Thread by @2Ludwig2

#COVID19COLIMA
Actualización 20 a 31 diciembre 2020, del Estado de Colima, en base a, las bases de datos abiertos @SSalud_mx , @saludcolima , @gobiernocolima y @GobiernoMX ; así como las proyecciones de @cimatoficial y @Conacyt_MX

Fuentes de información:
•Uso de datos abiertos (Ley): datos.gob.mx/libreusomx
•Uso de datos abiertos (Resumen): creativecommons.org/licenses/by/4.…
•Datos Federales: datos.gob.mx/busca/dataset/…
•Datos Estatales: datos.gob.mx/busca/dataset/…

•Proyecciones: coronavirus.conacyt.mx
•Ocupación Hospitalaria: gits.igg.unam.mx/red-irag-dashb…
•Todo sobre el COVID-19: coronavirus.gob.mx
•Datos Georreferenciados: datos.covid-19.conacyt.mx

Noticias más relevantes:

•Nueva variante de coronavirus que parece ser más contagiosa, preocupa a los epidemiólogos (Si, esta es la Inglaterra): robotitus.com/nueva-cepa-que…

•Comienzan ensayos de una terapia con anticuerpos para evitar que las personas con coronavirus se enfermen: robotitus.com/comienzan-ensa…

Exceso de Mortalidad asociado a COVID-19 en países seleccionados.

Fuente: nytimes.com/interactive/20…

Mortalidad y Exceso en países seleccionados.

Fuente: ft.com/content/a2901c…

Curva Epidemia Estatal, por condición de los pacientes.

Desglose de la primera curva anterior.
•Activos Diarios.
•Recuperados Acumulados.
•Defunciones Acumuladas.

Y por porcentajes.
•Activos: 3.22%
•Defunciones: 86.25%
•Recuperados: 10.53%

Casos y Recuperados por Fecha de presentación.
Notas:
El 18 de julio 2020, tuvimos un recuperado menos.
El 20 de agosto 2020, se confirmaron 141 nuevos casos.

Defunciones por fecha de presentación.
Nota:
El 21 de septiembre, se confirmaron 15 defunciones.

Días con más casos confirmados:
1. 20 agosto: 141
2. 24 julio: 98
3. 2 octubre: 94
4. 10 agosto: 91
5. 22 julio: 90
6. 3 octubre: 86
7. 1 octubre: 84
8. 31 diciembre: 82
9. 14 octubre: 81
10. 15 agosto: 79

Diferencia entre los casos por fecha de presentación y los casos reales (por fecha de inicio de síntomas)

Diferencia entre los recuperados por fecha de presentación y los recuperados reales (por fecha del Alta Sanitaria)

Diferencia entre las defunciones por fecha de presentación y las defunciones reales (por fecha de la defunción)

Reporte Semanal de @SSalud_mx
•Por Clasificación Final.
•Por Resultado.

Pruebas Diarias que se han realizado en la Entidad al Corte a las 16:00 horas 30 de diciembre del 2020, según la SSA Estatal.

Pruebas por Semana Epidémica
•Por Positividad.
•Por Resultado.
•Reporte diario de @saludcolima aplicable.
Nota:
La positividad de la última semana no cuenta, debido al alto número de sospechosos.

Aclaraciones:
•En realidad, hay 7,716 positivos y 7,246 negativos.
¿Por qué hay 7,716 positivos y 7,246 negativos, si registrados para ese día había: 7,504 positivos y 7,102 negativos?

Esto se debe a que @saludcolima en sus reportes diarios solo registra los casos ocurridos en pacientes, los cuales su residencia es el Estado de Colima.
Los 212 positivos y los 144 negativos "faltantes" son de:

Hay 76, pacientes residentes del Estado de Colima, que fueron atendidos en otros Estados (todos positivos).
Anexo los Estados en donde se les atendió y los municipios de donde son residentes:

Métricas por mes, según SSA Federal.
En total:
Personas Estudiadas: 17,289
Positivos: 7,927
Hospitalizados: 3,071
Defunciones: 1,093

Desglose de las personas estudiadas por mes.
En total:
Estudiados con muestra: 15,262
Estudiados sin muestra: 2,027

Métricas por semana epidemiológica:

Desglose de la métrica anterior.

