Many academics assume that people leave academia because of money.

I was a PI at @WhiteheadInst and @CUSEAS, then a CSO at @MyHeritage and now CEO/co-founder of @eleventx.

From this vantage point, I can tell you that they are wrong. Money is not the entire story.

Let's dig👇

https://twitter.com/dgmacarthur/status/1542649242069504000

1. Industry, especially early start-ups, give you freedom that you will never get in academia.

At academia, I was bound to university policies and at the hands of administrators of how to run my lab.

At @eleventx, I have a clear canvas to decide on policies, culture, HR, etc.

יש עוד צד שפשוט לא מדברים עליו בנוגע לפסיקה של בית המשפט האמריקאי.
שרשור מכיוון אחר.
🧵👇 טיי-זקס היא מחלה גנטית ששוברת את הלב. תינוקות שנולדים איתה נראים בריאים לחלוטין. ולפני גיל שנה הם מתחילים לאבד יכולות. פתאום כבר הם לא מחזיקים את הראש, כבר לא יושבים ללא תמיכה, מופיעים התקפים אפילפטים חזקים. הם צוללים לעיוורון, חירשות, ומוות בגיל 2-3.
nytimes.com/2011/10/16/opi…

If you think that we need to keep outsmart SARS-CoV-2, please read the following thread on our new @biorxivpreprint manuscript!

An international collaboration by:
@NIAIDNews🇺🇸
@CRUK_CI🇬🇧
@Cambridge_Uni🇬🇧
@eleventx 🇮🇱🇬🇧🇺🇸(us)

Let's start!
👇🥸🧵
bit.ly/covid19RNAi The vaccines have been an amazing triumph. No doubt! But there are caveats:
A. VE against infections quickly wanes even after 💉💉💉💉 shots (see below)
B. We put all the eggs in one basket - the spike protein.
C. Updates might be hard due to OAS

Our article at @eleventx in collaboration @TwistBioscience. Synthetic biology is so cool and mind blowing that I had to write a thread about it for non-biologists who are interested in to learn more about this area.
🤯🧵👇

https://twitter.com/eleventx/status/1490712871134806019

A new variant emerges and you want to test antiviral drugs against it. It turns out that getting a live virus is quite difficult (and rightly so). You need to:
1⃣Find a collaborator
2⃣Negotiate an MTA
3⃣Ship the live virus
4⃣Access to a BSL3 lab
And time is of the essence!

מאמר ראשון של החברה שלי @eleventx בשיתוף פעולה עם ענקית הדנ״א @TwistBioscienc. זה באמת קצת פסיכי אז אני חייב לשתף בשרשור מונגש שתבינו איפה אנחנו בביוטקס היום.
🤯🧵👇

https://twitter.com/eleventx/status/1490712871134806019

על וריאנטים שמעתם? בטח שמעתם. נניח שצץ וריאנט חדש ואתם רוצים לבדוק תרופות אנטי-ויראליות נגדו. מסתבר שלקבל וירוס חי זה מאד קשה (ובצדק):
- צריך למצוא חוקר שיש לו את הזן ורוצה לחלוק
- צריך חוזה העברה
- צריך לשלוח וירוסים חיים
- צריך מעבדה במיגון גבוה שקשה למצוא
ואין זמן!

קצת גרפים על קורונה בביוב ומה אפשר להוציא מזה.(@DrorMevorach - זה בשבילך).
״משחקים בקקה״
מתחילים...
👇🧵 קודם כל המון כבוד ל @_lewisy שהיה המנוע מאחורי הדיגומים בביוב. הרעיון הוא שמי שנדבק בקורונה מפריש את הוירוסים למערכת הביוב ולכן באמצעות PCR בתחנות ביוב שונות ניתן לעקוב אחר רמת הוירוס באוכלוסיה בלי בעיות של דיגומים.
הורדתי את כל נתוני מדידות מתחילת הפרויקט וככה זה נראה:

📢 המאמר לו חיכינו (ע״י הצוות המוכשר של פאוצ׳י ב @NIAIDNews).

