Henk-Jan Westeneng Profile picture
MD | MND researcher | Neurology | Imaging | Integration | Prediction | (Bayesian) statistics | Probability
GEROVARDUS Σιλουανός Profile picture Jan Willem Renders Profile picture Janine Born Profile picture Max Watson Profile picture 4 subscribed
Dec 9, 2021 7 tweets 3 min read
1). Er gaan geluiden op dat mensen minder ziek worden van Omicron dan van Delta.

Wat zegt de huidige (preliminaire) data hierover?

Draadje.

TL;DR 👇
2). Onze hersenen kunnen exponentiële groei moeilijk bevatten en zijn gevoelig voor gezichtsbedrog. Links is op een lineaire schaal, rechts dezelfde data op een logaritmische schaal. Links lijkt het mee te vallen, rechts niet.

Les 1: plot exponentiële processen op een log schaal
Dec 8, 2021 5 tweets 3 min read
1/ Using data of different #COVID19 variants from 42 countries in a multilevel multinomial model I compared the growth advantage of these variants.

The estimated growth advantage of Omicron compared to Delta (B.1.617.2) is 245%/week (95% credible interval: 205-297%). 2/ Extrapolation of these numbers in 42 different countries is demonstrated in the figure below.

If Omicron is detected in your country it will likely become the dominant variant within 1 month.
Nov 29, 2021 6 tweets 3 min read
Nu Omikron een serieuze bedreiging voor ons lijkt te zijn beginnen velen te *hopen* dat het allemaal meevalt, want *hopelijk* worden mensen er minder ziek van. Daarom goed om naar de cijfers te blijven kijken. Hieronder ziekenhuisopnames in Gauteng, Zuid-Afrika (>90% Omikron) Image Update: Zuid-Afrika heeft data bijgewerkt. In Gauteng in 2 weken van 135 naar 580 opnames (x4.3). Dus elke week verdubbeling. En in Zuid-Afrika zijn mensen gemiddeld ~16 jaar jonger dan in Nederland (27.6 vs. 43.3 jaar). Image
Nov 27, 2021 9 tweets 2 min read
1). Een klein sommetje over de nieuwe coronavariant (Omicron) in Nederland.

🧵 2). In NL worden wekelijks ~1500 aselecte samples gesequencet (in de 'kiemsurveillance'). In de afgelopen 7 dagen waren er 156000 bevestigde covid gevallen. Dus ~1% van alle bevestigde gevallen wordt gesequencet.
Nov 27, 2021 4 tweets 2 min read
1). @NUnl schreef gisteren een artikel met als titel: 'Zuid-Afrika: Nog geen indicatie dat vaccins niet werken tegen nieuwe variant'

nu.nl/coronavirus/61… 2). Hierin staat o.a.: 'Per vijf coronapatiënten zijn vier ongevaccineerd.' In Zuid-Afrika is 24% volledig gevaccineerd. Met deze gegevens kom ik op een *ruwe* vaccin effectiviteit van 20%.

Zie voor achtergrond berekening: cdc.gov/csels/dsepd/ss…
Nov 25, 2021 9 tweets 3 min read
1). Ons demissionaire kabinet straalt momenteel veel twijfel uit. De #COVID19 cijfers zijn allemaal zo 'snel' en 'overwacht' opgelopen. Daarom een draadje met wat scenario's waar nu uit gekozen kan worden.