Métricas de personas estudiadas por tipo de estudio y semana epidemiológica.

Por Jurisdicción las pruebas se realizan en:
Jurisdicción 1:
•Miguel Trejo Ochoa (ISSSTE)
•Hospital General de Zona 1 (IMSS)
•Usmer Colima (SSA Estatal)
•Usmer Zona Oriente (SSA Estatal)

Jurisdicción 2:
•Centro de Salud (Tecomán)
•Hospital General de Tecomán
Jurisdicción 3:
•Hospital General de Manzanillo
•Caps Manzanillo (SSA Estatal)

La Metodología de las pruebas en el Estado es:
•100% de pruebas a hospitalizados.
•100% de pruebas a defunciones.
•70% de pruebas a ambulatorios.

Casos Estimados:
Se uso el total de casos positivos por municipio y su relación para el calculo.
En total, existen 7,504 casos confirmados, 188,784 casos invisibles y 196,288 casos totales estimados.

De los cuales 58,886 casos fueron sintomáticos y 137,402 asintomáticos.

Explicación de lo anterior:
•De cada 100 personas con el virus SarsCov2 se han registrado al 3.82%.
•De cada 100 personas con síntomas asociados al virus, se han registrado al 12.74%

Lo que nos lleva a concluir:
•Los casos sintomáticos tendrían que multiplicarse por 7.85 y el total de casos por 26.16 veces, para conocer el total.
Como recordaran en su momento (marzo), la SSA Federal calculo estos mismos valores, solo que hizo hincapié en el primero.

Casos por Fecha de Registro.
Identifica la fecha de ingreso del paciente a la unidad médica de atención.

En estas semanas 52 y parte de la 53, se agregaron 317 casos positivos, 15 defunciones y 443 casos negativos.
Nuestro pico de casos confirmados es, 20 y 25 de agosto con 83 casos confirmados.

Diferencia.
•Son 317 positivos: 317 de diciembre.
•Son 443 negativos: 1 de noviembre y 442 de diciembre.
•Son 15 defunciones: 15 de diciembre.

Fecha de Inicio de Síntomas.
Identifica la fecha en que inició la sintomatología del paciente.

Mismos casos confirmados y defunciones, pero re-acomodados a fecha de inicio de síntomas.
•Nuestro pico real es, el 10 agosto con 97 casos.
•Nuestros picos de letalidad son, el 11 de julio, el 9 agosto y 1 septiembre con 11 defunciones.

Mismos casos confirmados positivos, pero re-acomodados por Jurisdicción.
Jurisdicción 1:
•Comala
•Colima
•Coquimatlán
•Cuauhtémoc
•Villa de Álvarez
Jurisdicción 2:
•Armería
•Ixtlahuacán
•Tecomán
Jurisdicción 3:
•Minatitlán
•Manzanillo

"Lo que se confirma a diario, no es, lo que ocurre a diario"
¿Cómo se distribuyen a lo largo del tiempo, estos 317 nuevos confirmados y estas 15 defunciones confirmadas?

Acumulados:

Acumulado de casos.
•Mil en 119 días.
•Dos Mil en 19 días.
•Tres Mil en 18 días.
•Cuatro Mil en 17 días.
•Cinco Mil en 24 días.
•Seis Mil en 20 días.
•Siete Mil en 31 días.

Acumulado de defunciones.
•Cien en 90 días.
•Doscientas en 19 días.
•Trescientas en 15 días.
•Cuatrocientas en 16 días.
•Quinientas en 20 días.
•Seiscientas en 22 días.
•Setecientas en 23 días.