האם כדאי לחכות לבוסטר מותאם אומיקרון?
בקצרה: לא! 🤯
בארוך: קבלו שרשור 🧵👇
biorxiv.org/content/10.110… הרבה אנשים מתלבטים אם לקחת את החיסון הרביעי או לחכות לבוסטר מותאם אומיקרון. המאמר הזה עשה את הדבר הבא:

שמונה 🐒 קיבלו 💉💉 של מודרנה עם החיסון הרגיל שלהם. תשעה חודשים לאחר מכן (41שבועות), הם חולקו לשתי קבוצות:
קבוצה1⃣:קיבלה 💉 בוסטר רגיל
קבוצה2⃣: קיבלה 💉בוסטר מותאם אומיקרון

📢 The study we all waited for by the brilliant team at the VRC/@NIAIDNews

Should we wait for an Omicron-specific booster?
Short answer: No 🤯

Long answer: A thread 🧵👇 The main question that many people contemplate is should I wait for an Omicron-specific booster or not?

Eight 🐒 received 💉💉 of the regular (WT) Moderna vaccine.
Then, 41-weeks later, they were split into 2 arms:
1⃣Got a regular (WT) 💉 booster
2⃣Got an Omicron 💉 booster

בניגוד לדעה הרווחת, תעשיית הפארמה שונאת את הפנדמיה.
שרשור על התייבשות ה pipeline עם מבט לטווח הבינוני ולניהול המגיפה.

גילוי נאות: הסטארט-אפ שלי מתעסק בתחום.
🧵 פיתוח תרופות הוא תהליך עתיר סיכון מבחינה אינרנטית. מולקולה שעובדת נהדר בתאים, עלולה לא לעבוד בעכבר. מולקולה שעובדת בעכבר, פתאום לא עובדת בקוף. מה שעבד בחיות כבר לא עובד בבני אדם, וכו׳. הביולוגיה היא אכזרית ולא נתונה לחיזוי מלא. אבל זה סיכון שחברות פארמה יודעות לקחת. מה הם שונאות?

What we can learn from 20 waves 🌊 of SARS-CoV-2?
A thread 🧵 1/11
👇👇👇 The figure 👆 shows the strongest wave (⬛️grey lines) in 20 countries around 🌍 with the largest testing per capita. The peak is centered to be at day 0 and the cases are normalized to its height. Black: the averaged wave 2/11

@sigallab did a fantastic job in framing the Abs response to Omicron. But his manuscript actually makes make me a bit concerned and I don't find the results encouraging. Let's dive in a short thread 🧵👇

https://twitter.com/erlichya/status/1475697014818099200

Just a reminder, the Omicron and the Delta are highly diverged from each other compared to the ancestral strain, which serves as the basis for the vaccine.

מאמר סופר מעניין על המכניזם של cell entry באומיקרון לעומת דלתא ו wuhan ולמה הוא אולי פחות וירולנטי. שרשור קצר שמסביר מה הולך כאן.

biorxiv.org/content/10.110… כולנו שמענו על Spike ועל כך שהוא נקשר ל ACE2 כדי להכנס לתוך התאים. אבל התהליך הזה הוא מאד לא פשוט. כמו שאתם מכניסים מפתח לתוך מנעול וצריכים קצת לנער את המפתח שיכנס בקלות, גם הספייק צריך קצת דרגות חופש כדי להיקשר טוב ל ACE2 ולבצע את הכניסה לתא.

Want to produce Paxlovid, Pfizer's new antiviral?

All you need to do is to follow the simple process in the short thread below. Step 1:

Most people don't appreciate that we are basically beyond GATTACA wild's dream of tracing people using DNA.

A short thread 1/5 🧵
👇

https://twitter.com/cdixon/status/1473373870635642880

If you recall, the police in GATTACA has access to Vincent's (the protagonist) eyelash. However, they can't identify him since he is not in any database.
2/5

Excellent analysis by @IdoIrani about the waning booster effect (for infection) stratified by age group in Israel.