Spoiler:
Keuzemogelijkheden: zwart, zwarter of zwartst. 2). Het heden kan niet begrepen worden zonder het verleden, dus 1 tweet over het verleden:
- Besmettingscijfers 📈 sinds ~8 weken
- IC-bezetting 📈 sinds ~7 weken
- IC nu voor >55% vol met COVID patiënten
- Testcapaciteit schiet tekort
- Rt 1.10-1.30 sinds >8 weken
Nov 23, 2021 4 tweets 2 min read
1). Gommers vanavond:
- over 10 dagen komen we in #codezwart
- 1350 IC bedden is niet haalbaar
- 1200-1250 IC bedden is nu waarschijnlijk het maximaal haalbare.
- "opschalingsplannen zijn papieren opschalingsplannen"

Bron: debatdirect.tweedekamer.nl/2021-11-23/zor… (Gommers in 2e helft) 2). Duidelijke som van Gommers:
- 188 BOSS bedden
- 350 IC bedden voor acute zorg (waarschijnlijk nog wat meer).
- 650 IC bedden voor COVID
Totaal: ~1200 IC bedden
Nov 22, 2021 12 tweets 4 min read
1). Morgen komt het RIVM met de wekelijkse #COVID19 update.

Vandaag vast mijn update. 🧵 2). Het aantal besmettingen is in deze pandemie in NL nog nooit zo hoog geweest en ze stijgen de pan uit.

Via @YorickB
Nov 19, 2021 7 tweets 3 min read
1). Het @rivm heeft nieuwe cijfers gepubliceerd over hoeveel opgenomen mensen gevaccineerd en ongevaccineerd waren en berekende op basis daarvan de vaccin effectiviteit (VE) tegen ziekenhuis- een IC-opname.
rivm.nl/documenten/eff… 2). In dit verslag komt het RIVM tot de volgende getallen:
Over de laatste acht weken was de VE 92% (95% BI 91-93) tegen ziekenhuisopname en 96% (95% BI 96-97) tegen IC opname. De onderliggende data staat hieronder.
Nov 18, 2021 15 tweets 4 min read
1) Een 'waning immunity' 🧵

Dit gaat over de verandering van de effectiviteit van vaccins tegen COVID-19 in de loop van de tijd. En wat dit voor het beleid zou kunnen betekenen. 2) Afnemende immuniteit (waning immunity) na vaccinatie tegen COVID-19 is momenteel een heet hangijzer. Voor dit draadje baseer ik me op een grote studie uit Israël nejm.org/doi/full/10.10…
Nov 17, 2021 10 tweets 3 min read
1). Hoe staat NL ervoor qua corona?

Spoiler: niet goed (voorzichtig uitgedrukt).

🧵 2). Momenteel:
- ~20000 vastgestelde besmettingen per dag en stijgend
- gemiddeld 227 zhk-opnames/dag over afgelopen week. stijgend
- gemiddeld 33 IC-opnames/dag over afgelopen week, stijgend
- ~45% van totale IC-capaciteit gevuld met covid patienten, stijgend
Nov 15, 2021 8 tweets 2 min read
Voordelen 1G ten opzichte van 2G:
- 1G is niet discriminerend
- 1G voorkomt toename polarisatie
- 1G voorkomt besmettingen
- 1G verbetert het zicht op het virus
- 1G is proportioneel (bij veel besmettingen)

Nu nog zorgen voor een goede implementatie! Ik kreeg hier zoveel reacties op dat ik ze niet kan beantwoorden. Belangrijkste tegenargumenten zijn:
1. Het kan niet (logistiek)
2. Het is (te) duur
3. Mensen gaan de booster niet meer nemen
4. Ja doei, ik ben gevaccineerd
5. Ik ben voor 0G.

Hier nog even een korte reactie.
Nov 12, 2021 13 tweets 3 min read
1). Kort geleden schreef ik iets over het gemis aan debat over grondrechten van Nederlanders in deze coronacrisis. In het volgende coronadebat heeft de Tweede Kamer de kans om hierover grondig te debatteren want >>
2). De mogelijke invoering van 2G lijkt me naast problemen met o.a. handhaafbaarheid en ethische problemen ook potentiële problemen met grondrechten geven.
Nov 12, 2021 6 tweets 1 min read
Lang wachten met blussen van een brand zorgt dat de brand groter wordt. Als de brand groter wordt moet er heftiger blusmateriaal ingezet worden. Als de brand desondanks niet onder controle komt moeten omwonenden bijvoorbeeld ramen en deuren gesloten houden. Brandweerlieden dragen persoonlijke beschermingsmiddelen, een bewijs dat hun huid vuurvast is helpt onvoldoende om het vuur te bestrijden.
Nov 9, 2021 7 tweets 3 min read
1) Minister @hugodejonge van Volksgezondheid zei vandaag dat we in de ziekenhuizen nog geen afname van effectiviteit van vaccins zien tegen ernstige ziekte en dat we daarom op tijd zijn met boostervaccins. 'We gaan ze dus al geven voordat de effectiviteit afneemt'.

