Thread by @ramos262740691

さて、遊び過ぎたのでそろそろまじめにTweetしよう。

まずリスクコミュニケーションが1つ必要かなと思っている。

ねぇ、君たち気管支ってどこだと思ってる？

①一般人のイメージの気管支の位置
(青線)
②生物学者の気管支の位置(赤線)

気管支ってのは解剖学的には気管が枝分かれしていくところ全部。
どんどん枝分かれしていって最終的に肺胞に至るのだが、その名が終末細気管支。

なので、「οはδと比較して気管支で70倍増え、肺胞細胞で10倍増えにくい」と言われて、イメージする内容が、もしかすると一般人と生物学者で違わないか？

と不安に思った次第。

というのも、今日「オミクロンになって呼吸器の上部、それも鼻とかですねかなり上の方で増えるようになってて肺には届かない」とTVで喋る医師を見かけたのだ。

本当か？

確かに、僕ももともと唾液で全然ウイルス取れにくかった新型コロナがοになってから今までよりは唾液で取れやすくなってる論文紹介しているし、
そもそもこんだけ感染力上がってて足が速いなら上部気道感染がメインになっている可能性が考えられるのは分かるよ。

ただ、断言できる様な文献出てたか？

今の所分かっているのは、これまでよりもTMPRSS2を使わなくなったということ。
ヒト鼻表皮細胞での増えやすさは今の所、以前紹介したこの一報だけで、香港の気管支70倍！ほど劇的な結果ではないよね。

https://twitter.com/ramos262740691/status/1477286253804789767?t=ZR5iwr7WiTJt4-Kh-ppGbQ&s=19

今までよりendsomalな経路侵入の割合が増えたとして、ではなぜ感染力が上がったのか？
(複製能増加の疑いは一報有り)
そして、現段階で考えられるのはPeacockの言うとおり、より細胞侵入のゼネラリストになったということだが、とすると、気管支で選択的に増えやすいのではなく、肺胞特異的増殖傾向が

減っただけだし、後遺症の原因と思われている全身性、特に脳神経系への感染しやすさはより上がったという結論になる。

でもそう結論するには、気管支増殖に偏り過ぎている気がして、何かそこに偏る特異的な侵入経路獲得があるんじゃないか…と思うんだよね。

でないと、今出ている情報だけでは

これまでより後遺症リスク上がっている可能性を当然警戒しなければならない。endosomal経路なら組織細胞に関わらず感染効率同じだもの。

さて、論文。
🇿🇦の西ケープ州？ではοでの入院リスクはδより44%低かった。

若い人が感染主体になったと言われているので、その年齢効果考えると大して劇的に減ってないなという印象があるが、そもそもこの論文では入院者の年齢層に違いがなく、そもそもδ感染入院者も若い。
medrxiv.org/content/10.110…

とすると年齢層揃ってるので、「οでは44%入院リスク低い」は、そのままウイルスの弱毒化と考えていい。

いや、そもそも「めちゃ若い人に感染対象移行してる！」も初出は🇿🇦データなんだけど。
入院者の年齢層・分布変わってないのどういうこと？🇿🇦全然高齢者いないとかそういう要素？

これはもう読みさえせず、図の斜め読みで。
medrxiv.org/content/10.110…

AvsDからモデルナブースター半量で全然いい(もっと減らせないの？)
BvsEからヤンセンよっわ…。でもファイザーブースターで抗体価ゲットできるね。
EvsFからファイザー2回のブースターヤンセンでもええね。と。

ま、大事なのは武漢株用ワクチンがどれだけοに持つかだと思ってるのでふーんとしか

さて、次はNBAの選手たちの頻回検査データを用いた面白い報告。
medrxiv.org/content/10.110…

これまでοの方がウイルス量が高い報告(と言ってもCt2程度)と変わらないとするインペリアルカレッジデータとありましたが、ちゃんとタイムコースを追った報告は初では？

大事なのはもうこのAの右側。
δはCt25から始まり…に対し
οはCt27くらいから始まりピークは25くらいだけどピーク時間短い。

で理論推定がこうなっている。
これは論文自体が述べているようにοの感染力の高さと矛盾しているし(この場合、例えば鼻表皮細胞特異的に発現している〇〇への親和性獲得等、何か受け側が弱くなっている変異がないと説明できない)、
また英国調査では、ο感染者の平均Ct値はちょっと低くなる方へシフト

だったという観察結果とも矛盾している。

さて、しばらくは様子見でしょう。
いま言えることは、ウイルス量変わってる報告でもCt2分(4倍程度)のウイルス量↑〜↓まで報告があり、変わらない報告も多いので「少なくとも劇的には変わらないね」でしょうか。

とするとどちらにしろ、

ο株はその感染力の劇的な高さを説明する生物学的な要素が1つかけたままです。
何かが見逃されている、と考えるべきでしょう。

次はまた困ったことに全然違う報告です。
ちょうどHIV保有者へのコロナワクチン臨床試験をやっていたモデルナさん。ο波でぶっ壊されたようですが、さて、ο感染者の48%がCt25未満だったと。

medrxiv.org/content/10.110…

さっきのNBAの報告は完全否定するデータですね。そんなことになれば明らかにウイルス量δより多いんだが…？
HIV保有者というのが幾らか影響しているでしょうから、また解釈が難しい。

また臨床試験開始時に1.6%だった無症状割合が27%に増加？
それでも、え、無症状割合少ないじゃんと思いますが

彼らのこれまでの経験・やり方ではδでの無症状割合はかなり低かったようで、まぁοの無症状割合はこれまでより明らかに高いだろうとの結論です。

ところでこの文献、サプリファイル見つからなかったんですけど…

詳細はサプリデータ開示待ちでしょう。

次は日本の兵庫県から。
medrxiv.org/content/10.110…

抗体検査結果から既感染者は4%にまで増加。
日本人1.2億人に外挿すると480万人が累計感染者となります。

これだと、これまでの報告の2.6倍が全体の感染者ということで、これまでの5倍より落ちました！これは良いニュース。

つまり、今年の夏以降は検査数は結構足りていたということになります。

たしかに検査充実率100越えてたもんね。
夏以降は殆ど取りこぼしがなかったのでしょう。

さて、この人達ワクチン接種済みなので90%の人が抗S蛋白抗体持っています。

ですが、οへの中和能を示したのは、36%にまで落ちました。

それは高齢者で15%と顕著です。接種が早かったことも関係してるかもしれませんが。

うん、オミクロン凄いねやっぱ。

あくまで中和能を示した人が36%いたということですので、逆に言えば64%の人は1ミリもオミクロンを中和する気配がなかったということです。

残った36%の人であっても、中和抗体価は既報通り大きく下がっているでしょう。41倍減とかね。

これでVE残ってると考える方がムリですよ。

この兵庫県の報告はワクチン効果がまずοに対しては残っていないことを示す報告です。

対応ワクチン間に合わなかったけど、高齢者は武漢株用サードショット打つしかないのかも…

οでの高齢者の重症化リスクはどうなんだろうね。まずはそこだよね。