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PhD in Public Health. Ingénieur Sur insta & tiktok : @ThibSciences ⚠️ Personal views. Analyses personnelles

Mar 4, 2020, 7 tweets

Spreading of #coronavirus via nextstrain.org

Évolution du coronavirus à partir du séquençage du génome viral chez 160 personnes infectées (phylogénie génétique) au cours du temps dans le monde

#COVID19fr #COVID #Covid_19fr #CORONAVIRUSENFRANCE #covid19

Arbre phylogénétique
Axe X = divergence = nombre de changements (mutations) dans le génome

Couleur = une région d'isolement dans un pays

Plusieurs séquences n'ont aucune mutation, ce qui signifie qu'elles sont toutes identiques à la racine (centre) de l'arbre

La faible diversité génétique à travers ces séquences suggère que l'ancêtre commun le plus récent de toutes les séquences nCoV était assez récent, car les mutations s'accumulent lentement pour les coronavirus à un taux d'environ 1-2 mutations par mois

Les auteurs de Nextstrain estiment que la grande similitude des génomes suggère qu'ils partagent un ancêtre commun récent (datant de mi-novembre et début décembre 2019)

Il n'y a actuellement aucune preuve que ces mutations modifient le comportement du virus - il est ATTENDU que les virus à ARN mutent.

Les coronavirus accumulent entre 1 et 3 changements dans leur génome par mois (taux de 3 × 10-4 à 1 × 10-3 par site et par an).

À mesure que l'agent pathogène se réplique et se propage, son génome doit se répliquer de nombreuses fois et des mutations aléatoires (erreurs de copie) vont s'accumuler dans le génome

Une étude affirme que le virus #COVID19 a probablement muté en 2 variants : S-cov et L-cov

L-cov aurait une transmissibilité plus élevée et infligerait plus de dommages au système respiratoire humain

Il manque d'études/données pour confirmer ce résultat

academic.oup.com/nsr/advance-ar…

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