Número de días por casos activos y número de días por defunciones.

De estos 317 nuevos casos positivos, 45 corresponden a hospitalizados (total 1,860) y 272 de ambulatorios (total 6,067)

Los 317 casos positivos, se distribuyen:
•Armería, total 131 (+2)
•Colima, total 2,133 (+101)
•Comala, total 85 (+1)
•Coquimatlán, total 144 (+1)
•Cuauhtémoc, total 202 (+15)

•Ixtlahuacán, total 108 (+0)
•Manzanillo, total 2,150 (+81)
•Minatitlán, total 46 (+2)
•Tecomán, total 1,181 (+39)
•Villa de Álvarez, total 1,746 (+75)

Mismos casos positivos, pero acomodados por municipio y su porcentaje.

De las 15 defunciones nuevas, 15 corresponden a personas hospitalizadas (total 752) y 0 corresponden a ambulatorias (total 47)

Las 15 defunciones nuevas, se distribuyen:
•Armería, total 23 (+0)
•Colima, total 188 (+7)
•Comala, total 15 (+0)
•Coquimatlán, total 17 (+0)
•Cuauhtémoc, total 26 (+0)

•Ixtlahuacán, total 13 (+0)
•Manzanillo, total 266 (+4)
•Minatitlán, total 6 (+0)
•Tecomán, total 122 (+3)
•Villa de Álvarez, total 122 (+1)

Mismas defunciones positivas, pero acomodadas por municipio y su porcentaje.

Tasa de ataque total y positividad actual por municipio.
A nivel Estatal:
•La positividad, total se sitúa en: 51.01%
•La tasa de ataque total, se sitúa en: 1.009%

Tasa de Letalidad por Municipio.
A nivel Estatal, la letalidad total se sitúa en: 10.07%

Nota: Desconozco el porque salieron mal los colores, sin embargo tanto los nombres como el orden de los municipios, están bien.

Evolución de los pacientes críticos positivos por porcentaje, desde el 1 septiembre a la actualidad.

Este es el estado, particular de los Pacientes Críticos Positivos al Corte a las 16:00 horas 30 de diciembre del 2020

Comorbilidades de los pacientes positivos y su tipo de manejo al Corte a las 16:00 horas 30 de diciembre del 2020

•Diabetes
•Enfermedad Pulmonar Obstructiva Crónica (EPOC)

•Asma
•Inmunosupreción

•Hipertensión
•VIH / SIDA

•Cardiovascular
•Obesidad

•Insuficiencia Renal Crónica
•Tabaquismo

•Otra Condición
•Embarazada (Corte del 31/12/2020)

Estado de los pacientes sin comorbilidades.

Estado de los pacientes con una sola comorbilidad.

Estado de los pacientes con doble comorbilidad.

Dobles Comorbilidades en pacientes positivos.

Estado de los pacientes con Múltiples comorbilidades.

Letalidad por Comorbilidad.

Porcentajes de los Casos de acuerdo a su comorbilidad.

Porcentajes de las Defunciones de acuerdo a su comorbilidad.

Diferencia de Porcentajes entre Casos y Defunciones en pacientes positivos.

Distribuciones de grupos de edades de los pacientes positivos.
•Positivos y Defunciones.
•Casos Ambulatorios y Hospitalizados.
•Defunciones Ambulatorios y Hospitalizadas.

Síntomas atribuibles a pacientes positivos.
•Por Casos Ambulatorios
•Por Casos Hospitalizados
•Por Defunciones Ambulatorias
•Por Defunciones Hospitalizadas

Casos Asintomáticos Positivos.

