Recientemente me han estado preguntando mucho en los medios de la vacuna #abdala. Aquí les dejo un 🧵 con información de está vacuna y también de la vacuna bivalente #Pfizer para que cada quien pueda tomar la mejor decisión de manera informada basada en evidencia científica
1/ Contexto: Soy experto en Genómica y Bioinformática y desde el inicio de la pandemia he estado colaborando para caracterizar al virus desde su entrada a México. Soy investigador del @ibt_unam soy Presidente de la @ACMor_Morelos y miembro del @CoViGenMex.
2/La vacuna Abdala es un biológico contra la COVID-19 creada por el Centro de Ingeniería Genética y Biotecnología del Ministerio de Salud Pública de Cuba. En resumen, se produce un fragmento de la proteína spike del virus que pone en la vacuna y se inyecta en el músculo.
3/La vacuna solo ha publicado sus resultados en The Lancet para la fase clínica 1/2, la cual prueba su seguridad. Aquí la liga thelancet.com/journals/lanam…
Los autores mencionan las limitaciones y sesgos que tiene su estudio, como el posible efecto que puedan tener las comorbilidades
4/Las comorbilidades en Mexico son un factor importante que está vacuna no hay datos para poder extrapolar al país. También mencionan que se requiere de un mayor seguimiento para evaluar si se debe poner un refuerzo al terminar el esquema completo para mantener la efectividad
5/Pasando a su estudio de fase clínica 3 este no ha sido publicado más que como "pre-print" lo que significa que estos resultados no están revisados por otros científicos y de hecho, es un requisito para que la OMS la pueda autorizar para uso de emergencia
medrxiv.org/content/10.110…
6/Después de revisar el artículo, yo encuentro varias limitaciones que deben ser consideradas.
-El estudio fue hecho solo en Cuba con ~48mil individuos de entre 19-80 años. Los estudios de fase 3 de cualquier vacuna, requieren individuos de diferentes partes del mundo.
7/Esto es importante para evaluar la eficacia y otras variables propias en diferentes poblaciones y momentos de la pandemia. Es posible que este estudio no vaya a ser aceptado en ninguna revista ni por la OMS ya que los resultados no son extrapolables para otras poblaciones.
8/-El estudio fue realizado con individuos reclutados entre marzo y abril del 2021. El estudio muestra eficacias altas (>90%) para evitar desde síntomas leves y graves, hasta evitar muertes. Esto con esquema de vacunación completo, 3 dosis (0,14 y 28 días) y bien 82% con 2 dosis.
9/En marzo-abril del 2021, no existía la variante Omicron en Cuba no otros países. Hoy en día, México es azotado por las más de 4 subvariantes de Omicron que han demostrado ser mucho más transmisibles que las que había en el 2021, por lo que se espera una baja eficacia de Abdala
10/Tampoco se hizo un diseño con subgrupos para evaluar como funciona en diferentes rangos de edad, sexo o etnias. Cuba tiene un fondo genético diferente al de México lo cual es importante considerar. Por otro lado, tampoco se podría usar para menores de 18 años.
11/Si bien todas las vacunas sufrieron una baja de eficiencia por la variante Delta, en ese momento era importante proteger contra la muerte, lo cual todas las vacunas lo lograban a pesar de las variantes que escapan de los anticuerpos creados por cualquier biológico...
12/Hoy es diferente. El objetivo es tratar de cortar la transmisión y para eso, necesitamos vacunas actualizadas que puedan generar anticuerpos contra las variantes más recientes de Omicron. Para ésto, tenemos el refuerzo bivalente de Pfizer y Moderna que son vacunas de mRNA.
13/Sin entrar en detalle, esta vacuna bivalente incluye información del virus original de Wuhan pero también de las variantes BA.4/5. A continuación, pongo en resumen de las evidencias que existen para sustentar si eficacia como refuerzo y por lo cual es una mucho mejor opción.
14/Estudios de laboratorio: 8 estudios donde se han probado anticuerpos generados por personas inmunizadas con refuerzo bivalente y robado con partículas virales de BA.5 y recombinantes como la XBB que actualmente es la más transmisible. Los resultados y referencias aquí abajo
15/Reportes de CDC: A finales del 2022 la agencia en USA reportó una buena eficiencia de la vacuna bivalente pero en particular, los resultados para los grupos de 65+ años son alentadores, 90% de eficiencia vs hospitalización y mayor protección comparado contra otros refuerzos.
16/Estudios en Israel: estudio de 700mil individuos con refuerzos bivalente presentaron una eficiencia ~81% en protección vs hospitalización. A pesar de que la población en Israel tiene una etnia mayoritaria los resultados se alinean muy bien con los de USA aún con la ola de BQ.1
17/Con las evidencias actuales, no es posible recomendar la vacuna Abdala cómo refuerzo y solo hay datos como esquema completo, pero que posiblemente ya no sean extrapolables a nuestra situación actual. Su seguridad está demostrada pero si eficacia no para la variante Omicron
18/Esto mismo le pasó a la vacuna de Johnson&Johnson en 2021 cuando apareció la variante Delta. La CDC recomendó que se prefirieran otras vacunas en vez de la de J&J y eso que la eficacia bajó al 66%. Esto fue una tragedia para la compañía pero 🤷🏽‍♂️

statnews.com/2021/01/29/jj-…
19/Finalmente en mi opinión es mucho mejor utilizar el refuerzo bivalente de Pfizer o Moderna en la actualidad. Están las evidencias y es cuestión de hacer las gestiones para su compra y aplicación pero posiblemente ya sea demasiado tarde.

