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Dec 28, 2022, 9 tweets

THREAD XBB

XBB.1.5 vient d'obtenir un surnom, Kraken. P̈révalent à New York, il booste une forte vague

Il est récemment apparu en France, en faible nombre, dans 4 régions

Les XBB pouvant causer une de nos prochaines vagues, ils méritent une petite synthèse.

#Covid19 #Variant

XBB est un recombinant de BJ.1 (branche BA.2.10), et de BM.1.1.1 (branche BA.2.75.3) avec une cassure en Spike, repéré le 12 septembre. La majeure partie du virus, après la cassure, provient de M.1.1.1.

#Covid19 #Variant

XBB se retrouve avec 5 mutations Spike améliorant l'affinité aux recepteurs ACE2 (dont Y144del, la meilleure), et donc l'infectivité du virus, 3 mutations d'échappement immunitaire ++ (346T, 460K, 486S), 3 mutations d'EI + (445P, 446S, 490S), et deux standard.

#Covid19 #Variant

XBB.1▶️XBB + S:G252V

Une autre mutation du NTD spike améliorant l'infectivité du virus.

XBB.1.1▶️+ ORF1a:P309L

Vue dans Delta, mutation Nsp1 renforçant le détournement de nos cellules au profit de la réplication virale.

#Covid19 #Variant

XBB.1.2 et 3 ne sont pas intéressants ajd.

XBB.1.4▶️XBB.1 + S:T883I

Mutation des BA.5* de l'été 2021➡️Avantage de croissance

XBB.1.4.1▶️+ S:S673G

Mutation à l'extrémité du furine cleavage site. La même à l'autre bout (686), accroit, in vitro, la transmission de +100%.

La star du moment :

XBB.1.5▶️XBB.1 + S:S486P

Le passage (toujours en 2 étapes) à la purine en S:486 donne le plus gros avantage d'échappement immunitaire connu à ce jour.

Cela peut expliquer son apparente dominance sur le reste de la famille.

#Covid19 #Variant

XBB.2▶️XBB + S:D253G

Mutation boucle N5 du NTD Spike (la "clé" ACE2). Vue dans Iota, qui a ravagé New York début 2021 avant l'arrivée de Delta.

XBB.3▶️XBB + ORF1b:I1988V

Mutation inconnue sur le RdRp NSP12 (réplication/transcription)

#Covid19 #Variant

XBB.4▶️XBB + S:K444R

Cette mutation est la seconde meilleure mutation d'échappement immunitaire connue aujourd'hui.

Tous ces XBB sont présents en France aujourd'hui, à bas bruit, attendant que leur heure vienne, peut-être.

#Covid19 #Variant

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