Thread by @mellziland

Um preprint apontou para uma nova linhagem do SARS-CoV-2, que circulou na Am. do Norte e Central, gerada por eventos de recombinação. Entender esses eventos é relevante para entender os caminhos evolutivos que o vírus pode trilhar.

Vamos entender 👇🧶

https://twitter.com/otavio_ranzani/status/1462702767592587265?t=NC6gWRIjLHD4X9lI1GbCZg&s=08

Vamos por partes então! O que são eventos de recombinação, afinal? De uma forma simples e geral, a recombinação é a troca de material genético entre genomas (por exemplo, entre vírus). O GIF abaixo mostra quando a porção vermelha é trocada pela verde, por exemplo👇

É diferente do que falamos na maior parte do tempo, quando o vírus adquiria mutações pontuais ("trocas de letrinhas", deleção de uma partezinha de seu material genético). Na figura abaixo, traduzida por mim*, fica mais claro os eventos

*Original: the-scientist.com/news-opinion/p…

Esses eventos de recombinação são propiciados especialmente durante uma co-infecção, ou seja, quando por exemplo um organismo se infecta com duas versões do SARS-CoV-2 diferentes.

A enzima que copia o material genético do vírus para o processo de formar mais vírus pode acabar combinando os materiais genéticos ali presentes (das duas versões desse mesmo vírus). Além disso, no caso de um vírus de RNA, esse processo pode ajudar a corrigir mutações deletérias

A recombinação ocorre em muitos vírus, incluindo influenza, HIV e outros coronavírus, e é uma forma sofisticada de evolução, em que o vírus pode passar a ser mais virulento ou infectar mais organismos, ou até mesmo novas espécies, dependendo.

Um estudo da @ScienceAdvances mostra que uma região da Spike foi introduzida pela recombinação com coronavírus de pangolins e isso possivelmente foi uma etapa crítica na evolução da capacidade do SARS-CoV-2 de infectar humanos science.org/doi/10.1126/sc…

Na MERS (Síndrome Respiratória do Oriente Médio), temos evidências sugerindo que recombinações a partir de co-infecção frequentes com linhagens distintas de MERS-CoV ocorrem provavelmente em camelos, trazendo uma fonte de possíveis infecções em humanos

academic.oup.com/ve/article/2/1…

Um trabalho publicado na @CellCellPress trouxe dados apontando para eventos de recombinação entre final de 2020 - início de 2021, em amostras do Reino Unido 🇬🇧. Esse vírus carregam alterações características da variante B.1.1.7 (#Alfa), mas tem um porém interessante 😶👇

Existem partes do genoma que não carregam o conjunto de alterações que são definidores da linhagem #Alfa. Porém, carregam alterações presentes em vírus não-B.1.1.7 que circulam na mesma área geográfica ao mesmo tempo que os recombinantes 🤯

Ainda nesse trabalho, em quatro casos, houve evidência de transmissão progressiva de um vírus de origem recombinante, incluindo um grupo de transmissão de 45 casos sequenciados ao longo de 2 meses sciencedirect.com/science/articl…!

A partir do trabalho desses cientistas, bem como de outros grupos, temos um conjunto de evidências apontando que a recombinação desempenhou um papel no surgimento e na evolução contínua do SARS-CoV-2. E agora, temos esse novo dado, que falarei a seguir 👇

Num preprint recente, analisando 4 linhagens do SARS-CoV-2 que circularam na Am.Norte/Central (.1.627, B.1.628, B.1.631 e B.1.634), viu-se que B.1.628 se originou de um evento de recombinação entre um vírus principal B.1.631 e um vírus de linhagem B.1.634

medrxiv.org/content/10.110…

Ainda, temos dados demonstrando a distribuição espacial e temporal das três linhagens, que co-circularam nos EUA🇺🇸 e no México🇲🇽 durante 2021, sugerindo que foi nesta região que ocorreu o evento de recombinação

O @oatila fez um fio muito esclarecedor sobre esse evento em específico e porque é importante acompanhá-lo. Não temos indicativo de que resultou em uma variante mais transmissível que a Delta, ou que haja um escape vacinal importante.

https://twitter.com/oatila/status/1462828646067023877

Porém, o alerta que ele citou ali é relevante. A transmissão sustentadamente alta é o nosso maior desafio. Podemos ter um risco de ver esses eventos de recombinação, entre outras modificações no vírus, acontecendo.

https://twitter.com/oatila/status/1462832730320875522

Mas é importante destacar que, como mencionei ali no início do fio, a recombinação no SARS-CoV-2 não é algo inesperado. Nessa matéria do @vocativo o prof. Eduardo Flores explica:

vocativo.com/covid-19/o-sar…

Ainda, na mesma matéria, o prof. Flores traz o mesmo alerta quanto a transmisão, riscos de eventos de recombinação e caminhos evolutivos que podem ser tomados pelo vírus. Não temos indicativo de algo mais transmissível que a Delta, mas devemos correr o risco?

Felizmente, coinfecções parecem ser incomuns, então não temos um motivo de pânico nesse momento. Mas soma-se a miríade de alertas quanto a manter uma transmissão alta, especialmente com uma cobertura vacinal necessitando aumentar.

https://twitter.com/analise_covid19/status/1461027407016730644

Nesse fio recente do @schrarstzhaupt devemos lembrar que estamos em um cabo de guerra com o vírus: de um lado, o vírus e seus mecanismos evolutivos. Do outro, as vacinas, e todas as medidas (como máscara, distanciamento..) que nos protegem do vírus

https://twitter.com/schrarstzhaupt/status/1463015801401843712

Nenhum de nós quer retroceder e viver novas restrições. Mas não devemos achar que a situação está propícia para grandes flexibilizações. Se não, poderemos estar pegando um caminho sabidamente complicado, como o do leste europeu, atualmente

https://twitter.com/schrarstzhaupt/status/1463015741163294723

Portanto, não há mistério: precisamos aumentar a cobertura vacinal:
📍estimular as pessoas a buscar a 1ª dose
📍estimular as pessoas a retornar para a 2ª dose
📍estimular as pessoas a voltar para a 3ª dose, se pertencentes ao público-alvo atual

E junto do aumento da cobertura vacinal, medidas que são SEMPRE bem-vindas e necessárias:
📍uso de máscaras, principalmente em ambientes fechados
📍distanciamento físico sempre que possível
📍ambientes abertos/ventilados sempre que possível

E mais isso:

https://twitter.com/mellziland/status/1461394459300667396

Marcando os especialistas: @oatila @otavio_ranzani @GrafTiago @PaolaResende1 @CaddeProject @nmrfaria @sailorrooscout @dogarrett @AndersonBrito_ @jasonptodd @wasimvacinas @reumalho @b_ishigami @ThomasVConti @dadourado @analise_covid19 @ntsnaleatorias @BlogsUnicamp @rafalpx

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