De los 443 negativos nuevos, 44 corresponden a personas hospitalizadas (total 1,126) y 399 corresponden a ambulatorios (total 6,197)

Los 443 negativos, se distribuyen:
•Armería, total 164 (+8)
•Colima, total 2,138 (+113)
•Comala, total 113 (+6)
•Coquimatlán, total 128 (+5)
•Cuauhtémoc, total 201 (+10)

•Ixtlahuacán, total 65 (+0)
•Manzanillo, total 1,635 (+130)
•Minatitlán, total 33 (+4)
•Tecomán, total 1,057 (+61)
•Villa de Álvarez, total 1,798 (+106)

Mismos casos negativos, pero acomodados por municipio y su porcentaje.

Se han registrado 14 nuevas defunciones en pacientes negativos, 14 de Hospitalizados (total 272) y 0 de Ambulatorios (total 6)

Las 14 defunciones negativas, se distribuyen:
•Armería, total 8 (+1)
•Colima, total 79 (+4)
•Cómala, total 8 (+1)
•Coquimatlán, total 2 (+1)
•Cuauhtémoc, total 10 (+0)

•Ixtlahuacán, total 3 (+0)
•Manzanillo, total 57 (+4)
•Minatitlán, total 4 (+0)
•Tecomán, total 38 (+1)
•Villa de Álvarez, total 69 (+2)

Mismos defunciones negativas, pero acomodadas por municipio y su porcentaje.

Evolución de los pacientes críticos negativos por porcentaje, desde el 1 septiembre a la actualidad.

Este es el estado, particular de los Pacientes Críticos Negativos al Corte a las 16:00 horas 30 de diciembre del 2020

Embarazadas negativas (Corte del 31/12/2020)

Dobles Comorbilidades en pacientes negativos.

Porcentajes de casos de acuerdo a su comorbilidad.

Porcentajes de las Defunciones de acuerdo a su comorbilidad.

Distribuciones de grupos de edades de los pacientes negativos:
•Negativos y Defunciones.
•Casos Ambulatorios y Hospitalizados.
•Defunciones Ambulatorios y Hospitalizadas.

Síntomas atribuibles a los pacientes negativos:
•Por Casos Ambulatorios
•Por Casos Hospitalizados
•Por Defunciones Ambulatorias
•Por Defunciones Hospitalizadas

Casos Asintomáticos Negativos.

Diferencia de Porcentajes entre pacientes Positivos y Negativos, con Comorbilidades.
Tanto de casos como de defunciones.

"Hoy" se termina la semana epidemia 52, y empieza la 53 y a su vez, la 1 del 2021.
A nivel Estatal, las semanas epidémicas, se quedan:
•Casos confirmados: +20.77%
•Defunciones: -11.11%

Curva epidémica del Estado.
•Curva de casos confirmados.
•Curva de defunciones confirmadas.

Tasa de Mortalidad.
•A nivel estatal la Mortalidad es: 0.1390%
•Con 1,091 defunciones.
•La Mortalidad asociada a COVID-19 es: 0.1016%
•Con 798 defunciones.

Aclaraciones:
•En realidad hay 1,093 defunciones totales y 799 defunciones por COVID-19.
•Hay 1 defunciones sospechosas y, 1 defunción sin municipio causada por el COVID-19.

Casos positivos y negativos por profesión.

Positivos y Negativos del personal médico.
•El personal positivo representa el: 17.29% del total.
•El personal negativo representa el: 20.25% del total.

Detalle del personal positivo.

Detalle del personal negativo.

Para el Corte a las 16:00 horas 30 de diciembre del 2020
Habían estudiados 2,829 personas del personal médico, de los cuales:
•Positivos: 1,334
•Negativos: 1,467
•Sospechosos: 28
Aquí están, divididos por el mes en el cual, empezaron su sintomatología.

Han habido 220 profesionales de la Salud contagiados por el COVID-19 en Hospitales.
Aclarar que son mutuamente incluyentes.
Nota: Se desconoce los datos de contagios en Hospitales de noviembre y diciembre 2020.

Censo del personal de la Salud 2019.
(A la espera del censo, del 2020)

Tasa de ataque por COVID-19 en el personal de la Salud, por municipio.

