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Koichi Kawakami, 川上浩一 Profile picture
Koichi Kawakami, 川上浩一
@koichi_kawakami
研究者。理学博士。専門は遺伝学、分子生物学、発生生物学、神経科学。モデル動物ゼブラフィッシュを使って脊椎動物の体づくりや脳のはたらきの研究をしています。Tweetは個人の意見です。論文リスト: https://t.co/2AXCLwhqs4…
Apr 24, 2023 • 7 tweets • 4 min read
感染研鈴木氏アドバイザリーボード提出の「ウイルスが発症後5日でなくなる」資料。
①これまでの国内外のどの研究とも相反するもので到底認められない(スレッドに繋げます)
②ウイルス分離実験は感染性を表すものではない
二重にアウト。厚労省がこれを医療機関に配布していると聞く。何考えてるの？😠 Image 昨年９月に療養期間が7日間に短縮された時にアドバイザリーボードに提出された資料。ウイルスしっかり、5日目でも7日目でも検出されていますが、強引に7日にしたのですよね。
#PCR検査と治療薬提供の拡充を求めます
Mar 23, 2023 • 12 tweets • 3 min read
ステルスオミクロン(見えないオミクロン):
ウイルスのN遺伝子内の代表的なプライマー・プローブのセットを用いたPCR検査で検出できないオミクロン変異株を見つけました。1例でしたが報告の価値があると考え、英文論文にまとめ投稿し査読をうけ、学術誌に掲載されました😊解説をスレッドにつなげます。 2022年10月中旬に大阪はびきの医療センターの森医師により採取された発熱患者の唾液検体は、複数回の核酸検査によりSARS-CoV-2陽性と診断されたものの、N遺伝子内のN1およびN2のプライマー・プローブを用いたPCR検査キットでは検出できませんでした。この不可思議な検体について解析を進めました。
Jan 16, 2023 • 33 tweets • 2 min read
あかたさん @akatachikako のキャスで、「女性は数学が不得手」と発言したローレンス・サマーズ氏が、私の米国時代のボス、ナンシー・ホプキンス氏の抗議により、女性差別を理由にハーバード大の学長を頸になった話を紹介しましたが、その記事はこちら↓
archive.boston.com/news/education…
翻訳を下につなげます 2/17/2005
ハーバード大のサマーズ総長が、男女間の生来の違いが、科学や数学の分野で成功する女性が少ない理由の一つではないかと発言し、金曜日の学会で騒動になった。サマーズ氏はまた、エリート大学の理工系女性教授の少なさに、差別がどの程度関わっているのかについても疑問を呈した。(1/n)
Dec 24, 2022 • 6 tweets • 2 min read
covSPECTRUMとだいぶちがう結果ですね。
どちらがより正確でしょうか？
（スレッドに繋げます）
@triangle24 9月
Nov 30, 2022 • 4 tweets • 1 min read
#MBSJ2022 #幕張分生2日目
2PW-03 16:15〜18:45
ヒト疾患研究へのモデル生物の挑戦-遺伝子機能と生命システムの理解へ
川上 浩一, 井ノ上 逸朗 (国立遺伝学研究所)

小型モデル生物を用いた希少・未診断疾患遺伝子の機能解析　井ノ上 逸朗( 国立遺伝学研究所)
↓ モデル生物を用いた解析によるヒト単一遺伝子疾患の病態解明　三宅 紀子（国立国際医療研究センター）

ヒト希少疾患の網羅的ゲノム解析から機能解析へ： genes to models　要 匡（国立成育医療研究センター）

疾患iPS細胞を用いた希少疾患の病態解析研究について　齋藤 潤（京都大学、CiRA）
↓
Nov 22, 2022 • 5 tweets • 2 min read
[Announcement]
Opportunity for collaboration (shelf-screen) in Kawakami lab
Dear #zebrafish researchers,
My lab has generated more than 2,000 transgenic fish lines that express Gal4 in specific organs, tissues and cells, which should be potentially useful for many purposes. (1/n) You may look at these expression patterns partly on the web database (kawakami.lab.nig.ac.jp/ztrap/). Since the database contains only a couple of side-view images that were taken by a stereoscope. If you are interested in particular expression patterns, I want you to visit my lab(2/n)
Nov 15, 2022 • 54 tweets • 13 min read
約3年ぶりの発熱。朝方、37.8-38度の熱。喉はそんなに痛くなく咳もほとんどなかったですが、喉の奥から鼻の奥にかけて腫れてる感じでけっこうしんどくて。1時間おきにうがいと鼻うがい。朝、行きつけの内科医の発熱外来を予約。検査します。今、バファリン飲んで平熱(36.5度)まで熱は下がっちゃった。 発熱外来をやっている行きつけの内科クリニックの駐車場で、まず、コロナとインフルの抗原検査。鼻咽頭ぬぐい液。同時にPCR検査のための唾液を採取。抗原検査の結果判定までは、15分。
Feb 1, 2022 • 4 tweets • 1 min read
政府はオミクロン放置の方針かもしれないが。