Factcheck 🧵 2) Als het aantal vaccinaties nauwelijks meer toeneemt en het percentage gevaccineerden in de ziekenhuizen neemt aanzienlijk toe, betekent dit dat de effectiviteit van het vaccin afneemt.
Nov 6, 2021 4 tweets 2 min read
1). Na weken van oplopende besmettingen, ziekenhuisopnames en sterfgevallen kregen we vandaag weer te maken met wat strengere maatregelen. 2). De stand is:
- R ~1.2 --> moet >20% dalen
- ~12.000 positieve testen vandaag --> moet ruim 4x halveren
- ongeveer heel NL niveau 'zeer ernstig'
- 288 covid patienten op de IC --> stijgt maar moet onder 100 of 200 dalen
- Zorgpersoneel uitgeput
- Sombere prognose 👇
Nov 5, 2021 13 tweets 3 min read
Het aantal vastgestelde #COVID19 besmettingen is opgelopen tot boven de 10000 per dag. De zorg geeft aan dat ze het bijna niet aan kunnen. Op 1 op de 3 IC-bedden ligt een ernstig zieke covid patiënt. Het aantal sterfgevallen stijgt. #zorginfarct

Daarom een paar observaties. 1). De strategie is onduidelijk. Daardoor is het niet duidelijk waarom maatregelen nodig zijn, wanneer maatregelen nodig zijn, hoe lang maatregelen nodig zijn en wat het concrete doel van de maatregelen is en of ze werken.
Nov 3, 2021 9 tweets 2 min read
1/ Er is momenteel nogal wat debat over coronavaccins en ziekenhuisopnames. Bij dezen een kleine bloemlezing uit de presentaties van Professor @RIVM_vDissel

Advies: Lees even het hele draadje. 2/ In het Catshuisoverleg (29-10-2021) werd onderstaand figuur getoond. Image
Oct 25, 2021 13 tweets 4 min read
1/ Morgen komt RIVM met de wekelijkse update. Vandaag vast mijn update. Waar stonden we, waar staan we, waar gaan we heen.
🧵 2/ We wisten dat de besmettingen opliepen en oplopen. Sinds ruim 4 weken. En gecorrigeerd voor % positieve testen zitten we inmiddels op het niveau van de dansen-met-jansen-piek.

We wisten dat de ziekenhuisopnames opliepen en oplopen. Sinds ruim 3 weken.
Sep 13, 2021 6 tweets 2 min read
1/ Volgens sommigen kunnen door de vaccinaties alle maatregelen afgeschaft worden.

Een 🧵 over vaccinaties, maatregelen en vrijheid. 2/ Hieronder de relatie tussen vaccinaties en maatregelen. 2 observaties:
1. Meer vaccinaties gaan gepaard met minder maatregelen (in EU 0.6 punten voor iedere 1% meer vaccinaties)
2. Alleen vaccinaties leiden waarschijnlijk niet tot volledig afschaffen maatregelen
Aug 17, 2021 9 tweets 4 min read
1/ Using GISAID data of 7 most prevalent #COVID19 variants from 42 countries, Delta variant still seems to have the largest growth advantage, but... 2/ Using sequencing data from the UK, AY.3 (which is also classified as Delta) and B.1.621 might have a growth advantage compared to B.1.617.2.

Word of caution: especially numbers of B.1.621 in the UK are currently low and growth advantage might be overestimated.