Share this page!

Enter URL or ID to Unroll

You can paste full URL like: https://x.com/threadreaderapp/status/1644127596119195649
or just the ID like: 1644127596119195649

How to get URL link on X (Twitter) App

  1. On the Twitter thread, click on or icon on the bottom
  2. Click again on or Share Via icon
  3. Click on Copy Link to Tweet
  4. Paste it above and click "Unroll Thread"!
  5. More info at Twitter Help
houter Profile picture
houter
@houterkabouter
I'm an educated fool. Aspirant relativist. PhD klinische & epidemiologische virologie.
Nov 13, 2021 • 4 tweets • 1 min read
Een volgtip voor rustige en genuanceerde duiding bij het verloop van de epidemie in ons land. Sinds 15 oktober stijgen de cijfers (besmettingen en hospitalisaties) ongeveer lineair en lijkt het eerder in de goede dan de foute richting te evolueren richting een piek. 1/4 Een exponentiële faze, die bij het natuurlijk verloop van een golf enkel initieel een bruikbare benadering is, is ook niet te verwachten tenzij omstandigheden (slechter weer) de stijgende immuniteit (en beperkte gedragswijziging) teniet zou doen. 2/4
Mar 6, 2021 • 10 tweets • 3 min read
Een draadje over de PREVENTIEPARADOX (sorry) als gevaarlijke dooddoener in tijden van pandemie, cc @jdceulaer @mboudry 1/10 Laat ons volgend gedachtenexperiment voeren. In januari waren er uitbraken in scholen, in vele gevallen door B.1.1.7, de nieuwe besmettelijke variant. Deze werd toen ingeschat 65% besmettelijker te zijn (een inschatting die wetenschappelijk nog altijd +/- standhoudt). 2/10
Dec 19, 2020 • 5 tweets • 3 min read
Current Re estimate 0.85 (95% cri 0.7 - 1.0). The model is not predicting a "third wave", since it estimates that infections <65y have continued to decrease (see more below). 1/5 #COVID19be Zoomed in version (as PDF: genomedetective.com/covid19-epi/be…). Case data <65y (which isn't being used by the model) is being overestimated since the end of October, but could now be starting to follow the predicted (downward) trend of the model.🤞 2/5
Dec 17, 2020 • 8 tweets • 3 min read
"De piek en het 'over de piek gaan' is pas gekomen op het einde van de herstvakantie" verklaart immunoloog Hans-Willem Snoeck, om daarna te argumenteren dat scholen best sluiten. Vreemde uitspraak die tegen alle data ingaat. 1/8
vrt.be/vrtnws/nl/Jour… De piek in vastgestelde besmettingen kwam op 27 oktober, hospitalisaties op 3 november, en overlijdens 10 november. Rekening houdende met vertraging voor elk van deze gegevens ten opzichte van infecties, kan je dit terugrekenen tot een piek van infecties rond 17 oktober. 2/8
Nov 8, 2020 • 11 tweets • 3 min read
Indien deze lockdown dient om de curves om te buigen, dan schiet ze wellicht haar doel voorbij, en in dat geval moet overwogen worden om deze veel sneller dan voorzien terug te draaien, gezien de grote maatschappelijke impact ervan. Het is ondertussen duidelijk dat besmettingscijfers (zelfs >65j) spectaculair dalen, hospitalisatie cijfers dalen, en overlijdens wellicht deze week de daling zullen inzetten. Weinig spannend dus.
Nov 8, 2020 • 6 tweets • 3 min read
We zijn een week ver in de nieuwe lockdown. Dat betekent dat we vanaf deze week een effect mogen verwachten in de cijfers van besmettingen, en vanaf volgende week een impact op cijfers van hospitalisaties. Wat mogen we verwachten? 1/6 Hoe weten we dat maatregelen van de lockdown nog geen rol spelen in de cijfers nu? Voor de Belgische cijfers weten we dit uit modellen: de tijd van infectie tot test is gemiddeld +/- 8 dagen; van infectie tot hospitalisatie is gemiddeld +/- 13 dagen. 2/6
Oct 5, 2020 • 6 tweets • 3 min read
1/6 Wat Zweden was voor zij die de lockdown in maart overdreven vonden, lijkt Duitsland nu voor zij die de aanpak van onze overheid (en bij uitbreiding, alle andere Westerse landen) te laks vinden.

