Interessante post di @SilvestriMd sulle evidenze dalla virologia molecolare che Omicron è meno patogenico. Aggiungo un paio di considerazioni epidemiologiche (non mi permetterei commenti di virologia, non è il mio campo) che credo siano rilevanti. 1/5

https://twitter.com/SilvestriMd/status/1490538852003553281

Tradurre l'evidenza molecolare in un numero epidemiologico a livello di popolazione è molto difficile. La riduzione di severità si misura quindi su infection fatality/hospitalization ratios che sono tra le quantità determinanti per le valutazioni di impatto epidemico 2/5

Le agenzie internazionali stanno alzando il livello di allarme rispetto a omicron. Questo non è perché le agenzie si divertono ad agitare la politica e i mercati. Lo fanno sulle analisi di risultati che preliminarmente cominciano a circolare tra addetti ai lavori
1/6 Dovrebbe essere chiaro che le agenzie di salute pubblica non lavorano guardando i grafici e le dichiarazioni su Twitter. Appena scattato l’allerta le agenzie hanno mobilitato centinaia di scienziati, work groups etc. che hanno cominciato a produrre analisi.
2/6

Special issue from Nature on computational social science.
Impressive list of contributions related to upcoming panels at the joint NetSci-Sunbelt conference “Networks 2021” on July 2, 2021
nature.com/collections/ca…
@Nature The combination of computational and social sciences requires the integration of explanatory and predictive approaches into ‘integrative modelling’.
nature.com/articles/s4158…

Molto sorpreso del dibattito Italiano riguardo la variante Delta. Non occuparsi di questa variante e' impossibile per via delle evidenze accumulate. Prendiamo come esempio questa analisi di Rt per ogni variante in 16 stati USA
1/5

https://twitter.com/trvrb/status/1407466076502302727

Consideriamo che negli USA la copertura a due dosi e' del 45% (anche se alcuni Stati sono ~33%) da confrontare con l'Italia che per le due dosi e' a ~27%. Sia negli US che in Europa gli scenari a partire da questi numeri indicano che bisogna "occuparsi" della Delta
2/5

Recentemente sono stato tirato dentro molti threads italiani sulle varianti. Provo allora a comunicare i miei due centesimi su come mai tutte le agenzie nazionali e internazionali e centinaia di scienziati si "occupano" (senza essere ottimisti o pessimisti) di varianti.
1/7 Il problema epidemiologico non si esaurisce con "il vaccino funziona si/no".
Purtroppo l'efficacia del vaccino verso le specifiche varianti puo' variare (anche rispetto a 1 o 2 dosi, vedere dati UK da confermare). Lo stesso vale per la possibilità di reinfezione.
2/7

First multi-model effort to project long-term trajectories of COVID-19 in real-time in the United States under different epidemiologic scenarios has been reported today in the @CDCMMWR
Large scale effort with a wonderful group of colleagues.
cdc.gov/mmwr/volumes/7… The work is ongoing since January and the paper reports the fourth round of projections with four scenarios with different vaccination coverage rates and effectiveness estimates and strength and implementation of nonpharmaceutical interventions (NPIs).

Thread del fine settimana per i data enthusiasts Italiani.
Durante i giorni scorsi, con la crescita dei casi in Italia, ho visto molte discussioni su tassi di mortalità, analisi longitudinali etc. Molti numeri OK ma anche conclusioni tipo "tortura i dati e loro confesseranno"1/9 Prima cosa bisogna sempre leggere le definizioni, altrimenti si calcolano numeri a caso. Quindi per il Case Fatality Ratio (CFR) e l'Infection Fatality Ratio (IFR) suggerisco di andare a leggere l'ottima discussione OMS
who.int/news-room/comm… 2/9

Piccolo thread con alcune semplici considerazioni sui dati europei di @Ruffino_Lorenzo (che sta facendo un eccellente lavoro). Analisi che si estendono da Marzo ad Agosto riportano dati non omogenei e quindi vanno interpretati con attenzione. 1/6

https://twitter.com/Ruffino_Lorenzo/status/1295992647585107969?s=20

I casi accertati a Marzo/Aprile nei vari paesi erano tra il 10% e il 20% dei casi reali. Da giugno in poi questo scarto e' diminuito enormemente (come in Italia). Quindi i numeri della parte sinistra del grafico non possono essere confrontati con quelli della parte destra. 2/6

Dopo due giorni di lettura di polemiche, una polarizzazione assurda di opinioni, e centinaia di tweet il mio unico modo di intervenire e' di cercare di fare un po' di chiarezza scientifica.
1/n Io non ho mai consigliato a nessuno tantomeno al governo di costruire 150K terapie intensive. A mia conoscenza non mi risulta che a nessuno è mai passata in testa una idea così balzana. Allora da dove arriva questo numero? Da uno scenario dell'Istituto Superiore di Sanità.
2/n

Non faccio mai thread lunghi ma ci vuole un chiarimento sulla presunta perdita di aggressività di COVID-19. Prima di tutto cosa vuol dire aggressività ?
1) la trasmissione del contagio
2) Severità della sintomatologia
3) Mutazioni genetiche
1/6 Per il punto 1)
La trasmissibilità e' scesa. Questi sono gli effetti di 8 settimane di lockdown. Nelle regioni del nord c'e' anche un 15% o piu' di immunità di massa. Le persone sono attente ad avere social distancing e igiene (-20%). Effetti che non sono dovuti al virus.
2/6