Thread by @YoSoyCiencia

Ok, ¿están listos? Estoy por abrir otro hilo y este esta laaaaargo...
-@OlgaGZamudio

@OlgaGZamudio En el grupo del Dr. Jaime Ortega-Lopez donde hice mi doctorado, había varias líneas de investigación. Una de ellas era trabajar con chaperones moleculares para facilitar el plegamiento de proteínas recombinantes. Pero, vamos por partes. Chaperón molecular, ¿qué carambas es eso?

@OlgaGZamudio Los chaperones son proteínas que impiden que otras se plieguen incorrectamente. Imaginemos una proteína desdoblada, que tiene parches que la hacen pegajosa, sin chaperones, estas proteínas se unirían una a la otra formando un gran lío, un agregado, que no sirve para mucho.

@OlgaGZamudio Las chaperonas, como esas tías o hermanas mayores que salían con una parejita de novios, están ahí, para evitar interacciones no deseadas.

@OlgaGZamudio Otras chaperonas rearreglan enlaces moleculares y otras más, conocidas como chaperoninas, son maestras del origami molecular y ayudan a plegar proteínas de la manera adecuada.

@OlgaGZamudio En el grupo de trabajo estas chaperonas se usaban fusionadas a regiones de otras proteínas y se fijaban a un soporte. ¿La ventaja? Se podían utilizar para plegar proteínas #recombinantes una y otra vez

@OlgaGZamudio porque muchas veces el problema de una proteína recombinante, al ser expresada en un organismo que no es el original es que no se pliega correctamente.

@OlgaGZamudio Imaginen tratar de plegar una proteína de mamífero en una bacteria, ya la maquinaria es diferente, hay cambios en la secuencia, o el ambiente es muy ácido o básico, o necesita condiciones para oxidarse o reducirse, o la maquinaria del hospedero le agrega carbohidratos…

@OlgaGZamudio Lo que quiero decir es que no siempre es fácil y que para cualquier aplicación o estudio es crucial, no sólo tener la proteína pura sino correctamente plegada. Lo que me lleva a…

@OlgaGZamudio La otra línea de investigación tiene que ver con proteasas de enfermedades parasitarias. De dos parásitos en particular, Trichomonas vaginalis y Entamoeba histolytica.

@OlgaGZamudio Estos parásitos pueden utilizar un cóctel de proteasas para digerir el tejido del organismo hospedero, invadir, alimentarse y defenderse de la respuesta inmune.

@OlgaGZamudio Yo trabajé con proteasas de Entamoeba histolytica, esa que, si no tienes cuidado viene de invitada no deseada en los tacos callejeros y hace que padezcas amibiasis.

@OlgaGZamudio Expresaba la proteína recombinante en la bacteria Escherichia coli en buenas cantidades, pero la bacteria no podía plegarla correctamente.

@OlgaGZamudio Así que tocaba hacerlo por separado. Un problema adicional cuando se trabaja con proteasas es que si se pliega correctamente y las condiciones son adecuadas, se activa. Resultado: pedacitos de proteína por doquier. Eso implicaba que tampoco podía usar chaperonas moleculares.

@OlgaGZamudio Lo que sí usé fueron chaperones químicos, mi proteína en el parásito esta embebida en la membrana de la célula. Así que usé surfactantes, moléculas que tiene una parte amante del agua y otra amante de la grasa, a veces se usa el termino detergente.

@OlgaGZamudio Estos surfactantes forman micelas, y las micelas se parecen a la membrana de una célula. Mi hipótesis era que ese ambiente parecido a la membrana molecular podía facilitar el plegamiento de mi proteína.

@OlgaGZamudio ¡Y así fue! ¿Y cómo supe que mi proteína estaba bien plegada? Porque pude hacerla funcionar y digerir en condiciones controladas a su sustrato.

Bueno y también use técnicas espectroscopicas. Pero eso, me temo, se quedará para otra ocasión.
Basta decir que los fans de El Principio pueden divertirse imaginando toda suerte de animales con los espectros de fluorescencia: