Kosova'dan getirildiği söylenenler arasındaki doktor Karakaya, hasta tutuklu Prof. Dr. Haberal’ın yattığı hastaneden alınıp hapishaneye götürülmesinde kilit rol oynayan iki rapora imza atmıştı. Ergenekon iftirasına dahil edilen Türkiye'nin en üretken bilim insanlarından Prof. Dr. Mehmet Haberal, tutuklandığı gece kalp krizi geçirip kaldırıldığı hastanede 23 ay geçirmiş, kendisini zindana atamamaları da leş kargalarına dert olmuştu.