets • 3 min read
ここのところいろいろなところでツイートされてよく見かけるこの論文（の解説和訳）に関連して、基礎ウイルス学的観点（と、これまでのG2P-Japan🇯🇵の研究成果）から、新型コロナのこれまでの進化の変遷について簡単にちょっとまとめてみようと思います🎐1/
rplroseus.hatenablog.com/entry/2023/05/… 2021年末のオミクロンBA.1、その直後の2022年初頭のBA.2、そして2022年夏のBA.5までは、出現から全世界規模での流行まで、「全とっかえ」状態でした。つまり、「最強ががすべてを制する」という構図が繰り返されました。これはオミクロン以前の、アルファ、デルタでも同じ構図でした。2/
Jun 29, 2023 • 11 tweets • 3 min read
BREAKING🔔 The 23rd paper from G2P-Japan🇯🇵 is out at Journal of Infectious Diseases @JIDJournal. Using animal model, we assessed the impact of imprinted immunity induced by mRNA vaccine. The result is striking, but this thread should be read to the end🧵1/
academic.oup.com/jid/advance-ar… First, in the case of unvaccinated animals, natural SARS-CoV-2 infection efficiently induced antiviral humoral immunity against the variant infected (B.1.1, BA.2, BQ.1 or XBB.1). 2/