In beide gevallen is de waarheid niet zo spectulair. 2/6 Wat Zweden betreft tijdens de eerste golf: ook daar was er een gedragswijziging (zie Google mobility data) die Re tot dicht bij of net onder 1 bracht. Zweden zijn van nature misschien ook iets 'afstandelijker'. medrxiv.org/content/10.110… ImageImage
Sep 28, 2020 • 5 tweets • 2 min read
1/ Re estimate: 1.33 (1.26 - 1.42). Estimated Belgians currently infected: 120K (90K - 190K) <65y, 2200 (1400 - 3000) >65y. At this rate (continuing our current behaviour), estimated COVID-19 deaths until Jan 1 2021: 5000 (3000 - 8000). #COVID19be 2/ Zoomed in version. I added two new charts: estimated age of infected population and estimated IFR (as a result of this change in demography).
Sep 22, 2020 • 6 tweets • 3 min read
1/6 New model (details below), estimating the Belgian epidemic from hospitalization, death (and case) data. Current Re estimate = 1.4 (1.3 - 1.5). Estimated deaths, continuing current behaviour, until Jan 2021: 1900 (1300 - 2700), with a peak of 300 hospitalizations per day. Image 2/6 Zoomed in version. This model more reliably fits both deaths (within two age-groups) and hospitalization data, something which recent model fits didn't manage. Image
Sep 15, 2020 • 7 tweets • 3 min read
We are again approaching peak corona panic, but there are two good reasons to stay vigilant but calm.

1) There is no urgency to react.
2) There may be no need to react, provided we keep avoiding (close) contacts between generations and within older generations.

1/7 Starting with the second point: this model predicts that even if we do nothing, the evolution of the epidemic will be "benign". Cases will rise to high levels, but deaths and hospitalizations are limited.

2/7
Sep 11, 2020 • 4 tweets • 2 min read
New model reconciling deaths, hospitalizations, and cases (in decreasing order of weight) and estimated 50000 (30000 - 80000) Belgians infected <65y; 200 (100 - 350) >65y. Estimated Re since Sept 1 is 1.2 (0.9 - 1.5). Current IFR ~ 0.07%. Around 5% of infections are found.

1/4 Image Incidence of cases, hospitalizations and deaths are modelled in a similar way, by assuming that the rate for each is proportional to the age-specific IFR, which is directly estimated from data on deaths.

2/4 Image
Sep 9, 2020 • 4 tweets • 1 min read
Het scenario van half juli dient zich terug aan. Infecties van jongeren beginnen door te sijpelen naar ouderen. Een stijgend aantal krijgt symptomen en wordt positief getest.

1/4 Door contactopsoring stijgen 'besmettingen' hierdoor ineens snel (denk aan half juli, Antwerpen) waardoor schattingen van R onterecht de hoogte in schieten (1.5 tot 2). Doemscenario's worden gepredikt. Nieuwe maatregelen worden afgekondigd die iedereen treft.

2/4
Sep 9, 2020 • 5 tweets • 2 min read
Updated model (details below). Still to early to estimate the impact of school opening. Current IFR ~ 0.07%. Estimated 50000 (34000 - 72000) <65j and 360 (240 - 540) >65j currently infected, means we're catching between 5% to 10% of infections. #covid19be cc #natconcovid 1/ Image This model is now estimated exclusively on information from deaths, except for the last month where cases are used to better model recent trends. Despite low deaths the model estimates a high number of (young) infected people.

2/4
Sep 4, 2020 • 4 tweets • 2 min read
De waarheid is toch dat we wellicht vanaf april ongeveer een evenzelfde percentage van infecties vinden (rond 10%).

1/4 Image Vanaf begin april had België ook zijn testcapaciteit op orde, dus het tekort van maart was niet langer een bottleneck.

