Desde #SEIMC publicamos una serie de observaciones sobre el valor de Ct en el diagnóstico de SARS-CoV-2 en las muestras clínicas 🔬🦠
Abro hilo 🧶
1⃣Las muestras que se utilizan para la detección de SARS-CoV-2 no son muestras homogéneas, a diferencia de otras que se utilizan para otros ensayos cuantitativos de PCR en tiempo real (RT-PCR) (p.e. suero/plasma).
2⃣No existen en la actualidad técnicas comerciales que incluyan estándares de cuantificación.
🔬Las técnicas comerciales son cualitativas, por lo tanto proporcionan tan sólo, a través del Ct, una estimación "semicuantitativa" de la carga viral.
3⃣Existen factores que influyen y condicionan el valor Ct que proporciona cualquier ensayo de RT-PCR.
🔸Hisopo utilizado para obtención
🔸Tipo y volumen del medio de transporte utilizado
🔸Calidad de la muestra obtenida, condiciones de transporte, el tiempo hasta procesamiento...
4⃣ Los valores de Ct que proporcionan distintas RT-PCR comerciales en una muestra dada pueden ser diferentes, incluso cuando la secuencia diana de éstas es la misma (variabilidad inter-prueba)
👀👉No existen estándares universales para generar resultados comparables.
5⃣En muestras de baja calidad (poca celularidad) el Ct puede no reflejar fielmente la carga viral presente en ese compartimento, independientemente de la RT-PCR comercial empleada.
🚨Solo el “delta Ct” provee una información precisa sobre la carga viral real presente en muestra.
6⃣Los rangos de valores de Ct que se asocian a la presencia de virus infectivo varían según la técnica de RT-PCR empleada, y posiblemente de la variante del SARS-CoV-2 🦠y del estado de vacunación del individuo💉
📌Puesto que el valor del Ct puede estar influido por numerosas variables, su uso como marcador ´único puede conducir a inferencias incorrectas relativas a la “infecciosidad” del individuo.
📌 #SEIMC considera que su utilización no siempre está plenamente justificada, no estimando actualmente como imperativo la necesidad de expresar los valores o rangos del Ct en los informes, y abogando por el consenso entre clínicos y microbiólogos para su correcta utilización.
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Los coronavirus (CoV) son virus de ARN de cadena positiva de la familia Coronaviridae. Su reservorio principal son animales, siendo las cepas + comunes q afectan al ser humano la 229E y la NL63 del grupo Alpha y la OC43 y la HKU1 del grupo Beta, que cursan como un resfriado común
No obstante, esta familia de virus se dio a conocer por todo el Mundo debido a las dos pandemias producidas por dos de sus serotipos: SARS-CoV en 2003 con más de 800 casos fatales y la pandemia actual de MERS-CoV (Península Arábiga). jamanetwork.com/journals/jama/…