Espero que les sea útil la información.

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Apr 2, 2022
Aunque la incidencia de SARS-CoV-2 ha ido a la baja, hay que recordar que la prevalencia es alta, no solo en el país sino en todo el mundo. Por lo tanto, el aplicar medidas preventivas como el uso de cubrebocas aún en espacios abiertos, sigue siendo un elemento importante. Abro🧵
1/ Contexto: Soy experto en Genómica y Bioinformática y desde el inicio de la pandemia he estado colaborando para caracterizar al virus desde su entrada a México. Soy investigador del @ibt_unam soy Presidente de la @ACMor_Morelos y miembro del @CoViGenMex.
2/Como ya se ha explicado en otros 🧵el modelo del queso suizo es una analogía en manejo de riesgos. Las medidas de seguridad tienen fallas, pero si usas más de una de manera aditiva, el riesgo disminuye y es más manejable. Es como poner capas de queso suizo una tras otra
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Feb 3, 2022
Las fiestas decembrinas están cobrando factura. La aparición y dominio de la variante #Omicron debe de recordarnos que el virus sigue mutando y generando cambios a tal grado de ya tener 3 sublinajes (BA.1, BA.2 y BA.3). Abro 🧵 para hacer algunas recomendaciones
1/ Contexto: Soy experto en Genómica y Bioinformática y desde el inicio de la pandemia he estado colaborando para caracterizar al virus desde su entrada a México. Soy investigador del @ibt_unam soy Presidente de la @ACMor_Morelos y miembro del @CoViGenMex.
2/ En varios países se observa desde hace tiempo la transmisión acelerada de la variante #Omicron de la cual, lo que sabemos es aún poco. Es un hecho que presenta un número muy grande de mutaciones y que son el resultado de una selección que confiere ventajas en la transmisión
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Jan 13, 2022
¿Debemos creer todo lo que sale en las noticias o en la prensa? Cuestionar la información que recibimos no es solo cuestión de decir "no lo creo". Cuestionar, contrastar información y emitir un juicio basado en evidencias es el trabajo de un científico. Abro 🧵 con ejemplo:
1/ Contexto: Soy experto en Genómica y Bioinformática y desde el inicio de la pandemia he estado colaborando para caracterizar al virus desde su entrada a México. Soy investigador del @ibt_unam soy Presidente de la @ACMor_Morelos y miembro del @CoViGenMex.
2/Recientemente me han preguntado o mencionado la nota que pongo a continuación y que se titula "Un enjuague bucal logra desactivar al 99.9% la COVID en unas horas, revela estudio". Esta nota es un ejemplo de como NO se debe hacer divulgación de algún tema
sinembargo.mx/10-01-2022/410…
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Dec 21, 2021
Recuento más reciente de los casos de #Omicron en #Mexico. Abro 🧵 corto para darles datos despistados en la base de datos @GISAID.
1/Contexto: Soy experto en Genómica&Bioinformática y desde el inicio de la pandemia colaboré con el gobierno de Cuernavaca para las medidas de prevención; soy investigador del @ibt_unam; Presidente de la @ACMor_Morelos y miembro de @CoViGenMex donde hacemos la vigilancia genómica
2/ Al 20/12/2021 se tienen 25 casos de #Omicron :
Hombres➡️15
Mujeres➡️10

Edades:
>= 65 años➡️13
50-64 años➡️3
40-49 años➡️2
30-39 años➡️3
20-29 años➡️2
Infantes: 5 años y 1 año

Lugares:
#CDMX 16
#Edoméx 6
#Tamaulipas 3
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Dec 9, 2021
Recientemente he tenido que dar información a los medios acerca de la variante #OMICRON como afectaría la eficacia de las vacunas y si puede ser más severa o letal. Abro 🧵para hablar de estos temas pero desgraciadamente, aún no tenemos certeza de nada y las evidencias son pocas
1/ Contexto: Soy experto en Genómica y Bioinformática y desde el inicio de la pandemia he estado colaborando para caracterizar al virus desde su entrada a México. Soy investigador del @ibt_unam soy Presidente de la @ACMor_Morelos y miembro del @CoViGenMex.
2/ El 1er caso de #OMICRON en México se confirmó recientemente (3 dic) y desde entonces a levantado la alarma en todo el país. El caso (H de 51 años, vacuna Pfizer 2 dosis) fue confirmado tanto por diagnóstico de qPCR y secuenciación del genoma del virus. gob.mx/salud/prensa/5…
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Jul 12, 2021
Existe mucha incertidumbre en la gente que ha sido vacunada y si estarán protegidos contra las nuevas variantes. Abro 🧵 compartir algunas reflexiones al respecto. Contexto: soy un científico experto en Genómica/Bioinformática que participa en la vigilancia genómica @CoViGenMex
1/El virus ha ido cambiando desde que salió de China. Estos cambios se llaman mutaciones y alteran la forma de sus proteínas. La proteína que más se ha estudiado es la proteína S (spike) que es la llave que usa para entrar en las células y es uno de los blancos de los anticuerpos
2/El primer cambio que se observó fue el llamado D614G. Ese cambio de aminoácido en la posición 614 de la proteína S, le permitió una mayor transmisión y generar mayores cargas virales. Fue la primera variante en todo el mundo. Cuando el virus llegó a México ya tenía dicho cambio
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