Personal Médico Estudiado por Municipio y su Resultado al Corte a las 16:00 horas 30 de diciembre del 2020, (aclarar que se uso el Censo del 2019, para el calculó).

Sospechosos y positividad del personal médico estudiado por municipio.

Unidades Médicas Covid en el Estado.
Colores:
•Colima - Rojo
•Manzanillo - Azul oscuro
•Tecomán - Blanco
•Villa de Álvarez - Amarillo
•Armería - Morado
•Cuauhtémoc - Azul claro
•Minatitlán - Oro
•Ixtlahuacán - Verde claro

Ocupación Hospitalaria Histórica por porcentaje, desde 01 de abril 2020

Ocupación Hospitalaria de las ultimas 2 semanas por porcentaje.

Curvas estimadas de Hospitalizados Totales.

Evolución del total de los pacientes críticos por porcentaje, desde el 1 septiembre a la actualidad.

Hay 31 menos pacientes sin prueba, ni diagnostico, 32 de Ambulatorios (Total 1,788) y -1 de Hospitalizados (Total 70)

Los 31 pacientes mas sin prueba, ni diagnostico, se distribuyen:
•Armería, total 28 (+1)
•Colima, total 627 (+9)
•Cómala, total 37 (+0)
•Coquimatlán, total 31 (+2)
•Cuauhtémoc, total 52 (+1)

•Ixtlahuacán, total 4 (+0)
•Manzanillo, total 319 (+3)
•Minatitlán, total 10 (+0)
•Tecomán, total 213 (+11)
•Villa de Álvarez, total 537 (+4)

Sin cambios en las defunciones, sin prueba, ni diagnostico.
Ambulatorios, Total 7 y Hospitalizados, Total 8

Las defunciones se distribuyen:
•Armería, total 0
•Colima, total 5
•Cómala, total 6
•Coquimatlán, total 0
•Cuauhtémoc, total 1

•Ixtlahuacán, total 0
•Manzanillo, total 6
•Minatitlán, total 0
•Tecomán, total 3
•Villa de Álvarez, total 0

Total de sospechosos, agrupados por semana epidémica.
Total de casos (por fecha de inicio de síntomas): 2,039
Sin Muestra: 1,716
Sin Resultado: 142
Con Posibilidad: 181

Total de defunciones sospechosas, agrupadas por semana epidémica.
Total de defunciones (por fecha de ocurrencia): 17
Sin Muestra: 12
Sin Resultado: 2
Con Posibilidad: 3

Histórico de Sospechosos Locales, con posibilidad de resultado, de acuerdo a los informes diarios de @saludcolima

Semáforo Epidémico Federal.
¿Cómo funciona?

Evolución de la ponderación del semáforo, desde los 10 indicadores.

Estatal.

Jurisdicciones.

Semáforo Epidémico Actual.
Colima se sitúa en, semáforo naranja.

Semáforos Federales.

Reporte del @Conacyt_MX y @cimatoficial aplicable al Estado de Colima de la Semana 53 (28/12/2020).
Casos Activos Estimados: 184 (+28)
Defunciones estimadas a 14 días: 11 (-2)
Positividad: 33.01% (+9.08)
Tendencia Hospitalaria: Ascendente Moderada

Zona Metropolitana Capital.
Casos Activos Estimados: 124 (+27)
Defunciones estimadas a 14 días: 9 (+0)
Positividad: 34.98% (+5.83)
Tendencia Hospitalaria: Ascendente Moderada

Zona Metropolitana Tecomán.
Casos Activos Estimados: 20 (+1)
Defunciones estimadas a 14 días: 0 (+0)
Positividad: 31.67% (+7.67)
Tendencia Hospitalaria: Estable

Y por último y como soy un #CerdoCapitalista , si quieren donarme algo, les dejo mi PayPal:
Solo si quieren y pueden.
paypal.com/paypalme/Ludwi…

@threadreaderapp unroll