1/ Un point sur l’indicateur sur "nombre de cas confirmés" et son lien avec les données SI-DEP.
(problème dans le thread, je recommence 🤨)
2/ Je rappelle que les données SI-DEP sont fournies par date de prélèvement avec un "embargo" de 3 jours. Donc au jour J (ex: 28/09) on a accès aux données à J-3 (ex : 25/09) ainsi que des mises à jour sur les jours précédents J-4, J-5, etc. (ex 24/09, 23/09, etc.)
3/ Alors à quoi correspond l'indicateur "nombre de cas confirmés" mis à jour tous les jours par SPF ? Il s'agit (en très grande majorité) des tests positifs SI-DEP arrivés le jour J, sans embargo donc sans distinction de date de prélèvement.
4/ Donc hier quand on nous dit 4070 nouveaux "cas confirmés" il s'agit de personnes dont le résultat est positif et qui ont potentiellement été prélevées à J, J-1, J-2, J-3, J-4, etc.
5/ J'ai essayé de faire un graphique pour expliquer ça (attention pas à l'échelle) :
6/ Si on compare l'évolution des deux indicateurs, on se rend compte par exemple qu'on a des mimima locaux de "cas confirmés" les lundis, ce qui est logique puisque le gros des cas confirmés sont des gens prélevés à J/J-1/J-2/J-3 qui inclus le weekend le lundi.
7/ Les plus grosses valeurs de "cas confirmés" sont plutôt en fin de semaine, comme les jours précédents contiennent des jours ouvrés
Petit retour d'expérience d'un échec personnel d'aide à l’installation de capteurs CO2 dans l'école maternelle de mon fils 1/N 🧵
Fin août 2021, voyant que rien ne bougeait j'ai proposé à la directrice de l'école de lui prêter un capteur ARANET4 personnel. Il fallait l'accord de la mairie 2/N
L'accord est arrivé la veille des vacances de la Toussaint (après 2 mois). Le capteur a été utilisé jusqu'à Noël avec beaucoup d'intérêt par l'équipe pédagogique 3/N
Santé Publique France publie ce soir un point épidémio. sur le COVID-19 chez les 0-17 ans.
Il contient notamment une information attendue depuis longtemps, les hospi. POUR cause de COVID ou AVEC le COVID (hospi. d'enfants COVID+ mais hospitalisés pour une autre raison)
Distribution hebdomadaire des cas pédiatriques nouvellement hospitalisés POUR COVID-19 en France du 01/01/2021 au 09/01/2022
Distribution hebdomadaire et par classe d’âge des cas pédiatriques nouvellement hospitalisés POUR COVID-19 en France du 01/01/2021 au 09/01/2022
À partir des taux d'incidence par niveau scolaire de la semaine 34 (semaine dernière) j'ai calculé l'estimation de la probabilité d'avoir au moins 1 cas positif dans un groupe de 30 élèves (de la même classe d'âges et du même département)
1/n
J'ai appliqué un facteur 3 sur les contaminations car les tests ne permettent pas d'identifier toutes les personnes positives (le choix de ce facteur peut être discuté).
2/n
J'avais déjà fait ce calcul en population générale il y a quelques mois
Les taux d’incidence, de positivité et de dépistage par niveau scolaire en France sont disponibles en open-data sur data.gouv.fr merci @SantePubliqueFr !
La transmission du SARS-CoV-2 entre groupes d'âge en France qui semblait être visible dans les cartes de chaleur (heatmap) en Août / Septembre a été étudié par @SCauchemez et al. @institutpasteur dans ce pre-print ⤵️
"Nous avons développé un modèle qui reconstruit la propagation du virus entre les groupes d’âge en nous appuyant sur les données des cas positifs et des hospitalisations stratifiées par âge dans les 13 régions métropolitaines, entre le 15 juin et le 28 septembre 2020."
"Dans toutes les régions, l’épidémie reprend chez les jeunes adultes et se propage dans les différents groupes d’âge pour atteindre les individus âgés de plus de 80 ans après 4 semaines en moyenne."