政府にとって重症者や死者はただの数字かもしれないが、一人一人が大事な人であり、大事な我が子。苦渋と葛藤の中、2年間自主休園、自主休校した親子もいる。その乖離が大きすぎる。

解決がないわけじゃない、一つは徹底した検査。
なぜ政府はやらない？
Jan 31, 2022 • 5 tweets • 1 min read
2年間自主休園していて、最後くらい遊びに行かせたい、と言う思いをDMで聴く。悲痛。😢

幼稚園、児童全員、定期PCR検査してあげればいいのですよ。そうすれば、悩まずにすむのに。
Jan 29, 2022 • 9 tweets • 5 min read
今週PCR試薬不足騒ぎの際、調べたのですが。広い意味のPCR法(拡散増幅検査NAAT、簡易PCR法とも言う)、けっこう医療機関等でやられているのですね。

感度は、
PCR(RT-qPCR)＞TMA＞NEAR(ID Now)≃LAMP＞ルミパルス(抗原定量)＞＞抗原定性
となります。下にtweet繋げます。
#空港検疫をPCRに戻して下さい TMA法(Transcription-mediated amplification method、転写依存的増幅法)：
文献を調べると、思ったより感度はよかったです。
PCR(RT-qPCR)法のCt値37以下では(それよりウイルス量が多い検体では)、RT-qPCR法と結果が一致する、とあります。
#空港検疫をPCRに戻して下さい
Jan 19, 2022 • 5 tweets • 2 min read
＞福島第一原発事故後に甲状腺がんになった若者6人が、東京電力の責任を裁判で追及する

プロパガンダにより各方面から無かったことにされそうになった東電福島第一原発事故後の #小児甲状腺癌 の多発。私が、Twitterで戦ったきたテーマの一つでもあります。

裁判が始まるのですね。全力で応援です。
Dec 25, 2021 • 7 tweets • 2 min read
＞厚労省担当者「抗原検査の陽性判明はPCRの91・4％」

この数字はルミパルスの取説↓
info.pmda.go.jp/tgo/pack/30200…
の一致率、22/24(91.6%)、27/30(90%)に近い数字。
けれども、この数字には意味がないことをスレッドで説明します。
#空港検疫を感度のわるい抗原検査から感度のよいPCR検査に戻して下さい ImageImage (承前)
ここでの問題点は、
①たった20~30の検体しか調べていないこと
②それぞれの検体のCt値を考慮していないこと
③検出限界を真摯に検討していないこと
です。
さて一致率の実態とはどういうものでしょう？↓
#空港検疫を感度のわるい抗原検査から感度のよいPCR検査に戻して下さい
Dec 21, 2021 • 6 tweets • 2 min read
従来型（武漢型）とオミクロン株のスパイク蛋白質遺伝子の比較中。アミノ酸レベルで違っている以上に塩基配列レベルで違っているので、ちょっとビックリ。
（上段が従来型、下段がオミクロン） 短い欠失が多い。
Nov 12, 2021 • 5 tweets • 1 min read
《職質されました(1)》
先日とある駐車場で初めて職質されました(経緯は略)。車の中を見せろと言う。当然応じるつもりはなく拒否。そうすると若い体の大きな警官は体でドアを押さえ閉めさせません。下手に触ると公務執行妨害になるし、知人の弁護士に相談する時間もなし。さて私はどうしたでしょう？↓ 《職質されました(2)》
スマホで110番しました😅「理不尽な職質を受けている。拒否すると車の発進を妨害する」。110番が所轄(?)のお偉いさんに繋がり説明。ほどなくして現場の警官に着信。何やら話したあと「職質を打ち切る許可が出た」。「ふざけるなよ」と思いましたが口にせず。参考にして下さい😊
Nov 26, 2020 • 5 tweets • 2 min read
理研の富岳を使った計算も良いですが。
「排気口の下に立ちマスクを着けて歌ったときの飛沫のシミュレーション」には吹き出しましたw

カラオケも宴会もGoToも。PCR検査してからやるようにしましょうよ。（そういうふうにできるようにしましょうよ）
”カラオケは換気口の下で”
this.kiji.is/70463088042714…
May 1, 2020 • 26 tweets • 6 min read
不思議なのは。我が国は「経済、経済」と言うのに、どうして「徹底的に検査・隔離して（多少偽陰性があっても）感染の状況を把握、経済活動を再開させよう」とならないで「検査を抑えて誰が感染しているかわからないから自粛しましょう」となるのでしょうね？検査をしてきた韓国や台湾は経済再開です。
Mar 20, 2020 • 10 tweets • 3 min read
「新型コロナウイルス感染症対策の状況分析・提言」
この提言ここがわかりません。人工呼吸器量産すればいいではないですか。
”現有の人工呼吸器の数を超えてしまうことが想定...各地域ごとに人工呼吸器等を整備するべきという趣旨でなく公衆衛生学的対策を講じることで...”
mhlw.go.jp/content/109000… 提言の中に、こういう非科学的な文言が挿入されていると、やはり政府の意向を感じるんですよね。