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Pablo Fuente 🎙️

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11 Mar, 36 tweets, 20 min read

#COVID19 ¿De qué hablamos cuando hablamos de variantes? Un hilo largo de lo que he ido aprendiendo. 👇

#COVID19 A lo largo del curso de la pandemia se han descrito numerosas variantes del SARS-CoV-2 que muestran diferencias genéticas con la secuencia original del virus. En Diciembre comenzaron a surgir variantes con doce mutaciones a la vez.

#COVID19 Se plantea la hipótesis de que, además de los factores habituales (paso del tiempo, propagación incontrolada del virus), ciertos individuos aceleran mucho la tasa de mutación. Algunas personas no pueden eliminar el virus durante mucho tiempo, sesenta días, cien días.

#COVID19 Estas personas tienen suficiente respuesta inmune para no morir, pero no lo suficiente como para deshacerse del virus. Eso crea una presión selectiva. Hay un experimento evolutivo dentro de estas personas.

#COVID19 El virus surge con una serie de cambios, algunos de los cuales mejoran su aptitud. Estos individuos no se convierten en superpropagadores, sino en supermutadores.

#COVID19 Muchos científicos ahora sospechan que la variante B.1.1.7, que surgió con casi dos docenas de mutaciones concurrentes en el Reino Unido, surgió de pacientes inmunosuprimidos que fueron tratados con terapias que ejercieron una mayor presión selectiva sobre el virus.

#COVID19 La variante sudafricana, por el contrario, parece haber evolucionado más gradualmente, lo que sugiere que la expansión de la población era su fuerza mutacional dominante.

#COVID19 El hecho de que diferentes variantes hayan afectado de forma independiente a las mismas mutaciones sugiere que ya estamos viendo los límites de adónde puede llegar el virus, tiene un número finito de opciones.

#COVID19 Con el tiempo, es probable que Sars-CoV-2 se vuelva menos letal, no más. Cuando las personas estamos expuestas a un virus, a menudo desarrollamos inmunidad de “reacción cruzada” que nos protege contra futuras infecciones, no solo por ese virus, sino también por variantes

#COVID19 con el tiempo, el virus también agota las posibilidades mutacionales que podrían permitirle infectar células mientras elude la memoria del sistema inmunológico. Eso podría tardar en ocurrir años o incluso décadas.

#COVID19 Cada semana aparecen noticias sobre nuevas variantes: Californiana (“el diablo”), Manhattan, Oregón…es necesario diferenciarlas mediante una clasificación para distinguir aquellas que son realmente peligrosas de otras sobre las que no se sabe nada...

#COVID19 y de otras que no son en absoluto peligrosas. •No todos los cambios genéticos son peligrosos, la mayoría de hecho no lo son.

#COVID19 Las vacunas parecen funcionar para prevenir las consecuencias más preocupantes de la infección: enfermedad grave, hospitalización y muerte. El riesgo está en la alta circulación de muchas de estas variantes con tanta gente aún por vacunar.

#COVID19 A medida que se vaya vacunando a la población iremos volviendo a la normalidad, pero siempre teniendo en cuenta que seguramente necesitaremos vacunas de refuerzo como pasa con la gripe.

#COVID19 Se ha hecho un esfuerzo enorme en secuenciar y eso puede ayudar a identificar mutaciones que podrían ser problemáticas, pero no pueden decirnos si esas mutaciones hacen que esa versión del virus se comporte de manera diferente a otras.

#COVID19 Para eso, debe realizar estudios con anticuerpos, células humanas vivas y modelos animales…y eso lleva tiempo.

#COVID19 Hay muchos científicos que encuentran algo (que a ellos les parece) interesante y luego se dirigen directamente a los medios de comunicación, con datos limitados, sin estudios disponibles y sin coordinación con los departamentos de salud locales.

#COVID19 Esto tiene explicación, quizás los científicos quieran alertar a las farmacéuticas (es posible que tengan que modificar sus productos), las autoridades de salud pública también pueden monitorizar más de cerca las variantes...

#COVID19...e incluso sirve para que los ciudadanos tengan más precauciones.

#COVID19 No se trata solo de encontrar nuevas variantes, se trata de caracterizar su comportamiento biológico: ¿qué significa que alguien se infecte con una variante frente a otra? Obtener secuencias es solo el comienzo de la historia.

#COVID19 Se necesita mucha más ciencia para saber si una mutación es significativa. Y en este momento, muchos laboratorios que están publicando sobre esto solo hablan de una parte de la historia (es lo rápido que se puede hacer)..pero lo que es rápido también puede ser engañoso.

#COVID19 El clickbait hace el resto, se visualizan muchas noticias con este tema. La “scariants” venden. (junta las palabras “scare” -miedo- y “variants” -variantes).

#COVID19 Por ello se propone la siguiente diferenciación (y va por orden como veremos luego):
oVariantes
oVariantes de Interés (VOI)
oVariantes bajo estudio (VUI)
oVariantes Preocupantes (VOC)

#COVID19 ¿Qué es lo importante e inusual? pues aquellas a las que se le pueden atribuir un mayor impacto potencial en la salud pública a través de varios aspectos...

#COVID19
oaumento en la transmisibilidad,
oaumento en la gravedad
oescape a la respuesta inmune adquirida tras infección natural o generada por algunas vacunas.
oevadir medidas de salud pública, incluidos los diagnósticos y los tratamientos.

#COVID19 Por el momento solo hay 3 en la categoría de Variantes Preocupantes (VOC). La B.1.351 (sudafricana), la B.1.1.7 (británica) y la P.1 (brasileña)

#COVID19 La cepa británica, que según el Ministerio de Sanidad y varios estudios es más contagiosa y virulenta que el resto, arrecia en España y ya es predominante en los análisis realizados en siete comunidades autónomas.

#COVID19 En territorios como Cantabria o Cataluña, más de 7 de cada 10 nuevos contagios están vinculados con esta variante. En Andalucía, Asturias, Baleares, Cantabria, Cataluña, Galicia y Navarra, el porcentaje de positivos de la variante de Reino Unido es ya superior al 50 %.

#COVID19 Variantes de Interés (VOI) hay muchas, incluidas las de California (B.1.429/427) y Nueva York (B.1.526). Pueden llegar a ser importantes, y debemos monitorizarlas, pero hay que poner más énfasis en la supervisión de las que ya sabemos son importantes (VOCs).

#COVID19 Para pasar de VOI a VOC se requieren evidencias científicas. La que mejor lo hace es Reino Unido por su poder de secuenciación y estudio.

#COVID19 Eso si, una vez que se tienen evidencias, hay que moverse muy rápido.

#COVID19 ¿Qué debería alertarnos de una VOI?
oVariante con muchas mutaciones (por ejemplo, ORF1b P314L)
oCon mutaciones que ya sabemos que son importantes
oAumento rápido de la frecuencia
oEvolución convergente
oPropagación en zonas con altos niveles de inmunidad

#COVID19 Ayer dije en #Horizonte que me hay que mirar bien la variante de Manhattan. ¿Por qué?
- Dos sublinajes - uno con la mutación E484K y otro con la S477N (conocidas por su importancia)
- Rápido aumento de la frecuencia de ambos
- Altos niveles de inmunidad en Nueva York

#COVID19 Debería ser una VUI (variante bajo estudio) que posiblemente pronto pasará a VOC (variante que preocupa).

#COVID19 Mientras tanto, dejemos a la ciencia trabajar, no entremos en pánico cada vez que leamos sobre una nueva variante...y sobre todo, sigamos protegiéndonos y teniendo cuidado. FIN.