Vous n'êtes pas sans savoir que le Covid-19 circule très activement sur le territoire : chaque semaine, 3,5% des habitants sont testés positifs.

Or, cette très forte circulation du virus change le sens des indicateurs hospitaliers.

Thread 👇 Parmi ces 3,5% de la population, certaines personnes seront admises à l'hôpital car elles développeront une forme grave de la maladie ; mais d'autres devront être hospitalisées pour une raison qui n'a rien à voir avec leur test positif : AVC, accident domestique, opération, ...

[THREAD]

Vous avez sûrement vu la vidéo @m6info qui dévoile les fêtes clandestines "de haut standing" qui ont lieu à Paris, au mépris des mesures sanitaires (et des sanctions) en vigueur 💸

L'occasion de s'intéresser au fondement économique des attestations et des amendes🧑‍🏫 Pour ça, je me réfère au livre Freakonomics de Levitt et Dubner. C'est un ouvrage qui essaye d'analyser avec les modèles économiques des sujets "inhabituels".

Je ne suis pas d'accord avec l'intégralité de ce qui y est avancé, mais la partie sur les amendes est très intéressante.

En un mois,

- Le nombre de patients hospitalisés pour Covid-19 a BAISSÉ de 11% 📉

- Le nombre de patients en réanimation pour Covid-19 a AUGMENTÉ de 18% 📈

Décryptage dans ce thread "Vaccination & Saturation hospitalière" ⬇️ Depuis le début de la pandémie, le gouvernement a 2 objectifs sanitaires principaux :
- Réduire la mortalité
- Eviter la saturation des services de réanimation (et donc la mortalité supplémentaire que cela implique)

La vaccination doit notamment permettre d'y répondre

Dans le thread ci-dessous, aucune vérité, juste des idées auxquelles j'ai très humblement pensé, et que j'aimerais partager pour avoir le retour de scientifiques pouvant me dire si ça a du sens ou pas du tout ! Comme beaucoup d'entre vous, j'ai du mal à comprendre la situation actuelle où l'on sait que les variants représentent une part de plus en plus importante des cas, sans que ceux-ci n'explosent.

Dans le tweet cité, très intéressante modélisation qui représente la courbe épidémique allemande divisée en 2 selon les variants.
J'ai essayé un exercice similaire, avec en bleu les cas, en rouge le variant estimé grâce aux deux enquêtes Flash et en gris la différence.
A dérouler

https://twitter.com/c_endt/status/1357750987029643268

Ce que je trouve intéressant, c'est que dans la modélisation pour l'Allemagne, on a un "creux" du total de cas (courbe convexe), alors que dans celle pour la France, on a une "bosse" du nombre total de cas (courbe concave)

[THREAD : J'ai une question]

Depuis le début de la pandémie, je réponds souvent « je ne sais pas » aux questions car je ne suis ni médecin, ni épidémiologiste, juste un étudiant qui aime les statistiques.

1/11 Aujourd’hui, il y a quelque chose que je ne comprends pas sur les contaminations au Royaume-Uni, et je demande avec beaucoup d’humilité l’éclairage des personnes de ma TL qui sont légitimes pour expliquer ce sujet

2/11

Je suis pour la mise en place de mesures sanitaires adaptées car la pandémie fait des dégâts humains graves.

Mais je ne pense pas qu'il faille les justifier par ce genre de carte, qui semble avoir été construite uniquement pour justifier le couvre-feu à 18h.

(À dérouler) Le taux d'incidence se calcule à partir des données des tests entre J-9 et J-2. Permet-il déjà d'évaluer l'impact d'une mesure mise en place il y a 12 ou 4 jours selon les départements ?

Par ailleurs, que veut dire ce -10/+50 en légende ? Une variation ? Par rapport à quand ?

Ce soir, le taux de positivité des tests #COVID19 va chuter. Pourquoi ? Thread explicatif d'un changement de calcul opéré par @SantePubliqueFr, afin de mieux refléter la réalité.