The worrying part: the rate of decline is most age groups is similar to the 2nd jab. @IdoIrani This tweet is trending. So a few comments 1/2:
1 Data:
datadashboard.health.gov.il/COVID-19/gener…
2. This is a tweet not peer reviewed publication. It is a preliminary analysis with some caveats as described here.

https://twitter.com/erlichya/status/1467811422226849800

3. The y-axis should be crude VE
4. Some Idiots...

Due to popular demand, a thread for the general audience on Molnupiravir, Merck's new treatment for Covid19.

Let's start! The compound (left) looks like an RNA nucleotide called Cytidine (right) that is found in every cell in nature.

BTW: How do I know it is an RNA nucleotide? You see the two "legs" at the bottom with "OH OH"? If the right leg is OH it is RNA and if it's H, it is DNA. Easy.

שרשור על מה זה Molnupiravir, התרופה החדשה של Merck כנגד Covid19.
יאללה מתחילים. הדבר הראשון שרואים היא שהתרופה (משמאל) נראית כמו נוקלאוטיד RNA שנקרא Cytidine ומצוי בכל תא של אורגניזם בטבע (מימין).

אגב, איך אני יודע שזה נוקלאוטידים של RNA ולא DNA? רואים למטה כמו שני רגלים עם OH בכל צד? אז אם הרגל הימנית היא OH, זה RNA, ואם היא פשוט H, אז זה DNA. קל!

covid19 in 🇮🇱.

Due to ✡️ holiday season, it is hard to get a reliable estimator of R. Previously, I showed that the avg susceptiblity of ISR population (S) is nicely correlated with R. This estimator is not affected by # test but only by # vaxxed and VE.

https://twitter.com/erlichya/status/1438612458353070084?s=20

As a reminder, S(t), the susceptiblity of day t is 1 - Σf_i(t) •VE_i(t). Where f_i(t) is the % of the population that already took the i-th dose and VE is the efficacy of the dose in day t. Both parameters can be in calculated from MoH public dashboard on a daily basis.
So...

לפני כשבועיים הצגתי את מדד ה susceptibles.

המדד (קו שחור) משערך את % האנשים שחשופים להדבקה וצופה לא רע של R (קו אדום). אבל בניגוד ל R, הוא לא תלוי בכמות הבדיקות אלא רק ב% המחוסנים ויעילות כל מנה (מדד נמוך=טוב יותר).

אז המדד (קו שחור) היום באותה רמה של 3/21, כלומר צופה R<1😍 עוד פרטים: המדד אומר שאם לוקחים את אחוזי המתחסנים בכל מנה ואת היעילות של המנות בכמה ימים האחרונים, יש באוכלוסיה פחות מ 60% אחוז אנשים שחשופים להדבקה. במרץ, עם ההגבלות, זה הספיק. היום יש דלתא מצד אבל עוד 300 אלף מחלימים. בזהירות: נראה שאנו מעבר לשיא, כל זמן שיעילות החיסונים תמשיך.

Israel 🇮🇱, booster 💉💉💉, and herd immunity 🐑.
A thread based on the Ministry of Health data with many graphs.
Let's dive!
👇👇👇 Many of you heard about the decline of vaccine effectiveness in Israel in the past few months. The MoH publishes now on a daily basis the rate of infection in unvaxxed, vaxxed (2nd dose), and boosted individuals per 100K, which is a real treasure!
nature.com/articles/d4158…

שרשור על חסינות האוכלוסיה בישראל והתפשטות התחלואה. איפה היינו ולאן אנחנו הולכים.
יהיה גרפים 📊. ויהיה מעניין!
🧵👇🧐 עם הדאטה בדאשבורד אפשר עכשיו לחשב בכל יום החל מינואר את יעילות הגולמית של מנה 2 לעומת לא מחוסנים. מה אנחנו רואים כאן בעצם? זה פשוט יחס המאומתים בין מחוסנים 2 ללא מחוסנים בכל יום לאחר נירומול לגודל האוכלוסיה. זאת יעילות גולמית כי היא לא מתקוננת למגזר או גיל (אבל לאחר החלקה).