Versuch einer Daten-basierten Übersicht zur aktuellen Verbreitung der Virusvarianten in Österreich (1.2.2021)

Anhand von Mutations-spezifischen PCR und Sequenzier-Daten von @CeMM_News @IMBA_Vienna @IMPvienna @imed_tweets @MedUni_Wien et al. erhärten sich folgende Punkte: 1/7
1) Es gibt ein Ost-West Gefälle von B.1.1.7.
2) Die neuen Virusvarianten verteilen sich regional sehr unterschiedlich.
3) B.1.1.7 ("UK Variante) ist insgesamt auf dem Vormarsch
4) B.1.351 ("SA Variante") findet sich vorwiegend in Tirol. 2/7
Burgenland: KW1->4: 1.7 auf 37% B.1.1.7 (von n=765)

Wien KW2: 15% B.1.1.7 (von n=256), zuletzt 30% B.1.1.7; Einzelfälle von B.1351; 17% B.1.17 im Abwasser

NÖ: 15% B.1.1.7 (n=560); KW2: 71% B.1.1.7 in Abwasser Bad Vöslau

Stm: 3.5% B.1.1.7 (Mitte Jän; n=777) auf 26% (n=50) 3/7
Salzburg: Kläranlage Salzach-Pongau 0% (18.12.), 5% (23.12.), 16% (27.12.) auf 54% B.1.1.7 (3.1.).

Tirol: 0.8% B.1.1.7 und 3.3 % B.1351 (Mitte Jän, n=565); zuletzt 5% B.1.1.7 und 15% B.1351 (n=495).

Vorarlberg: <1% B.1.1.7 (n=423), 0% im Abwasser von Bregenz 0% (10.1.) 4/7
Trotz Limitationen der jeweiligen Datensätze ergibt sich insgesamt das Bild eines kontinuierlichen Anstiegs & heterogene Verteilung der neuen Varianten (v.a. B.1.1.7). Ähnlich wie in CH, NL und anderen Ländern. Die B.1.351 Resultate aus Tirol bedürfen weiterer Aufmerksamkeit. 5/7
Die absoluten Zahlen steigen bisher nicht in Österreich. Jedoch verdrängen die Varianten kontinuierlich die herkömmlichen Viren. Das läßt vermuten, daß der bisherige Lockdown zwar funktioniert, aber nicht effektiv genug für Varianten mit erhöhter Infektiösität ist. 6/7
Dieser Thread versucht die Datenlage mit Stand heute aus wissenschaftlicher Sicht und daraus resultierende Erkenntnisse darzulegen, wie sie heute der Regierung präsentiert wurden. Klar ist, daß Infektionszahlen zu hoch sind. Auf Empfehlungen wird hier bewußt verzichtet. 7/7
PS: Die Prozentsätze beziehen sich jeweils auf die gezogenen Stichproben.
PPS: Ging im ersten Tweet verloren, Daten stammen auch von @agesnews .

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4 Jan
@CeMM_News @oeaw @agesnews Team hat SARS-CoV-2 UK Variante VO-202012/01 (alias B.1.1.7 bzw. 501Y.V1) und Südafrika Variante 501Y.V2 (alias B.1.351) in Österreich detektiert. Projektwebsite: sarscov2-austria.org 1/n
Virussequenzierungen über die Feiertage haben die UK Variante bei 4 Personen und die Südafrika Variante bei 1 Person identifiziert. 4 der Personen wurden am Flughafen Wien positiv getestet und 3 Personen hatten Reisehintergrund zu UK bzw. SA. 2/n
Was bedeutet das? Erstmal ist das nicht unbedingt überraschend, da die UK Variante schon in 33 Ländern und die SA Variante in zumindest 7 Ländern gefunden wurde. Gleichzeitig gibt es damit nun den konkreten Beweis, daß diese Virusvarianten in Ö angekommen sind. 3/n
Read 10 tweets
20 Dec 20
Neue Virusvarianten – was tun?

SARS-CoV-2 sammelt ca. 2 Mutationen jedes Monat in seinem 30.000 Buchstaben langen Genom an. Doch was braucht es, um diese Mutationen zu verstehen und gegebenfalls darauf zu reagieren? Ein paar allgemeine Überlegungen mit Fokus auf Österreich: 1/n
Wie identifiziert man in der Bevölkerung zirkulierende Mutationen?
Jedes Land folgt einer anderen Strategie. UK hat 20M für Virussequenzierungen bereit gestellt. In Ö stammen >98% der Virusgenome von unserer Kollaborationsplattform (@CeMM_News @oeaw @MedUni_Wien @agesnews ). 2/n
Wie viele Viren werden in jedem Land sequenziert?

Anzahl an Virussequenzen (aus Datenbank @GISAID), dividiert durch Anzahl bisher bestätigter SARS-CoV-2 Fälle (@JohnsHopkins):
DK0,12%
UK0.062%
CH0.0088%
NL0.0049%
AT0.0027%
IL0.0012%
FR0.0011%
IT0.00049%
HU0.00090%
3/n
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