2/4
vrt.be/vrtnws/nl/2020…
Sep 1, 2020 • 9 tweets • 3 min read
Schatting reproductiegetal op 1 september: 0.89 (0.84 - 0.93). Door de start van de school kunnen we er best vanuit gaan dat dit terug zal stijgen, en dan komen we al snel terug boven 1 uit. Maar dat hoeft geen drama te zijn.

1/9 Image Dit model schat dat een hoog aantal Belgen vandaag geïnfecteerd zijn: 0.5% < 65j, en 0.02% > 65j. Het model baseert zich hiervoor op overlijdens (per leeftijdsgroep) en schattingen van IFR door Moolenbergs et. al (die zijn geschat op basis van serorpevalentie steekproeven).

2/9
Aug 30, 2020 • 6 tweets • 2 min read
Re inschatting voor vandaag is 0.88 (0.81 - 0.94). Het model zou nauwkeuriger moeten zijn door beter rekening te houden met leeftijdsafhankelijkheid van IFR, ook binnen de twee leeftijdsgroepen (details in thread).

1/6 Image IFR voor SARS-CoV-2 is zeer leeftijdspecifiek: de kans op overlijden stijgt exponentieel (sic) met de leeftijd. Tot nog toe gebruikte het model twee leeftijdsgroepen: <65j, IFR = 0.09% en >65j, IFR = 3%. Maar er is ook aanzienlijke variatie binnen elke groep.

2/6 Image
Aug 27, 2020 • 8 tweets • 3 min read
Dat is een uitspraak gebaseerd op eenvoudig aantoonbare onwaarheden.

1/7 "wat nu veel beter lukt bij de 2de dan bij 1e golf" : o ja ?

Ons gedrag heeft enkel impact op transmissie; maatregelen hebben enkel impact op ons gedrag. De eerste lockdown liet Rt zakken tot < 0.8; bij de tweede golf landen we ergens 0.8 - 0.9

2/7
ImageImage
Aug 2, 2020 • 7 tweets • 2 min read
Er is nood aan een langetermijn plan dat perspectief biedt. Lockdowns zijn daar geen onderdeel van. 1/7 Er wordt vaak verwezen naar landen zoals China, Nieuw-Zeeland, Australië, Oostenrijk, Finland, etc... die erin leken in te slagen om broeihaarden op te sporen en te blussen. Maar die lijst wordt met de dag korter. Ook Australië kampt nu met een grote uitbraak. 2/7
Jul 31, 2020 • 4 tweets • 2 min read
Er circuleert nochtans helemaal niet meer virus nu in vergelijking met maart.

kuleuvenblogt.be/2020/07/31/waa… 1/4 Image We moeten COVID-19 ernstig nemen en een onvoorbereid land draagt de gevolgen. Desondanks is het onwaarschijnlijk dat deze tweede golf erger wordt, niet in het minst omdat er nu véél minder geïnfecteerden zijn, en transmissie een pak trager (wat exponentieel véél scheelt). 2/4 Image
Jul 25, 2020 • 4 tweets • 2 min read
Op 17 maart, de dag dat de lockdown werd afgekondigd, werden er al 422 besmettingen geteld, vergelijkbaar met afgelopen maandag.

bron: vrt.be/vrtnws/nl/2020… 1/4 Image Als we toen evenveel zouden testen als nu, dan zouden we deze grafiek zien. Vooral tijdens de piek kon test capaciteit absoluut niet volgen maar vanaf half april, drie weken voorbij de piek, werden cases ongeveer even vlot gevonden als vandaag. 2/4 Image
Jul 21, 2020 • 5 tweets • 2 min read
R0 is sinds begin juli gestegen tot 1.8 (1.6 - 2.0), indien we de stijging niet kunnen toeschrijven aan 'beter testen', ten opzichte van vorige week.

Enkele doorgerekende scenario's voor bijkomende maatregelen, en impact van timing. 1/5 Image We zouden bvb kunnen terugkeren naar de situatie van begin juni (horeca dicht, bouwverlof afgeschaft, studenten terug in de blok 🤓; we weten helaas niet wat het meeste invloed heeft op R).

Stel we doen dit vanaf nu vrijdag. Sterfgevallen zullen pieken rond 25 per dag. 2/5 Image