A dérouler ⬇️ Dans certains pays, on calcule le taux de positivité à partir du nombre de tests réalisés : si une même personne réalise 3 tests différents, on remplit 3 "cases" différentes pour le résultat.

Situation #COVID19 au 7 décembre : Entrées et sorties de l'hôpital Situation #COVID19 au 7 décembre : Estimation du R à partir des entrées à l'hôpital

Alors que le président s'exprimera demain à propos de la crise sanitaire, quelle est la situation #COVID19 dans les hôpitaux français ?

Thread à dérouler Les entrées à l'hôpital continuent leur baisse. Elles sont désormais à leur niveau du 26 octobre.

Les sorties ont elle aussi commencé à baisser, aussi bien pour les retours à domicile que pour les décès.

Le "solde" quotidien est à nouveau négatif.

Situation #COVID19 en France, 21 novembre

Entrées et sorties de l'hôpital Situation #COVID19 en France, 21 novembre

Estimation du R à partir des entrées à l'hôpital

[THREAD] – À dérouler :

Pourquoi il faut prendre avec beaucoup de précautions la baisse actuelle du nombre de cas de #COVID19 ?

1/27 Depuis une dizaine de jours, le nombre de nouveaux cas de COVID19 a baissé de manière drastique. A Paris, la baisse est de 50% en 1 semaine. Un chiffre colossal, qui correspond à un R de 0,5 : lors du premier confinement, cet indicateur n’était descendu qu’à 0,7.

2/27

Les tests antigéniques ne seront pleinement intégrés à la base SI-DEP qu'à partir de demain. Difficile de dire quelle proportion des tests ils représentent.
Pour avoir une idée très sommaire de la répartition, pourriez-vous remplir et partager ce sondage ?

Cette semaine, j'ai : Échantillon évidemment non-représentatif, duquel on ne pourra pas tirer de conclusion. Mais je suis curieux de connaitre une approximation de la répartition.

#COVID19 : Situation au 12 novembre

Entrées et sorties de l'hôpital #COVID19 : Situation au 12 novembre

Estimation du R à partir des entrées à l'hôpital

Situation #COVID19 au 11 novembre :

Entrées et sorties de l'hôpital Situation #COVID19 au 11 novembre :

Estimation du R à partir des entrées à l'hôpital

COVID-19 : Situation au 15 septembre

Entrées et sorties de l'hôpital, solde quotidien du nombre de patient hospitalisés COVID-19 : Situation au 15 septembre

Estimation du R à partir des entrées à l'hôpital

J'aimerais vous proposer une nouvelle représentation du nombre de cas de COVID-19 en France.

Elle fait la distinction entre différentes classes d'âge, et permet de comprendre l'évolution du profil des malades. Les données présentées croisent deux sources.

Jusqu'à la mi-mai, le nombre de nouveaux cas présenté par Santé Publique France.
A partir de la mi-mai, le nombre de cas remonté par le SI-DEP.

⬇️ A dérouler ⬇️

Quelle est la méthode exacte de calcul du R utilisée par le gouvernement et comment la reproduire facilement chez vous pour étudier l’évolution de l’épidémie ?

1/19 Nous avons parlé plusieurs fois du R, de ce qu’il signifie et de différentes démarches pour l’estimer. Si cela vous intéresse, vous pouvez relire ce thread :

https://twitter.com/eorphelin/status/1260274505223745541?s=20

2/19

COVID-19 : Des courbes pour comprendre, 1 Juin 2020 COVID-19 : Des courbes pour comprendre, 1 Juin 2020

Tendances quotidiennes des nouveaux décès hospitaliers par région

Estimation du R-0

J'utilise désormais les passages aux urgences pour suspicion COVID-19, indicateur utilisé par le gouvernement Pour comparaison, voici le calcul partagé par le gouvernement